Protein–RNA interactions for Protein: P41238

APOBEC1, C->U-editing enzyme APOBEC-1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 236 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
APOBEC1P41238 CCDC40-201ENST00000269318 1970 ntTSL 2 BASIC15.02■□□□□ -0
APOBEC1P41238 PCDHA3-201ENST00000522353 5260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
APOBEC1P41238 AHRR-201ENST00000316418 5661 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
APOBEC1P41238 AC112229.1-202ENST00000490013 2918 ntTSL 2 BASIC15.02■□□□□ -0
APOBEC1P41238 ZDHHC4-206ENST00000405731 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
APOBEC1P41238 CLIC5-202ENST00000339561 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
APOBEC1P41238 MEIS3-206ENST00000559524 1828 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.02■□□□□ -0
APOBEC1P41238 TSC22D1-AS1-201ENST00000616360 2845 ntTSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
APOBEC1P41238 TYROBP-201ENST00000262629 568 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
APOBEC1P41238 HIST1H3D-201ENST00000356476 411 ntAPPRIS P1 BASIC15.02■□□□□ -0
APOBEC1P41238 SUMO1-201ENST00000392244 831 ntTSL 2 BASIC15.02■□□□□ -0
APOBEC1P41238 MOB1B-202ENST00000396051 1107 ntTSL 2 BASIC15.02■□□□□ -0
APOBEC1P41238 SUMO1-209ENST00000409712 761 ntTSL 2 BASIC15.02■□□□□ -0
APOBEC1P41238 IMP4-203ENST00000409935 958 ntTSL 5 BASIC15.02■□□□□ -0
APOBEC1P41238 HILS1-201ENST00000504307 1219 ntTSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
APOBEC1P41238 NMU-202ENST00000505262 693 ntTSL 3 BASIC15.02■□□□□ -0
APOBEC1P41238 AC112191.1-201ENST00000523689 701 ntBASIC15.02■□□□□ -0
APOBEC1P41238 MVB12A-211ENST00000529939 1091 ntTSL 3 BASIC15.02■□□□□ -0
APOBEC1P41238 PAX9-204ENST00000554201 1289 ntTSL 2 BASIC15.02■□□□□ -0
APOBEC1P41238 AC126696.3-201ENST00000563993 575 ntTSL 4 BASIC15.02■□□□□ -0
APOBEC1P41238 COX5A-206ENST00000568783 571 ntTSL 3 BASIC15.02■□□□□ -0
APOBEC1P41238 METTL23-202ENST00000586200 465 ntTSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
APOBEC1P41238 METTL23-212ENST00000590964 1006 ntTSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
APOBEC1P41238 AL513190.1-201ENST00000621254 727 ntBASIC15.02■□□□□ -0
APOBEC1P41238 AL662799.1-201ENST00000630418 496 ntTSL 5 BASIC15.02■□□□□ -0
APOBEC1P41238 AC092865.6-201ENST00000642101 219 ntBASIC15.02■□□□□ -0
APOBEC1P41238 ARHGAP26-202ENST00000378004 9200 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
APOBEC1P41238 SACS-AS1-201ENST00000443092 2234 ntTSL 2 BASIC15.02□□□□□ -0.01
APOBEC1P41238 ELAC2-203ENST00000426905 2671 ntTSL 2 BASIC15.02□□□□□ -0.01
APOBEC1P41238 NDUFB2-AS1-201ENST00000465466 1648 ntTSL 2 BASIC15.02□□□□□ -0.01
APOBEC1P41238 CCDC43-202ENST00000457422 2058 ntTSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
APOBEC1P41238 SLC29A2-202ENST00000357440 2514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
APOBEC1P41238 SLC29A2-205ENST00000544554 2505 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.02□□□□□ -0.01
APOBEC1P41238 CCDC90B-202ENST00000455220 1550 ntTSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
APOBEC1P41238 FUT3-202ENST00000458379 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
APOBEC1P41238 HNF1A-212ENST00000544413 2014 ntTSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
APOBEC1P41238 KIAA1586-203ENST00000545356 2883 ntTSL 2 BASIC15.02□□□□□ -0.01
APOBEC1P41238 HLA-B-249ENST00000412585 1547 ntAPPRIS P1 BASIC15.02□□□□□ -0.01
APOBEC1P41238 TUSC3-204ENST00000506802 1546 ntTSL 5 BASIC15.02□□□□□ -0.01
APOBEC1P41238 BCL11B-202ENST00000357195 7559 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
APOBEC1P41238 CLU-215ENST00000523500 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
APOBEC1P41238 ZNF385A-212ENST00000551109 2369 ntTSL 5 BASIC15.02□□□□□ -0.01
APOBEC1P41238 FAM174B-201ENST00000327355 2792 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
APOBEC1P41238 AMFR-201ENST00000290649 3600 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
APOBEC1P41238 ARL4C-202ENST00000390645 4013 ntAPPRIS P1 BASIC15.01□□□□□ -0.01
APOBEC1P41238 ST3GAL5-229ENST00000638986 2331 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.01□□□□□ -0.01
APOBEC1P41238 UNC13A-205ENST00000551649 6052 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.01□□□□□ -0.01
APOBEC1P41238 NPM2-203ENST00000397940 1874 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.01□□□□□ -0.01
APOBEC1P41238 SCAMP4-201ENST00000316097 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
APOBEC1P41238 SPG7-201ENST00000268704 3076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
APOBEC1P41238 FAM49B-223ENST00000522746 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
APOBEC1P41238 DNAJB8-AS1-201ENST00000471626 1798 ntTSL 2 BASIC15.01□□□□□ -0.01
APOBEC1P41238 MYB-205ENST00000367814 3302 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
APOBEC1P41238 AC009163.2-201ENST00000460606 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
APOBEC1P41238 PMS2P7-201ENST00000506558 1336 ntBASIC15.01□□□□□ -0.01
APOBEC1P41238 RPLP2-201ENST00000321153 781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
APOBEC1P41238 RNF151-201ENST00000321392 786 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
APOBEC1P41238 SPACA4-201ENST00000321762 972 ntAPPRIS P1 BASIC15.01□□□□□ -0.01
APOBEC1P41238 ELK1-202ENST00000343894 736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
APOBEC1P41238 ADARB2-201ENST00000381305 703 ntTSL 2 BASIC15.01□□□□□ -0.01
APOBEC1P41238 POU5F1P6-201ENST00000466990 990 ntBASIC15.01□□□□□ -0.01
APOBEC1P41238 HIST4H4-204ENST00000539745 577 ntAPPRIS P1 BASIC15.01□□□□□ -0.01
APOBEC1P41238 AC002347.1-201ENST00000569543 541 ntBASIC15.01□□□□□ -0.01
APOBEC1P41238 RNF151-203ENST00000569714 796 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
APOBEC1P41238 LEF1-201ENST00000265165 3068 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
APOBEC1P41238 FAM184B-201ENST00000265018 6622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
APOBEC1P41238 SLC6A9-202ENST00000360584 2330 ntTSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
APOBEC1P41238 PHF1-202ENST00000374516 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
APOBEC1P41238 SLC9A2-201ENST00000233969 5410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
APOBEC1P41238 CHCHD3-201ENST00000262570 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
APOBEC1P41238 MAP3K9-201ENST00000381250 4025 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.01□□□□□ -0.01
APOBEC1P41238 UCHL5-206ENST00000367455 5327 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
APOBEC1P41238 B3GNT8-201ENST00000321702 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
APOBEC1P41238 LYPD5-203ENST00000594013 1519 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.01□□□□□ -0.01
APOBEC1P41238 APOPT1-201ENST00000409074 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
APOBEC1P41238 CES4A-206ENST00000540579 1825 ntTSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
APOBEC1P41238 LTK-204ENST00000561619 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
APOBEC1P41238 ADGRG2-202ENST00000354791 4494 ntTSL 5 BASIC15.01□□□□□ -0.01
APOBEC1P41238 ATP6V1E1-201ENST00000253413 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
APOBEC1P41238 PTPRA-205ENST00000399903 3337 ntTSL 5 BASIC15□□□□□ -0.01
APOBEC1P41238 INPP4A-202ENST00000409016 9996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
APOBEC1P41238 EIF4G3-212ENST00000602326 6196 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
APOBEC1P41238 CPVL-202ENST00000396276 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
APOBEC1P41238 MCM7-203ENST00000354230 2975 ntTSL 2 BASIC15□□□□□ -0.01
APOBEC1P41238 SEMA3B-213ENST00000618865 2925 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15□□□□□ -0.01
APOBEC1P41238 CRYM-AS1-201ENST00000338573 1661 ntTSL 2 BASIC15□□□□□ -0.01
APOBEC1P41238 PDE4DIP-230ENST00000530472 1690 ntTSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
APOBEC1P41238 PSEN2-211ENST00000626989 1972 ntTSL 5 BASIC15□□□□□ -0.01
APOBEC1P41238 ALOX12P2-203ENST00000570921 1945 ntBASIC15□□□□□ -0.01
APOBEC1P41238 MAGEA2-207ENST00000620710 1947 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15□□□□□ -0.01
APOBEC1P41238 AP004609.1-201ENST00000498872 1646 ntTSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
APOBEC1P41238 HNRNPU-205ENST00000444376 6827 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
APOBEC1P41238 IQCE-210ENST00000438376 2170 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15□□□□□ -0.01
APOBEC1P41238 CDS1-201ENST00000295887 4461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
APOBEC1P41238 NAT9-210ENST00000580301 1860 ntTSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
APOBEC1P41238 GUCY1B3-206ENST00000507146 2709 ntTSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
APOBEC1P41238 S100A16-204ENST00000368706 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
APOBEC1P41238 ATP5G3-202ENST00000392541 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
APOBEC1P41238 C22orf39-203ENST00000399568 1005 ntTSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
APOBEC1P41238 PRR29-203ENST00000425164 1266 ntTSL 2 BASIC15□□□□□ -0.01
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 91.7 ms