Protein–RNA interactions for Protein: P56597

NME5, Nucleoside diphosphate kinase homolog 5, humanhuman

Predictions only

Length 212 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NME5P56597 NLE1-202ENST00000442241 2588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
NME5P56597 CCDC187-205ENST00000638797 10126 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
NME5P56597 SYNRG-222ENST00000614941 3406 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
NME5P56597 AC006277.1-201ENST00000624348 1610 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
NME5P56597 PODNL1-201ENST00000254320 1859 ntTSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
NME5P56597 ARMC6-203ENST00000392336 1866 ntTSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
NME5P56597 GPR32-201ENST00000270590 1269 ntAPPRIS P1 BASIC16.17■□□□□ 0.18
NME5P56597 NDUFA11-201ENST00000308961 539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
NME5P56597 SOD2-201ENST00000337404 991 ntTSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
NME5P56597 ROMO1-203ENST00000374077 422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
NME5P56597 MPIG6B-205ENST00000375810 910 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
NME5P56597 NUS1P2-201ENST00000417358 873 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
NME5P56597 PCED1CP-201ENST00000419887 785 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
NME5P56597 BX890604.1-205ENST00000425492 856 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
NME5P56597 METTL21A-205ENST00000426075 1051 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
NME5P56597 BX005266.1-201ENST00000473402 457 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
NME5P56597 CSRP1-214ENST00000531916 890 ntTSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
NME5P56597 MPI-205ENST00000562606 1052 ntTSL 3 BASIC16.17■□□□□ 0.18
NME5P56597 AL049597.2-201ENST00000565575 961 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
NME5P56597 COX5A-204ENST00000567270 579 ntTSL 3 BASIC16.17■□□□□ 0.18
NME5P56597 FAM57A-205ENST00000572018 373 ntTSL 3 BASIC16.17■□□□□ 0.18
NME5P56597 AC010463.1-201ENST00000596542 1207 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
NME5P56597 FLT3LG-206ENST00000597551 951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
NME5P56597 AC099336.1-202ENST00000602961 463 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
NME5P56597 TMEM114-203ENST00000620492 945 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
NME5P56597 PURB-201ENST00000395699 9069 ntAPPRIS P1 BASIC16.17■□□□□ 0.18
NME5P56597 CACFD1-206ENST00000540581 2880 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
NME5P56597 AC010491.1-201ENST00000563101 2797 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
NME5P56597 ATG9B-212ENST00000639579 4539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
NME5P56597 DPP6-203ENST00000404039 4798 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
NME5P56597 CDK1-204ENST00000448257 1948 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
NME5P56597 PDE1C-202ENST00000396182 2420 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
NME5P56597 TRMT2A-202ENST00000403707 2928 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
NME5P56597 RBM12-201ENST00000359646 5332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
NME5P56597 TBRG4-203ENST00000395655 2225 ntTSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
NME5P56597 LMNB1-201ENST00000261366 2878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
NME5P56597 CDH7-203ENST00000536984 3766 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
NME5P56597 CCT6A-202ENST00000335503 2529 ntTSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
NME5P56597 CERK-201ENST00000216264 4450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
NME5P56597 LINC01270-201ENST00000371639 2281 ntTSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
NME5P56597 RASA4B-202ENST00000465829 2931 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
NME5P56597 TGFBR2-202ENST00000359013 4605 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
NME5P56597 COQ8B-201ENST00000243583 2041 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
NME5P56597 SLITRK2-202ENST00000370490 7672 ntAPPRIS P1 BASIC16.16■□□□□ 0.18
NME5P56597 LCAT-201ENST00000264005 1507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
NME5P56597 RAD1-208ENST00000628399 1678 ntTSL 3 BASIC16.16■□□□□ 0.18
NME5P56597 CREM-211ENST00000374726 1207 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
NME5P56597 CGB7-201ENST00000377280 918 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.16■□□□□ 0.18
NME5P56597 PDLIM7-205ENST00000393551 1226 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
NME5P56597 COLEC11-207ENST00000404205 1062 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
NME5P56597 NABP1-203ENST00000409510 843 ntTSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
NME5P56597 AC069368.1-202ENST00000437723 750 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
NME5P56597 MTG1-205ENST00000477902 1283 ntTSL 3 BASIC16.16■□□□□ 0.18
NME5P56597 KNCN-203ENST00000481882 1037 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
NME5P56597 AC104819.1-201ENST00000504587 486 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
NME5P56597 AC087289.1-201ENST00000586808 890 ntTSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
NME5P56597 CIRBP-235ENST00000591935 746 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC16.16■□□□□ 0.18
NME5P56597 TMIGD2-202ENST00000595645 1212 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
NME5P56597 BEAN1-211ENST00000622872 1171 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
NME5P56597 SUSD4-204ENST00000366878 3025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
NME5P56597 SEPT11-203ENST00000502584 2615 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
NME5P56597 ANKRD26-201ENST00000376087 6591 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
NME5P56597 SIK3-205ENST00000446921 3858 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
NME5P56597 AL596087.1-201ENST00000400979 1969 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
NME5P56597 AC009292.1-201ENST00000502156 1986 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
NME5P56597 ZNF276-201ENST00000289816 4589 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
NME5P56597 RASA1-201ENST00000274376 3752 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
NME5P56597 LMF2-202ENST00000474879 2582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
NME5P56597 PRKAG1-217ENST00000552212 1497 ntTSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
NME5P56597 SLC4A2-214ENST00000485713 4925 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
NME5P56597 CPEB2-203ENST00000382395 5524 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
NME5P56597 C14orf93-202ENST00000341470 2221 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
NME5P56597 PTPRF-201ENST00000359947 7727 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
NME5P56597 AC007495.1-201ENST00000501259 2678 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
NME5P56597 IER3-202ENST00000376377 1350 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
NME5P56597 DYRK1B-205ENST00000597639 1806 ntTSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
NME5P56597 ELFN1-202ENST00000561626 3742 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
NME5P56597 TMUB2-209ENST00000587989 1969 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC16.15■□□□□ 0.18
NME5P56597 WIZ-206ENST00000599686 3644 ntTSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
NME5P56597 KXD1-201ENST00000222307 1426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
NME5P56597 CRAT-201ENST00000318080 2763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
NME5P56597 TUBB-206ENST00000330914 2632 ntTSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
NME5P56597 CELF4-202ENST00000361795 1853 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
NME5P56597 ZFAND5-205ENST00000376962 2785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
NME5P56597 LRRC20-206ENST00000395011 2903 ntTSL 4 BASIC16.15■□□□□ 0.18
NME5P56597 ATP5J-203ENST00000400090 647 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
NME5P56597 PLAGL1-206ENST00000416623 3237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
NME5P56597 LINC00887-203ENST00000429578 1717 ntTSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
NME5P56597 CATIP-AS1-202ENST00000441749 480 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
NME5P56597 ABCD1P5-201ENST00000445663 754 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
NME5P56597 RPP14-206ENST00000466547 805 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.15■□□□□ 0.18
NME5P56597 C12orf76-204ENST00000547573 607 ntTSL 3 BASIC16.15■□□□□ 0.18
NME5P56597 TNFRSF13B-206ENST00000583789 859 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
NME5P56597 GZMM-202ENST00000592501 941 ntTSL 3 BASIC16.15■□□□□ 0.18
NME5P56597 TERC-201ENST00000602385 541 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
NME5P56597 AL590235.2-202ENST00000602543 594 ntTSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
NME5P56597 C10orf111-201ENST00000624760 1714 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
NME5P56597 MTHFR-217ENST00000641820 1569 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
NME5P56597 PTPN13-204ENST00000436978 8573 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
NME5P56597 RNF182-206ENST00000537388 3274 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 38.5 ms