Protein–RNA interactions for Protein: Q01726

MC1R, Melanocyte-stimulating hormone receptor, humanhuman

Predictions only

Length 317 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MC1RQ01726 AL603756.1-201ENST00000606511 2163 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
MC1RQ01726 SLC27A1-201ENST00000252595 3594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
MC1RQ01726 TJP2-202ENST00000377245 4611 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
MC1RQ01726 TMEM127-202ENST00000432959 3099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
MC1RQ01726 PTPRC-206ENST00000413409 1338 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
MC1RQ01726 CLN5-208ENST00000636183 6664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
MC1RQ01726 VPS54-201ENST00000272322 3463 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
MC1RQ01726 GSR-201ENST00000221130 3119 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
MC1RQ01726 SH2B3-202ENST00000538307 2062 ntTSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
MC1RQ01726 ZNF580-202ENST00000543039 1707 ntAPPRIS P1 BASIC16.14■□□□□ 0.17
MC1RQ01726 ETV4-211ENST00000591713 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
MC1RQ01726 SHISA6-204ENST00000441885 7575 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
MC1RQ01726 WDR61-201ENST00000267973 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
MC1RQ01726 SMTNL2-201ENST00000338859 1919 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
MC1RQ01726 AC226118.1-201ENST00000515213 2146 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
MC1RQ01726 NFATC1-208ENST00000586434 2103 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
MC1RQ01726 TMEM155-202ENST00000394394 1753 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC16.13■□□□□ 0.17
MC1RQ01726 RAB3IP-207ENST00000483530 1755 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
MC1RQ01726 ZNF619-205ENST00000456778 2192 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
MC1RQ01726 PRKCSH-205ENST00000587327 2189 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
MC1RQ01726 LIFR-202ENST00000453190 4253 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
MC1RQ01726 LHX9-204ENST00000367391 1623 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
MC1RQ01726 CFAP77-201ENST00000343036 1818 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
MC1RQ01726 PDLIM7-201ENST00000355572 977 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
MC1RQ01726 C9orf116-202ENST00000371789 1278 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
MC1RQ01726 ID3-201ENST00000374561 1251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
MC1RQ01726 CLTA-203ENST00000396603 1090 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
MC1RQ01726 TCF20-203ENST00000404876 1058 ntTSL 3 BASIC16.13■□□□□ 0.17
MC1RQ01726 LINC00029-202ENST00000414668 1117 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
MC1RQ01726 XXYLT1-204ENST00000429994 865 ntTSL 3 BASIC16.13■□□□□ 0.17
MC1RQ01726 LINC02558-202ENST00000436395 298 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
MC1RQ01726 AKR1A1-204ENST00000471651 1018 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
MC1RQ01726 LINC01485-205ENST00000523617 586 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
MC1RQ01726 COX14-202ENST00000548985 677 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
MC1RQ01726 AC010776.2-201ENST00000588946 1081 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
MC1RQ01726 MAP3K9-201ENST00000381250 4025 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
MC1RQ01726 LZTS3-202ENST00000337576 4238 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
MC1RQ01726 BVES-202ENST00000336775 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
MC1RQ01726 IRF1-202ENST00000405885 2061 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
MC1RQ01726 TNK2-AS1-201ENST00000458180 2096 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
MC1RQ01726 RBBP7-204ENST00000404022 1904 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
MC1RQ01726 AL132857.2-201ENST00000634305 1737 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
MC1RQ01726 TUBB8P12-201ENST00000308911 1335 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
MC1RQ01726 TUBB7P-202ENST00000428444 1305 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
MC1RQ01726 TUBB8P7-204ENST00000567960 1332 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
MC1RQ01726 CHRNB2-201ENST00000368476 5867 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
MC1RQ01726 NBL1-210ENST00000615215 2160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
MC1RQ01726 TMUB2-204ENST00000538716 1953 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
MC1RQ01726 DUSP8-202ENST00000397374 4480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
MC1RQ01726 PLXDC2-202ENST00000377242 2822 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
MC1RQ01726 SBNO2-202ENST00000438103 4537 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
MC1RQ01726 TNRC18P3-201ENST00000441896 2691 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
MC1RQ01726 TMEM138-201ENST00000278826 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
MC1RQ01726 GPS1-226ENST00000623691 1839 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
MC1RQ01726 FMNL1-201ENST00000328118 2330 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
MC1RQ01726 TSC2-204ENST00000401874 5421 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
MC1RQ01726 UGT3A2-204ENST00000513300 1924 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
MC1RQ01726 KLK3-201ENST00000326003 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
MC1RQ01726 FOS-208ENST00000555686 1496 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
MC1RQ01726 NFIX-209ENST00000587760 1487 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
MC1RQ01726 COL8A2-202ENST00000397799 4670 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
MC1RQ01726 ANKRD23-203ENST00000418232 2156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
MC1RQ01726 CSNK2B-203ENST00000375882 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
MC1RQ01726 PRUNE2-202ENST00000376713 1069 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
MC1RQ01726 HRAS-204ENST00000417302 1233 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
MC1RQ01726 HRAS-205ENST00000451590 1151 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
MC1RQ01726 AL390729.1-201ENST00000456651 587 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
MC1RQ01726 AP000892.1-201ENST00000504906 488 ntTSL 3 BASIC16.12■□□□□ 0.17
MC1RQ01726 MAGIX-204ENST00000614074 778 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
MC1RQ01726 AC093028.1-201ENST00000622998 982 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
MC1RQ01726 ETV3L-201ENST00000454449 1976 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
MC1RQ01726 NSMCE3-201ENST00000332303 4838 ntAPPRIS P1 BASIC16.12■□□□□ 0.17
MC1RQ01726 B4GALNT4-201ENST00000329962 3444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
MC1RQ01726 TLE2-204ENST00000455444 2253 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
MC1RQ01726 GRAMD1A-202ENST00000411896 2523 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
MC1RQ01726 FOXS1-201ENST00000375978 1319 ntAPPRIS P1 BASIC16.12■□□□□ 0.17
MC1RQ01726 PKLR-201ENST00000342741 2083 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
MC1RQ01726 DEPTOR-203ENST00000523492 1397 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
MC1RQ01726 SYTL3-203ENST00000367081 2692 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
MC1RQ01726 GCK-202ENST00000345378 2421 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
MC1RQ01726 FBXL22-202ENST00000534939 2443 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.11■□□□□ 0.17
MC1RQ01726 C2orf81-206ENST00000640868 2407 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
MC1RQ01726 ZNF514-202ENST00000411425 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
MC1RQ01726 CDK19-202ENST00000368911 6246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
MC1RQ01726 NR4A2-203ENST00000409108 1735 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
MC1RQ01726 LINC00887-203ENST00000429578 1717 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
MC1RQ01726 DAPK2-202ENST00000457488 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
MC1RQ01726 ALDH3A1-202ENST00000395555 1495 ntTSL 3 BASIC16.11■□□□□ 0.17
MC1RQ01726 AP3D1-202ENST00000355272 5034 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
MC1RQ01726 RASSF8-AS1-202ENST00000500276 2610 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
MC1RQ01726 TP73-208ENST00000378295 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
MC1RQ01726 NRSN2-AS1-202ENST00000442637 762 ntTSL 3 BASIC16.11■□□□□ 0.17
MC1RQ01726 FAM185BP-201ENST00000443595 716 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
MC1RQ01726 SLC25A36-204ENST00000453248 1040 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
MC1RQ01726 LINC00596-201ENST00000559615 937 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
MC1RQ01726 AC020558.1-201ENST00000583662 425 ntTSL 3 BASIC16.11■□□□□ 0.17
MC1RQ01726 AC002091.2-201ENST00000585297 402 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
MC1RQ01726 BSG-214ENST00000614867 960 ntTSL 3 BASIC16.11■□□□□ 0.17
MC1RQ01726 PCDHGC4-204ENST00000618371 812 ntTSL 3 BASIC16.11■□□□□ 0.17
MC1RQ01726 UBE3D-208ENST00000626828 114 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 47.7 ms