Protein–RNA interactions for Protein: Q12840

KIF5A, Kinesin heavy chain isoform 5A, humanhuman

Predictions only

Length 1,032 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KIF5AQ12840 RN7SL850P-201ENST00000579959 291 ntBASIC17.87■□□□□ 0.45
KIF5AQ12840 AC002091.2-201ENST00000585297 402 ntTSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
KIF5AQ12840 AC016582.2-201ENST00000591908 446 ntTSL 3 BASIC17.87■□□□□ 0.45
KIF5AQ12840 NDUFA6-203ENST00000602404 1080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
KIF5AQ12840 RHOT1-203ENST00000358365 3297 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
KIF5AQ12840 TOR4A-201ENST00000357503 4148 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
KIF5AQ12840 CDIP1-209ENST00000567695 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
KIF5AQ12840 PBX3-204ENST00000373489 2775 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
KIF5AQ12840 COL4A3BP-204ENST00000405807 2843 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
KIF5AQ12840 FAM222B-202ENST00000452648 2836 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
KIF5AQ12840 AC092384.3-202ENST00000564646 2873 ntBASIC17.87■□□□□ 0.45
KIF5AQ12840 RTN4RL1-201ENST00000331238 3625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
KIF5AQ12840 PSMC5-202ENST00000375812 1494 ntTSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
KIF5AQ12840 CBX8-201ENST00000269385 3791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
KIF5AQ12840 KRT73-201ENST00000305748 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
KIF5AQ12840 LCAT-201ENST00000264005 1507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
KIF5AQ12840 RAB37-208ENST00000402449 1560 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
KIF5AQ12840 SUPT20HL2-201ENST00000486479 2409 ntBASIC17.87■□□□□ 0.45
KIF5AQ12840 LMNA-202ENST00000361308 1713 ntTSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
KIF5AQ12840 ISPD-201ENST00000399310 1709 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
KIF5AQ12840 BDP1-202ENST00000380675 2861 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
KIF5AQ12840 NFATC4-210ENST00000554050 3057 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
KIF5AQ12840 SLC25A48-203ENST00000425402 2062 ntTSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
KIF5AQ12840 PCDHA6-203ENST00000529310 5374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
KIF5AQ12840 AC012485.3-201ENST00000637634 2424 ntTSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
KIF5AQ12840 MBD4-203ENST00000429544 2478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
KIF5AQ12840 NOMO2-203ENST00000543392 3765 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
KIF5AQ12840 CST3-202ENST00000398409 832 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.86■□□□□ 0.45
KIF5AQ12840 AL109741.1-201ENST00000432195 403 ntTSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
KIF5AQ12840 DYNC1LI2-202ENST00000440564 1145 ntTSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
KIF5AQ12840 LINC00265-3P-201ENST00000447588 903 ntBASIC17.86■□□□□ 0.45
KIF5AQ12840 RBSN-204ENST00000449050 903 ntTSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
KIF5AQ12840 EIF5A2-203ENST00000474096 570 ntTSL 4 BASIC17.86■□□□□ 0.45
KIF5AQ12840 YKT6-207ENST00000496112 1270 ntTSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
KIF5AQ12840 MCRIP1-206ENST00000573478 1123 ntTSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
KIF5AQ12840 KRT8P39-201ENST00000396270 1433 ntBASIC17.86■□□□□ 0.45
KIF5AQ12840 USP4-201ENST00000265560 3126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
KIF5AQ12840 APP-204ENST00000357903 3543 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
KIF5AQ12840 HARS-203ENST00000431330 1774 ntTSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
KIF5AQ12840 CFAP45-201ENST00000368099 1842 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
KIF5AQ12840 NFAM1-201ENST00000329021 5602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
KIF5AQ12840 MGME1-202ENST00000377709 1936 ntTSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
KIF5AQ12840 MINDY1-202ENST00000361738 1961 ntTSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
KIF5AQ12840 AC104640.1-201ENST00000562617 2109 ntBASIC17.86■□□□□ 0.45
KIF5AQ12840 ATG9B-212ENST00000639579 4539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
KIF5AQ12840 SIGLEC10-201ENST00000339313 2256 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
KIF5AQ12840 HPN-201ENST00000262626 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
KIF5AQ12840 PDE1C-202ENST00000396182 2420 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
KIF5AQ12840 PRX-201ENST00000291825 5502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
KIF5AQ12840 ACSL3-201ENST00000357430 5679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
KIF5AQ12840 OTX1-201ENST00000282549 2861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
KIF5AQ12840 OTX1-202ENST00000366671 2861 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.85■□□□□ 0.45
KIF5AQ12840 NORAD-201ENST00000565493 5339 ntBASIC17.85■□□□□ 0.45
KIF5AQ12840 CACNG7-201ENST00000222212 1016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
KIF5AQ12840 KXD1-201ENST00000222307 1426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
KIF5AQ12840 PLPPR5-201ENST00000263177 3288 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
KIF5AQ12840 NPFFR2-202ENST00000344413 1234 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
KIF5AQ12840 CD5L-201ENST00000368174 2191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
KIF5AQ12840 SIKE1-203ENST00000369528 5506 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
KIF5AQ12840 AKIRIN1-201ENST00000372984 1330 ntTSL 2 BASIC17.85■□□□□ 0.45
KIF5AQ12840 ARHGEF1-204ENST00000378152 2986 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
KIF5AQ12840 SUV39H2-204ENST00000378325 1292 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
KIF5AQ12840 SUCLA2-201ENST00000378654 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
KIF5AQ12840 PSMC3IP-202ENST00000393795 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
KIF5AQ12840 NR4A1-204ENST00000394825 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
KIF5AQ12840 LONRF1-201ENST00000398246 3594 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
KIF5AQ12840 CGREF1-206ENST00000405600 1346 ntAPPRIS P2 TSL 4 BASIC17.85■□□□□ 0.45
KIF5AQ12840 GUCD1-204ENST00000407471 3482 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
KIF5AQ12840 TMEM213-202ENST00000413208 480 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.85■□□□□ 0.45
KIF5AQ12840 HAGLR-204ENST00000425005 623 ntTSL 3 BASIC17.85■□□□□ 0.45
KIF5AQ12840 NDUFA13-201ENST00000428459 576 ntTSL 2 BASIC17.85■□□□□ 0.45
KIF5AQ12840 HLA-DQB2-231ENST00000435145 2026 ntBASIC17.85■□□□□ 0.45
KIF5AQ12840 TRIM73-203ENST00000437796 1169 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
KIF5AQ12840 AP002383.4-201ENST00000442518 975 ntBASIC17.85■□□□□ 0.45
KIF5AQ12840 PRYP5-201ENST00000451909 266 ntBASIC17.85■□□□□ 0.45
KIF5AQ12840 RAB9A-202ENST00000464506 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
KIF5AQ12840 BCL11A-209ENST00000489516 1508 ntTSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
KIF5AQ12840 ATG13-216ENST00000530500 2030 ntTSL 2 BASIC17.85■□□□□ 0.45
KIF5AQ12840 CACNG5-202ENST00000533854 1311 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.85■□□□□ 0.45
KIF5AQ12840 CHMP1A-202ENST00000535997 2295 ntTSL 2 BASIC17.85■□□□□ 0.45
KIF5AQ12840 ZFAND6-207ENST00000558494 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
KIF5AQ12840 AC074051.2-201ENST00000565115 352 ntBASIC17.85■□□□□ 0.45
KIF5AQ12840 IFT20-215ENST00000585313 852 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC17.85■□□□□ 0.45
KIF5AQ12840 AP002414.4-201ENST00000589764 1148 ntBASIC17.85■□□□□ 0.45
KIF5AQ12840 GLG1-201ENST00000205061 8261 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
KIF5AQ12840 UNC13A-204ENST00000550896 5200 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
KIF5AQ12840 WDR81-202ENST00000409644 6733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
KIF5AQ12840 ARHGAP5-205ENST00000433497 3047 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
KIF5AQ12840 MFSD4B-201ENST00000368847 5958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
KIF5AQ12840 ALPL-204ENST00000374840 2589 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
KIF5AQ12840 LMF2-202ENST00000474879 2582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
KIF5AQ12840 HDAC5-202ENST00000336057 5040 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
KIF5AQ12840 FEN1-201ENST00000305885 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
KIF5AQ12840 FES-207ENST00000444422 2266 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
KIF5AQ12840 ATXN7-213ENST00000538065 6842 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
KIF5AQ12840 ADAM15-208ENST00000447332 2146 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
KIF5AQ12840 MYH14-204ENST00000440075 4247 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
KIF5AQ12840 CCDC116-203ENST00000607942 1913 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
KIF5AQ12840 AQP3-201ENST00000297991 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
KIF5AQ12840 GFAP-203ENST00000435360 1779 ntTSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 52.4 ms