Protein–RNA interactions for Protein: P57773

GJA9, Gap junction alpha-9 protein, humanhuman

Predictions only

Length 515 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GJA9P57773 DNAJB2-201ENST00000336576 3176 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
GJA9P57773 C19orf54-203ENST00000470681 2521 ntTSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
GJA9P57773 ZSWIM5-201ENST00000359600 5819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
GJA9P57773 YY1AP1-206ENST00000359205 2690 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
GJA9P57773 TRIM8-201ENST00000302424 2831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
GJA9P57773 AL512652.2-201ENST00000625156 1716 ntBASIC18.28■□□□□ 0.52
GJA9P57773 POC1A-201ENST00000296484 1898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
GJA9P57773 TRIM50-201ENST00000333149 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
GJA9P57773 PTGES3-202ENST00000414274 1547 ntTSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
GJA9P57773 IMPDH1P4-201ENST00000445028 1534 ntBASIC18.28■□□□□ 0.52
GJA9P57773 RAD1-208ENST00000628399 1678 ntTSL 3 BASIC18.28■□□□□ 0.52
GJA9P57773 MAPK8IP3-216ENST00000610761 5626 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
GJA9P57773 HNRNPUL1-203ENST00000378215 2864 ntTSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
GJA9P57773 PANK2-209ENST00000621507 1763 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
GJA9P57773 KDM1A-202ENST00000400181 3059 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
GJA9P57773 RAB43-201ENST00000315150 4467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
GJA9P57773 B3GNT8-201ENST00000321702 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
GJA9P57773 RANBP10-201ENST00000317506 5341 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
GJA9P57773 RANBP10-209ENST00000630626 5305 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
GJA9P57773 MUTYH-201ENST00000354383 1744 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
GJA9P57773 BAG5-201ENST00000299204 4848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
GJA9P57773 H2BFWT-201ENST00000217926 894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
GJA9P57773 WDR38-201ENST00000373574 1252 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
GJA9P57773 PIR-201ENST00000380420 1282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
GJA9P57773 MXI1-205ENST00000393134 889 ntTSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.52
GJA9P57773 TRIM74-202ENST00000395244 1286 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
GJA9P57773 AC062015.1-201ENST00000423838 1134 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
GJA9P57773 TRIM73-204ENST00000447409 1286 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
GJA9P57773 ACA64.2-201ENST00000459014 129 ntBASIC18.27■□□□□ 0.52
GJA9P57773 HSPB7-207ENST00000487046 844 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
GJA9P57773 FAU-205ENST00000527548 538 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
GJA9P57773 AP001995.1-201ENST00000531784 1157 ntTSL 4 BASIC18.27■□□□□ 0.52
GJA9P57773 AC105339.1-202ENST00000559535 1283 ntTSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
GJA9P57773 SLC9A3-AS1-206ENST00000607005 435 ntTSL 3 BASIC18.27■□□□□ 0.52
GJA9P57773 AC017083.2-201ENST00000608069 979 ntBASIC18.27■□□□□ 0.52
GJA9P57773 ZNF274-202ENST00000345813 2678 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
GJA9P57773 SCARB1-208ENST00000544327 1812 ntTSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
GJA9P57773 OLA1-202ENST00000344357 1656 ntTSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.52
GJA9P57773 ZNF140-207ENST00000440550 1663 ntTSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.52
GJA9P57773 LRRC38-201ENST00000376085 2209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
GJA9P57773 AC012414.7-201ENST00000621235 1507 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
GJA9P57773 NECAB2-203ENST00000565691 2064 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
GJA9P57773 CLEC18C-201ENST00000314151 1934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
GJA9P57773 KLK15-201ENST00000326856 1389 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.51
GJA9P57773 CLEC18A-208ENST00000568461 1934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
GJA9P57773 RAB40C-203ENST00000535977 2717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.51
GJA9P57773 LRRN4CL-201ENST00000317449 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
GJA9P57773 MEG3-205ENST00000412736 1615 ntTSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.51
GJA9P57773 SFRP2-201ENST00000274063 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
GJA9P57773 MPP1-202ENST00000369534 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
GJA9P57773 NR2E3-204ENST00000621736 2032 ntTSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.51
GJA9P57773 ZNF76-202ENST00000339411 2447 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
GJA9P57773 RNF166-203ENST00000541206 2419 ntTSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.51
GJA9P57773 TNPO2-203ENST00000450764 4993 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
GJA9P57773 DEF6-201ENST00000316637 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
GJA9P57773 PRMT2-203ENST00000355680 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
GJA9P57773 DVL2-209ENST00000575458 2659 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
GJA9P57773 FST-202ENST00000396947 2538 ntTSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
GJA9P57773 PHF1-201ENST00000374512 2224 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
GJA9P57773 HOXC5-201ENST00000312492 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
GJA9P57773 DYRK1B-205ENST00000597639 1806 ntTSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
GJA9P57773 ZNF789-201ENST00000331410 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
GJA9P57773 ZNF22-201ENST00000298299 2551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
GJA9P57773 ATP6V0B-201ENST00000236067 944 ntTSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
GJA9P57773 NTMT1-201ENST00000372480 852 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.26■□□□□ 0.51
GJA9P57773 AL133456.1-201ENST00000415655 577 ntTSL 4 BASIC18.26■□□□□ 0.51
GJA9P57773 H2AFV-207ENST00000446531 1041 ntTSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
GJA9P57773 AC092910.3-202ENST00000469070 982 ntTSL 3 BASIC18.26■□□□□ 0.51
GJA9P57773 ATP6V0B-211ENST00000498664 825 ntTSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
GJA9P57773 SERF1B-208ENST00000515588 792 ntTSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
GJA9P57773 LINC01975-201ENST00000571890 549 ntTSL 4 BASIC18.26■□□□□ 0.51
GJA9P57773 5S_rRNA.22-201ENST00000614916 106 ntBASIC18.26■□□□□ 0.51
GJA9P57773 AC004461.2-201ENST00000629517 803 ntBASIC18.26■□□□□ 0.51
GJA9P57773 POMK-203ENST00000614426 1527 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC18.26■□□□□ 0.51
GJA9P57773 ISG20-201ENST00000306072 1856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
GJA9P57773 NR4A1-203ENST00000394824 2639 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
GJA9P57773 AL391256.1-201ENST00000443260 1855 ntBASIC18.26■□□□□ 0.51
GJA9P57773 AP005717.1-201ENST00000500705 1899 ntTSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
GJA9P57773 CD300LG-204ENST00000539718 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
GJA9P57773 CCDC91-220ENST00000545336 2738 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
GJA9P57773 CCDC137-201ENST00000329214 2468 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
GJA9P57773 CCKAR-201ENST00000295589 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
GJA9P57773 PIMREG-201ENST00000250056 1473 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
GJA9P57773 MRPS21-201ENST00000581066 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
GJA9P57773 ALOX15B-205ENST00000573359 1809 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
GJA9P57773 ZNF48-206ENST00000622647 2695 ntTSL 4 BASIC18.26■□□□□ 0.51
GJA9P57773 RHCE-201ENST00000294413 1591 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
GJA9P57773 IGSF8-205ENST00000614243 2191 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
GJA9P57773 KLK8-211ENST00000600767 1324 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
GJA9P57773 HNF1A-212ENST00000544413 2014 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
GJA9P57773 UBE2D2-202ENST00000398733 2702 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
GJA9P57773 TLK2-203ENST00000346027 3449 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
GJA9P57773 NOL4-211ENST00000589544 2221 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
GJA9P57773 ACSL6-201ENST00000296869 2561 ntTSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
GJA9P57773 TLE2-217ENST00000590536 2344 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
GJA9P57773 C2orf54-203ENST00000402775 1958 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
GJA9P57773 AL512625.3-203ENST00000445604 1602 ntTSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
GJA9P57773 NDUFB7-201ENST00000215565 531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
GJA9P57773 SLC18B1-202ENST00000367918 472 ntTSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
GJA9P57773 LYPLA2-201ENST00000374501 1117 ntTSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 49 ms