Protein–RNA interactions for Protein: Q01362

MS4A2, High affinity immunoglobulin epsilon receptor subunit beta, humanhuman

Predictions only

Length 244 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MS4A2Q01362 DZIP1-204ENST00000376829 3738 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
MS4A2Q01362 PHF23-202ENST00000454255 1662 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
MS4A2Q01362 PACS1-209ENST00000529757 1688 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
MS4A2Q01362 TRIP10-210ENST00000600428 2249 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
MS4A2Q01362 UVSSA-206ENST00000507531 2597 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
MS4A2Q01362 FGF8-201ENST00000320185 799 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
MS4A2Q01362 ZHX1-C8orf76-201ENST00000357082 1257 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
MS4A2Q01362 CENPM-203ENST00000402338 1002 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
MS4A2Q01362 LINC00982-205ENST00000420957 435 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
MS4A2Q01362 TSPY22P-201ENST00000427496 604 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
MS4A2Q01362 DANCR-204ENST00000444958 709 ntTSL 3 BASIC15.74■□□□□ 0.11
MS4A2Q01362 ATP5G1P1-201ENST00000448724 379 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
MS4A2Q01362 POU5F1P6-201ENST00000466990 990 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
MS4A2Q01362 TMEM258-204ENST00000537328 575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
MS4A2Q01362 TSFM-208ENST00000543727 651 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
MS4A2Q01362 CALM3-208ENST00000596362 1203 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
MS4A2Q01362 GABRA5-202ENST00000355395 2183 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
MS4A2Q01362 HNRNPU-204ENST00000440865 3207 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
MS4A2Q01362 UNC13A-206ENST00000552293 5314 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
MS4A2Q01362 RNF25-201ENST00000295704 1914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
MS4A2Q01362 AP003680.1-201ENST00000598970 3660 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
MS4A2Q01362 AL139130.1-201ENST00000451362 5586 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
MS4A2Q01362 PCMTD1-206ENST00000521344 1712 ntTSL 3 BASIC15.74■□□□□ 0.11
MS4A2Q01362 SYN1-201ENST00000295987 3299 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
MS4A2Q01362 NF2-202ENST00000338641 6025 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
MS4A2Q01362 DUS3L-202ENST00000320699 1355 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
MS4A2Q01362 ACP2-201ENST00000256997 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
MS4A2Q01362 SRPX-201ENST00000378533 1874 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
MS4A2Q01362 PCGF3-213ENST00000620529 1899 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
MS4A2Q01362 MMP2-201ENST00000219070 3741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
MS4A2Q01362 SHISA2-201ENST00000319420 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
MS4A2Q01362 RNF135-202ENST00000328381 2892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
MS4A2Q01362 PITPNM1-201ENST00000356404 4225 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
MS4A2Q01362 ATP5S-201ENST00000245448 1671 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
MS4A2Q01362 GOLGA2P3Y-201ENST00000416946 1653 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
MS4A2Q01362 BCAR1-207ENST00000538440 3192 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
MS4A2Q01362 NSMCE3-201ENST00000332303 4838 ntAPPRIS P1 BASIC15.73■□□□□ 0.11
MS4A2Q01362 FKBP3-202ENST00000396062 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
MS4A2Q01362 CGREF1-206ENST00000405600 1346 ntAPPRIS P2 TSL 4 BASIC15.73■□□□□ 0.11
MS4A2Q01362 PPM1D-201ENST00000305921 4778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
MS4A2Q01362 HHIPL1-201ENST00000330710 7390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
MS4A2Q01362 TEN1-CDK3-202ENST00000569284 3287 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
MS4A2Q01362 CTSD-201ENST00000236671 2123 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
MS4A2Q01362 SLIT1-204ENST00000371070 4564 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
MS4A2Q01362 PAX3-206ENST00000392070 2258 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
MS4A2Q01362 SYT17-201ENST00000355377 3081 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
MS4A2Q01362 MAPKAP1-201ENST00000265960 3395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
MS4A2Q01362 AHSA2-202ENST00000394457 6574 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
MS4A2Q01362 ZNF81-201ENST00000334937 610 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
MS4A2Q01362 AL020989.1-201ENST00000422979 469 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
MS4A2Q01362 BX664615.1-201ENST00000443558 458 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
MS4A2Q01362 AC004080.5-201ENST00000498652 368 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
MS4A2Q01362 LY6E-213ENST00000522528 606 ntTSL 3 BASIC15.73■□□□□ 0.11
MS4A2Q01362 LY6L-201ENST00000562505 988 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
MS4A2Q01362 MIR4492-201ENST00000581627 80 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
MS4A2Q01362 IGHV3-41-201ENST00000613121 348 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
MS4A2Q01362 AC243829.1-201ENST00000615128 1059 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
MS4A2Q01362 HPS1-202ENST00000338546 1580 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
MS4A2Q01362 SCAP-215ENST00000545718 2950 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
MS4A2Q01362 C6orf106-203ENST00000374026 4232 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
MS4A2Q01362 SPATC1-201ENST00000377470 2007 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
MS4A2Q01362 AL928970.1-201ENST00000422679 2923 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
MS4A2Q01362 LRFN1-201ENST00000248668 3381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
MS4A2Q01362 BRD3-201ENST00000303407 5652 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
MS4A2Q01362 SYNM-201ENST00000328642 3960 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
MS4A2Q01362 SLIT3-201ENST00000332966 4895 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
MS4A2Q01362 TMEM143-203ENST00000435956 2272 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
MS4A2Q01362 SUN2-203ENST00000406622 2725 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
MS4A2Q01362 ATE1-209ENST00000543447 4826 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
MS4A2Q01362 SNX18-202ENST00000343017 3140 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
MS4A2Q01362 SLC8B1-201ENST00000202831 2975 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
MS4A2Q01362 DPP6-205ENST00000427557 2388 ntTSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
MS4A2Q01362 MCM3AP-AS1-202ENST00000420074 1947 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
MS4A2Q01362 SSB-202ENST00000409333 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
MS4A2Q01362 CCAR2-202ENST00000389279 3980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
MS4A2Q01362 CCDC74A-206ENST00000467992 1347 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
MS4A2Q01362 ALDH3A2-221ENST00000581518 2785 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
MS4A2Q01362 PPIL2-212ENST00000626352 2625 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
MS4A2Q01362 MYADML2-201ENST00000409745 2452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
MS4A2Q01362 WDR45-239ENST00000634944 1745 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
MS4A2Q01362 ZSCAN10-209ENST00000576985 2739 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
MS4A2Q01362 PWP2-201ENST00000291576 3297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
MS4A2Q01362 RHOC-204ENST00000369633 1295 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.72■□□□□ 0.11
MS4A2Q01362 AC078883.2-201ENST00000441212 558 ntTSL 3 BASIC15.72■□□□□ 0.11
MS4A2Q01362 YPEL3-207ENST00000566134 761 ntTSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
MS4A2Q01362 ALOX15B-205ENST00000573359 1809 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
MS4A2Q01362 MAP7D1-203ENST00000373150 3238 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
MS4A2Q01362 NID1-202ENST00000366595 5412 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
MS4A2Q01362 SHROOM1-201ENST00000319854 3190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
MS4A2Q01362 PPP6R1-201ENST00000412770 3961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
MS4A2Q01362 GSN-206ENST00000394353 2311 ntTSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
MS4A2Q01362 PCED1B-202ENST00000546455 2328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
MS4A2Q01362 MAGEA12-202ENST00000393869 1761 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
MS4A2Q01362 KREMEN1-201ENST00000327813 2719 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
MS4A2Q01362 P3H1-201ENST00000236040 2993 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
MS4A2Q01362 TMEM65-201ENST00000297632 9029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
MS4A2Q01362 PML-215ENST00000565898 5393 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
MS4A2Q01362 CNGA4-201ENST00000379936 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
MS4A2Q01362 SYT15-202ENST00000374323 6428 ntTSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
MS4A2Q01362 HNRNPK-204ENST00000376263 2942 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.8 ms