Protein–RNA interactions for Protein: P55011

SLC12A2, Solute carrier family 12 member 2, humanhuman

Predictions only

Length 1,212 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLC12A2P55011 SURF4-208ENST00000613129 3148 ntTSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
SLC12A2P55011 C12orf29-201ENST00000356891 2919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
SLC12A2P55011 GPAT3-208ENST00000611707 2633 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
SLC12A2P55011 FOXP1-218ENST00000498215 2400 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
SLC12A2P55011 AL391005.1-201ENST00000623953 2435 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
SLC12A2P55011 SLC6A9-202ENST00000360584 2330 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
SLC12A2P55011 CUL3-202ENST00000344951 6592 ntTSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
SLC12A2P55011 RPRD1A-209ENST00000590898 1945 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
SLC12A2P55011 PABPC4-203ENST00000372858 2753 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
SLC12A2P55011 GLOD4-203ENST00000536578 2497 ntTSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
SLC12A2P55011 BCAT2-209ENST00000599246 1449 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
SLC12A2P55011 SARDH-202ENST00000371867 1326 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
SLC12A2P55011 CCNC-209ENST00000520371 2186 ntTSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
SLC12A2P55011 IRF2BP2-202ENST00000366610 4615 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
SLC12A2P55011 RUNDC3B-203ENST00000394654 2064 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
SLC12A2P55011 TGOLN2-203ENST00000398263 6138 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
SLC12A2P55011 DUOXA2-201ENST00000323030 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
SLC12A2P55011 GALE-216ENST00000617979 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
SLC12A2P55011 MAGED4-211ENST00000599522 2669 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
SLC12A2P55011 AC083864.1-201ENST00000381493 1497 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
SLC12A2P55011 NSFL1C-201ENST00000216879 3568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
SLC12A2P55011 TMEM177-201ENST00000272521 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
SLC12A2P55011 LRRC59-201ENST00000225972 2910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
SLC12A2P55011 ZNF805-201ENST00000354309 2396 ntTSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
SLC12A2P55011 CFAP45-201ENST00000368099 1842 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
SLC12A2P55011 HIST2H3DP1-201ENST00000401004 416 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
SLC12A2P55011 PTCHD3P3-201ENST00000403073 906 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
SLC12A2P55011 AC087163.2-201ENST00000457299 853 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
SLC12A2P55011 AC004080.2-201ENST00000523331 556 ntTSL 4 BASIC16.69■□□□□ 0.26
SLC12A2P55011 TMEM106C-214ENST00000550161 976 ntTSL 3 BASIC16.69■□□□□ 0.26
SLC12A2P55011 CIRBP-235ENST00000591935 746 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC16.69■□□□□ 0.26
SLC12A2P55011 AC006557.2-201ENST00000592985 1240 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
SLC12A2P55011 REXO1L6P-202ENST00000619970 1078 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
SLC12A2P55011 SETD3-209ENST00000630307 1281 ntTSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
SLC12A2P55011 SEPT8-204ENST00000378699 2289 ntTSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
SLC12A2P55011 PICALM-204ENST00000526033 3613 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
SLC12A2P55011 LHCGR-204ENST00000405626 2073 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
SLC12A2P55011 CCDC40-201ENST00000269318 1970 ntTSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
SLC12A2P55011 MIF4GD-204ENST00000577542 1531 ntTSL 3 BASIC16.69■□□□□ 0.26
SLC12A2P55011 NFIX-214ENST00000592199 1509 ntTSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
SLC12A2P55011 KCNJ10-208ENST00000639408 1546 ntTSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
SLC12A2P55011 SOWAHB-201ENST00000334306 3220 ntAPPRIS P1 BASIC16.69■□□□□ 0.26
SLC12A2P55011 MBD1-224ENST00000591416 4905 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
SLC12A2P55011 HYAL1-202ENST00000320295 2324 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
SLC12A2P55011 PAX3-207ENST00000409551 1782 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
SLC12A2P55011 LINC00487-201ENST00000382045 2131 ntTSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
SLC12A2P55011 PPM1F-203ENST00000407142 5587 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
SLC12A2P55011 SLC6A2-209ENST00000568943 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
SLC12A2P55011 ATP5S-201ENST00000245448 1671 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
SLC12A2P55011 STK32C-204ENST00000368622 2010 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
SLC12A2P55011 ROBO3-201ENST00000397801 4569 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
SLC12A2P55011 ROBO3-220ENST00000538940 4551 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
SLC12A2P55011 AC092143.3-201ENST00000565150 1900 ntTSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
SLC12A2P55011 TIMP3-201ENST00000266085 4603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
SLC12A2P55011 DIMT1-201ENST00000199320 2859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
SLC12A2P55011 CAP2-202ENST00000378990 1812 ntTSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
SLC12A2P55011 C12orf66-204ENST00000544871 2441 ntTSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
SLC12A2P55011 AC107871.1-202ENST00000562767 3389 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.68■□□□□ 0.26
SLC12A2P55011 EDC3-202ENST00000426797 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
SLC12A2P55011 SIK1-201ENST00000270162 4712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
SLC12A2P55011 CU639417.2-201ENST00000613488 4705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
SLC12A2P55011 BX088651.4-201ENST00000435586 2579 ntTSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
SLC12A2P55011 KDM3A-201ENST00000312912 4886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
SLC12A2P55011 GJC3-201ENST00000312891 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
SLC12A2P55011 TYMS-202ENST00000323250 693 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
SLC12A2P55011 RAB17-203ENST00000409576 466 ntTSL 3 BASIC16.68■□□□□ 0.26
SLC12A2P55011 BAALC-AS2-201ENST00000436771 496 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
SLC12A2P55011 DYNC1LI2-202ENST00000440564 1145 ntTSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
SLC12A2P55011 MOBP-208ENST00000441980 830 ntAPPRIS P4 TSL 4 BASIC16.68■□□□□ 0.26
SLC12A2P55011 TM4SF19-TCTEX1D2-201ENST00000442633 964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
SLC12A2P55011 PGAP2-206ENST00000459679 795 ntTSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
SLC12A2P55011 MRPL21-208ENST00000567045 932 ntTSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
SLC12A2P55011 ATPAF2-213ENST00000585101 566 ntTSL 4 BASIC16.68■□□□□ 0.26
SLC12A2P55011 IER2-202ENST00000587885 1291 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.68■□□□□ 0.26
SLC12A2P55011 FAM238C-204ENST00000640224 1268 ntTSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
SLC12A2P55011 CCNI2-204ENST00000614847 2642 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
SLC12A2P55011 ATE1-209ENST00000543447 4826 ntTSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
SLC12A2P55011 UBQLN1-201ENST00000257468 2299 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
SLC12A2P55011 TRABD-202ENST00000380909 2272 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
SLC12A2P55011 RGN-203ENST00000397180 2257 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
SLC12A2P55011 MMRN2-201ENST00000372027 4375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
SLC12A2P55011 B3GLCT-201ENST00000343307 4254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
SLC12A2P55011 TEX264-209ENST00000457573 1448 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
SLC12A2P55011 CPSF4-201ENST00000292476 1691 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
SLC12A2P55011 GALNT6-201ENST00000356317 2809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
SLC12A2P55011 COL23A1-202ENST00000407622 2329 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
SLC12A2P55011 TRIM39-205ENST00000396551 3249 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
SLC12A2P55011 GDE1-201ENST00000353258 2958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
SLC12A2P55011 PLXDC1-201ENST00000315392 6252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
SLC12A2P55011 FBXO4-202ENST00000296812 1731 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
SLC12A2P55011 GATA6-201ENST00000269216 3770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
SLC12A2P55011 INHA-201ENST00000243786 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
SLC12A2P55011 BANP-204ENST00000393208 2283 ntTSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
SLC12A2P55011 SLC38A11-202ENST00000409058 1647 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
SLC12A2P55011 PCDHGA11-202ENST00000518882 2263 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
SLC12A2P55011 MFF-202ENST00000337110 1760 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
SLC12A2P55011 HTD2-201ENST00000461393 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
SLC12A2P55011 ABCC1-201ENST00000399408 6594 ntTSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
SLC12A2P55011 ABCC1-202ENST00000399410 6552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
SLC12A2P55011 DECR2-202ENST00000424398 1012 ntTSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 43.3 ms