Protein–RNA interactions for Protein: Q02487

DSC2, Desmocollin-2, humanhuman

Predictions only

Length 901 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DSC2Q02487 TBRG4-203ENST00000395655 2225 ntTSL 2 BASIC16.81■□□□□ 0.28
DSC2Q02487 SIGLEC7-201ENST00000305628 1469 ntTSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
DSC2Q02487 LINC02167-203ENST00000566900 1489 ntTSL 2 BASIC16.81■□□□□ 0.28
DSC2Q02487 BCL2L12-202ENST00000246785 1431 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
DSC2Q02487 GFOD2-201ENST00000268797 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
DSC2Q02487 ICAM4-203ENST00000393717 1390 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.81■□□□□ 0.28
DSC2Q02487 ME2P1-201ENST00000426028 1970 ntBASIC16.81■□□□□ 0.28
DSC2Q02487 YBX2P1-201ENST00000394192 760 ntBASIC16.81■□□□□ 0.28
DSC2Q02487 MCCD1P2-201ENST00000423228 335 ntBASIC16.81■□□□□ 0.28
DSC2Q02487 AL109741.1-201ENST00000432195 403 ntTSL 2 BASIC16.81■□□□□ 0.28
DSC2Q02487 FIS1-203ENST00000442303 631 ntTSL 3 BASIC16.81■□□□□ 0.28
DSC2Q02487 HILS1-201ENST00000504307 1219 ntTSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
DSC2Q02487 BRF1-219ENST00000551787 824 ntTSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
DSC2Q02487 PMF1-BGLAP-204ENST00000567140 655 ntTSL 3 BASIC16.81■□□□□ 0.28
DSC2Q02487 ARHGDIA-208ENST00000581876 709 ntTSL 3 BASIC16.81■□□□□ 0.28
DSC2Q02487 AC099522.2-201ENST00000607001 744 ntBASIC16.81■□□□□ 0.28
DSC2Q02487 EPB41L3-207ENST00000545076 3190 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.81■□□□□ 0.28
DSC2Q02487 USP4-201ENST00000265560 3126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
DSC2Q02487 YY1-201ENST00000262238 6697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
DSC2Q02487 TLCD2-201ENST00000330676 5971 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.81■□□□□ 0.28
DSC2Q02487 PDE4DIP-230ENST00000530472 1690 ntTSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
DSC2Q02487 AC016027.1-202ENST00000607927 1699 ntBASIC16.81■□□□□ 0.28
DSC2Q02487 RALGDS-205ENST00000393160 3801 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
DSC2Q02487 PI16-201ENST00000373674 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
DSC2Q02487 TXNDC11-202ENST00000356957 3178 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
DSC2Q02487 SLC22A12-205ENST00000473690 2522 ntTSL 2 BASIC16.8■□□□□ 0.28
DSC2Q02487 AASDHPPT-201ENST00000278618 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
DSC2Q02487 SHOX-201ENST00000334060 1951 ntTSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
DSC2Q02487 CAMKV-204ENST00000466940 1475 ntTSL 2 BASIC16.8■□□□□ 0.28
DSC2Q02487 MYH14-202ENST00000376970 6787 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
DSC2Q02487 ZNF503-201ENST00000372524 3347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
DSC2Q02487 FNDC8-201ENST00000158009 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
DSC2Q02487 GLS2-216ENST00000610413 2296 ntTSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
DSC2Q02487 PCIF1-201ENST00000372409 2747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
DSC2Q02487 SIPA1-201ENST00000394224 3628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
DSC2Q02487 SEPT9-237ENST00000591198 2160 ntTSL 2 BASIC16.8■□□□□ 0.28
DSC2Q02487 HCCS-203ENST00000380763 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
DSC2Q02487 AC002056.1-201ENST00000395613 760 ntBASIC16.8■□□□□ 0.28
DSC2Q02487 MOB1B-202ENST00000396051 1107 ntTSL 2 BASIC16.8■□□□□ 0.28
DSC2Q02487 CBX7-202ENST00000401405 784 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
DSC2Q02487 C2orf49-202ENST00000410049 854 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
DSC2Q02487 AC006042.2-201ENST00000428660 568 ntTSL 4 BASIC16.8■□□□□ 0.28
DSC2Q02487 CR559946.1-201ENST00000453835 531 ntTSL 4 BASIC16.8■□□□□ 0.28
DSC2Q02487 AC112191.1-201ENST00000523689 701 ntBASIC16.8■□□□□ 0.28
DSC2Q02487 HIST4H4-204ENST00000539745 577 ntAPPRIS P1 BASIC16.8■□□□□ 0.28
DSC2Q02487 AP000777.2-201ENST00000539897 501 ntTSL 4 BASIC16.8■□□□□ 0.28
DSC2Q02487 FLYWCH2-203ENST00000572006 754 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.8■□□□□ 0.28
DSC2Q02487 ELOF1-204ENST00000587806 1172 ntTSL 2 BASIC16.8■□□□□ 0.28
DSC2Q02487 ACP5-212ENST00000592828 1699 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
DSC2Q02487 ARFRP1-213ENST00000619493 2456 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.8■□□□□ 0.28
DSC2Q02487 EML2-203ENST00000536630 2791 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.8■□□□□ 0.28
DSC2Q02487 TSC22D4-201ENST00000300181 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
DSC2Q02487 TSPAN17-209ENST00000515708 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
DSC2Q02487 DUSP18-206ENST00000407308 1978 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
DSC2Q02487 C16orf71-201ENST00000299320 2722 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
DSC2Q02487 ZNF354C-201ENST00000315475 5411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
DSC2Q02487 HLA-B-249ENST00000412585 1547 ntAPPRIS P1 BASIC16.8■□□□□ 0.28
DSC2Q02487 NGFR-201ENST00000172229 3417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
DSC2Q02487 ZNF514-201ENST00000295208 3011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
DSC2Q02487 CHFR-203ENST00000432561 2648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
DSC2Q02487 EEFSEC-202ENST00000483457 1859 ntTSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
DSC2Q02487 DEF8-225ENST00000569453 1852 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.8■□□□□ 0.28
DSC2Q02487 PHKA1-205ENST00000541944 5944 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
DSC2Q02487 PNMA6E-202ENST00000633844 2596 ntTSL 3 BASIC16.8■□□□□ 0.28
DSC2Q02487 AP1AR-201ENST00000274000 2902 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
DSC2Q02487 RNF157-202ENST00000319945 2937 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.8■□□□□ 0.28
DSC2Q02487 C16orf89-203ENST00000474471 1829 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
DSC2Q02487 CROCCP3-201ENST00000263511 5368 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
DSC2Q02487 EIPR1-202ENST00000398659 1795 ntTSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
DSC2Q02487 PRDM5-202ENST00000394435 2492 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
DSC2Q02487 ABCB10-201ENST00000344517 3857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
DSC2Q02487 CPVL-202ENST00000396276 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
DSC2Q02487 TRIM11-201ENST00000284551 2715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
DSC2Q02487 FHL1-207ENST00000394155 2706 ntTSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
DSC2Q02487 PNRC1-202ENST00000354922 1345 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
DSC2Q02487 CGREF1-206ENST00000405600 1346 ntAPPRIS P2 TSL 4 BASIC16.79■□□□□ 0.28
DSC2Q02487 HAPLN3-201ENST00000359595 1980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
DSC2Q02487 SALL3-202ENST00000537592 6555 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
DSC2Q02487 FADS3-207ENST00000527697 1640 ntTSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
DSC2Q02487 TMEM147-201ENST00000222284 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
DSC2Q02487 PDLIM7-201ENST00000355572 977 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
DSC2Q02487 HIST1H2BD-202ENST00000377777 496 ntAPPRIS P1 BASIC16.79■□□□□ 0.28
DSC2Q02487 AMACR-204ENST00000382085 1195 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
DSC2Q02487 ATP5G3-202ENST00000392541 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
DSC2Q02487 ALG1L5P-201ENST00000482043 771 ntBASIC16.79■□□□□ 0.28
DSC2Q02487 KRTAP5-9-201ENST00000528743 1136 ntAPPRIS P1 BASIC16.79■□□□□ 0.28
DSC2Q02487 TMEM88-202ENST00000574668 510 ntTSL 2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
DSC2Q02487 METTL23-202ENST00000586200 465 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
DSC2Q02487 METTL23-212ENST00000590964 1006 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
DSC2Q02487 AC004597.1-201ENST00000595525 561 ntTSL 4 BASIC16.79■□□□□ 0.28
DSC2Q02487 AC092902.6-201ENST00000641783 218 ntBASIC16.79■□□□□ 0.28
DSC2Q02487 MFSD1-202ENST00000392813 2244 ntTSL 2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
DSC2Q02487 TBL2-201ENST00000305632 3161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
DSC2Q02487 ITSN2-201ENST00000355123 6300 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
DSC2Q02487 PIKFYVE-204ENST00000407449 1898 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
DSC2Q02487 C17orf113-201ENST00000587304 3746 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
DSC2Q02487 CDK11B-208ENST00000629289 2490 ntTSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
DSC2Q02487 CDK11B-209ENST00000629312 2496 ntTSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
DSC2Q02487 VARS-215ENST00000375663 4312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
DSC2Q02487 GPAT2-201ENST00000359548 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.9 ms