Protein–RNA interactions for Protein: P28676

GCA, Grancalcin, humanhuman

Predictions only

Length 217 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GCAP28676 HOGA1-202ENST00000370646 2488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
GCAP28676 TMED7-TICAM2-202ENST00000333314 3453 ntTSL 2 BASIC16.61■□□□□ 0.25
GCAP28676 CCDC144B-202ENST00000445752 2197 ntTSL 2 BASIC16.61■□□□□ 0.25
GCAP28676 TFAP2C-201ENST00000201031 2866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
GCAP28676 SDCBP2-202ENST00000360779 1519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
GCAP28676 AL592424.1-201ENST00000563624 1536 ntBASIC16.61■□□□□ 0.25
GCAP28676 TCF25-201ENST00000263346 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
GCAP28676 BAIAP2-219ENST00000575245 2229 ntTSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
GCAP28676 CHRFAM7A-203ENST00000401522 1913 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
GCAP28676 AC073957.2-201ENST00000549241 1562 ntTSL 4 BASIC16.61■□□□□ 0.25
GCAP28676 AC009237.3-202ENST00000608013 3042 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
GCAP28676 PHTF1-201ENST00000357783 2747 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
GCAP28676 FIBP-202ENST00000357519 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
GCAP28676 MIR648-201ENST00000385046 94 ntBASIC16.61■□□□□ 0.25
GCAP28676 AC016999.1-201ENST00000447880 452 ntTSL 3 BASIC16.61■□□□□ 0.25
GCAP28676 AC021087.1-201ENST00000512642 522 ntTSL 2 BASIC16.61■□□□□ 0.25
GCAP28676 AHSA1-208ENST00000555517 832 ntTSL 2 BASIC16.61■□□□□ 0.25
GCAP28676 NME3-204ENST00000563498 920 ntTSL 2 BASIC16.61■□□□□ 0.25
GCAP28676 CTDNEP1-207ENST00000572043 857 ntTSL 3 BASIC16.61■□□□□ 0.25
GCAP28676 TUBB4A-209ENST00000598006 565 ntTSL 2 BASIC16.61■□□□□ 0.25
GCAP28676 TMEM178A-206ENST00000618232 1286 ntTSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
GCAP28676 AC244517.11-201ENST00000624192 573 ntTSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
GCAP28676 PGM5P2-202ENST00000637225 1043 ntBASIC16.61■□□□□ 0.25
GCAP28676 CCT7-216ENST00000540468 1674 ntTSL 2 BASIC16.61■□□□□ 0.25
GCAP28676 PICALM-204ENST00000526033 3613 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
GCAP28676 CNOT6-202ENST00000393356 6303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
GCAP28676 MIEF2-203ENST00000395704 2879 ntTSL 2 BASIC16.61■□□□□ 0.25
GCAP28676 KCNK3-201ENST00000302909 6162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
GCAP28676 PCDH1-203ENST00000394536 3827 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
GCAP28676 TIPRL-202ENST00000367833 3032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
GCAP28676 RBM14-202ENST00000393979 1426 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
GCAP28676 DACT3-203ENST00000410105 3085 ntTSL 2 BASIC16.61■□□□□ 0.25
GCAP28676 AL353732.1-201ENST00000569618 1459 ntBASIC16.61■□□□□ 0.25
GCAP28676 AL356309.3-201ENST00000624132 1934 ntBASIC16.6■□□□□ 0.25
GCAP28676 IL6R-202ENST00000368485 5914 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
GCAP28676 SYDE2-202ENST00000341460 5512 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
GCAP28676 LINC01118-203ENST00000479311 1588 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
GCAP28676 OPRD1-201ENST00000234961 9345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
GCAP28676 RAB40B-206ENST00000571995 3859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
GCAP28676 FGFR1-206ENST00000397091 5702 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
GCAP28676 FUT7-201ENST00000314412 2584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
GCAP28676 FRMD4A-203ENST00000357447 6821 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
GCAP28676 TSPEAR-202ENST00000397916 2114 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
GCAP28676 BACE1-211ENST00000528053 4083 ntTSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
GCAP28676 PLCB2-201ENST00000260402 4616 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
GCAP28676 ZNF662-201ENST00000328199 3186 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
GCAP28676 DAPK2-202ENST00000457488 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
GCAP28676 PI4KAP1-204ENST00000612579 1703 ntBASIC16.6■□□□□ 0.25
GCAP28676 CDCP2-201ENST00000371330 2723 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
GCAP28676 PRKCZ-202ENST00000400921 2294 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
GCAP28676 DDX19B-207ENST00000563206 1765 ntTSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
GCAP28676 TMEM44-201ENST00000330115 1278 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
GCAP28676 ABHD11-203ENST00000395147 812 ntTSL 3 BASIC16.6■□□□□ 0.25
GCAP28676 KRT16P4-201ENST00000453883 522 ntBASIC16.6■□□□□ 0.25
GCAP28676 SLC2A1-204ENST00000460369 541 ntTSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
GCAP28676 HOXB-AS2-201ENST00000464382 845 ntTSL 4 BASIC16.6■□□□□ 0.25
GCAP28676 RAB42-202ENST00000465518 857 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
GCAP28676 ARTN-206ENST00000472435 402 ntTSL 3 BASIC16.6■□□□□ 0.25
GCAP28676 RPL29-204ENST00000479017 670 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.6■□□□□ 0.25
GCAP28676 MCCC2-205ENST00000509358 1214 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
GCAP28676 SFTPC-204ENST00000520605 519 ntTSL 3 BASIC16.6■□□□□ 0.25
GCAP28676 SFTPC-210ENST00000524255 681 ntTSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
GCAP28676 C12orf76-204ENST00000547573 607 ntTSL 3 BASIC16.6■□□□□ 0.25
GCAP28676 AC020934.1-201ENST00000588469 739 ntTSL 3 BASIC16.6■□□□□ 0.25
GCAP28676 CCDC61-202ENST00000594087 1017 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
GCAP28676 AL162497.1-201ENST00000615635 518 ntTSL 4 BASIC16.6■□□□□ 0.25
GCAP28676 SBDS-205ENST00000617799 953 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
GCAP28676 NXNL2-205ENST00000618633 739 ntTSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
GCAP28676 JAKMIP1-204ENST00000409831 2371 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
GCAP28676 ACOX3-202ENST00000413009 2374 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
GCAP28676 ZNF446-201ENST00000335841 1889 ntTSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
GCAP28676 GLUD2-201ENST00000328078 2493 ntAPPRIS P1 BASIC16.6■□□□□ 0.25
GCAP28676 YY1AP1-210ENST00000368339 3073 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
GCAP28676 SNTG2-202ENST00000407292 1436 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
GCAP28676 ANKMY2-201ENST00000306999 2555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
GCAP28676 PLEKHN1-201ENST00000379407 2194 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
GCAP28676 PSMD2-201ENST00000310118 3449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
GCAP28676 DEPDC5-203ENST00000400242 2395 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
GCAP28676 RAB28-202ENST00000330852 1715 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
GCAP28676 PLEKHA2-208ENST00000616927 1748 ntTSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
GCAP28676 VIPR2-201ENST00000262178 3944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
GCAP28676 ZNF385C-205ENST00000618554 2596 ntTSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
GCAP28676 CD68-201ENST00000250092 1878 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
GCAP28676 DNAAF5-201ENST00000297440 3410 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
GCAP28676 KLHL31-201ENST00000370905 5743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
GCAP28676 SCPEP1-201ENST00000262288 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
GCAP28676 RASA4B-207ENST00000541662 2794 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
GCAP28676 ASH2L-212ENST00000545394 2808 ntTSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
GCAP28676 NNAT-202ENST00000346199 1209 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
GCAP28676 SNHG5-201ENST00000369605 1032 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
GCAP28676 EDN3-203ENST00000371025 1153 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
GCAP28676 CYGB-205ENST00000590175 830 ntTSL 3 BASIC16.59■□□□□ 0.25
GCAP28676 ZNF575-205ENST00000601282 1086 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
GCAP28676 AC138894.3-201ENST00000603787 634 ntBASIC16.59■□□□□ 0.25
GCAP28676 AC092119.3-201ENST00000612618 583 ntBASIC16.59■□□□□ 0.25
GCAP28676 LDHAL6A-203ENST00000615355 1042 ntTSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
GCAP28676 SSR4P1-203ENST00000599569 2260 ntBASIC16.59■□□□□ 0.25
GCAP28676 IFNAR2-204ENST00000382264 1389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
GCAP28676 DMKN-209ENST00000429837 1447 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
GCAP28676 ARHGEF1-219ENST00000599846 3393 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 45.5 ms