Protein–RNA interactions for Protein: Q09472

EP300, Histone acetyltransferase p300, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 2,414 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EP300Q09472 MAPRE1-201ENST00000375571 2623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
EP300Q09472 ZNF398-202ENST00000475153 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
EP300Q09472 LINC00905-202ENST00000588117 1768 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
EP300Q09472 MATK-203ENST00000395045 2073 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
EP300Q09472 CTTN-203ENST00000376561 2247 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
EP300Q09472 PCID2-203ENST00000375457 2372 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
EP300Q09472 KSR1-205ENST00000509603 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
EP300Q09472 ARL16-201ENST00000397498 1227 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
EP300Q09472 C1orf210-201ENST00000423420 629 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.96■□□□□ 0.15
EP300Q09472 AC073133.1-201ENST00000426187 432 ntTSL 3 BASIC15.96■□□□□ 0.15
EP300Q09472 AC026954.1-201ENST00000429771 1293 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
EP300Q09472 FTLP1-201ENST00000449155 526 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
EP300Q09472 TMEM97-205ENST00000583381 578 ntTSL 4 BASIC15.96■□□□□ 0.15
EP300Q09472 AC020765.3-201ENST00000613051 740 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
EP300Q09472 C9orf50-202ENST00000619117 796 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
EP300Q09472 ARL16-214ENST00000621051 1181 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
EP300Q09472 LINC00592-202ENST00000640420 768 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
EP300Q09472 NFIC-210ENST00000590282 1558 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.14
EP300Q09472 DRG1-201ENST00000331457 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
EP300Q09472 MAEA-201ENST00000264750 2058 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.14
EP300Q09472 ZFP64-206ENST00000371523 2234 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.14
EP300Q09472 TMEM259-209ENST00000592590 2509 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.14
EP300Q09472 PTRH1-204ENST00000419060 2692 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.14
EP300Q09472 LEMD2-201ENST00000293760 2958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
EP300Q09472 ANKRD17-211ENST00000639793 3486 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.14
EP300Q09472 DUSP18-206ENST00000407308 1978 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
EP300Q09472 SLC35A3-205ENST00000465289 5696 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
EP300Q09472 PSRC1-205ENST00000409138 1826 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
EP300Q09472 MLKL-201ENST00000306247 1781 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
EP300Q09472 NUDT4-202ENST00000415493 4839 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
EP300Q09472 CDIPT-209ENST00000569956 1532 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
EP300Q09472 FDPS-201ENST00000356657 1478 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
EP300Q09472 OTUD5-204ENST00000428668 1493 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
EP300Q09472 FAM169B-201ENST00000332908 579 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
EP300Q09472 CPLX2-202ENST00000393745 826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
EP300Q09472 RPL17P11-201ENST00000417593 544 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
EP300Q09472 AC016723.1-201ENST00000430546 633 ntTSL 3 BASIC15.95■□□□□ 0.14
EP300Q09472 AL355864.2-201ENST00000447420 863 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
EP300Q09472 LYRM9-204ENST00000503642 432 ntTSL 3 BASIC15.95■□□□□ 0.14
EP300Q09472 EIF3M-203ENST00000524896 1207 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
EP300Q09472 KLK15-203ENST00000596931 692 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
EP300Q09472 IFITM3-204ENST00000602735 713 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
EP300Q09472 AC128714.1-201ENST00000637035 887 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
EP300Q09472 IL32-201ENST00000008180 1056 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
EP300Q09472 PRSS12-201ENST00000296498 4809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
EP300Q09472 PPP1R18-201ENST00000274853 4599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
EP300Q09472 PPP1R18-205ENST00000615527 4597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
EP300Q09472 RAB39A-201ENST00000320578 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
EP300Q09472 ARFRP1-212ENST00000618838 1623 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
EP300Q09472 MBD1-207ENST00000398488 1512 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
EP300Q09472 WHAMMP3-203ENST00000621139 4494 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
EP300Q09472 CHMP5-201ENST00000223500 1477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
EP300Q09472 EEPD1-201ENST00000242108 4765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
EP300Q09472 NPPC-201ENST00000295440 500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
EP300Q09472 ACTG1P3-201ENST00000431775 1114 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
EP300Q09472 DMKN-216ENST00000458071 510 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.95■□□□□ 0.14
EP300Q09472 CENPBD1P1-203ENST00000479047 569 ntTSL 3 BASIC15.95■□□□□ 0.14
EP300Q09472 TSACC-208ENST00000481479 741 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
EP300Q09472 SPDYE16-201ENST00000515340 858 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
EP300Q09472 ADM-202ENST00000524948 584 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
EP300Q09472 RAB40B-202ENST00000538809 704 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
EP300Q09472 AC013565.3-201ENST00000565547 450 ntTSL 3 BASIC15.95■□□□□ 0.14
EP300Q09472 ZNF790-AS1-204ENST00000589556 650 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
EP300Q09472 AC026979.3-201ENST00000607315 403 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
EP300Q09472 FHL2-212ENST00000607522 759 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
EP300Q09472 FP565260.5-201ENST00000623188 479 ntTSL 3 BASIC15.95■□□□□ 0.14
EP300Q09472 CMPK2-201ENST00000256722 2884 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
EP300Q09472 TRPC1-201ENST00000273482 4324 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
EP300Q09472 YTHDC2-207ENST00000515883 2629 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
EP300Q09472 LGI3-201ENST00000306317 3272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
EP300Q09472 SPTBN4-207ENST00000595535 6105 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
EP300Q09472 MIB2-231ENST00000518681 3116 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
EP300Q09472 ETNK2-202ENST00000367201 2431 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
EP300Q09472 CPSF4-201ENST00000292476 1691 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
EP300Q09472 NRG2-202ENST00000289422 2923 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
EP300Q09472 SPAG16-204ENST00000413312 2258 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
EP300Q09472 SMIM10-201ENST00000330288 1536 ntAPPRIS P1 BASIC15.94■□□□□ 0.14
EP300Q09472 TPRA1-204ENST00000450633 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
EP300Q09472 CAPN5-205ENST00000529629 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
EP300Q09472 TMEM256-201ENST00000302422 486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
EP300Q09472 ATP5D-202ENST00000395633 704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
EP300Q09472 AQP8-202ENST00000566125 1276 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
EP300Q09472 Metazoa_SRP.69-201ENST00000615730 281 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
EP300Q09472 AC008687.7-202ENST00000637404 953 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
EP300Q09472 LRRC45-201ENST00000306688 2701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
EP300Q09472 FGFR1-238ENST00000532791 5590 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
EP300Q09472 AC104581.1-202ENST00000635932 2618 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
EP300Q09472 PRSS23-201ENST00000280258 4015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
EP300Q09472 PAX1-205ENST00000613128 5352 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
EP300Q09472 WLS-202ENST00000354777 2037 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
EP300Q09472 NCAPH2-205ENST00000420993 2037 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
EP300Q09472 POLR3E-209ENST00000564209 2464 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
EP300Q09472 FRMD8P1-201ENST00000440433 1524 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
EP300Q09472 TSPAN7-202ENST00000378482 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
EP300Q09472 CLDN7-203ENST00000538261 1923 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
EP300Q09472 KRT8P37-201ENST00000451609 1420 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
EP300Q09472 TOP3BP1-201ENST00000420768 1380 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
EP300Q09472 DUSP13-208ENST00000478873 1335 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
EP300Q09472 GLCCI1-201ENST00000223145 4743 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
EP300Q09472 FANK1-204ENST00000368695 1296 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30 ms