Protein–RNA interactions for Protein: P49459

UBE2A, Ubiquitin-conjugating enzyme E2 A, humanhuman

Predictions only

Length 152 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
UBE2AP49459 NT5C2-211ENST00000470299 249 ntTSL 5 BASIC10.6□□□□□ -0.71
UBE2AP49459 FICD-205ENST00000552758 603 ntTSL 2 BASIC10.6□□□□□ -0.71
UBE2AP49459 EFCAB11-211ENST00000556609 568 ntTSL 3 BASIC10.6□□□□□ -0.71
UBE2AP49459 TNFRSF13B-206ENST00000583789 859 ntTSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
UBE2AP49459 AC138207.7-201ENST00000584499 668 ntTSL 5 BASIC10.6□□□□□ -0.71
UBE2AP49459 AC087289.1-201ENST00000586808 890 ntTSL 5 BASIC10.6□□□□□ -0.71
UBE2AP49459 AC020934.1-201ENST00000588469 739 ntTSL 3 BASIC10.6□□□□□ -0.71
UBE2AP49459 GPX4-210ENST00000611653 793 ntTSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
UBE2AP49459 SLC35G1-202ENST00000427197 2402 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
UBE2AP49459 CNTNAP3B-201ENST00000276974 3240 ntTSL 5 BASIC10.6□□□□□ -0.71
UBE2AP49459 REEP1-208ENST00000538924 1702 ntTSL 5 BASIC10.6□□□□□ -0.71
UBE2AP49459 NAP1L4-201ENST00000380542 2511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
UBE2AP49459 CELF6-201ENST00000287202 3345 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
UBE2AP49459 AL021920.2-201ENST00000624828 1351 ntBASIC10.6□□□□□ -0.71
UBE2AP49459 FXN-201ENST00000377270 2608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
UBE2AP49459 TMEM245-201ENST00000374586 7980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
UBE2AP49459 PRPF31-203ENST00000419967 2269 ntTSL 5 BASIC10.6□□□□□ -0.71
UBE2AP49459 CHD1-212ENST00000614616 8095 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.6□□□□□ -0.71
UBE2AP49459 GDPGP1-202ENST00000558017 5323 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.6□□□□□ -0.71
UBE2AP49459 UBE3D-203ENST00000369747 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
UBE2AP49459 NDRG2-204ENST00000360463 2047 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
UBE2AP49459 STX3-203ENST00000529177 1571 ntTSL 2 BASIC10.6□□□□□ -0.71
UBE2AP49459 AC092068.3-201ENST00000587894 2016 ntBASIC10.6□□□□□ -0.71
UBE2AP49459 SERPINB6-207ENST00000612421 1570 ntTSL 2 BASIC10.6□□□□□ -0.71
UBE2AP49459 CELF6-204ENST00000543764 1676 ntTSL 2 BASIC10.6□□□□□ -0.71
UBE2AP49459 GATA3-201ENST00000346208 2654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
UBE2AP49459 AC105020.1-201ENST00000435356 2205 ntBASIC10.6□□□□□ -0.71
UBE2AP49459 TRAPPC8-210ENST00000582513 3205 ntTSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
UBE2AP49459 PBX1-215ENST00000559240 2866 ntTSL 5 BASIC10.59□□□□□ -0.71
UBE2AP49459 GOLGA2P10-204ENST00000618004 1349 ntTSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
UBE2AP49459 LAT2-201ENST00000275635 1869 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
UBE2AP49459 CD300A-202ENST00000360141 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
UBE2AP49459 ANTXRL-206ENST00000622632 1964 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.59□□□□□ -0.71
UBE2AP49459 CYBA-210ENST00000569359 1415 ntTSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
UBE2AP49459 CDK4-201ENST00000257904 2076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
UBE2AP49459 DOLK-201ENST00000372586 2090 ntAPPRIS P1 BASIC10.59□□□□□ -0.71
UBE2AP49459 SERINC2-205ENST00000536384 2062 ntTSL 2 BASIC10.59□□□□□ -0.71
UBE2AP49459 C11orf68-203ENST00000530188 1528 ntAPPRIS ALT2 BASIC10.59□□□□□ -0.71
UBE2AP49459 CDIPT-209ENST00000569956 1532 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.59□□□□□ -0.71
UBE2AP49459 TMUB2-213ENST00000589856 1505 ntTSL 2 BASIC10.59□□□□□ -0.71
UBE2AP49459 FAM86DP-207ENST00000497543 2152 ntTSL 2 BASIC10.59□□□□□ -0.71
UBE2AP49459 DFNA5-207ENST00000419307 2265 ntTSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
UBE2AP49459 KDELC2-201ENST00000323468 4312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
UBE2AP49459 SLC37A1-201ENST00000352133 3664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
UBE2AP49459 MYC-202ENST00000377970 2351 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
UBE2AP49459 JHDM1D-AS1-201ENST00000566699 2380 ntBASIC10.59□□□□□ -0.71
UBE2AP49459 TFAP2D-201ENST00000008391 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
UBE2AP49459 AC138028.2-202ENST00000567968 4528 ntTSL 2 BASIC10.59□□□□□ -0.71
UBE2AP49459 CHAT-201ENST00000337653 2458 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
UBE2AP49459 VGLL3-202ENST00000398399 10400 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
UBE2AP49459 UCKL1-202ENST00000358711 1845 ntTSL 2 BASIC10.59□□□□□ -0.71
UBE2AP49459 ZMYM3-203ENST00000373981 1841 ntTSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
UBE2AP49459 HS6ST2-203ENST00000406696 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
UBE2AP49459 DCAF12L2-201ENST00000360028 2599 ntAPPRIS P1 BASIC10.59□□□□□ -0.71
UBE2AP49459 AP000550.1-201ENST00000420508 4833 ntTSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
UBE2AP49459 PCDHGA6-202ENST00000610583 5650 ntAPPRIS P1 BASIC10.59□□□□□ -0.71
UBE2AP49459 B4GALNT2-201ENST00000300404 1906 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
UBE2AP49459 SIT1-201ENST00000259608 1231 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
UBE2AP49459 PRMT2-201ENST00000291705 1011 ntTSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
UBE2AP49459 MED30-201ENST00000297347 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
UBE2AP49459 CENPX-201ENST00000306704 751 ntTSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
UBE2AP49459 MCL1-201ENST00000307940 1110 ntTSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
UBE2AP49459 OR10H5-201ENST00000308940 1132 ntAPPRIS P1 BASIC10.59□□□□□ -0.71
UBE2AP49459 UBE2C-204ENST00000356455 850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
UBE2AP49459 FIBP-202ENST00000357519 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
UBE2AP49459 TLE1-202ENST00000376484 666 ntTSL 3 BASIC10.59□□□□□ -0.71
UBE2AP49459 CENPM-203ENST00000402338 1002 ntTSL 2 BASIC10.59□□□□□ -0.71
UBE2AP49459 DMKN-206ENST00000418261 1257 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
UBE2AP49459 AKR7L-201ENST00000420396 1240 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.59□□□□□ -0.71
UBE2AP49459 CYHR1-203ENST00000424149 1162 ntTSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
UBE2AP49459 KLHL21-204ENST00000467612 1056 ntTSL 3 BASIC10.59□□□□□ -0.71
UBE2AP49459 IDH3B-206ENST00000474315 1279 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
UBE2AP49459 AC106771.1-201ENST00000502209 372 ntTSL 2 BASIC10.59□□□□□ -0.71
UBE2AP49459 MSRA-206ENST00000521209 814 ntTSL 3 BASIC10.59□□□□□ -0.71
UBE2AP49459 KRTCAP3-207ENST00000543753 956 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.59□□□□□ -0.71
UBE2AP49459 PSME1-205ENST00000559123 1033 ntTSL 5 BASIC10.59□□□□□ -0.71
UBE2AP49459 CHRNB1-207ENST00000575379 1095 ntTSL 2 BASIC10.59□□□□□ -0.71
UBE2AP49459 TMEM220-203ENST00000578345 559 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.59□□□□□ -0.71
UBE2AP49459 AC005632.4-201ENST00000613759 431 ntTSL 3 BASIC10.59□□□□□ -0.71
UBE2AP49459 ASAH1-255ENST00000637638 699 ntTSL 2 BASIC10.59□□□□□ -0.71
UBE2AP49459 AP000867.4-201ENST00000641616 219 ntBASIC10.59□□□□□ -0.71
UBE2AP49459 MAEA-202ENST00000303400 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
UBE2AP49459 GUCY1A2-202ENST00000347596 2532 ntTSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
UBE2AP49459 LMF1-201ENST00000262301 2621 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.59□□□□□ -0.71
UBE2AP49459 CACNA2D3-201ENST00000288197 3671 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
UBE2AP49459 CACNA2D3-206ENST00000474759 3675 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
UBE2AP49459 MREG-205ENST00000620139 2618 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.59□□□□□ -0.71
UBE2AP49459 SSR4-201ENST00000320857 1671 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.59□□□□□ -0.71
UBE2AP49459 OS9-205ENST00000413095 1660 ntTSL 2 BASIC10.59□□□□□ -0.71
UBE2AP49459 CCDC142-201ENST00000290418 2835 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC10.59□□□□□ -0.71
UBE2AP49459 TSC22D1-AS1-201ENST00000616360 2845 ntTSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
UBE2AP49459 GLIS2-201ENST00000262366 4469 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.59□□□□□ -0.71
UBE2AP49459 KCP-206ENST00000613019 4853 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC10.59□□□□□ -0.71
UBE2AP49459 ANO6-202ENST00000423947 5504 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
UBE2AP49459 DNASE1L2-201ENST00000320700 1326 ntTSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.71
UBE2AP49459 CACNG5-202ENST00000533854 1311 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.58□□□□□ -0.71
UBE2AP49459 NCOA6-206ENST00000612493 4082 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.58□□□□□ -0.71
UBE2AP49459 CRB3-203ENST00000598494 1443 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.58□□□□□ -0.72
UBE2AP49459 AFMID-201ENST00000327898 1700 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
UBE2AP49459 DPEP3-201ENST00000268793 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 53 ms