Protein–RNA interactions for Protein: Q0VFZ6

CCDC173, Coiled-coil domain-containing protein 173, humanhuman

Predictions only

Length 552 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC173Q0VFZ6 ARPC1B-201ENST00000252725 1551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
CCDC173Q0VFZ6 HNRNPU-201ENST00000283179 3120 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.86■□□□□ 0.61
CCDC173Q0VFZ6 PARVB-210ENST00000619710 1530 ntTSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
CCDC173Q0VFZ6 RNFT2-203ENST00000392549 2896 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.86■□□□□ 0.61
CCDC173Q0VFZ6 CHRNB4-202ENST00000412074 1355 ntTSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
CCDC173Q0VFZ6 THEMIS2-202ENST00000373921 2687 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.86■□□□□ 0.61
CCDC173Q0VFZ6 WDR20-205ENST00000424963 2695 ntTSL 5 BASIC18.86■□□□□ 0.61
CCDC173Q0VFZ6 TRAPPC3-209ENST00000616395 1336 ntTSL 3 BASIC18.86■□□□□ 0.61
CCDC173Q0VFZ6 TRAPPC3-210ENST00000617904 1305 ntTSL 2 BASIC18.86■□□□□ 0.61
CCDC173Q0VFZ6 HBA1-201ENST00000320868 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
CCDC173Q0VFZ6 TNFSF13-208ENST00000483039 959 ntTSL 2 BASIC18.86■□□□□ 0.61
CCDC173Q0VFZ6 RBPMS-AS1-202ENST00000519753 1031 ntTSL 5 BASIC18.86■□□□□ 0.61
CCDC173Q0VFZ6 NDUFS3-213ENST00000534716 1263 ntTSL 2 BASIC18.86■□□□□ 0.61
CCDC173Q0VFZ6 AC006011.2-201ENST00000621313 1158 ntBASIC18.86■□□□□ 0.61
CCDC173Q0VFZ6 SCPEP1-216ENST00000631024 444 ntTSL 5 BASIC18.86■□□□□ 0.61
CCDC173Q0VFZ6 MAP2K3-202ENST00000342679 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
CCDC173Q0VFZ6 PCDHA6-203ENST00000529310 5374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
CCDC173Q0VFZ6 UBE2J1-201ENST00000435041 4290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
CCDC173Q0VFZ6 B4GALNT1-201ENST00000341156 3036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
CCDC173Q0VFZ6 DDOST-206ENST00000602624 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
CCDC173Q0VFZ6 NRIP1-203ENST00000400202 7671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.86■□□□□ 0.61
CCDC173Q0VFZ6 ALDH3A2-221ENST00000581518 2785 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.86■□□□□ 0.61
CCDC173Q0VFZ6 ASXL1-210ENST00000613218 7038 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.86■□□□□ 0.61
CCDC173Q0VFZ6 ZNF497-201ENST00000311044 3468 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.86■□□□□ 0.61
CCDC173Q0VFZ6 RUSC1-214ENST00000490373 1700 ntTSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
CCDC173Q0VFZ6 PTPRH-201ENST00000263434 3343 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
CCDC173Q0VFZ6 CTNS-202ENST00000381870 2470 ntTSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
CCDC173Q0VFZ6 P2RX5-209ENST00000552276 1642 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.85■□□□□ 0.61
CCDC173Q0VFZ6 PDXP-202ENST00000403251 1571 ntTSL 2 BASIC18.85■□□□□ 0.61
CCDC173Q0VFZ6 AC010460.3-201ENST00000511359 1579 ntBASIC18.85■□□□□ 0.61
CCDC173Q0VFZ6 ARHGEF16-203ENST00000378378 3061 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.85■□□□□ 0.61
CCDC173Q0VFZ6 TAF6-209ENST00000452041 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
CCDC173Q0VFZ6 CLEC18A-201ENST00000288040 2155 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
CCDC173Q0VFZ6 PRRT2-214ENST00000637064 2153 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.85■□□□□ 0.61
CCDC173Q0VFZ6 NDRG2-211ENST00000397858 2054 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.85■□□□□ 0.61
CCDC173Q0VFZ6 TTLL13P-202ENST00000438251 2738 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC18.85■□□□□ 0.61
CCDC173Q0VFZ6 TMEM50A-201ENST00000374358 2683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
CCDC173Q0VFZ6 MAX-204ENST00000358402 1973 ntTSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
CCDC173Q0VFZ6 ZFP41-203ENST00000520584 3284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
CCDC173Q0VFZ6 KRT15-201ENST00000254043 5237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
CCDC173Q0VFZ6 FUT5-201ENST00000252675 1916 ntAPPRIS P1 BASIC18.85■□□□□ 0.61
CCDC173Q0VFZ6 ELANE-201ENST00000263621 920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
CCDC173Q0VFZ6 POMZP3-201ENST00000275569 1259 ntTSL 2 BASIC18.85■□□□□ 0.61
CCDC173Q0VFZ6 ZNF584-202ENST00000322834 1042 ntTSL 2 BASIC18.85■□□□□ 0.61
CCDC173Q0VFZ6 WNT7B-203ENST00000410058 714 ntTSL 3 BASIC18.85■□□□□ 0.61
CCDC173Q0VFZ6 TSPY12P-201ENST00000421279 868 ntBASIC18.85■□□□□ 0.61
CCDC173Q0VFZ6 NT5C2-211ENST00000470299 249 ntTSL 5 BASIC18.85■□□□□ 0.61
CCDC173Q0VFZ6 NEURL1B-202ENST00000520919 1089 ntTSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
CCDC173Q0VFZ6 AC132938.3-201ENST00000579095 357 ntTSL 2 BASIC18.85■□□□□ 0.61
CCDC173Q0VFZ6 CENPX-206ENST00000580435 710 ntTSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
CCDC173Q0VFZ6 METTL23-204ENST00000586752 904 ntTSL 2 BASIC18.85■□□□□ 0.61
CCDC173Q0VFZ6 AL121894.2-201ENST00000602977 491 ntBASIC18.85■□□□□ 0.61
CCDC173Q0VFZ6 ELL-203ENST00000596124 1852 ntTSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
CCDC173Q0VFZ6 MEIS3-206ENST00000559524 1828 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.85■□□□□ 0.61
CCDC173Q0VFZ6 BANP-203ENST00000393207 2438 ntTSL 2 BASIC18.85■□□□□ 0.61
CCDC173Q0VFZ6 RAB3IP-207ENST00000483530 1755 ntTSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
CCDC173Q0VFZ6 ZNF804B-201ENST00000333190 4659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
CCDC173Q0VFZ6 PCED1B-202ENST00000546455 2328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
CCDC173Q0VFZ6 PDE9A-203ENST00000335440 1728 ntTSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
CCDC173Q0VFZ6 TUBGCP2-204ENST00000417178 4029 ntTSL 2 BASIC18.85■□□□□ 0.61
CCDC173Q0VFZ6 TDRD6-201ENST00000316081 6817 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
CCDC173Q0VFZ6 RNF32-202ENST00000317955 1682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
CCDC173Q0VFZ6 TRMT44-205ENST00000513449 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
CCDC173Q0VFZ6 NFIX-210ENST00000588228 1692 ntTSL 2 BASIC18.85■□□□□ 0.61
CCDC173Q0VFZ6 OR4D1-202ENST00000641449 4925 ntAPPRIS P1 BASIC18.85■□□□□ 0.61
CCDC173Q0VFZ6 HOXB4-201ENST00000332503 3757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
CCDC173Q0VFZ6 ARHGAP39-201ENST00000276826 4697 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.85■□□□□ 0.61
CCDC173Q0VFZ6 AP001922.1-201ENST00000499390 1504 ntTSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
CCDC173Q0VFZ6 FUT8-AS1-201ENST00000621019 1521 ntBASIC18.84■□□□□ 0.61
CCDC173Q0VFZ6 CDH16-207ENST00000568632 2526 ntTSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
CCDC173Q0VFZ6 LARP6-201ENST00000299213 4469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
CCDC173Q0VFZ6 FMNL1-206ENST00000587489 2487 ntTSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
CCDC173Q0VFZ6 CLEC18C-203ENST00000541793 1955 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
CCDC173Q0VFZ6 CLEC18C-210ENST00000569347 1970 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
CCDC173Q0VFZ6 FZR1-202ENST00000395095 1491 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
CCDC173Q0VFZ6 B3GLCT-201ENST00000343307 4254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
CCDC173Q0VFZ6 RIMS3-201ENST00000372683 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
CCDC173Q0VFZ6 GYG1-201ENST00000296048 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
CCDC173Q0VFZ6 AC136621.1-201ENST00000624017 2304 ntBASIC18.84■□□□□ 0.61
CCDC173Q0VFZ6 ASIC4-202ENST00000358078 2741 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.84■□□□□ 0.61
CCDC173Q0VFZ6 MVB12B-201ENST00000361171 4819 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.84■□□□□ 0.61
CCDC173Q0VFZ6 DNAJC4-201ENST00000321460 1015 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
CCDC173Q0VFZ6 CCDC107-201ENST00000327351 804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
CCDC173Q0VFZ6 AL445645.1-201ENST00000451318 1019 ntTSL 2 BASIC18.84■□□□□ 0.61
CCDC173Q0VFZ6 TMEM218-206ENST00000527766 812 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.84■□□□□ 0.61
CCDC173Q0VFZ6 METRN-205ENST00000568415 612 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.84■□□□□ 0.61
CCDC173Q0VFZ6 AC012645.3-201ENST00000568506 470 ntTSL 3 BASIC18.84■□□□□ 0.61
CCDC173Q0VFZ6 RPARP-AS1-206ENST00000596366 631 ntTSL 3 BASIC18.84■□□□□ 0.61
CCDC173Q0VFZ6 AC024563.2-201ENST00000603282 481 ntBASIC18.84■□□□□ 0.61
CCDC173Q0VFZ6 AL358472.4-201ENST00000633140 710 ntBASIC18.84■□□□□ 0.61
CCDC173Q0VFZ6 DIAPH2-204ENST00000373054 3376 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.84■□□□□ 0.61
CCDC173Q0VFZ6 NDRG2-206ENST00000397844 2096 ntTSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
CCDC173Q0VFZ6 AC097637.2-201ENST00000624096 1997 ntBASIC18.84■□□□□ 0.61
CCDC173Q0VFZ6 CPD-201ENST00000225719 9394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
CCDC173Q0VFZ6 AC138904.3-201ENST00000635780 2681 ntTSL 5 BASIC18.84■□□□□ 0.61
CCDC173Q0VFZ6 EYA2-201ENST00000317304 1540 ntTSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
CCDC173Q0VFZ6 SCAP-215ENST00000545718 2950 ntTSL 5 BASIC18.84■□□□□ 0.61
CCDC173Q0VFZ6 ALDOA-226ENST00000569798 1499 ntTSL 2 BASIC18.84■□□□□ 0.61
CCDC173Q0VFZ6 EVPL-201ENST00000301607 6614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
CCDC173Q0VFZ6 FUT3-209ENST00000589918 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.61
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34.2 ms