Protein–RNA interactions for Protein: Q08170

SRSF4, Serine/arginine-rich splicing factor 4, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 494 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SRSF4Q08170 BORCS8-206ENST00000585679 801 ntTSL 3 BASIC14.12□□□□□ -0.15
SRSF4Q08170 AC140113.2-201ENST00000604370 208 ntBASIC14.12□□□□□ -0.15
SRSF4Q08170 AL139424.1-201ENST00000607572 797 ntBASIC14.12□□□□□ -0.15
SRSF4Q08170 ANKMY2-206ENST00000628652 1270 ntTSL 5 BASIC14.12□□□□□ -0.15
SRSF4Q08170 IPMK-201ENST00000373935 6133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
SRSF4Q08170 MELTF-201ENST00000296350 3963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
SRSF4Q08170 TBRG4-203ENST00000395655 2225 ntTSL 2 BASIC14.12□□□□□ -0.15
SRSF4Q08170 POC1B-202ENST00000393179 3096 ntTSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
SRSF4Q08170 CYP51A1-201ENST00000003100 3210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
SRSF4Q08170 TBC1D20-201ENST00000354200 4466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
SRSF4Q08170 SLC6A2-204ENST00000561820 2268 ntTSL 5 BASIC14.12□□□□□ -0.15
SRSF4Q08170 RELT-201ENST00000064780 3535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
SRSF4Q08170 UNC13A-206ENST00000552293 5314 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.12□□□□□ -0.15
SRSF4Q08170 RUSC1-205ENST00000368354 3114 ntTSL 2 BASIC14.12□□□□□ -0.15
SRSF4Q08170 TLL1-204ENST00000507499 4818 ntTSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
SRSF4Q08170 KDM6A-212ENST00000543216 5655 ntTSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
SRSF4Q08170 CSNK2A1-203ENST00000400217 1451 ntTSL 2 BASIC14.12□□□□□ -0.15
SRSF4Q08170 KDM4B-201ENST00000159111 5593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
SRSF4Q08170 PC-208ENST00000529047 1607 ntTSL 3 BASIC14.12□□□□□ -0.15
SRSF4Q08170 SNTB1-201ENST00000395601 5164 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.11□□□□□ -0.15
SRSF4Q08170 MASTL-203ENST00000375946 3623 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.11□□□□□ -0.15
SRSF4Q08170 DMTN-202ENST00000358242 2772 ntTSL 5 BASIC14.11□□□□□ -0.15
SRSF4Q08170 JPH2-202ENST00000372980 4787 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.11□□□□□ -0.15
SRSF4Q08170 CLK2-202ENST00000361168 1934 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.11□□□□□ -0.15
SRSF4Q08170 AC073324.2-201ENST00000626532 2941 ntTSL 4 BASIC14.11□□□□□ -0.15
SRSF4Q08170 ARHGAP39-202ENST00000377307 4673 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.11□□□□□ -0.15
SRSF4Q08170 COL4A2-201ENST00000360467 6281 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.11□□□□□ -0.15
SRSF4Q08170 BEGAIN-201ENST00000355173 2674 ntTSL 1 (best) BASIC14.11□□□□□ -0.15
SRSF4Q08170 SURF4-202ENST00000371989 2984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.11□□□□□ -0.15
SRSF4Q08170 SREK1-216ENST00000612404 2128 ntTSL 1 (best) BASIC14.11□□□□□ -0.15
SRSF4Q08170 SMAP1-201ENST00000316999 2403 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.11□□□□□ -0.15
SRSF4Q08170 ANKRD23-201ENST00000318357 2597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.11□□□□□ -0.15
SRSF4Q08170 CNOT10-202ENST00000331889 2573 ntTSL 1 (best) BASIC14.11□□□□□ -0.15
SRSF4Q08170 KIFC3-206ENST00000541240 3047 ntTSL 2 BASIC14.11□□□□□ -0.15
SRSF4Q08170 DLC1-203ENST00000358919 4392 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.11□□□□□ -0.15
SRSF4Q08170 DHDH-201ENST00000221403 1081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.11□□□□□ -0.15
SRSF4Q08170 HSPB1-201ENST00000248553 909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.11□□□□□ -0.15
SRSF4Q08170 SNX31-201ENST00000311812 2457 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.11□□□□□ -0.15
SRSF4Q08170 FTMT-201ENST00000321339 879 ntAPPRIS P1 BASIC14.11□□□□□ -0.15
SRSF4Q08170 BOLA1-202ENST00000369152 859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.11□□□□□ -0.15
SRSF4Q08170 SLFNL1-203ENST00000372611 1865 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.11□□□□□ -0.15
SRSF4Q08170 TEX30-206ENST00000376032 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.11□□□□□ -0.15
SRSF4Q08170 FAM99B-201ENST00000382166 1067 ntTSL 5 BASIC14.11□□□□□ -0.15
SRSF4Q08170 SH3BP4-202ENST00000392011 5194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.11□□□□□ -0.15
SRSF4Q08170 AC073347.1-201ENST00000421633 2643 ntBASIC14.11□□□□□ -0.15
SRSF4Q08170 SYBU-205ENST00000422135 3226 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.11□□□□□ -0.15
SRSF4Q08170 C11orf74-203ENST00000446510 1062 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.11□□□□□ -0.15
SRSF4Q08170 SPINT1-AS1-203ENST00000565315 629 ntTSL 2 BASIC14.11□□□□□ -0.15
SRSF4Q08170 GZMM-202ENST00000592501 941 ntTSL 3 BASIC14.11□□□□□ -0.15
SRSF4Q08170 C1QL3-202ENST00000619991 783 ntTSL 1 (best) BASIC14.11□□□□□ -0.15
SRSF4Q08170 HOXD3-202ENST00000410016 2384 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.11□□□□□ -0.15
SRSF4Q08170 AP005117.1-202ENST00000581724 1908 ntBASIC14.11□□□□□ -0.15
SRSF4Q08170 RFWD2-204ENST00000367669 3033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.11□□□□□ -0.15
SRSF4Q08170 TUBB8P12-201ENST00000308911 1335 ntBASIC14.11□□□□□ -0.15
SRSF4Q08170 TUBB7P-202ENST00000428444 1305 ntBASIC14.11□□□□□ -0.15
SRSF4Q08170 TUBB8P7-204ENST00000567960 1332 ntBASIC14.11□□□□□ -0.15
SRSF4Q08170 ST14-201ENST00000278742 3539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.11□□□□□ -0.15
SRSF4Q08170 JMY-201ENST00000396137 9042 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.11□□□□□ -0.15
SRSF4Q08170 PHKA1-201ENST00000339490 6121 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.11□□□□□ -0.15
SRSF4Q08170 HOGA1-202ENST00000370646 2488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.1□□□□□ -0.15
SRSF4Q08170 TMTC4-203ENST00000376234 3483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.1□□□□□ -0.15
SRSF4Q08170 ADAMTSL1-202ENST00000327883 1864 ntTSL 1 (best) BASIC14.1□□□□□ -0.15
SRSF4Q08170 SCNN1A-221ENST00000543768 2361 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.1□□□□□ -0.15
SRSF4Q08170 EIF2AK4-208ENST00000559624 3548 ntTSL 1 (best) BASIC14.1□□□□□ -0.15
SRSF4Q08170 ASTN2-202ENST00000313400 4747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.1□□□□□ -0.15
SRSF4Q08170 DMAP1-201ENST00000315913 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.1□□□□□ -0.15
SRSF4Q08170 EVPLL-201ENST00000399134 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.1□□□□□ -0.15
SRSF4Q08170 ARHGAP9-201ENST00000393791 2597 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.1□□□□□ -0.15
SRSF4Q08170 POTEE-204ENST00000613282 1926 ntTSL 5 BASIC14.1□□□□□ -0.15
SRSF4Q08170 POTEI-202ENST00000615053 1926 ntTSL 5 BASIC14.1□□□□□ -0.15
SRSF4Q08170 SDCBP2-201ENST00000339987 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.1□□□□□ -0.15
SRSF4Q08170 HYAL3-205ENST00000450982 1402 ntTSL 1 (best) BASIC14.1□□□□□ -0.15
SRSF4Q08170 TERF1-201ENST00000276602 3268 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.1□□□□□ -0.15
SRSF4Q08170 FEN1-201ENST00000305885 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.1□□□□□ -0.15
SRSF4Q08170 MAGEA8-201ENST00000286482 1778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.1□□□□□ -0.15
SRSF4Q08170 TBXAS1-202ENST00000411653 1792 ntTSL 1 (best) BASIC14.1□□□□□ -0.15
SRSF4Q08170 CACNG7-201ENST00000222212 1016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.1□□□□□ -0.15
SRSF4Q08170 VTN-201ENST00000226218 2149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.1□□□□□ -0.15
SRSF4Q08170 ROMO1-201ENST00000336695 496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.1□□□□□ -0.15
SRSF4Q08170 INPP5F-203ENST00000369081 874 ntTSL 1 (best) BASIC14.1□□□□□ -0.15
SRSF4Q08170 CLDN7-202ENST00000397317 1228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.1□□□□□ -0.15
SRSF4Q08170 AP000355.1-201ENST00000432032 480 ntTSL 5 BASIC14.1□□□□□ -0.15
SRSF4Q08170 SRP19-202ENST00000445150 833 ntTSL 2 BASIC14.1□□□□□ -0.15
SRSF4Q08170 IGHV3-22-201ENST00000520721 359 ntBASIC14.1□□□□□ -0.15
SRSF4Q08170 RDH5-202ENST00000547072 1054 ntTSL 5 BASIC14.1□□□□□ -0.15
SRSF4Q08170 KIRREL3-AS1-201ENST00000548204 586 ntTSL 3 BASIC14.1□□□□□ -0.15
SRSF4Q08170 SNHG15-206ENST00000580528 1073 ntTSL 2 BASIC14.1□□□□□ -0.15
SRSF4Q08170 RLN3-202ENST00000585987 541 ntTSL 1 (best) BASIC14.1□□□□□ -0.15
SRSF4Q08170 ACYP2-209ENST00000607452 831 ntTSL 2 BASIC14.1□□□□□ -0.15
SRSF4Q08170 HOTTIP_1.1-201ENST00000620415 57 ntBASIC14.1□□□□□ -0.15
SRSF4Q08170 CAND2-206ENST00000626378 333 ntTSL 5 BASIC14.1□□□□□ -0.15
SRSF4Q08170 ZNF644-201ENST00000337393 5763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.1□□□□□ -0.15
SRSF4Q08170 ADAM23-201ENST00000264377 6330 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.1□□□□□ -0.15
SRSF4Q08170 PEX16-201ENST00000241041 1479 ntTSL 1 (best) BASIC14.1□□□□□ -0.15
SRSF4Q08170 PCM1-206ENST00000518537 2171 ntTSL 1 (best) BASIC14.1□□□□□ -0.15
SRSF4Q08170 RDH10-201ENST00000240285 3949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.1□□□□□ -0.15
SRSF4Q08170 XKR4-203ENST00000622811 3907 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.1□□□□□ -0.15
SRSF4Q08170 YY1AP1-210ENST00000368339 3073 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.1□□□□□ -0.15
SRSF4Q08170 IRAK1-204ENST00000393687 2049 ntTSL 1 (best) BASIC14.1□□□□□ -0.15
SRSF4Q08170 FBXO4-201ENST00000281623 1682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.1□□□□□ -0.15
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.3 ms