Protein–RNA interactions for Protein: Q12986

NFX1, Transcriptional repressor NF-X1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,120 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NFX1Q12986 B4GALT4-216ENST00000483209 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
NFX1Q12986 SFTPB-202ENST00000409383 1867 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
NFX1Q12986 RAB3IP-207ENST00000483530 1755 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
NFX1Q12986 CAMKV-217ENST00000620470 1485 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
NFX1Q12986 C11orf71-201ENST00000325636 652 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
NFX1Q12986 VMA21-202ENST00000370361 693 ntTSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
NFX1Q12986 CTRC-202ENST00000375949 898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
NFX1Q12986 C2orf88-205ENST00000443551 692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
NFX1Q12986 ZNF655-216ENST00000449244 544 ntTSL 4 BASIC18.23■□□□□ 0.51
NFX1Q12986 UCHL1-204ENST00000503431 917 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.23■□□□□ 0.51
NFX1Q12986 AC069120.2-201ENST00000524091 540 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
NFX1Q12986 ASXL1-206ENST00000542461 1068 ntTSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
NFX1Q12986 AC087386.1-201ENST00000553658 572 ntTSL 4 BASIC18.23■□□□□ 0.51
NFX1Q12986 AL133467.1-201ENST00000554161 993 ntTSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
NFX1Q12986 FOXO3-202ENST00000406360 7341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
NFX1Q12986 RIC8B-203ENST00000392839 2440 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
NFX1Q12986 HIBCH-201ENST00000359678 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
NFX1Q12986 ARID5A-203ENST00000454558 3079 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
NFX1Q12986 WRAP53-203ENST00000431639 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
NFX1Q12986 WRAP53-204ENST00000457584 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
NFX1Q12986 MAP3K6-201ENST00000357582 4136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
NFX1Q12986 ARPC5-201ENST00000294742 1637 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
NFX1Q12986 AC011676.5-201ENST00000624864 2660 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
NFX1Q12986 STARD3NL-204ENST00000434197 1341 ntTSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
NFX1Q12986 ZDHHC11-209ENST00000511539 1303 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
NFX1Q12986 ZDHHC11B-204ENST00000622126 1301 ntTSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
NFX1Q12986 MAP3K9-206ENST00000555993 4449 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
NFX1Q12986 PACSIN2-205ENST00000407585 3080 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
NFX1Q12986 CLCN2-204ENST00000434054 2897 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
NFX1Q12986 NOL4L-211ENST00000621426 6577 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
NFX1Q12986 KDM6A-213ENST00000611820 5924 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
NFX1Q12986 MAP3K8-207ENST00000542547 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
NFX1Q12986 RNF121-203ENST00000393713 2132 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
NFX1Q12986 CLN3-229ENST00000567963 1452 ntTSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
NFX1Q12986 EML3-201ENST00000278845 3017 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
NFX1Q12986 IL12RB1-201ENST00000322153 1902 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
NFX1Q12986 SLC3A2-201ENST00000338663 1904 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
NFX1Q12986 ARL13B-203ENST00000394222 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
NFX1Q12986 RHBDF1P1-201ENST00000427504 1941 ntBASIC18.22■□□□□ 0.51
NFX1Q12986 BATF2-202ENST00000435842 1949 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
NFX1Q12986 BCL2L12-203ENST00000441864 1371 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
NFX1Q12986 TM2D3-207ENST00000559107 1353 ntTSL 3 BASIC18.22■□□□□ 0.51
NFX1Q12986 SRP19-201ENST00000282999 937 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
NFX1Q12986 NQO2-203ENST00000380441 1021 ntTSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
NFX1Q12986 TNNT3-204ENST00000381558 1258 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
NFX1Q12986 U52111.1-201ENST00000434284 914 ntTSL 3 BASIC18.22■□□□□ 0.51
NFX1Q12986 RNASEH1-AS1-202ENST00000438436 1218 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
NFX1Q12986 NAGK-205ENST00000443938 1221 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
NFX1Q12986 AL512638.1-201ENST00000457493 794 ntBASIC18.22■□□□□ 0.51
NFX1Q12986 SSNA1-204ENST00000464553 723 ntTSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
NFX1Q12986 AC092691.1-201ENST00000484092 554 ntTSL 4 BASIC18.22■□□□□ 0.51
NFX1Q12986 TSC22D3-213ENST00000506081 956 ntTSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
NFX1Q12986 FBXO4-206ENST00000509134 1284 ntTSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
NFX1Q12986 TIMM13-202ENST00000591871 631 ntTSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
NFX1Q12986 FAM178B-204ENST00000490605 2710 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
NFX1Q12986 IGF2-204ENST00000381406 5179 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
NFX1Q12986 IGLON5-201ENST00000270642 2606 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
NFX1Q12986 ILVBL-209ENST00000534378 2067 ntTSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
NFX1Q12986 DNAH14-206ENST00000400952 1984 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
NFX1Q12986 RPAIN-203ENST00000381209 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
NFX1Q12986 SLC2A5-201ENST00000377414 2344 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
NFX1Q12986 NAPA-AS1-201ENST00000593284 1753 ntTSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
NFX1Q12986 TTLL10-201ENST00000379288 2114 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
NFX1Q12986 PTPRC-206ENST00000413409 1338 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
NFX1Q12986 GPR137-212ENST00000539851 1843 ntTSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
NFX1Q12986 SLC12A2-208ENST00000628403 3617 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
NFX1Q12986 FBXO4-202ENST00000296812 1731 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
NFX1Q12986 CACNA1A-201ENST00000360228 8627 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
NFX1Q12986 GALNT9-202ENST00000397325 1727 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
NFX1Q12986 SH2B1-216ENST00000618521 2935 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
NFX1Q12986 RAB8A-201ENST00000300935 2827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
NFX1Q12986 MMEL1-201ENST00000378412 2849 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
NFX1Q12986 SETD7-204ENST00000506866 1602 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
NFX1Q12986 LINC00895-201ENST00000629028 1637 ntBASIC18.21■□□□□ 0.51
NFX1Q12986 GHDC-202ENST00000414034 2496 ntTSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
NFX1Q12986 AGXT-201ENST00000307503 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
NFX1Q12986 ZNF623-201ENST00000458270 2733 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
NFX1Q12986 CCNL1-201ENST00000295925 549 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
NFX1Q12986 EIF5A-201ENST00000336452 1256 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
NFX1Q12986 ERAS-201ENST00000338270 1266 ntAPPRIS P1 BASIC18.21■□□□□ 0.51
NFX1Q12986 POP5-202ENST00000357500 801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
NFX1Q12986 AUNIP-201ENST00000374298 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
NFX1Q12986 TSPY16P-201ENST00000449843 468 ntBASIC18.21■□□□□ 0.51
NFX1Q12986 LINC01812-201ENST00000457448 725 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
NFX1Q12986 AC097493.3-201ENST00000509725 367 ntBASIC18.21■□□□□ 0.51
NFX1Q12986 Z97055.2-201ENST00000563715 859 ntTSL 3 BASIC18.21■□□□□ 0.51
NFX1Q12986 METTL23-202ENST00000586200 465 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
NFX1Q12986 METTL23-212ENST00000590964 1006 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
NFX1Q12986 TPBG-203ENST00000543496 2881 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
NFX1Q12986 DCLK2-204ENST00000506325 2298 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
NFX1Q12986 CCNA1-203ENST00000625767 1699 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
NFX1Q12986 ADARB1-204ENST00000389863 3563 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
NFX1Q12986 CLCN2-205ENST00000457512 2820 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
NFX1Q12986 MMP17-206ENST00000535291 2301 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
NFX1Q12986 IRF1-202ENST00000405885 2061 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
NFX1Q12986 TNK2-AS1-201ENST00000458180 2096 ntTSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
NFX1Q12986 ZFP91-201ENST00000316059 5220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
NFX1Q12986 OR2C3-203ENST00000617752 2481 ntAPPRIS P1 BASIC18.21■□□□□ 0.5
NFX1Q12986 CHST11-205ENST00000549260 5696 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.5
NFX1Q12986 THEM4-201ENST00000368814 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
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