Protein–RNA interactions for Protein: Q05586

GRIN1, Glutamate receptor ionotropic, NMDA 1, humanhuman

Predictions only

Length 938 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GRIN1Q05586 SASH1-201ENST00000367467 7711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
GRIN1Q05586 CABP1-204ENST00000453000 1857 ntTSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
GRIN1Q05586 KRT2-201ENST00000309680 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
GRIN1Q05586 CSK-210ENST00000567571 2443 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.75■□□□□ 0.59
GRIN1Q05586 PAUPAR-201ENST00000630360 2965 ntBASIC18.75■□□□□ 0.59
GRIN1Q05586 ZNF418-208ENST00000599852 2501 ntTSL 2 BASIC18.75■□□□□ 0.59
GRIN1Q05586 TGIF1-201ENST00000330513 1980 ntTSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
GRIN1Q05586 ATP6V1E1-201ENST00000253413 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
GRIN1Q05586 U73166.1-201ENST00000439898 2625 ntTSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
GRIN1Q05586 CACNA1A-227ENST00000636549 6792 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.75■□□□□ 0.59
GRIN1Q05586 SLC22A5-203ENST00000435065 1746 ntTSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
GRIN1Q05586 DIABLO-208ENST00000464942 2569 ntTSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
GRIN1Q05586 ELK1-202ENST00000343894 736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
GRIN1Q05586 ANAPC11-201ENST00000344877 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
GRIN1Q05586 COPS7B-207ENST00000410024 1103 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.75■□□□□ 0.59
GRIN1Q05586 AL354836.1-201ENST00000414042 681 ntTSL 2 BASIC18.75■□□□□ 0.59
GRIN1Q05586 ATP6V0CP3-201ENST00000417255 467 ntBASIC18.75■□□□□ 0.59
GRIN1Q05586 AP000442.1-201ENST00000533552 769 ntTSL 5 BASIC18.75■□□□□ 0.59
GRIN1Q05586 L2HGDH-205ENST00000555423 841 ntTSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
GRIN1Q05586 NUBP2-214ENST00000568706 913 ntTSL 2 BASIC18.75■□□□□ 0.59
GRIN1Q05586 ANAPC11-213ENST00000577747 672 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.75■□□□□ 0.59
GRIN1Q05586 ARMC7-203ENST00000581078 1002 ntTSL 2 BASIC18.75■□□□□ 0.59
GRIN1Q05586 GIPC1-213ENST00000591349 1068 ntTSL 2 BASIC18.75■□□□□ 0.59
GRIN1Q05586 NUTM2B-AS1-211ENST00000601369 1233 ntTSL 2 BASIC18.75■□□□□ 0.59
GRIN1Q05586 UAP1L1-202ENST00000409858 3365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
GRIN1Q05586 FBF1-205ENST00000586717 4825 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.75■□□□□ 0.59
GRIN1Q05586 C17orf100-201ENST00000542475 1756 ntAPPRIS P1 BASIC18.75■□□□□ 0.59
GRIN1Q05586 NUCB1-202ENST00000407032 2158 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.75■□□□□ 0.59
GRIN1Q05586 AQP10-203ENST00000484864 2262 ntTSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
GRIN1Q05586 LITAF-201ENST00000339430 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
GRIN1Q05586 DIRC2-201ENST00000261038 3596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
GRIN1Q05586 FOXS1-201ENST00000375978 1319 ntAPPRIS P1 BASIC18.74■□□□□ 0.59
GRIN1Q05586 AC092919.2-201ENST00000623631 1645 ntBASIC18.74■□□□□ 0.59
GRIN1Q05586 DAND5-202ENST00000585548 1731 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
GRIN1Q05586 SERTM1-201ENST00000315190 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
GRIN1Q05586 AC010491.1-201ENST00000563101 2797 ntBASIC18.74■□□□□ 0.59
GRIN1Q05586 LATS1-202ENST00000392273 2567 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
GRIN1Q05586 AL136309.2-201ENST00000427049 2277 ntTSL 2 BASIC18.74■□□□□ 0.59
GRIN1Q05586 AC024909.3-201ENST00000611513 2257 ntBASIC18.74■□□□□ 0.59
GRIN1Q05586 ARHGEF28-203ENST00000426542 6118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
GRIN1Q05586 HHATL-205ENST00000441594 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
GRIN1Q05586 RAB37-208ENST00000402449 1560 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.74■□□□□ 0.59
GRIN1Q05586 CCDC90B-202ENST00000455220 1550 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
GRIN1Q05586 PRKAG1-217ENST00000552212 1497 ntTSL 2 BASIC18.74■□□□□ 0.59
GRIN1Q05586 MAP6-202ENST00000434603 4329 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
GRIN1Q05586 METTL26-201ENST00000301686 794 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.74■□□□□ 0.59
GRIN1Q05586 GBGT1-201ENST00000372036 871 ntTSL 3 BASIC18.74■□□□□ 0.59
GRIN1Q05586 METTL26-205ENST00000397666 726 ntTSL 2 BASIC18.74■□□□□ 0.59
GRIN1Q05586 LBH-204ENST00000406087 559 ntTSL 4 BASIC18.74■□□□□ 0.59
GRIN1Q05586 CRCP-205ENST00000431089 942 ntTSL 2 BASIC18.74■□□□□ 0.59
GRIN1Q05586 NTMT1-207ENST00000482347 1072 ntTSL 2 BASIC18.74■□□□□ 0.59
GRIN1Q05586 AC023355.1-201ENST00000560323 752 ntTSL 3 BASIC18.74■□□□□ 0.59
GRIN1Q05586 AL031432.2-201ENST00000566714 459 ntBASIC18.74■□□□□ 0.59
GRIN1Q05586 COQ7-208ENST00000568985 714 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.74■□□□□ 0.59
GRIN1Q05586 AL928711.1-201ENST00000570165 459 ntBASIC18.74■□□□□ 0.59
GRIN1Q05586 AC055811.1-201ENST00000584203 1231 ntTSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
GRIN1Q05586 FBF1-204ENST00000586631 621 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.74■□□□□ 0.59
GRIN1Q05586 AC008878.2-201ENST00000601870 942 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC18.74■□□□□ 0.59
GRIN1Q05586 SCUBE2-207ENST00000520467 3148 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.74■□□□□ 0.59
GRIN1Q05586 PLEKHG4-205ENST00000450733 4480 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
GRIN1Q05586 EPN1-203ENST00000411543 2621 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
GRIN1Q05586 GPER1-206ENST00000617001 1900 ntTSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
GRIN1Q05586 MYOD1-201ENST00000250003 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
GRIN1Q05586 FLAD1-203ENST00000315144 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
GRIN1Q05586 ESR2-201ENST00000267525 1518 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
GRIN1Q05586 DPM2-201ENST00000314392 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
GRIN1Q05586 AC025580.3-201ENST00000617932 1424 ntBASIC18.74■□□□□ 0.59
GRIN1Q05586 AC006449.6-201ENST00000612330 2296 ntBASIC18.74■□□□□ 0.59
GRIN1Q05586 HMGCLL1-202ENST00000308161 1314 ntTSL 2 BASIC18.74■□□□□ 0.59
GRIN1Q05586 CGREF1-206ENST00000405600 1346 ntAPPRIS P2 TSL 4 BASIC18.74■□□□□ 0.59
GRIN1Q05586 LRRC20-206ENST00000395011 2903 ntTSL 4 BASIC18.73■□□□□ 0.59
GRIN1Q05586 AP005329.2-201ENST00000580139 1771 ntTSL 2 BASIC18.73■□□□□ 0.59
GRIN1Q05586 INHBB-201ENST00000295228 3204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
GRIN1Q05586 ZNF213-206ENST00000574902 3208 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
GRIN1Q05586 ALPPL2-201ENST00000295453 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
GRIN1Q05586 EYA2-208ENST00000497062 2384 ntTSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
GRIN1Q05586 CALHM2-202ENST00000369788 1843 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.73■□□□□ 0.59
GRIN1Q05586 COL18A1-202ENST00000355480 5924 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
GRIN1Q05586 MUC1-204ENST00000343256 648 ntTSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
GRIN1Q05586 MRPL9-202ENST00000368830 1296 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
GRIN1Q05586 AL590627.1-203ENST00000421194 1026 ntBASIC18.73■□□□□ 0.59
GRIN1Q05586 LINC01786-201ENST00000434139 268 ntTSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
GRIN1Q05586 STARD13-205ENST00000439831 945 ntTSL 2 BASIC18.73■□□□□ 0.59
GRIN1Q05586 AC002398.2-201ENST00000587767 660 ntTSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
GRIN1Q05586 AC004877.2-201ENST00000623941 599 ntBASIC18.73■□□□□ 0.59
GRIN1Q05586 FADS1-216ENST00000542506 1725 ntTSL 2 BASIC18.73■□□□□ 0.59
GRIN1Q05586 LINC01144-201ENST00000626198 1710 ntBASIC18.73■□□□□ 0.59
GRIN1Q05586 BX276092.9-202ENST00000636096 1722 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
GRIN1Q05586 RPL3L-201ENST00000268661 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
GRIN1Q05586 EPHX2-201ENST00000380476 2064 ntTSL 2 BASIC18.73■□□□□ 0.59
GRIN1Q05586 BATF2-201ENST00000301887 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
GRIN1Q05586 KCNQ2-213ENST00000626839 9213 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
GRIN1Q05586 PPP2R5D-206ENST00000472118 2963 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
GRIN1Q05586 EXT2-210ENST00000533608 3136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
GRIN1Q05586 TMED9-201ENST00000332598 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
GRIN1Q05586 ALDOA-226ENST00000569798 1499 ntTSL 2 BASIC18.72■□□□□ 0.59
GRIN1Q05586 LRRC57-204ENST00000563454 2407 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.72■□□□□ 0.59
GRIN1Q05586 VASP-201ENST00000245932 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
GRIN1Q05586 HMGN1-204ENST00000380749 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
GRIN1Q05586 SPATA18-202ENST00000419395 2816 ntTSL 2 BASIC18.72■□□□□ 0.59
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 40.4 ms