Protein–RNA interactions for Protein: P63121

HERVK_113, Endogenous retrovirus group K member 113 Pro protein, humanhuman

Predictions only

Length 156 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HERVK_113P63121 CRADD-202ENST00000542893 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
HERVK_113P63121 TNFRSF14-AS1-202ENST00000432521 3608 ntTSL 2 BASIC11.55□□□□□ -0.56
HERVK_113P63121 DMRTC2-201ENST00000269945 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
HERVK_113P63121 IRF4-201ENST00000380956 5331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
HERVK_113P63121 KRTAP5-10-201ENST00000398531 1176 ntAPPRIS P1 BASIC11.55□□□□□ -0.56
HERVK_113P63121 ACP1-205ENST00000407983 703 ntTSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
HERVK_113P63121 LINC01381-201ENST00000431650 466 ntTSL 3 BASIC11.55□□□□□ -0.56
HERVK_113P63121 AC068134.1-202ENST00000439072 356 ntTSL 5 BASIC11.55□□□□□ -0.56
HERVK_113P63121 DANCR-204ENST00000444958 709 ntTSL 3 BASIC11.55□□□□□ -0.56
HERVK_113P63121 AC092597.1-201ENST00000487352 616 ntBASIC11.55□□□□□ -0.56
HERVK_113P63121 FNDC5-205ENST00000496770 837 ntTSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
HERVK_113P63121 DENND3-207ENST00000518347 850 ntTSL 2 BASIC11.55□□□□□ -0.56
HERVK_113P63121 AC103957.2-201ENST00000521218 510 ntTSL 2 BASIC11.55□□□□□ -0.56
HERVK_113P63121 MOK-234ENST00000524370 1165 ntTSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
HERVK_113P63121 TMEM218-206ENST00000527766 812 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.55□□□□□ -0.56
HERVK_113P63121 LINC02317-201ENST00000555413 426 ntTSL 3 BASIC11.55□□□□□ -0.56
HERVK_113P63121 FAM98C-205ENST00000588262 826 ntTSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
HERVK_113P63121 FCGRT-210ENST00000596975 1054 ntTSL 5 BASIC11.55□□□□□ -0.56
HERVK_113P63121 AC006942.1-201ENST00000600669 520 ntTSL 2 BASIC11.55□□□□□ -0.56
HERVK_113P63121 FGF14-AS2-201ENST00000606448 1074 ntBASIC11.55□□□□□ -0.56
HERVK_113P63121 AL138831.2-201ENST00000606564 490 ntBASIC11.55□□□□□ -0.56
HERVK_113P63121 LCE1E-203ENST00000619588 267 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.55□□□□□ -0.56
HERVK_113P63121 AC100830.1-201ENST00000560387 1609 ntTSL 2 BASIC11.55□□□□□ -0.56
HERVK_113P63121 SYVN1-202ENST00000307289 2841 ntTSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
HERVK_113P63121 POLL-206ENST00000370172 2308 ntTSL 2 BASIC11.55□□□□□ -0.56
HERVK_113P63121 MGAT4B-202ENST00000337755 3027 ntTSL 2 BASIC11.55□□□□□ -0.56
HERVK_113P63121 CTNNBIP1-203ENST00000377263 3000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
HERVK_113P63121 FOS-208ENST00000555686 1496 ntTSL 2 BASIC11.55□□□□□ -0.56
HERVK_113P63121 CD1E-213ENST00000444681 1820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
HERVK_113P63121 PCCB-209ENST00000469217 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.55□□□□□ -0.56
HERVK_113P63121 APC2-201ENST00000233607 10151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
HERVK_113P63121 MPP1-205ENST00000413259 2195 ntTSL 2 BASIC11.55□□□□□ -0.56
HERVK_113P63121 KRT76-201ENST00000332411 2529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
HERVK_113P63121 SOGA3-201ENST00000465909 3756 ntTSL 5 BASIC11.55□□□□□ -0.56
HERVK_113P63121 THSD4-202ENST00000355327 9200 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.55□□□□□ -0.56
HERVK_113P63121 MLLT6-210ENST00000620609 2714 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
HERVK_113P63121 CCDC83-201ENST00000280245 2358 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC11.55□□□□□ -0.56
HERVK_113P63121 ZSWIM8-221ENST00000604729 6075 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.55□□□□□ -0.56
HERVK_113P63121 GSAP-201ENST00000257626 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
HERVK_113P63121 RNF182-206ENST00000537388 3274 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.55□□□□□ -0.56
HERVK_113P63121 UIMC1-201ENST00000377227 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
HERVK_113P63121 PDPK1-202ENST00000342085 7241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
HERVK_113P63121 PHGDH-202ENST00000369409 1882 ntTSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
HERVK_113P63121 C19orf48-201ENST00000345523 1503 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.55□□□□□ -0.56
HERVK_113P63121 DAND5-202ENST00000585548 1731 ntTSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
HERVK_113P63121 JPH4-201ENST00000356300 4278 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
HERVK_113P63121 USP19-205ENST00000398898 4474 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.54□□□□□ -0.56
HERVK_113P63121 KITLG-202ENST00000347404 1948 ntTSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
HERVK_113P63121 C14orf93-205ENST00000397379 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
HERVK_113P63121 SLC34A1-204ENST00000512593 1912 ntTSL 2 BASIC11.54□□□□□ -0.56
HERVK_113P63121 POM121-203ENST00000434423 3750 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.54□□□□□ -0.56
HERVK_113P63121 KCNK7-203ENST00000394216 1563 ntTSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
HERVK_113P63121 SCARB1-202ENST00000339570 3329 ntTSL 5 BASIC11.54□□□□□ -0.56
HERVK_113P63121 AC025165.1-201ENST00000356672 2355 ntTSL 5 BASIC11.54□□□□□ -0.56
HERVK_113P63121 BTNL9-201ENST00000327705 3500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
HERVK_113P63121 ABHD10-201ENST00000273359 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
HERVK_113P63121 MRPL49-201ENST00000279242 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
HERVK_113P63121 SLC29A1-205ENST00000371740 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
HERVK_113P63121 SASH3-201ENST00000356892 2626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
HERVK_113P63121 KRAS-201ENST00000256078 1119 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
HERVK_113P63121 COPE-201ENST00000262812 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
HERVK_113P63121 COPE-203ENST00000351079 907 ntTSL 2 BASIC11.54□□□□□ -0.56
HERVK_113P63121 DHRS4L2-202ENST00000397071 1117 ntTSL 2 BASIC11.54□□□□□ -0.56
HERVK_113P63121 HDAC11-204ENST00000404040 967 ntTSL 3 BASIC11.54□□□□□ -0.56
HERVK_113P63121 UCHL1-204ENST00000503431 917 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.54□□□□□ -0.56
HERVK_113P63121 AC009185.1-201ENST00000517634 911 ntTSL 3 BASIC11.54□□□□□ -0.56
HERVK_113P63121 TUBA1A-203ENST00000546918 984 ntTSL 3 BASIC11.54□□□□□ -0.56
HERVK_113P63121 RDH5-202ENST00000547072 1054 ntTSL 5 BASIC11.54□□□□□ -0.56
HERVK_113P63121 AC005786.3-201ENST00000589360 565 ntTSL 3 BASIC11.54□□□□□ -0.56
HERVK_113P63121 AC008735.6-201ENST00000635964 1292 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.54□□□□□ -0.56
HERVK_113P63121 GCAT-202ENST00000323205 1656 ntTSL 2 BASIC11.54□□□□□ -0.56
HERVK_113P63121 TINF2-208ENST00000558566 1874 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.54□□□□□ -0.56
HERVK_113P63121 LSP1-217ENST00000612798 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.54□□□□□ -0.56
HERVK_113P63121 GTDC1-219ENST00000542155 2677 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.54□□□□□ -0.56
HERVK_113P63121 B4GALNT3-201ENST00000266383 5068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
HERVK_113P63121 NTRK3-202ENST00000355254 2938 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.54□□□□□ -0.56
HERVK_113P63121 ADAM15-208ENST00000447332 2146 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.54□□□□□ -0.56
HERVK_113P63121 POTEE-204ENST00000613282 1926 ntTSL 5 BASIC11.54□□□□□ -0.56
HERVK_113P63121 POTEI-202ENST00000615053 1926 ntTSL 5 BASIC11.54□□□□□ -0.56
HERVK_113P63121 APBB1-224ENST00000621678 1907 ntTSL 5 BASIC11.54□□□□□ -0.56
HERVK_113P63121 SEPT8-208ENST00000378721 1723 ntTSL 5 BASIC11.54□□□□□ -0.56
HERVK_113P63121 TTC29-202ENST00000398886 1729 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.54□□□□□ -0.56
HERVK_113P63121 NFIX-214ENST00000592199 1509 ntTSL 5 BASIC11.54□□□□□ -0.56
HERVK_113P63121 FKBP3-202ENST00000396062 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
HERVK_113P63121 NTMT1-211ENST00000617943 1346 ntTSL 3 BASIC11.54□□□□□ -0.56
HERVK_113P63121 SLC6A9-204ENST00000372307 2162 ntTSL 2 BASIC11.54□□□□□ -0.56
HERVK_113P63121 LGALS3BP-218ENST00000591778 1961 ntTSL 2 BASIC11.54□□□□□ -0.56
HERVK_113P63121 NDUFV1-201ENST00000322776 1596 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
HERVK_113P63121 SSTR2-201ENST00000357585 7683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
HERVK_113P63121 RNF113B-201ENST00000267291 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
HERVK_113P63121 FUT3-202ENST00000458379 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
HERVK_113P63121 TNRC18-203ENST00000399537 10572 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.53□□□□□ -0.56
HERVK_113P63121 TNRC18-205ENST00000430969 10562 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.53□□□□□ -0.56
HERVK_113P63121 CPEB2-205ENST00000442003 6797 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.53□□□□□ -0.56
HERVK_113P63121 RGN-202ENST00000352078 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
HERVK_113P63121 ROCK1-201ENST00000399799 9484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
HERVK_113P63121 KIFC1-211ENST00000428849 2706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
HERVK_113P63121 CEP164-201ENST00000278935 5630 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
HERVK_113P63121 SLFNL1-203ENST00000372611 1865 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.53□□□□□ -0.56
HERVK_113P63121 LINC01250-201ENST00000457478 2344 ntTSL 2 BASIC11.53□□□□□ -0.56
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 42.7 ms