Protein–RNA interactions for Protein: Q12996

CSTF3, Cleavage stimulation factor subunit 3, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 717 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CSTF3Q12996 KRTAP1-1-201ENST00000306271 903 ntAPPRIS P1 BASIC16.07■□□□□ 0.16
CSTF3Q12996 TMEM59-202ENST00000371337 600 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
CSTF3Q12996 CHCHD1-201ENST00000372833 835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
CSTF3Q12996 SLC2A8-201ENST00000373352 914 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
CSTF3Q12996 INIP-202ENST00000374236 874 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
CSTF3Q12996 UBE2C-206ENST00000405520 641 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
CSTF3Q12996 SLC9A3R1-202ENST00000413388 1285 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
CSTF3Q12996 HCG4-201ENST00000418983 998 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
CSTF3Q12996 WDR53-204ENST00000433160 887 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
CSTF3Q12996 C1orf109-203ENST00000464085 919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
CSTF3Q12996 NTMT1-207ENST00000482347 1072 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
CSTF3Q12996 EEF1E1-205ENST00000507463 654 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
CSTF3Q12996 IGHV3-65-201ENST00000523210 341 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
CSTF3Q12996 AC069287.3-201ENST00000527297 589 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
CSTF3Q12996 MRPL52-208ENST00000553711 586 ntTSL 3 BASIC16.07■□□□□ 0.16
CSTF3Q12996 CIPC-205ENST00000555437 566 ntTSL 3 BASIC16.07■□□□□ 0.16
CSTF3Q12996 AC087641.1-201ENST00000557561 1021 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
CSTF3Q12996 AL512357.1-201ENST00000557687 518 ntTSL 4 BASIC16.07■□□□□ 0.16
CSTF3Q12996 AC105339.3-201ENST00000560043 636 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
CSTF3Q12996 AC133919.2-201ENST00000565965 589 ntTSL 4 BASIC16.07■□□□□ 0.16
CSTF3Q12996 IFT20-215ENST00000585313 852 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC16.07■□□□□ 0.16
CSTF3Q12996 AC012615.3-201ENST00000592884 500 ntTSL 3 BASIC16.07■□□□□ 0.16
CSTF3Q12996 AL356488.2-201ENST00000602755 427 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
CSTF3Q12996 UBE2C-208ENST00000617055 705 ntTSL 3 BASIC16.07■□□□□ 0.16
CSTF3Q12996 AC244517.11-201ENST00000624192 573 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
CSTF3Q12996 CXorf40B-205ENST00000462691 1440 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC16.07■□□□□ 0.16
CSTF3Q12996 AC073957.2-201ENST00000549241 1562 ntTSL 4 BASIC16.07■□□□□ 0.16
CSTF3Q12996 LGALS12-201ENST00000255684 1667 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
CSTF3Q12996 CCDC183-201ENST00000338005 1671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
CSTF3Q12996 GNS-201ENST00000258145 5122 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
CSTF3Q12996 CDK2-204ENST00000553376 1725 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
CSTF3Q12996 FMO5-208ENST00000578284 1784 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
CSTF3Q12996 EIF2B4-212ENST00000622434 1771 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
CSTF3Q12996 LENG8-208ENST00000610347 5789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
CSTF3Q12996 POTEE-204ENST00000613282 1926 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
CSTF3Q12996 POTEI-202ENST00000615053 1926 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
CSTF3Q12996 TMEM25-202ENST00000354064 1965 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
CSTF3Q12996 AC009163.2-201ENST00000460606 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
CSTF3Q12996 CYP2R1-201ENST00000334636 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
CSTF3Q12996 C20orf166-AS1-201ENST00000412495 2302 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
CSTF3Q12996 SHANK3-201ENST00000262795 7091 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
CSTF3Q12996 IKBKE-204ENST00000584998 2487 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
CSTF3Q12996 ADAM11-203ENST00000535346 2529 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
CSTF3Q12996 TCF3-212ENST00000588136 2658 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
CSTF3Q12996 SLC45A1-202ENST00000471889 2784 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
CSTF3Q12996 TVP23B-202ENST00000476139 2989 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
CSTF3Q12996 SLC16A3-211ENST00000581287 4830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
CSTF3Q12996 OTUD3-201ENST00000375120 6397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
CSTF3Q12996 MAPT-201ENST00000262410 6762 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
CSTF3Q12996 MITF-204ENST00000352241 4814 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
CSTF3Q12996 MAN1C1-203ENST00000374332 4641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
CSTF3Q12996 MAN1C1-208ENST00000611903 4647 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
CSTF3Q12996 MIB2-217ENST00000504599 3311 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
CSTF3Q12996 FAM210B-201ENST00000371384 3046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
CSTF3Q12996 SQLE-201ENST00000265896 2961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
CSTF3Q12996 AL021453.1-201ENST00000333487 2989 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
CSTF3Q12996 RASGRP2-206ENST00000377494 2983 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
CSTF3Q12996 STKLD1-201ENST00000371957 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
CSTF3Q12996 PIAS3-201ENST00000369298 2761 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
CSTF3Q12996 COQ8A-202ENST00000366778 2743 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
CSTF3Q12996 U73166.1-201ENST00000439898 2625 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
CSTF3Q12996 SLC39A13-201ENST00000354884 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
CSTF3Q12996 PITPNM2-208ENST00000542749 6660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
CSTF3Q12996 ANTXRL-205ENST00000620264 2206 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
CSTF3Q12996 NEK2-202ENST00000366999 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
CSTF3Q12996 LYPD5-202ENST00000414615 2137 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
CSTF3Q12996 FOXN1-203ENST00000579795 2145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
CSTF3Q12996 AC026691.1-201ENST00000602502 2017 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
CSTF3Q12996 DYRK1B-205ENST00000597639 1806 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
CSTF3Q12996 BPTF-202ENST00000321892 11292 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
CSTF3Q12996 SPOCK1-202ENST00000394945 4846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
CSTF3Q12996 TGFBR2-201ENST00000295754 4621 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
CSTF3Q12996 DHRS1-201ENST00000288111 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
CSTF3Q12996 SH2B1-206ENST00000545570 1488 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
CSTF3Q12996 ZNF84-202ENST00000392319 7020 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
CSTF3Q12996 SDR39U1-206ENST00000553930 1325 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
CSTF3Q12996 RPS2P28-201ENST00000314255 741 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
CSTF3Q12996 C1orf226-202ENST00000426197 1049 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
CSTF3Q12996 KRT18P67-201ENST00000432816 1264 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
CSTF3Q12996 FAM197Y8-203ENST00000450145 560 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
CSTF3Q12996 AF186996.4-201ENST00000467186 377 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
CSTF3Q12996 AC106791.1-202ENST00000508281 1148 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
CSTF3Q12996 GOLGA7-203ENST00000518270 808 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
CSTF3Q12996 EEF1D-238ENST00000531621 840 ntTSL 3 BASIC16.06■□□□□ 0.16
CSTF3Q12996 RPS29-206ENST00000557111 488 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
CSTF3Q12996 PTPN21-201ENST00000328736 6089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
CSTF3Q12996 PANX2-201ENST00000159647 2964 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
CSTF3Q12996 ARHGEF6-202ENST00000370620 4764 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
CSTF3Q12996 COL4A3BP-204ENST00000405807 2843 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
CSTF3Q12996 TIGAR-201ENST00000179259 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
CSTF3Q12996 AL162727.3-201ENST00000635661 2787 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
CSTF3Q12996 CD276-213ENST00000561213 2690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
CSTF3Q12996 AL512625.1-201ENST00000305709 2541 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
CSTF3Q12996 F3-201ENST00000334047 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
CSTF3Q12996 SEPT8-204ENST00000378699 2289 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
CSTF3Q12996 TSHZ1-204ENST00000580243 3582 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
CSTF3Q12996 LINC00487-201ENST00000382045 2131 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
CSTF3Q12996 AL031731.1-201ENST00000642131 2094 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
CSTF3Q12996 KIAA1211-203ENST00000504228 4628 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
CSTF3Q12996 UCKL1-203ENST00000369908 1954 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
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