Protein–RNA interactions for Protein: P62701

RPS4X, 40S ribosomal protein S4, X isoform, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 263 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RPS4XP62701 AC022188.1-201ENST00000620960 1664 ntBASIC15.02□□□□□ -0.01
RPS4XP62701 TRPC1-201ENST00000273482 4324 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
RPS4XP62701 SNX31-201ENST00000311812 2457 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.02□□□□□ -0.01
RPS4XP62701 RAB37-208ENST00000402449 1560 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.02□□□□□ -0.01
RPS4XP62701 MALT1-202ENST00000348428 9368 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
RPS4XP62701 SEPT4-201ENST00000317256 1530 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
RPS4XP62701 CCDC83-201ENST00000280245 2358 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.02□□□□□ -0.01
RPS4XP62701 CCNA2-201ENST00000274026 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
RPS4XP62701 AP2A2-222ENST00000534328 1491 ntTSL 5 BASIC15.01□□□□□ -0.01
RPS4XP62701 SH2B1-206ENST00000545570 1488 ntTSL 2 BASIC15.01□□□□□ -0.01
RPS4XP62701 FRMD6-AS1-201ENST00000617151 2229 ntBASIC15.01□□□□□ -0.01
RPS4XP62701 SYTL2-215ENST00000527523 3049 ntTSL 2 BASIC15.01□□□□□ -0.01
RPS4XP62701 UIMC1-201ENST00000377227 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
RPS4XP62701 CRELD1-206ENST00000452070 1778 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.01□□□□□ -0.01
RPS4XP62701 TRIL-201ENST00000539664 4935 ntAPPRIS P1 BASIC15.01□□□□□ -0.01
RPS4XP62701 LCA10-201ENST00000618311 1392 ntTSL 2 BASIC15.01□□□□□ -0.01
RPS4XP62701 CACNA1G-206ENST00000416767 4899 ntTSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
RPS4XP62701 OR6D1P-203ENST00000641209 4860 ntBASIC15.01□□□□□ -0.01
RPS4XP62701 TMPRSS2-206ENST00000458356 1701 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.01□□□□□ -0.01
RPS4XP62701 CLPTM1L-209ENST00000507807 1740 ntTSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
RPS4XP62701 CGREF1-206ENST00000405600 1346 ntAPPRIS P2 TSL 4 BASIC15.01□□□□□ -0.01
RPS4XP62701 STARD3NL-204ENST00000434197 1341 ntTSL 5 BASIC15.01□□□□□ -0.01
RPS4XP62701 TLE2-202ENST00000426948 2406 ntTSL 5 BASIC15.01□□□□□ -0.01
RPS4XP62701 EVA1C-202ENST00000382699 1668 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
RPS4XP62701 MOSPD3-201ENST00000223054 1053 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.01□□□□□ -0.01
RPS4XP62701 PF4-201ENST00000296029 604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
RPS4XP62701 TMEM44-201ENST00000330115 1278 ntTSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
RPS4XP62701 PAXX-201ENST00000371620 812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
RPS4XP62701 CD99-204ENST00000381187 892 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.01□□□□□ -0.01
RPS4XP62701 PMP22-202ENST00000395936 816 ntTSL 3 BASIC15.01□□□□□ -0.01
RPS4XP62701 MCFD2-205ENST00000409218 648 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.01□□□□□ -0.01
RPS4XP62701 RFX3-AS1-201ENST00000423112 552 ntTSL 3 BASIC15.01□□□□□ -0.01
RPS4XP62701 AC108751.1-201ENST00000490852 363 ntBASIC15.01□□□□□ -0.01
RPS4XP62701 TPD52L1-211ENST00000532429 1022 ntTSL 2 BASIC15.01□□□□□ -0.01
RPS4XP62701 AP000763.4-201ENST00000544674 752 ntTSL 5 BASIC15.01□□□□□ -0.01
RPS4XP62701 AC008992.1-201ENST00000591132 446 ntTSL 2 BASIC15.01□□□□□ -0.01
RPS4XP62701 C16orf71-201ENST00000299320 2722 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
RPS4XP62701 C1orf43-201ENST00000350592 1610 ntTSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
RPS4XP62701 NKIRAS1-202ENST00000412028 1605 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.01□□□□□ -0.01
RPS4XP62701 C7orf31-201ENST00000283905 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
RPS4XP62701 INTS11-247ENST00000540437 2629 ntTSL 2 BASIC15.01□□□□□ -0.01
RPS4XP62701 INPP4A-204ENST00000409540 3231 ntTSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
RPS4XP62701 CHAT-205ENST00000395562 2528 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
RPS4XP62701 SH3BP5-202ENST00000383791 2822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
RPS4XP62701 LINC01502-201ENST00000445997 2471 ntTSL 2 BASIC15.01□□□□□ -0.01
RPS4XP62701 WASF1-206ENST00000392588 3122 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.01□□□□□ -0.01
RPS4XP62701 SLC44A1-203ENST00000374724 3088 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.01□□□□□ -0.01
RPS4XP62701 INTS14-209ENST00000567744 2419 ntTSL 2 BASIC15.01□□□□□ -0.01
RPS4XP62701 C4orf50-202ENST00000531445 6860 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.01□□□□□ -0.01
RPS4XP62701 EPHX2-201ENST00000380476 2064 ntTSL 2 BASIC15.01□□□□□ -0.01
RPS4XP62701 FAM214B-206ENST00000603301 3256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
RPS4XP62701 ORMDL1-203ENST00000392350 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
RPS4XP62701 NCAPH2-205ENST00000420993 2037 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
RPS4XP62701 MAP3K9-206ENST00000555993 4449 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
RPS4XP62701 PRR15-201ENST00000319694 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
RPS4XP62701 KRT23-201ENST00000209718 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
RPS4XP62701 SLFNL1-201ENST00000302946 1951 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
RPS4XP62701 LIFR-202ENST00000453190 4253 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15□□□□□ -0.01
RPS4XP62701 ZSCAN10-201ENST00000252463 2463 ntTSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
RPS4XP62701 COL4A3BP-203ENST00000380494 5651 ntTSL 2 BASIC15□□□□□ -0.01
RPS4XP62701 SLC6A9-204ENST00000372307 2162 ntTSL 2 BASIC15□□□□□ -0.01
RPS4XP62701 ELOF1-201ENST00000252445 1019 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15□□□□□ -0.01
RPS4XP62701 MRPS16-201ENST00000372940 866 ntTSL 2 BASIC15□□□□□ -0.01
RPS4XP62701 ODF3B-204ENST00000405135 917 ntTSL 5 BASIC15□□□□□ -0.01
RPS4XP62701 HNRNPA1P28-201ENST00000424481 961 ntBASIC15□□□□□ -0.01
RPS4XP62701 AC004832.2-201ENST00000426397 482 ntBASIC15□□□□□ -0.01
RPS4XP62701 AL049569.1-201ENST00000446261 636 ntTSL 3 BASIC15□□□□□ -0.01
RPS4XP62701 AL391069.2-202ENST00000447795 622 ntTSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
RPS4XP62701 DHDH-204ENST00000523250 634 ntTSL 5 BASIC15□□□□□ -0.01
RPS4XP62701 AC135050.2-203ENST00000529564 725 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15□□□□□ -0.01
RPS4XP62701 AP000442.1-201ENST00000533552 769 ntTSL 5 BASIC15□□□□□ -0.01
RPS4XP62701 MMP17-203ENST00000535004 719 ntTSL 3 BASIC15□□□□□ -0.01
RPS4XP62701 LDLRAD2-203ENST00000543870 1180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
RPS4XP62701 ELOF1-204ENST00000587806 1172 ntTSL 2 BASIC15□□□□□ -0.01
RPS4XP62701 ZEB1-AS1-209ENST00000607455 559 ntTSL 4 BASIC15□□□□□ -0.01
RPS4XP62701 BACE1-201ENST00000313005 6326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
RPS4XP62701 DHX30-205ENST00000445061 4065 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
RPS4XP62701 PUF60-201ENST00000313352 1804 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
RPS4XP62701 TMEM101-201ENST00000206380 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
RPS4XP62701 COQ6-220ENST00000629426 1538 ntTSL 5 BASIC15□□□□□ -0.01
RPS4XP62701 DNAJB8-AS1-201ENST00000471626 1798 ntTSL 2 BASIC15□□□□□ -0.01
RPS4XP62701 ARHGAP44-202ENST00000340825 4211 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
RPS4XP62701 ARHGAP44-203ENST00000379672 4228 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
RPS4XP62701 C2CD4C-201ENST00000332235 3129 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15□□□□□ -0.01
RPS4XP62701 SPATC1-201ENST00000377470 2007 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
RPS4XP62701 GMPR2-217ENST00000559104 1719 ntTSL 5 BASIC15□□□□□ -0.01
RPS4XP62701 PDK1-203ENST00000410055 2990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
RPS4XP62701 ERO1A-201ENST00000395686 5285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
RPS4XP62701 CLDN14-204ENST00000399137 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
RPS4XP62701 ARID5A-201ENST00000357485 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
RPS4XP62701 NUCB1-202ENST00000407032 2158 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15□□□□□ -0.01
RPS4XP62701 SCP2-201ENST00000371509 1889 ntTSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
RPS4XP62701 SP100-204ENST00000409341 1898 ntTSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
RPS4XP62701 HHATL-205ENST00000441594 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
RPS4XP62701 SLC37A4-217ENST00000545985 2606 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.99□□□□□ -0.01
RPS4XP62701 RCAN3-210ENST00000618490 2386 ntTSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
RPS4XP62701 PCGF3-213ENST00000620529 1899 ntBASIC14.99□□□□□ -0.01
RPS4XP62701 IGLL5-203ENST00000532223 1335 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
RPS4XP62701 MTERF2-201ENST00000240050 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
RPS4XP62701 SMIM10-201ENST00000330288 1536 ntAPPRIS P1 BASIC14.99□□□□□ -0.01
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