Protein–RNA interactions for Protein: P49759

CLK1, Dual specificity protein kinase CLK1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 484 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CLK1P49759 PTHLH-205ENST00000535992 1891 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
CLK1P49759 B4GALT4-216ENST00000483209 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
CLK1P49759 RNASEH2B-202ENST00000422660 4830 ntTSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.1
CLK1P49759 SSFA2-205ENST00000431877 5150 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
CLK1P49759 LINC02012-201ENST00000608206 1725 ntBASIC15.71■□□□□ 0.1
CLK1P49759 GCFC2-201ENST00000321027 4440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
CLK1P49759 H1F0-201ENST00000340857 2344 ntAPPRIS P1 BASIC15.71■□□□□ 0.1
CLK1P49759 STAT5B-201ENST00000293328 5103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
CLK1P49759 UBR5-212ENST00000521922 9008 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.1
CLK1P49759 IPO8-201ENST00000256079 5325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
CLK1P49759 SYNM-201ENST00000328642 3960 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
CLK1P49759 ERO1B-202ENST00000354619 4567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
CLK1P49759 HYAL2-208ENST00000447092 4054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
CLK1P49759 CUL3-202ENST00000344951 6592 ntTSL 2 BASIC15.7■□□□□ 0.1
CLK1P49759 PDPK2P-201ENST00000382326 2387 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
CLK1P49759 ELN-206ENST00000380553 2703 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.7■□□□□ 0.1
CLK1P49759 PLXDC1-201ENST00000315392 6252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
CLK1P49759 DACT3-203ENST00000410105 3085 ntTSL 2 BASIC15.7■□□□□ 0.1
CLK1P49759 TAOK3-201ENST00000392533 4384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
CLK1P49759 ATG2A-201ENST00000377264 6357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
CLK1P49759 PRKCSH-217ENST00000592741 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
CLK1P49759 SLC5A7-201ENST00000264047 5152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
CLK1P49759 TINF2-201ENST00000267415 1852 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
CLK1P49759 SLC17A7-204ENST00000600601 2237 ntTSL 2 BASIC15.7■□□□□ 0.1
CLK1P49759 NKX3-1-201ENST00000380871 3271 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
CLK1P49759 ZNF804B-201ENST00000333190 4659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
CLK1P49759 CD276-213ENST00000561213 2690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.7■□□□□ 0.1
CLK1P49759 AC079776.2-201ENST00000641154 1609 ntBASIC15.7■□□□□ 0.1
CLK1P49759 DFFB-203ENST00000341385 572 ntTSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
CLK1P49759 SMOX-204ENST00000346595 982 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
CLK1P49759 ZHX1-C8orf76-201ENST00000357082 1257 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.7■□□□□ 0.1
CLK1P49759 MRPL43-205ENST00000370234 798 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
CLK1P49759 ELOB-202ENST00000409477 997 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
CLK1P49759 C7orf34-201ENST00000409607 766 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
CLK1P49759 LSM5-204ENST00000409909 740 ntTSL 2 BASIC15.7■□□□□ 0.1
CLK1P49759 CHCHD3-203ENST00000448878 1038 ntTSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
CLK1P49759 AC106791.1-202ENST00000508281 1148 ntTSL 2 BASIC15.7■□□□□ 0.1
CLK1P49759 TMEM218-203ENST00000526175 972 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.7■□□□□ 0.1
CLK1P49759 ZNF628-203ENST00000598519 3847 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
CLK1P49759 SMN2-213ENST00000614240 804 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
CLK1P49759 NFIB-212ENST00000622520 1274 ntTSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
CLK1P49759 ASB10-202ENST00000377867 1738 ntTSL 2 BASIC15.7■□□□□ 0.1
CLK1P49759 CHKA-201ENST00000265689 2530 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
CLK1P49759 CLIC6-202ENST00000360731 3860 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
CLK1P49759 MFGE8-201ENST00000268150 1937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
CLK1P49759 MTG1-201ENST00000317502 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
CLK1P49759 IQCF5-AS1-201ENST00000440723 2000 ntTSL 2 BASIC15.7■□□□□ 0.1
CLK1P49759 IKBKE-204ENST00000584998 2487 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
CLK1P49759 ABCB6-201ENST00000265316 3016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
CLK1P49759 PRPF31-201ENST00000321030 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
CLK1P49759 LSP1-201ENST00000311604 1699 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
CLK1P49759 SNHG15-202ENST00000577700 3116 ntTSL 2 BASIC15.7■□□□□ 0.1
CLK1P49759 RCN2-203ENST00000394885 6347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
CLK1P49759 POC1A-203ENST00000474012 1760 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.7■□□□□ 0.1
CLK1P49759 EGFR-203ENST00000344576 2864 ntTSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
CLK1P49759 ESM1-201ENST00000381403 1326 ntTSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
CLK1P49759 SLC39A7-202ENST00000374677 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
CLK1P49759 GRM5-205ENST00000455756 7927 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.69■□□□□ 0.1
CLK1P49759 C4A-259ENST00000498271 5269 ntTSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
CLK1P49759 SYBU-224ENST00000529690 1983 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.69■□□□□ 0.1
CLK1P49759 B3GLCT-201ENST00000343307 4254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
CLK1P49759 CRB3-203ENST00000598494 1443 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.69■□□□□ 0.1
CLK1P49759 SLC43A2-204ENST00000571650 3261 ntTSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
CLK1P49759 RCOR1-201ENST00000262241 5754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
CLK1P49759 AL109955.1-201ENST00000417346 1540 ntTSL 2 BASIC15.69■□□□□ 0.1
CLK1P49759 AC023830.1-201ENST00000569678 1543 ntTSL 2 BASIC15.69■□□□□ 0.1
CLK1P49759 NSDHL-203ENST00000440023 1630 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
CLK1P49759 PRICKLE4-204ENST00000458694 1646 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
CLK1P49759 EIF4G1-203ENST00000350481 4990 ntTSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
CLK1P49759 OPA1-204ENST00000361828 6381 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
CLK1P49759 MAGEA4-206ENST00000393921 1727 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
CLK1P49759 PLAGL1-211ENST00000625622 3216 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.69■□□□□ 0.1
CLK1P49759 SGO1-203ENST00000412997 2587 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
CLK1P49759 ATP2A2-204ENST00000539276 4094 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
CLK1P49759 BTNL9-201ENST00000327705 3500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
CLK1P49759 EIF2AK4-208ENST00000559624 3548 ntTSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
CLK1P49759 TOPAZ1-201ENST00000309765 5334 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
CLK1P49759 RSPH14-201ENST00000216036 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
CLK1P49759 TCEAL3-201ENST00000243286 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
CLK1P49759 INS-201ENST00000250971 503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
CLK1P49759 CENPX-201ENST00000306704 751 ntTSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
CLK1P49759 INSL3-201ENST00000317306 755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
CLK1P49759 PTRHD1-201ENST00000328379 1105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
CLK1P49759 PRSS38-201ENST00000366757 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
CLK1P49759 ROMO1-203ENST00000374077 422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
CLK1P49759 CMTM2-202ENST00000379486 904 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
CLK1P49759 IGF2-202ENST00000381392 1005 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
CLK1P49759 GOSR2-202ENST00000393456 788 ntTSL 3 BASIC15.69■□□□□ 0.1
CLK1P49759 MRPL28-203ENST00000429738 310 ntTSL 2 BASIC15.69■□□□□ 0.1
CLK1P49759 BPHL-208ENST00000434640 1186 ntTSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
CLK1P49759 DZIP1L-204ENST00000469243 2107 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.69■□□□□ 0.1
CLK1P49759 NDUFB9-204ENST00000518008 789 ntTSL 2 BASIC15.69■□□□□ 0.1
CLK1P49759 PLPP5-214ENST00000531823 875 ntTSL 3 BASIC15.69■□□□□ 0.1
CLK1P49759 SMAD3-210ENST00000559092 584 ntTSL 4 BASIC15.69■□□□□ 0.1
CLK1P49759 LDHAL6A-203ENST00000615355 1042 ntTSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
CLK1P49759 REXO1L6P-202ENST00000619970 1078 ntBASIC15.69■□□□□ 0.1
CLK1P49759 ANKMY2-206ENST00000628652 1270 ntTSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
CLK1P49759 AP1S2-201ENST00000329235 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
CLK1P49759 THAP3-201ENST00000054650 1366 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
CLK1P49759 AC107871.1-202ENST00000562767 3389 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.69■□□□□ 0.1
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.8 ms