Protein–RNA interactions for Protein: Q13084

MRPL28, 39S ribosomal protein L28, mitochondrial, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 256 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MRPL28Q13084 LGMN-216ENST00000557434 1797 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
MRPL28Q13084 SLC39A8-202ENST00000394833 3238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
MRPL28Q13084 SLC29A2-205ENST00000544554 2505 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
MRPL28Q13084 RAPH1-202ENST00000319170 9808 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
MRPL28Q13084 SLC43A3-203ENST00000395124 2617 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
MRPL28Q13084 SEPT11-209ENST00000510515 1886 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
MRPL28Q13084 TRIM11-201ENST00000284551 2715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
MRPL28Q13084 TEX13C-201ENST00000632600 5095 ntAPPRIS P1 BASIC15.06■□□□□ 0
MRPL28Q13084 SF3A2-201ENST00000221494 1963 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
MRPL28Q13084 GPR176-205ENST00000561100 2816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
MRPL28Q13084 PSD2-201ENST00000274710 4513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
MRPL28Q13084 GDA-201ENST00000238018 2074 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
MRPL28Q13084 ABTB1-206ENST00000468137 2065 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
MRPL28Q13084 NBL1-211ENST00000618761 2051 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
MRPL28Q13084 TERF1P1-201ENST00000311003 1181 ntBASIC15.06■□□□□ 0
MRPL28Q13084 KCNK7-202ENST00000342202 1283 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
MRPL28Q13084 ARHGEF1-204ENST00000378152 2986 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
MRPL28Q13084 ABHD16A-201ENST00000395952 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
MRPL28Q13084 SMIM11A-202ENST00000399295 1074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
MRPL28Q13084 HDAC11-204ENST00000404040 967 ntTSL 3 BASIC15.06■□□□□ 0
MRPL28Q13084 C2orf82-202ENST00000409230 663 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC15.06■□□□□ 0
MRPL28Q13084 AC114763.1-202ENST00000414911 867 ntTSL 3 BASIC15.06■□□□□ 0
MRPL28Q13084 AC092647.4-201ENST00000457211 535 ntBASIC15.06■□□□□ 0
MRPL28Q13084 TVP23B-202ENST00000476139 2989 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
MRPL28Q13084 LINC02106-201ENST00000506534 606 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
MRPL28Q13084 JPH4-203ENST00000544177 1124 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
MRPL28Q13084 P4HB-223ENST00000576390 439 ntTSL 4 BASIC15.06■□□□□ 0
MRPL28Q13084 PRKCSH-217ENST00000592741 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
MRPL28Q13084 AL592071.1-201ENST00000611956 408 ntBASIC15.06■□□□□ 0
MRPL28Q13084 SMIM11B-207ENST00000624758 1074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
MRPL28Q13084 SLC2A13-202ENST00000380858 3082 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
MRPL28Q13084 DKC1-213ENST00000620277 3079 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
MRPL28Q13084 RERE-204ENST00000400908 5790 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
MRPL28Q13084 TCP11L2-201ENST00000299045 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
MRPL28Q13084 F3-201ENST00000334047 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
MRPL28Q13084 SIGLEC10-201ENST00000339313 2256 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
MRPL28Q13084 SLC4A7-210ENST00000440156 4120 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
MRPL28Q13084 AL021920.2-201ENST00000624828 1351 ntBASIC15.06■□□□□ 0
MRPL28Q13084 EPHX4-201ENST00000370383 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
MRPL28Q13084 CACNA1I-202ENST00000402142 10004 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
MRPL28Q13084 AP001922.1-201ENST00000499390 1504 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
MRPL28Q13084 EIF4G1-201ENST00000342981 5667 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
MRPL28Q13084 VWA2-203ENST00000603594 2600 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
MRPL28Q13084 AC092171.3-201ENST00000610122 2651 ntBASIC15.06■□□□□ 0
MRPL28Q13084 FAM104A-201ENST00000403627 2798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
MRPL28Q13084 C5orf30-202ENST00000510890 2933 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
MRPL28Q13084 TCP11L2-203ENST00000547153 1788 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
MRPL28Q13084 ZNF180-202ENST00000391956 3049 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
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MRPL28Q13084 SEMA5B-201ENST00000195173 4523 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ 0
MRPL28Q13084 TMEM30A-201ENST00000230461 4594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
MRPL28Q13084 SLC9A7P1-201ENST00000554295 3311 ntBASIC15.05■□□□□ 0
MRPL28Q13084 MFF-201ENST00000304593 2004 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.05■□□□□ 0
MRPL28Q13084 ZNF397-204ENST00000585800 2046 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ 0
MRPL28Q13084 CYP2R1-201ENST00000334636 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
MRPL28Q13084 KCNT1-212ENST00000628528 7057 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.05■□□□□ 0
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MRPL28Q13084 GCM2-201ENST00000379491 2441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
MRPL28Q13084 SLC1A7-204ENST00000611397 2499 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
MRPL28Q13084 KCNMA1-202ENST00000286628 6233 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
MRPL28Q13084 MBD1-222ENST00000590208 2913 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
MRPL28Q13084 ANKRD37-201ENST00000335174 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
MRPL28Q13084 KRT18P38-201ENST00000449496 1282 ntBASIC15.05■□□□□ -0
MRPL28Q13084 MHENCR-202ENST00000449500 801 ntTSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
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MRPL28Q13084 NSDHL-203ENST00000440023 1630 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
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MRPL28Q13084 COPS3-212ENST00000539941 1699 ntTSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
MRPL28Q13084 CELF6-204ENST00000543764 1676 ntTSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
MRPL28Q13084 NSUN5P2-201ENST00000388955 1789 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
MRPL28Q13084 AL391256.1-201ENST00000443260 1855 ntBASIC15.05■□□□□ -0
MRPL28Q13084 BRIX1-201ENST00000336767 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
MRPL28Q13084 ADAD1-203ENST00000388725 1918 ntTSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
MRPL28Q13084 TGIF1-201ENST00000330513 1980 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
MRPL28Q13084 STEAP3-204ENST00000409811 2103 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
MRPL28Q13084 SORCS1-201ENST00000263054 7272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
MRPL28Q13084 GSPT2-201ENST00000340438 2802 ntAPPRIS P1 BASIC15.05■□□□□ -0
MRPL28Q13084 PDPK1-201ENST00000268673 4728 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
MRPL28Q13084 SMARCA2-214ENST00000450198 5602 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
MRPL28Q13084 CCAR2-202ENST00000389279 3980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
MRPL28Q13084 GUCD1-204ENST00000407471 3482 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
MRPL28Q13084 PABPC4-201ENST00000372856 3016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
MRPL28Q13084 CYP2S1-201ENST00000310054 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
MRPL28Q13084 HYAL1-201ENST00000266031 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
MRPL28Q13084 RNASE4-203ENST00000555835 2520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
MRPL28Q13084 C1R-202ENST00000536053 2347 ntTSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
MRPL28Q13084 AC136759.1-201ENST00000534201 2163 ntTSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
MRPL28Q13084 DZIP1L-204ENST00000469243 2107 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
MRPL28Q13084 GAD2-203ENST00000376261 5858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
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