Protein–RNA interactions for Protein: P35222

CTNNB1, Catenin beta-1, humanhuman

Predictions only

Length 781 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CTNNB1P35222 HNF1B-201ENST00000613727 1546 ntTSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
CTNNB1P35222 WIPF2-210ENST00000585043 2693 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
CTNNB1P35222 FBXO15-201ENST00000419743 1708 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.47■□□□□ 0.39
CTNNB1P35222 TRIM46-209ENST00000543729 1703 ntTSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
CTNNB1P35222 RAI1-201ENST00000353383 7662 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
CTNNB1P35222 CCDC34-201ENST00000317945 2109 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
CTNNB1P35222 ARHGEF18-201ENST00000319670 5212 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
CTNNB1P35222 COL8A2-202ENST00000397799 4670 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
CTNNB1P35222 PTPA-201ENST00000337738 2845 ntTSL 2 BASIC17.47■□□□□ 0.39
CTNNB1P35222 PRAF2-201ENST00000376386 801 ntTSL 2 BASIC17.47■□□□□ 0.39
CTNNB1P35222 DGCR6-202ENST00000413981 1039 ntTSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
CTNNB1P35222 BMP7-AS1-201ENST00000445956 436 ntTSL 2 BASIC17.47■□□□□ 0.39
CTNNB1P35222 AL589987.1-201ENST00000453380 819 ntBASIC17.47■□□□□ 0.39
CTNNB1P35222 AC005342.2-201ENST00000544163 315 ntTSL 3 BASIC17.47■□□□□ 0.39
CTNNB1P35222 IL32-232ENST00000552356 623 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.47■□□□□ 0.39
CTNNB1P35222 AC099568.2-201ENST00000609194 695 ntBASIC17.47■□□□□ 0.39
CTNNB1P35222 IFNL3-202ENST00000613087 734 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
CTNNB1P35222 MFNG-201ENST00000356998 2088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
CTNNB1P35222 ILVBL-209ENST00000534378 2067 ntTSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
CTNNB1P35222 MTA1-207ENST00000435036 2888 ntTSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
CTNNB1P35222 PCGF3-201ENST00000362003 5685 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
CTNNB1P35222 BEGAIN-211ENST00000637646 2911 ntTSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
CTNNB1P35222 HSF2-202ENST00000452194 2643 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
CTNNB1P35222 AC133548.2-201ENST00000568567 2605 ntTSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
CTNNB1P35222 AL445433.2-201ENST00000425113 2544 ntTSL 2 BASIC17.47■□□□□ 0.39
CTNNB1P35222 PCGF6-202ENST00000369847 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
CTNNB1P35222 FIBIN-201ENST00000318627 1938 ntAPPRIS P1 BASIC17.47■□□□□ 0.39
CTNNB1P35222 TBXA2R-204ENST00000589966 1814 ntTSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
CTNNB1P35222 DIABLO-203ENST00000353548 1345 ntTSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
CTNNB1P35222 HR-202ENST00000381418 6336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
CTNNB1P35222 GDA-201ENST00000238018 2074 ntTSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
CTNNB1P35222 GYG1-201ENST00000296048 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
CTNNB1P35222 PTHLH-205ENST00000535992 1891 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
CTNNB1P35222 SNX33P1-201ENST00000592116 1762 ntBASIC17.46■□□□□ 0.39
CTNNB1P35222 ACOT9-201ENST00000336430 1675 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
CTNNB1P35222 DNM1-206ENST00000475805 2710 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.46■□□□□ 0.39
CTNNB1P35222 DKKL1-201ENST00000221498 1222 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
CTNNB1P35222 VMO1-203ENST00000416307 712 ntTSL 2 BASIC17.46■□□□□ 0.39
CTNNB1P35222 ZNF815P-202ENST00000422825 805 ntTSL 5 BASIC17.46■□□□□ 0.39
CTNNB1P35222 AL157832.1-201ENST00000428273 495 ntTSL 2 BASIC17.46■□□□□ 0.39
CTNNB1P35222 ZNF589-204ENST00000440261 917 ntTSL 2 BASIC17.46■□□□□ 0.39
CTNNB1P35222 RALY-AS1-203ENST00000440595 660 ntTSL 3 BASIC17.46■□□□□ 0.39
CTNNB1P35222 APOA1-AS-201ENST00000444200 563 ntTSL 4 BASIC17.46■□□□□ 0.39
CTNNB1P35222 AC093724.1-201ENST00000448659 1027 ntBASIC17.46■□□□□ 0.39
CTNNB1P35222 C3orf67-212ENST00000491845 832 ntTSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
CTNNB1P35222 RPL10P19-202ENST00000520582 722 ntTSL 3 BASIC17.46■□□□□ 0.39
CTNNB1P35222 FAM92A-214ENST00000522324 1072 ntTSL 2 BASIC17.46■□□□□ 0.39
CTNNB1P35222 FUZ-207ENST00000526575 482 ntTSL 4 BASIC17.46■□□□□ 0.39
CTNNB1P35222 AC233702.7-201ENST00000536958 924 ntTSL 5 BASIC17.46■□□□□ 0.39
CTNNB1P35222 CACNA2D4-208ENST00000538027 952 ntTSL 5 BASIC17.46■□□□□ 0.39
CTNNB1P35222 RRN3-205ENST00000563559 2128 ntTSL 5 BASIC17.46■□□□□ 0.39
CTNNB1P35222 AC111170.2-201ENST00000585369 768 ntTSL 3 BASIC17.46■□□□□ 0.39
CTNNB1P35222 KLK15-204ENST00000598239 855 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
CTNNB1P35222 NOP53-AS1-201ENST00000602048 540 ntTSL 4 BASIC17.46■□□□□ 0.39
CTNNB1P35222 AC093726.1-201ENST00000608064 963 ntBASIC17.46■□□□□ 0.39
CTNNB1P35222 PDCD6-212ENST00000614778 1050 ntTSL 2 BASIC17.46■□□□□ 0.39
CTNNB1P35222 MIR6069-201ENST00000620069 79 ntBASIC17.46■□□□□ 0.39
CTNNB1P35222 KCNQ2-215ENST00000629241 2853 ntTSL 5 BASIC17.46■□□□□ 0.39
CTNNB1P35222 SLCO4A1-201ENST00000217159 2776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
CTNNB1P35222 PANX1-202ENST00000436171 2750 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
CTNNB1P35222 LUC7L2-210ENST00000619796 2783 ntTSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
CTNNB1P35222 GABBR1-204ENST00000377016 4299 ntTSL 5 BASIC17.46■□□□□ 0.39
CTNNB1P35222 B4GALT4-216ENST00000483209 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
CTNNB1P35222 SCARB2-201ENST00000264896 4792 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
CTNNB1P35222 TRIP10-201ENST00000313244 2153 ntTSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
CTNNB1P35222 SCNN1D-206ENST00000400928 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.46■□□□□ 0.39
CTNNB1P35222 TVP23C-204ENST00000438826 1852 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.38
CTNNB1P35222 CERS5-203ENST00000422340 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.46■□□□□ 0.38
CTNNB1P35222 AC138696.1-201ENST00000522452 2897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.38
CTNNB1P35222 PITPNM2-209ENST00000546049 1793 ntTSL 5 BASIC17.45■□□□□ 0.38
CTNNB1P35222 P4HA2-201ENST00000166534 2230 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
CTNNB1P35222 TTLL10-201ENST00000379288 2114 ntTSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
CTNNB1P35222 GALE-216ENST00000617979 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
CTNNB1P35222 GAS2L1-210ENST00000621062 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
CTNNB1P35222 SMTNL2-201ENST00000338859 1919 ntTSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
CTNNB1P35222 HPS3-202ENST00000460120 2745 ntTSL 2 BASIC17.45■□□□□ 0.38
CTNNB1P35222 GRAMD2B-218ENST00000542322 2977 ntTSL 2 BASIC17.45■□□□□ 0.38
CTNNB1P35222 PDXDC1-204ENST00000455313 2183 ntTSL 2 BASIC17.45■□□□□ 0.38
CTNNB1P35222 CD300LG-204ENST00000539718 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
CTNNB1P35222 CHAD-201ENST00000258969 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
CTNNB1P35222 RHOU-201ENST00000366691 4372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
CTNNB1P35222 AC008764.6-201ENST00000595909 2069 ntBASIC17.45■□□□□ 0.38
CTNNB1P35222 TMEM235-201ENST00000374946 2409 ntTSL 5 BASIC17.45■□□□□ 0.38
CTNNB1P35222 FTH1-201ENST00000273550 1229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
CTNNB1P35222 SPATC1L-202ENST00000330205 1182 ntTSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
CTNNB1P35222 MPV17-208ENST00000405076 603 ntTSL 5 BASIC17.45■□□□□ 0.38
CTNNB1P35222 RPL28-204ENST00000431533 590 ntTSL 2 BASIC17.45■□□□□ 0.38
CTNNB1P35222 AL356441.1-201ENST00000452618 492 ntTSL 3 BASIC17.45■□□□□ 0.38
CTNNB1P35222 ROPN1-207ENST00000484329 566 ntTSL 3 BASIC17.45■□□□□ 0.38
CTNNB1P35222 FTH1-202ENST00000526640 786 ntTSL 2 BASIC17.45■□□□□ 0.38
CTNNB1P35222 RPL28-206ENST00000558752 671 ntTSL 3 BASIC17.45■□□□□ 0.38
CTNNB1P35222 AC012173.1-201ENST00000567942 430 ntTSL 3 BASIC17.45■□□□□ 0.38
CTNNB1P35222 AC061975.2-201ENST00000581722 295 ntBASIC17.45■□□□□ 0.38
CTNNB1P35222 HS3ST2-201ENST00000261374 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
CTNNB1P35222 CAP2-208ENST00000611958 2686 ntTSL 2 BASIC17.45■□□□□ 0.38
CTNNB1P35222 AL589702.1-201ENST00000641229 1509 ntBASIC17.45■□□□□ 0.38
CTNNB1P35222 TMEM198-201ENST00000344458 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
CTNNB1P35222 PSMC3IP-202ENST00000393795 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
CTNNB1P35222 PCDHA7-202ENST00000525929 5221 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
CTNNB1P35222 AP001189.5-201ENST00000637683 1413 ntTSL 5 BASIC17.45■□□□□ 0.38
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.9 ms