Protein–RNA interactions for Protein: P36383

GJC1, Gap junction gamma-1 protein, humanhuman

Predictions only

Length 396 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GJC1P36383 SERPINA4-202ENST00000555095 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
GJC1P36383 TRIM39-205ENST00000396551 3249 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
GJC1P36383 VSTM2A-204ENST00000407838 3112 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.58■□□□□ 0.41
GJC1P36383 AC131160.1-201ENST00000639401 3058 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.41
GJC1P36383 LINC00599-203ENST00000519461 2922 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
GJC1P36383 GNS-201ENST00000258145 5122 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
GJC1P36383 AC068831.1-204ENST00000501381 1621 ntTSL 2 BASIC17.58■□□□□ 0.41
GJC1P36383 PNMA6E-202ENST00000633844 2596 ntTSL 3 BASIC17.58■□□□□ 0.41
GJC1P36383 CCT6A-202ENST00000335503 2529 ntTSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.41
GJC1P36383 YTHDF1-202ENST00000370339 3301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
GJC1P36383 LIMS2-208ENST00000410011 2335 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
GJC1P36383 DCST1-201ENST00000295542 2279 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.58■□□□□ 0.4
GJC1P36383 MICALL2-201ENST00000297508 3121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
GJC1P36383 FUK-207ENST00000571514 3054 ntTSL 2 BASIC17.58■□□□□ 0.4
GJC1P36383 KRTAP1-1-201ENST00000306271 903 ntAPPRIS P1 BASIC17.58■□□□□ 0.4
GJC1P36383 MYCNOS-201ENST00000419083 770 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
GJC1P36383 FAM197Y8-203ENST00000450145 560 ntBASIC17.58■□□□□ 0.4
GJC1P36383 RNPS1P1-201ENST00000507437 918 ntBASIC17.58■□□□□ 0.4
GJC1P36383 AL121820.2-201ENST00000556301 279 ntTSL 2 BASIC17.58■□□□□ 0.4
GJC1P36383 AL512357.1-201ENST00000557687 518 ntTSL 4 BASIC17.58■□□□□ 0.4
GJC1P36383 RNPS1-222ENST00000567147 830 ntTSL 3 BASIC17.58■□□□□ 0.4
GJC1P36383 SNHG15-203ENST00000578968 982 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
GJC1P36383 TUBB4A-209ENST00000598006 565 ntTSL 2 BASIC17.58■□□□□ 0.4
GJC1P36383 ONECUT1-201ENST00000305901 2092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
GJC1P36383 NBL1-211ENST00000618761 2051 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
GJC1P36383 ADAMTS13-201ENST00000355699 4442 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
GJC1P36383 SGSH-201ENST00000326317 2784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
GJC1P36383 SCAI-202ENST00000373549 1968 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
GJC1P36383 BBS5-201ENST00000295240 3475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
GJC1P36383 MAGEA2-207ENST00000620710 1947 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.58■□□□□ 0.4
GJC1P36383 EIF4G1-209ENST00000414031 5569 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
GJC1P36383 HSD17B12-201ENST00000278353 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
GJC1P36383 EPHX1-206ENST00000614058 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
GJC1P36383 SLC6A2-209ENST00000568943 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
GJC1P36383 FBXO4-202ENST00000296812 1731 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
GJC1P36383 FBXO4-201ENST00000281623 1682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
GJC1P36383 ADCY1-202ENST00000432715 1693 ntTSL 2 BASIC17.58■□□□□ 0.4
GJC1P36383 NKIRAS1-202ENST00000412028 1605 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.4
GJC1P36383 TBC1D1-203ENST00000402522 1567 ntTSL 2 BASIC17.57■□□□□ 0.4
GJC1P36383 DAAM2-211ENST00000633794 3871 ntTSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
GJC1P36383 CARD14-202ENST00000570421 2607 ntTSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
GJC1P36383 WLS-202ENST00000354777 2037 ntTSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
GJC1P36383 ZFP1-208ENST00000568079 1426 ntTSL 2 BASIC17.57■□□□□ 0.4
GJC1P36383 KMT5A-202ENST00000402868 3140 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
GJC1P36383 POTEE-204ENST00000613282 1926 ntTSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
GJC1P36383 POTEI-202ENST00000615053 1926 ntTSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
GJC1P36383 NAP1L4-222ENST00000620138 2479 ntTSL 2 BASIC17.57■□□□□ 0.4
GJC1P36383 TNR-201ENST00000263525 5190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
GJC1P36383 APP-204ENST00000357903 3543 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
GJC1P36383 TMEM216-201ENST00000334888 1306 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.57■□□□□ 0.4
GJC1P36383 IGSF8-202ENST00000368086 2366 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
GJC1P36383 SURF4-207ENST00000545297 2863 ntTSL 2 BASIC17.57■□□□□ 0.4
GJC1P36383 C4A-243ENST00000428956 5460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
GJC1P36383 C4B-202ENST00000435363 5460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
GJC1P36383 DYRK1B-205ENST00000597639 1806 ntTSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
GJC1P36383 C20orf166-AS1-201ENST00000412495 2302 ntTSL 2 BASIC17.57■□□□□ 0.4
GJC1P36383 SYVN1-202ENST00000307289 2841 ntTSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
GJC1P36383 RNASEH2A-201ENST00000221486 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
GJC1P36383 PTPMT1-201ENST00000326656 928 ntTSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
GJC1P36383 TBC1D7-201ENST00000343141 1027 ntTSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
GJC1P36383 LYPLA2-204ENST00000374505 907 ntTSL 3 BASIC17.57■□□□□ 0.4
GJC1P36383 POMC-203ENST00000395826 959 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.57■□□□□ 0.4
GJC1P36383 C1orf109-203ENST00000464085 919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.57■□□□□ 0.4
GJC1P36383 MPIG6B-210ENST00000480039 790 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
GJC1P36383 UCHL1-204ENST00000503431 917 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.57■□□□□ 0.4
GJC1P36383 AP001107.6-201ENST00000526655 516 ntTSL 3 BASIC17.57■□□□□ 0.4
GJC1P36383 EEF1D-238ENST00000531621 840 ntTSL 3 BASIC17.57■□□□□ 0.4
GJC1P36383 AC116612.1-201ENST00000557144 562 ntTSL 3 BASIC17.57■□□□□ 0.4
GJC1P36383 IRF5-214ENST00000613821 595 ntTSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
GJC1P36383 TMEM178A-206ENST00000618232 1286 ntTSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
GJC1P36383 RCN2-203ENST00000394885 6347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
GJC1P36383 NF1-211ENST00000487476 2265 ntTSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
GJC1P36383 ARHGAP27-208ENST00000528384 2296 ntTSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
GJC1P36383 COQ8A-202ENST00000366778 2743 ntTSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
GJC1P36383 WDR53-201ENST00000332629 1679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
GJC1P36383 CA9-201ENST00000378357 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
GJC1P36383 VCAN-204ENST00000502527 2087 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
GJC1P36383 DIRAS2-201ENST00000375765 4386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
GJC1P36383 RGS11-202ENST00000316163 2376 ntTSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
GJC1P36383 LAD1-201ENST00000367313 2336 ntTSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
GJC1P36383 AP002414.3-201ENST00000589352 1468 ntBASIC17.56■□□□□ 0.4
GJC1P36383 TEX264-215ENST00000611400 1488 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.56■□□□□ 0.4
GJC1P36383 CDKN2AIP-203ENST00000504169 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
GJC1P36383 PIKFYVE-204ENST00000407449 1898 ntTSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
GJC1P36383 HSD3B7-201ENST00000262520 2200 ntTSL 2 BASIC17.56■□□□□ 0.4
GJC1P36383 TCP10L2-202ENST00000366832 2185 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
GJC1P36383 PCM1-206ENST00000518537 2171 ntTSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
GJC1P36383 MMP2-201ENST00000219070 3741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
GJC1P36383 NOS1AP-205ENST00000493151 5559 ntTSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
GJC1P36383 CHAD-201ENST00000258969 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
GJC1P36383 GABARAPL1-205ENST00000539170 1700 ntTSL 3 BASIC17.56■□□□□ 0.4
GJC1P36383 AP001372.2-201ENST00000526036 2493 ntTSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
GJC1P36383 STAC-201ENST00000273183 3227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
GJC1P36383 APLN-201ENST00000429967 3205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
GJC1P36383 COPS8-202ENST00000392008 1654 ntTSL 2 BASIC17.56■□□□□ 0.4
GJC1P36383 RAD1-208ENST00000628399 1678 ntTSL 3 BASIC17.56■□□□□ 0.4
GJC1P36383 PLK2-215ENST00000617412 2792 ntTSL 5 BASIC17.56■□□□□ 0.4
GJC1P36383 CTSB-228ENST00000533455 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
GJC1P36383 ZNHIT1-201ENST00000305105 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
GJC1P36383 FAM99B-201ENST00000382166 1067 ntTSL 5 BASIC17.56■□□□□ 0.4
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.5 ms