Protein–RNA interactions for Protein: P38570

ITGAE, Integrin alpha-E, humanhuman

Predictions only

Length 1,179 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ITGAEP38570 SETD7-204ENST00000506866 1602 ntTSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
ITGAEP38570 UBE2R2-201ENST00000263228 4075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
ITGAEP38570 ZNF286A-204ENST00000464847 5616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
ITGAEP38570 AD000864.1-201ENST00000624076 2295 ntBASIC25.13■■□□□ 1.61
ITGAEP38570 PSMG3-201ENST00000252329 1007 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.13■■□□□ 1.61
ITGAEP38570 ALKBH6-202ENST00000378875 973 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
ITGAEP38570 HNRNPFP1-201ENST00000391730 1133 ntBASIC25.13■■□□□ 1.61
ITGAEP38570 RBPMS2P1-201ENST00000437762 623 ntBASIC25.13■■□□□ 1.61
ITGAEP38570 HLA-J-203ENST00000494367 1087 ntBASIC25.13■■□□□ 1.61
ITGAEP38570 AC090515.4-201ENST00000558042 450 ntTSL 3 BASIC25.13■■□□□ 1.61
ITGAEP38570 NNAT-201ENST00000062104 1297 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
ITGAEP38570 AC087645.4-201ENST00000638890 792 ntTSL 5 BASIC25.13■■□□□ 1.61
ITGAEP38570 AC020934.3-201ENST00000639810 348 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.13■■□□□ 1.61
ITGAEP38570 TMEM138-201ENST00000278826 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
ITGAEP38570 RWDD4-202ENST00000327570 2590 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC25.13■■□□□ 1.61
ITGAEP38570 CACNA1G-206ENST00000416767 4899 ntTSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
ITGAEP38570 IFNGR1-201ENST00000367739 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
ITGAEP38570 CCDC90B-202ENST00000455220 1550 ntTSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
ITGAEP38570 GSKIP-205ENST00000555181 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
ITGAEP38570 NRSN1-203ENST00000378478 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
ITGAEP38570 IL34-202ENST00000429149 1779 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.13■■□□□ 1.61
ITGAEP38570 ZNF302-202ENST00000446502 2635 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.13■■□□□ 1.61
ITGAEP38570 ANKRD23-203ENST00000418232 2156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
ITGAEP38570 SERHL2-203ENST00000340239 1315 ntTSL 5 BASIC25.12■■□□□ 1.61
ITGAEP38570 LINC00963-208ENST00000454968 1403 ntTSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
ITGAEP38570 HLA-B-249ENST00000412585 1547 ntAPPRIS P1 BASIC25.12■■□□□ 1.61
ITGAEP38570 NDUFV1-216ENST00000529927 1503 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
ITGAEP38570 SMPD4-202ENST00000409031 4896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
ITGAEP38570 TACR2-202ENST00000373307 1740 ntTSL 2 BASIC25.12■■□□□ 1.61
ITGAEP38570 ARCN1-203ENST00000392859 1709 ntTSL 2 BASIC25.12■■□□□ 1.61
ITGAEP38570 SPRYD7-202ENST00000378195 3086 ntTSL 2 BASIC25.12■■□□□ 1.61
ITGAEP38570 PAK4-202ENST00000358301 2739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
ITGAEP38570 WWOX-201ENST00000355860 710 ntTSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
ITGAEP38570 SNHG5-201ENST00000369605 1032 ntTSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
ITGAEP38570 SLC2A8-201ENST00000373352 914 ntTSL 2 BASIC25.12■■□□□ 1.61
ITGAEP38570 RFPL4AP1-201ENST00000530883 850 ntBASIC25.12■■□□□ 1.61
ITGAEP38570 GALNT9-208ENST00000541995 1001 ntTSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
ITGAEP38570 AL355385.1-201ENST00000606123 409 ntBASIC25.12■■□□□ 1.61
ITGAEP38570 TSSK3-201ENST00000373534 1368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
ITGAEP38570 TGIF1-205ENST00000401449 1670 ntTSL 2 BASIC25.12■■□□□ 1.61
ITGAEP38570 DACH1-203ENST00000619232 2986 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.12■■□□□ 1.61
ITGAEP38570 ABCB10-201ENST00000344517 3857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
ITGAEP38570 SNX14-210ENST00000505648 3193 ntTSL 2 BASIC25.11■■□□□ 1.61
ITGAEP38570 SYT6-205ENST00000609117 4424 ntTSL 5 BASIC25.11■■□□□ 1.61
ITGAEP38570 ALOX12-201ENST00000251535 2358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
ITGAEP38570 NRXN1-209ENST00000405581 5078 ntTSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
ITGAEP38570 CDK19-202ENST00000368911 6246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
ITGAEP38570 CRELD1-201ENST00000326434 1994 ntTSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
ITGAEP38570 PCGF1-201ENST00000233630 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
ITGAEP38570 GABRD-218ENST00000640949 1684 ntTSL 5 BASIC25.11■■□□□ 1.61
ITGAEP38570 FHAD1-205ENST00000375997 1459 ntTSL 3 BASIC25.11■■□□□ 1.61
ITGAEP38570 FERMT2-203ENST00000395631 3369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
ITGAEP38570 GADD45B-201ENST00000215631 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
ITGAEP38570 TMEM270-201ENST00000320531 854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
ITGAEP38570 TPM2-201ENST00000329305 1018 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC25.11■■□□□ 1.61
ITGAEP38570 ITGA9-AS1-201ENST00000366441 895 ntTSL 3 BASIC25.11■■□□□ 1.61
ITGAEP38570 CACNB2-206ENST00000377328 1233 ntTSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
ITGAEP38570 AL645939.2-201ENST00000427340 991 ntBASIC25.11■■□□□ 1.61
ITGAEP38570 XXYLT1-204ENST00000429994 865 ntTSL 3 BASIC25.11■■□□□ 1.61
ITGAEP38570 KRT18P34-201ENST00000488218 1270 ntBASIC25.11■■□□□ 1.61
ITGAEP38570 KIAA0930-215ENST00000496226 589 ntTSL 5 BASIC25.11■■□□□ 1.61
ITGAEP38570 IGLL5-201ENST00000526893 1050 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
ITGAEP38570 IGLL5-202ENST00000531372 882 ntTSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
ITGAEP38570 AC004408.1-201ENST00000579256 573 ntTSL 4 BASIC25.11■■□□□ 1.61
ITGAEP38570 METTL23-202ENST00000586200 465 ntTSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
ITGAEP38570 METTL23-212ENST00000590964 1006 ntTSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
ITGAEP38570 CLN3-255ENST00000637100 1284 ntTSL 5 BASIC25.11■■□□□ 1.61
ITGAEP38570 PIGT-207ENST00000543458 2037 ntTSL 2 BASIC25.11■■□□□ 1.61
ITGAEP38570 CDK2-204ENST00000553376 1725 ntTSL 5 BASIC25.11■■□□□ 1.61
ITGAEP38570 NCALD-217ENST00000521599 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
ITGAEP38570 SLC9A7-201ENST00000328306 3838 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
ITGAEP38570 CORO6-210ENST00000580212 2345 ntTSL 5 BASIC25.11■■□□□ 1.61
ITGAEP38570 NAA50-201ENST00000240922 6135 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
ITGAEP38570 ATP5S-201ENST00000245448 1671 ntTSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
ITGAEP38570 TTC8-216ENST00000614125 2377 ntTSL 5 BASIC25.1■■□□□ 1.61
ITGAEP38570 ITPK1-210ENST00000556603 3174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
ITGAEP38570 MIER1-206ENST00000371016 1802 ntTSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
ITGAEP38570 HGS-201ENST00000329138 2970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
ITGAEP38570 USP4-201ENST00000265560 3126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
ITGAEP38570 TRPC4AP-202ENST00000451813 3138 ntTSL 2 BASIC25.1■■□□□ 1.61
ITGAEP38570 MAPK15-202ENST00000395107 834 ntTSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
ITGAEP38570 TSFM-210ENST00000550559 897 ntTSL 5 BASIC25.1■■□□□ 1.61
ITGAEP38570 AL133467.1-201ENST00000554161 993 ntTSL 2 BASIC25.1■■□□□ 1.61
ITGAEP38570 RPL28-205ENST00000558131 444 ntTSL 5 BASIC25.1■■□□□ 1.61
ITGAEP38570 Z97055.2-201ENST00000563715 859 ntTSL 3 BASIC25.1■■□□□ 1.61
ITGAEP38570 AP000842.3-202ENST00000569238 1080 ntBASIC25.1■■□□□ 1.61
ITGAEP38570 TVP23B-206ENST00000574226 1080 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
ITGAEP38570 AC004597.1-201ENST00000595525 561 ntTSL 4 BASIC25.1■■□□□ 1.61
ITGAEP38570 FBLIM1-201ENST00000332305 1530 ntTSL 2 BASIC25.1■■□□□ 1.61
ITGAEP38570 GLIS1-202ENST00000628545 2807 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.1■■□□□ 1.61
ITGAEP38570 SLC25A45-208ENST00000527174 2138 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.1■■□□□ 1.61
ITGAEP38570 PANK2-209ENST00000621507 1763 ntTSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
ITGAEP38570 MAGI3-203ENST00000369615 6508 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.1■■□□□ 1.61
ITGAEP38570 RBBP7-204ENST00000404022 1904 ntTSL 5 BASIC25.1■■□□□ 1.61
ITGAEP38570 CHUK-201ENST00000370397 3625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
ITGAEP38570 TMEM161A-201ENST00000162044 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
ITGAEP38570 RHNO1-209ENST00000618250 2070 ntAPPRIS P3 TSL 4 BASIC25.09■■□□□ 1.61
ITGAEP38570 CPEB3-203ENST00000614585 5789 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.09■■□□□ 1.61
ITGAEP38570 OGFOD2-224ENST00000545612 1465 ntTSL 2 BASIC25.09■■□□□ 1.61
ITGAEP38570 GABARAPL1-201ENST00000266458 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 44.9 ms