Protein–RNA interactions for Protein: Q0VD83

APOBR, Apolipoprotein B receptor, humanhuman

Predictions only

Length 1,088 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
APOBRQ0VD83 HEBP2-204ENST00000607197 10014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
APOBRQ0VD83 TLE2-202ENST00000426948 2406 ntTSL 5 BASIC19.51■□□□□ 0.71
APOBRQ0VD83 ZDHHC13-202ENST00000446113 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
APOBRQ0VD83 TMEM198B-203ENST00000482378 2230 ntTSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
APOBRQ0VD83 FSTL3-206ENST00000592947 2144 ntTSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
APOBRQ0VD83 GPS1-202ENST00000320548 1949 ntTSL 2 BASIC19.51■□□□□ 0.71
APOBRQ0VD83 ANAPC13-206ENST00000514612 1420 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.51■□□□□ 0.71
APOBRQ0VD83 SYBU-230ENST00000532779 2765 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.5■□□□□ 0.71
APOBRQ0VD83 SYVN1-202ENST00000307289 2841 ntTSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
APOBRQ0VD83 PSMA8-202ENST00000343848 1675 ntTSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
APOBRQ0VD83 KRT35-202ENST00000393989 1670 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.5■□□□□ 0.71
APOBRQ0VD83 CHST11-205ENST00000549260 5696 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
APOBRQ0VD83 DNM2-202ENST00000359692 3588 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
APOBRQ0VD83 CEP72-201ENST00000264935 2434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
APOBRQ0VD83 AC104809.1-201ENST00000425110 2345 ntTSL 2 BASIC19.5■□□□□ 0.71
APOBRQ0VD83 PPP1R3E-201ENST00000452015 4773 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.5■□□□□ 0.71
APOBRQ0VD83 THAP3-202ENST00000307896 1046 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.5■□□□□ 0.71
APOBRQ0VD83 VSTM1-201ENST00000338372 1023 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
APOBRQ0VD83 ANAPC11-201ENST00000344877 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
APOBRQ0VD83 GBGT1-201ENST00000372036 871 ntTSL 3 BASIC19.5■□□□□ 0.71
APOBRQ0VD83 REEP2-206ENST00000506158 1021 ntTSL 2 BASIC19.5■□□□□ 0.71
APOBRQ0VD83 AF131215.3-201ENST00000532453 639 ntTSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
APOBRQ0VD83 NR2C2AP-204ENST00000538165 891 ntTSL 2 BASIC19.5■□□□□ 0.71
APOBRQ0VD83 ANAPC11-213ENST00000577747 672 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.5■□□□□ 0.71
APOBRQ0VD83 TMEM220-AS1-206ENST00000583343 876 ntTSL 3 BASIC19.5■□□□□ 0.71
APOBRQ0VD83 AC007064.4-201ENST00000637740 555 ntBASIC19.5■□□□□ 0.71
APOBRQ0VD83 AC092865.6-201ENST00000642101 219 ntBASIC19.5■□□□□ 0.71
APOBRQ0VD83 RNF19A-201ENST00000341084 4285 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.5■□□□□ 0.71
APOBRQ0VD83 SLC27A5-201ENST00000263093 2361 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
APOBRQ0VD83 CHAT-203ENST00000351556 2286 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.5■□□□□ 0.71
APOBRQ0VD83 GCK-209ENST00000616242 2260 ntTSL 5 BASIC19.5■□□□□ 0.71
APOBRQ0VD83 AC092919.2-201ENST00000623631 1645 ntBASIC19.5■□□□□ 0.71
APOBRQ0VD83 CLUH-201ENST00000435359 5224 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.5■□□□□ 0.71
APOBRQ0VD83 SLC25A35-205ENST00000580340 1541 ntTSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
APOBRQ0VD83 NPM2-203ENST00000397940 1874 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC19.5■□□□□ 0.71
APOBRQ0VD83 ZDHHC4-206ENST00000405731 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
APOBRQ0VD83 CACNA1A-215ENST00000635727 7536 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.5■□□□□ 0.71
APOBRQ0VD83 NIM1K-201ENST00000326035 2313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
APOBRQ0VD83 EIF2B4-212ENST00000622434 1771 ntTSL 5 BASIC19.49■□□□□ 0.71
APOBRQ0VD83 IRF5-215ENST00000619830 1652 ntTSL 2 BASIC19.49■□□□□ 0.71
APOBRQ0VD83 CSAD-208ENST00000444623 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
APOBRQ0VD83 DVL1-202ENST00000378891 2926 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
APOBRQ0VD83 CD72-204ENST00000396757 2035 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.49■□□□□ 0.71
APOBRQ0VD83 EPHA10-203ENST00000427468 3167 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.49■□□□□ 0.71
APOBRQ0VD83 PCDHGA11-202ENST00000518882 2263 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
APOBRQ0VD83 CARD14-202ENST00000570421 2607 ntTSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
APOBRQ0VD83 KCNK3-201ENST00000302909 6162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
APOBRQ0VD83 SLC25A45-201ENST00000294187 2196 ntTSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
APOBRQ0VD83 TRIM9-202ENST00000338969 3312 ntTSL 2 BASIC19.49■□□□□ 0.71
APOBRQ0VD83 XRCC3-209ENST00000554913 2539 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.49■□□□□ 0.71
APOBRQ0VD83 WDR45-239ENST00000634944 1745 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.49■□□□□ 0.71
APOBRQ0VD83 NCAPD2-201ENST00000315579 5548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
APOBRQ0VD83 HNRNPF-204ENST00000443950 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
APOBRQ0VD83 RPLP2-201ENST00000321153 781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
APOBRQ0VD83 BEX3-201ENST00000361298 921 ntTSL 2 BASIC19.49■□□□□ 0.71
APOBRQ0VD83 MRPL9-202ENST00000368830 1296 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
APOBRQ0VD83 SGO2-202ENST00000409203 1041 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
APOBRQ0VD83 MED15P5-201ENST00000423150 992 ntBASIC19.49■□□□□ 0.71
APOBRQ0VD83 AL359915.2-201ENST00000425884 745 ntTSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
APOBRQ0VD83 AC139530.3-201ENST00000620344 690 ntBASIC19.49■□□□□ 0.71
APOBRQ0VD83 AC087645.4-201ENST00000638890 792 ntTSL 5 BASIC19.49■□□□□ 0.71
APOBRQ0VD83 RGL2-247ENST00000497454 3278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
APOBRQ0VD83 CXXC1-201ENST00000285106 2936 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
APOBRQ0VD83 TXNDC2-201ENST00000306084 1873 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
APOBRQ0VD83 SH3BP5-202ENST00000383791 2822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
APOBRQ0VD83 GLOD4-203ENST00000536578 2497 ntTSL 5 BASIC19.49■□□□□ 0.71
APOBRQ0VD83 ATP6V1E1-201ENST00000253413 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
APOBRQ0VD83 KCNQ2-213ENST00000626839 9213 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
APOBRQ0VD83 SLC22A1-202ENST00000366963 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
APOBRQ0VD83 OSGIN1-203ENST00000393306 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
APOBRQ0VD83 CCDC116-203ENST00000607942 1913 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.49■□□□□ 0.71
APOBRQ0VD83 CLN3-216ENST00000565316 1318 ntTSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
APOBRQ0VD83 RAB35-201ENST00000229340 2945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
APOBRQ0VD83 SCRIB-203ENST00000377533 5108 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
APOBRQ0VD83 MYO1B-202ENST00000339514 5026 ntTSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
APOBRQ0VD83 MFSD11-202ENST00000355954 2832 ntTSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
APOBRQ0VD83 SPSB2-203ENST00000519357 1496 ntTSL 2 BASIC19.48■□□□□ 0.71
APOBRQ0VD83 TAP2-202ENST00000374899 2497 ntTSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
APOBRQ0VD83 TMEM132E-201ENST00000321639 5631 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.48■□□□□ 0.71
APOBRQ0VD83 C1orf43-201ENST00000350592 1610 ntTSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
APOBRQ0VD83 ST3GAL6-214ENST00000483910 1886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
APOBRQ0VD83 CYP2T1P-202ENST00000641596 2535 ntBASIC19.48■□□□□ 0.71
APOBRQ0VD83 TRABD-202ENST00000380909 2272 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.48■□□□□ 0.71
APOBRQ0VD83 SNAI2-201ENST00000020945 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
APOBRQ0VD83 KIF25-202ENST00000354419 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
APOBRQ0VD83 NPB-201ENST00000333383 704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
APOBRQ0VD83 CD99L2-202ENST00000355149 1278 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
APOBRQ0VD83 EFCAB1-209ENST00000523092 648 ntTSL 2 BASIC19.48■□□□□ 0.71
APOBRQ0VD83 BLOC1S1-201ENST00000547076 837 ntTSL 2 BASIC19.48■□□□□ 0.71
APOBRQ0VD83 L2HGDH-205ENST00000555423 841 ntTSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
APOBRQ0VD83 COQ7-208ENST00000568985 714 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.48■□□□□ 0.71
APOBRQ0VD83 CD7-202ENST00000578509 925 ntTSL 3 BASIC19.48■□□□□ 0.71
APOBRQ0VD83 MED16-214ENST00000617672 554 ntTSL 5 BASIC19.48■□□□□ 0.71
APOBRQ0VD83 MARCH1-203ENST00000503008 5877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
APOBRQ0VD83 SLC6A9-204ENST00000372307 2162 ntTSL 2 BASIC19.48■□□□□ 0.71
APOBRQ0VD83 MPP1-205ENST00000413259 2195 ntTSL 2 BASIC19.48■□□□□ 0.71
APOBRQ0VD83 RALYL-208ENST00000522455 2168 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.48■□□□□ 0.71
APOBRQ0VD83 LHCGR-203ENST00000403273 1921 ntTSL 5 BASIC19.48■□□□□ 0.71
APOBRQ0VD83 TRAK1-209ENST00000487159 5536 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.48■□□□□ 0.71
APOBRQ0VD83 ABHD10-201ENST00000273359 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 52.4 ms