Protein–RNA interactions for Protein: P36542

ATP5C1, ATP synthase subunit gamma, mitochondrial, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 298 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATP5C1P36542 NFYC-210ENST00000425457 1536 ntTSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
ATP5C1P36542 ZSWIM8-223ENST00000605216 6004 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
ATP5C1P36542 B3GNT8-201ENST00000321702 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
ATP5C1P36542 KCNJ5-201ENST00000338350 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
ATP5C1P36542 AKIRIN1-202ENST00000432648 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
ATP5C1P36542 AC008677.1-201ENST00000519230 1561 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
ATP5C1P36542 RNF216P1-203ENST00000404404 2427 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
ATP5C1P36542 TRPV4-205ENST00000537083 2436 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
ATP5C1P36542 GGT7-201ENST00000336431 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
ATP5C1P36542 SPEM1-201ENST00000323675 982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
ATP5C1P36542 NME1-NME2-202ENST00000393193 1021 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
ATP5C1P36542 LGMN-202ENST00000393218 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
ATP5C1P36542 ARHGAP11B-201ENST00000428041 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
ATP5C1P36542 XXYLT1-204ENST00000429994 865 ntTSL 3 BASIC17.16■□□□□ 0.34
ATP5C1P36542 PLAC9P1-202ENST00000433290 400 ntTSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
ATP5C1P36542 CDKN1A-204ENST00000448526 2104 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.16■□□□□ 0.34
ATP5C1P36542 SSNA1-204ENST00000464553 723 ntTSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
ATP5C1P36542 FAM72B-205ENST00000471903 676 ntTSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
ATP5C1P36542 AC092691.1-201ENST00000484092 554 ntTSL 4 BASIC17.16■□□□□ 0.34
ATP5C1P36542 AHSA2-208ENST00000489653 1197 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
ATP5C1P36542 AC006116.8-201ENST00000587004 987 ntTSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
ATP5C1P36542 MOB3A-209ENST00000592280 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
ATP5C1P36542 SPTSSB-204ENST00000617024 1292 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
ATP5C1P36542 CBR3-AS1-216ENST00000624883 564 ntTSL 3 BASIC17.16■□□□□ 0.34
ATP5C1P36542 TCF7-204ENST00000395029 3330 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
ATP5C1P36542 AC100830.1-201ENST00000560387 1609 ntTSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
ATP5C1P36542 MYOD1-201ENST00000250003 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
ATP5C1P36542 SEPT8-205ENST00000378701 1817 ntTSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
ATP5C1P36542 PARP15-202ENST00000464300 2156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
ATP5C1P36542 RABL6-201ENST00000311502 3091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
ATP5C1P36542 TFEB-201ENST00000230323 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
ATP5C1P36542 LETM2-201ENST00000297720 1693 ntTSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
ATP5C1P36542 DUOXA1-202ENST00000430224 1317 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
ATP5C1P36542 ZNF500-201ENST00000219478 5880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
ATP5C1P36542 CPVL-202ENST00000396276 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
ATP5C1P36542 GGT4P-201ENST00000623672 1708 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
ATP5C1P36542 FAHD2B-202ENST00000414820 1388 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
ATP5C1P36542 FUT2-201ENST00000391876 1593 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
ATP5C1P36542 AP3S2-216ENST00000617003 1561 ntBASIC17.15■□□□□ 0.34
ATP5C1P36542 CFC1B-202ENST00000619050 1554 ntTSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
ATP5C1P36542 ACSM2A-213ENST00000575690 2322 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
ATP5C1P36542 GATAD2A-202ENST00000360315 5671 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
ATP5C1P36542 IL34-202ENST00000429149 1779 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
ATP5C1P36542 AC078925.2-201ENST00000624013 1973 ntBASIC17.15■□□□□ 0.34
ATP5C1P36542 MAP4K2-202ENST00000377350 2931 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
ATP5C1P36542 ASPRV1-201ENST00000320256 2177 ntAPPRIS P1 BASIC17.15■□□□□ 0.34
ATP5C1P36542 AMHR2-202ENST00000379791 1437 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
ATP5C1P36542 FICD-204ENST00000552695 3347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
ATP5C1P36542 ISM1-201ENST00000262487 2593 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
ATP5C1P36542 SEPHS2-201ENST00000478753 2551 ntAPPRIS P1 BASIC17.15■□□□□ 0.34
ATP5C1P36542 LSM1-201ENST00000311351 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
ATP5C1P36542 PPP1R27-201ENST00000330261 782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
ATP5C1P36542 POLR3GL-202ENST00000369314 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
ATP5C1P36542 LY6G6C-201ENST00000375819 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
ATP5C1P36542 CD81-202ENST00000381036 880 ntTSL 3 BASIC17.15■□□□□ 0.34
ATP5C1P36542 MIR770-201ENST00000390219 98 ntBASIC17.15■□□□□ 0.34
ATP5C1P36542 UBE2F-202ENST00000409332 1138 ntTSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
ATP5C1P36542 YAE1D1-202ENST00000432096 968 ntTSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
ATP5C1P36542 AC098859.1-201ENST00000502915 1238 ntBASIC17.15■□□□□ 0.34
ATP5C1P36542 CERNA1-201ENST00000559779 908 ntTSL 3 BASIC17.15■□□□□ 0.34
ATP5C1P36542 RARRES2P9-201ENST00000565168 469 ntBASIC17.15■□□□□ 0.34
ATP5C1P36542 AC051619.7-201ENST00000568314 623 ntBASIC17.15■□□□□ 0.34
ATP5C1P36542 AC009133.1-203ENST00000569039 589 ntTSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
ATP5C1P36542 FSTL3-202ENST00000588773 746 ntTSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
ATP5C1P36542 MIR6080-201ENST00000617359 66 ntBASIC17.15■□□□□ 0.34
ATP5C1P36542 MAP3K9-206ENST00000555993 4449 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
ATP5C1P36542 TBXAS1-210ENST00000458722 2057 ntTSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
ATP5C1P36542 VEGFA-205ENST00000372067 3535 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
ATP5C1P36542 MAGEA4-206ENST00000393921 1727 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
ATP5C1P36542 REPIN1-203ENST00000444957 2969 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
ATP5C1P36542 TJP2-202ENST00000377245 4611 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
ATP5C1P36542 SKOR1-203ENST00000554054 3620 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
ATP5C1P36542 ADAMTS4-201ENST00000367995 1961 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
ATP5C1P36542 DUOXA2-201ENST00000323030 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
ATP5C1P36542 GGNBP2-212ENST00000613102 2847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
ATP5C1P36542 GRAMD1B-214ENST00000635736 2814 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
ATP5C1P36542 HOXA10-202ENST00000396344 1570 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
ATP5C1P36542 BIN3-201ENST00000276416 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.34
ATP5C1P36542 SLC39A13-202ENST00000362021 2296 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
ATP5C1P36542 SEPT2-245ENST00000616972 3446 ntTSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
ATP5C1P36542 TRPC1-201ENST00000273482 4324 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
ATP5C1P36542 CCDC120-204ENST00000597275 2752 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
ATP5C1P36542 TAB1-202ENST00000331454 1660 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
ATP5C1P36542 SLC25A45-208ENST00000527174 2138 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.14■□□□□ 0.33
ATP5C1P36542 RBBP7-204ENST00000404022 1904 ntTSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
ATP5C1P36542 AC139530.2-201ENST00000571730 1922 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
ATP5C1P36542 SLC41A3-203ENST00000360370 2169 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
ATP5C1P36542 PPOX-202ENST00000367999 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
ATP5C1P36542 GABARAPL1-205ENST00000539170 1700 ntTSL 3 BASIC17.14■□□□□ 0.33
ATP5C1P36542 GCK-202ENST00000345378 2421 ntTSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
ATP5C1P36542 C11orf71-201ENST00000325636 652 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
ATP5C1P36542 TMEM91-205ENST00000436170 864 ntTSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
ATP5C1P36542 KLF2P3-201ENST00000451977 1087 ntBASIC17.14■□□□□ 0.33
ATP5C1P36542 ST7-OT4-203ENST00000466018 894 ntTSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
ATP5C1P36542 PMF1-BGLAP-203ENST00000490491 1007 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
ATP5C1P36542 WDR25-203ENST00000542471 1214 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
ATP5C1P36542 AC011476.2-201ENST00000585492 1271 ntTSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
ATP5C1P36542 ERCC1-212ENST00000591636 836 ntTSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
ATP5C1P36542 PRKCB-202ENST00000321728 2689 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
ATP5C1P36542 NLRP6-203ENST00000534750 2936 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.2 ms