Protein–RNA interactions for Protein: Q01860

POU5F1, POU domain, class 5, transcription factor 1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 360 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
POU5F1Q01860 GSKIP-207ENST00000556095 3834 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
POU5F1Q01860 ACSF3-204ENST00000406948 2247 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
POU5F1Q01860 SLC25A35-205ENST00000580340 1541 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
POU5F1Q01860 AL391005.1-201ENST00000623953 2435 ntBASIC17.99■□□□□ 0.47
POU5F1Q01860 COPS7B-206ENST00000410017 2051 ntTSL 3 BASIC17.99■□□□□ 0.47
POU5F1Q01860 SERPINB6-201ENST00000335686 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
POU5F1Q01860 SLC35E2B-204ENST00000614300 2156 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
POU5F1Q01860 BANP-204ENST00000393208 2283 ntTSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
POU5F1Q01860 BLZF1-202ENST00000367807 1295 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
POU5F1Q01860 MRPS18A-202ENST00000372133 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
POU5F1Q01860 DPM2-202ENST00000373110 738 ntTSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
POU5F1Q01860 ITGB2-204ENST00000397846 422 ntTSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
POU5F1Q01860 AP001062.3-201ENST00000422357 704 ntTSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
POU5F1Q01860 SPDYE11-202ENST00000450699 704 ntBASIC17.99■□□□□ 0.47
POU5F1Q01860 NDUFS7-216ENST00000546283 1060 ntTSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
POU5F1Q01860 LINC01225-203ENST00000563550 1244 ntBASIC17.99■□□□□ 0.47
POU5F1Q01860 SPDYE9P-201ENST00000570642 692 ntBASIC17.99■□□□□ 0.47
POU5F1Q01860 TVP23B-206ENST00000574226 1080 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
POU5F1Q01860 AC004597.1-201ENST00000595525 561 ntTSL 4 BASIC17.99■□□□□ 0.47
POU5F1Q01860 AC022145.2-201ENST00000598203 171 ntBASIC17.99■□□□□ 0.47
POU5F1Q01860 SPDYE10P-202ENST00000612005 668 ntBASIC17.99■□□□□ 0.47
POU5F1Q01860 SPDYE8P-202ENST00000612377 668 ntBASIC17.99■□□□□ 0.47
POU5F1Q01860 AC008267.7-201ENST00000624570 1194 ntBASIC17.99■□□□□ 0.47
POU5F1Q01860 TMEM114-205ENST00000624696 560 ntTSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
POU5F1Q01860 ATP10A-201ENST00000356865 6680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
POU5F1Q01860 LINC01215-201ENST00000607746 2592 ntTSL 3 BASIC17.99■□□□□ 0.47
POU5F1Q01860 TRIM39-201ENST00000376656 3338 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
POU5F1Q01860 CYP2S1-201ENST00000310054 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
POU5F1Q01860 AL162727.3-201ENST00000635661 2787 ntBASIC17.99■□□□□ 0.47
POU5F1Q01860 NLE1-203ENST00000586869 5286 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
POU5F1Q01860 DAG1-220ENST00000539901 5665 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
POU5F1Q01860 PACS1-209ENST00000529757 1688 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
POU5F1Q01860 AC016027.1-202ENST00000607927 1699 ntBASIC17.99■□□□□ 0.47
POU5F1Q01860 GPAA1P2-202ENST00000606848 1787 ntBASIC17.99■□□□□ 0.47
POU5F1Q01860 FLVCR1-AS1-201ENST00000356684 2525 ntTSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
POU5F1Q01860 OSBPL1A-203ENST00000399441 1887 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
POU5F1Q01860 TINF2-208ENST00000558566 1874 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
POU5F1Q01860 PCBP3-204ENST00000400309 1986 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
POU5F1Q01860 BSG-215ENST00000618006 1329 ntTSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
POU5F1Q01860 C2CD4C-201ENST00000332235 3129 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
POU5F1Q01860 SURF4-208ENST00000613129 3148 ntTSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
POU5F1Q01860 KCNK9-203ENST00000520439 1441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
POU5F1Q01860 AC010478.1-202ENST00000559112 2367 ntTSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
POU5F1Q01860 PSMC3-201ENST00000298852 1544 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
POU5F1Q01860 RAN-212ENST00000543796 2661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
POU5F1Q01860 CES4A-206ENST00000540579 1825 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
POU5F1Q01860 DYRK1B-205ENST00000597639 1806 ntTSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
POU5F1Q01860 ATP2A3-201ENST00000309890 4826 ntTSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
POU5F1Q01860 AL353608.3-201ENST00000603200 2211 ntTSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
POU5F1Q01860 SYNDIG1L-202ENST00000554823 2420 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.98■□□□□ 0.47
POU5F1Q01860 LINC02199-201ENST00000506655 2702 ntBASIC17.98■□□□□ 0.47
POU5F1Q01860 SOWAHC-201ENST00000356454 4657 ntAPPRIS P1 BASIC17.98■□□□□ 0.47
POU5F1Q01860 FBXO21-201ENST00000330622 2906 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
POU5F1Q01860 SLC39A8-201ENST00000356736 3144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
POU5F1Q01860 MIB2-217ENST00000504599 3311 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
POU5F1Q01860 PHKA2-201ENST00000379942 5559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
POU5F1Q01860 SLC22A23-203ENST00000406686 5658 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
POU5F1Q01860 CRYBA2-201ENST00000295728 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
POU5F1Q01860 H2AFZ-201ENST00000296417 979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
POU5F1Q01860 CXCL1-201ENST00000395761 1097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
POU5F1Q01860 AL122058.1-202ENST00000426580 252 ntTSL 3 BASIC17.98■□□□□ 0.47
POU5F1Q01860 AC018730.1-201ENST00000454183 327 ntTSL 3 BASIC17.98■□□□□ 0.47
POU5F1Q01860 AC005020.2-201ENST00000455905 830 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.98■□□□□ 0.47
POU5F1Q01860 GALNT9-208ENST00000541995 1001 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
POU5F1Q01860 AL133467.1-201ENST00000554161 993 ntTSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
POU5F1Q01860 AP000894.3-201ENST00000582554 351 ntTSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
POU5F1Q01860 IL11-202ENST00000585513 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
POU5F1Q01860 AC005330.1-201ENST00000590086 1238 ntTSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
POU5F1Q01860 AC004835.2-201ENST00000603762 682 ntBASIC17.98■□□□□ 0.47
POU5F1Q01860 ACYP2-209ENST00000607452 831 ntTSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
POU5F1Q01860 CU104787.1-201ENST00000624155 288 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
POU5F1Q01860 MAP4K1-203ENST00000586296 1363 ntTSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
POU5F1Q01860 BORCS8-203ENST00000477565 1489 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
POU5F1Q01860 GABRD-218ENST00000640949 1684 ntTSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
POU5F1Q01860 PPEF2-207ENST00000621010 1797 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
POU5F1Q01860 AL031731.1-201ENST00000642131 2094 ntBASIC17.98■□□□□ 0.47
POU5F1Q01860 NDUFA11-205ENST00000592634 2154 ntTSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
POU5F1Q01860 SPINT1-202ENST00000562057 2456 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
POU5F1Q01860 SASH1-201ENST00000367467 7711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
POU5F1Q01860 PALM-201ENST00000264560 2755 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC17.98■□□□□ 0.47
POU5F1Q01860 VEGFA-205ENST00000372067 3535 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
POU5F1Q01860 SLC29A2-205ENST00000544554 2505 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
POU5F1Q01860 LGMN-211ENST00000555699 1728 ntTSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
POU5F1Q01860 MFSD2B-202ENST00000406420 1528 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
POU5F1Q01860 BCL2L12-202ENST00000246785 1431 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
POU5F1Q01860 ELP5-201ENST00000354429 1304 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
POU5F1Q01860 NSL1-203ENST00000366978 1344 ntTSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
POU5F1Q01860 CGREF1-206ENST00000405600 1346 ntAPPRIS P2 TSL 4 BASIC17.98■□□□□ 0.47
POU5F1Q01860 TSPAN4-208ENST00000409531 1339 ntTSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
POU5F1Q01860 ENC1-201ENST00000302351 5520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
POU5F1Q01860 DLG4-201ENST00000302955 3184 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
POU5F1Q01860 FGFR2-215ENST00000457416 3061 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
POU5F1Q01860 NFASC-205ENST00000403080 2462 ntTSL 2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
POU5F1Q01860 SGK3-206ENST00000520976 2483 ntTSL 2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
POU5F1Q01860 TBC1D4-204ENST00000431480 6347 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
POU5F1Q01860 ZNF703-201ENST00000331569 3349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
POU5F1Q01860 B3GNT8-201ENST00000321702 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
POU5F1Q01860 ASH1L-207ENST00000548830 1862 ntTSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
POU5F1Q01860 KAT7-213ENST00000510819 1769 ntTSL 2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
POU5F1Q01860 AP005329.2-201ENST00000580139 1771 ntTSL 2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 62.9 ms