Protein–RNA interactions for Protein: P49354

FNTA, Protein farnesyltransferase/geranylgeranyltransferase type-1 subunit alpha, humanhuman

Predictions only

Length 379 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FNTAP49354 PSMC3IP-202ENST00000393795 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
FNTAP49354 EXOG-201ENST00000287675 2792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
FNTAP49354 CAAP1-201ENST00000333916 2791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
FNTAP49354 MAIP1-202ENST00000392290 1386 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
FNTAP49354 SLC29A1-205ENST00000371740 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
FNTAP49354 CGREF1-206ENST00000405600 1346 ntAPPRIS P2 TSL 4 BASIC17.31■□□□□ 0.36
FNTAP49354 ZNF19-208ENST00000565637 2612 ntTSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
FNTAP49354 ZNF580-202ENST00000543039 1707 ntAPPRIS P1 BASIC17.31■□□□□ 0.36
FNTAP49354 DBI-201ENST00000311521 714 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
FNTAP49354 PTGDS-202ENST00000371625 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
FNTAP49354 BAG1-202ENST00000379704 1128 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
FNTAP49354 ISCU-202ENST00000392807 1069 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
FNTAP49354 HOXD12-201ENST00000404162 841 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
FNTAP49354 NUS1P2-201ENST00000417358 873 ntBASIC17.31■□□□□ 0.36
FNTAP49354 SBDSP1-202ENST00000423945 618 ntTSL 3 BASIC17.31■□□□□ 0.36
FNTAP49354 ISCU-203ENST00000431221 799 ntTSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
FNTAP49354 BX005266.1-201ENST00000473402 457 ntBASIC17.31■□□□□ 0.36
FNTAP49354 IDH3B-206ENST00000474315 1279 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
FNTAP49354 AC027682.5-201ENST00000567122 530 ntTSL 3 BASIC17.31■□□□□ 0.36
FNTAP49354 AC002310.4-201ENST00000568114 377 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
FNTAP49354 AC064862.7-201ENST00000604520 867 ntBASIC17.31■□□□□ 0.36
FNTAP49354 AL591684.3-201ENST00000605187 298 ntBASIC17.31■□□□□ 0.36
FNTAP49354 AP001269.4-201ENST00000609611 512 ntBASIC17.31■□□□□ 0.36
FNTAP49354 AL161669.4-201ENST00000634353 732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
FNTAP49354 CFLAR-204ENST00000341582 2056 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
FNTAP49354 SLC25A48-203ENST00000425402 2062 ntTSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
FNTAP49354 LYAR-201ENST00000343470 1569 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
FNTAP49354 MAST3-201ENST00000262811 5896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
FNTAP49354 UROC1-202ENST00000383579 2735 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
FNTAP49354 LHCGR-203ENST00000403273 1921 ntTSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
FNTAP49354 TXNDC2-201ENST00000306084 1873 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
FNTAP49354 ACTL8-201ENST00000375406 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
FNTAP49354 AC012313.3-202ENST00000599109 3322 ntTSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
FNTAP49354 ALDOA-226ENST00000569798 1499 ntTSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
FNTAP49354 TMC7-201ENST00000304381 3640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
FNTAP49354 CACFD1-206ENST00000540581 2880 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.3■□□□□ 0.36
FNTAP49354 DNAJB8-AS1-201ENST00000471626 1798 ntTSL 2 BASIC17.3■□□□□ 0.36
FNTAP49354 PANK2-209ENST00000621507 1763 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
FNTAP49354 BTNL9-201ENST00000327705 3500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
FNTAP49354 RAP1GDS1-203ENST00000380158 2085 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
FNTAP49354 KCNMA1-219ENST00000480683 2963 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
FNTAP49354 PCDHA1-203ENST00000504120 5263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
FNTAP49354 NLE1-202ENST00000442241 2588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
FNTAP49354 ATG4B-205ENST00000404914 2878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
FNTAP49354 EFCAB2-203ENST00000366523 1233 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.3■□□□□ 0.36
FNTAP49354 EEF1D-202ENST00000395119 1249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
FNTAP49354 CATIP-AS1-202ENST00000441749 480 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
FNTAP49354 POU5F1P6-201ENST00000466990 990 ntBASIC17.3■□□□□ 0.36
FNTAP49354 AMACR-208ENST00000512079 858 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
FNTAP49354 MTHFSD-203ENST00000543303 1207 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
FNTAP49354 AC091167.2-201ENST00000579581 588 ntBASIC17.3■□□□□ 0.36
FNTAP49354 RLN3-202ENST00000585987 541 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
FNTAP49354 MTHFSD-220ENST00000634347 1207 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
FNTAP49354 ARID1A-205ENST00000457599 6268 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
FNTAP49354 GSAP-201ENST00000257626 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
FNTAP49354 TMEM139-201ENST00000359333 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
FNTAP49354 DHRS1-201ENST00000288111 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
FNTAP49354 MAN2A2-216ENST00000559717 6704 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.3■□□□□ 0.36
FNTAP49354 MED26-201ENST00000263390 3174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
FNTAP49354 RAB28-202ENST00000330852 1715 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
FNTAP49354 USP13-201ENST00000263966 8323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
FNTAP49354 DCLK2-201ENST00000296550 4265 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
FNTAP49354 PACS1-209ENST00000529757 1688 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
FNTAP49354 PTPRN2-205ENST00000409483 4711 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.29■□□□□ 0.36
FNTAP49354 FAM184B-201ENST00000265018 6622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
FNTAP49354 SALL4-203ENST00000395997 1918 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
FNTAP49354 KCNQ2-204ENST00000359125 3253 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
FNTAP49354 UBAP1-201ENST00000297661 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
FNTAP49354 TNRC18P2-201ENST00000417666 2714 ntBASIC17.29■□□□□ 0.36
FNTAP49354 AL512625.3-203ENST00000445604 1602 ntTSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
FNTAP49354 GLIPR2-205ENST00000619700 1645 ntTSL 3 BASIC17.29■□□□□ 0.36
FNTAP49354 CACFD1-201ENST00000291722 2688 ntTSL 2 BASIC17.29■□□□□ 0.36
FNTAP49354 PLCD3-212ENST00000619929 6107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
FNTAP49354 CYP4B1-203ENST00000371923 2110 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
FNTAP49354 TXNDC2-206ENST00000611534 2066 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
FNTAP49354 CDCA5-201ENST00000275517 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
FNTAP49354 DAPK1-202ENST00000408954 5892 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.29■□□□□ 0.36
FNTAP49354 MPIG6B-205ENST00000375810 910 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
FNTAP49354 AC106795.1-205ENST00000512851 1056 ntBASIC17.29■□□□□ 0.36
FNTAP49354 FICD-205ENST00000552758 603 ntTSL 2 BASIC17.29■□□□□ 0.36
FNTAP49354 TMEM220-203ENST00000578345 559 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.29■□□□□ 0.36
FNTAP49354 CCDC61-202ENST00000594087 1017 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
FNTAP49354 FLT3LG-206ENST00000597551 951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
FNTAP49354 ZNF575-205ENST00000601282 1086 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.29■□□□□ 0.36
FNTAP49354 NPAP1P7-201ENST00000613027 823 ntBASIC17.29■□□□□ 0.36
FNTAP49354 NDUFA6-204ENST00000617763 1183 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
FNTAP49354 SBDS-205ENST00000617799 953 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
FNTAP49354 AL589182.2-201ENST00000619332 1049 ntBASIC17.29■□□□□ 0.36
FNTAP49354 REXO1L3P-201ENST00000622202 1288 ntBASIC17.29■□□□□ 0.36
FNTAP49354 AL139288.1-201ENST00000623748 933 ntBASIC17.29■□□□□ 0.36
FNTAP49354 HLA-F-218ENST00000376861 1544 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.29■□□□□ 0.36
FNTAP49354 LCMT2-202ENST00000567039 1545 ntTSL 2 BASIC17.29■□□□□ 0.36
FNTAP49354 GFAP-203ENST00000435360 1779 ntTSL 2 BASIC17.29■□□□□ 0.36
FNTAP49354 CMTM3-203ENST00000460097 1797 ntTSL 2 BASIC17.29■□□□□ 0.36
FNTAP49354 GPR108-202ENST00000430424 2009 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
FNTAP49354 PPM1D-201ENST00000305921 4778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
FNTAP49354 RDX-201ENST00000343115 4491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
FNTAP49354 HSFX1-201ENST00000370416 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
FNTAP49354 ZFAND6-207ENST00000558494 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
FNTAP49354 CTCF-201ENST00000264010 3939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.9 ms