Protein–RNA interactions for Protein: P25789

PSMA4, Proteasome subunit alpha type-4, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 261 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PSMA4P25789 WDR74-205ENST00000525752 1724 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.15
PSMA4P25789 ARHGAP22-201ENST00000249601 2751 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
PSMA4P25789 SEPT5-204ENST00000406395 1974 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.15
PSMA4P25789 ARHGEF1-204ENST00000378152 2986 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
PSMA4P25789 BVES-202ENST00000336775 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
PSMA4P25789 OSGIN1-203ENST00000393306 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
PSMA4P25789 ZNF408-201ENST00000311764 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
PSMA4P25789 C12orf66-204ENST00000544871 2441 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.15
PSMA4P25789 MAIP1-202ENST00000392290 1386 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
PSMA4P25789 EXT2-210ENST00000533608 3136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
PSMA4P25789 SHANK3-201ENST00000262795 7091 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
PSMA4P25789 HYAL1-201ENST00000266031 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
PSMA4P25789 TTC6-206ENST00000553443 5833 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
PSMA4P25789 PPEF2-207ENST00000621010 1797 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
PSMA4P25789 CDIPT-209ENST00000569956 1532 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
PSMA4P25789 SLC29A1-205ENST00000371740 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
PSMA4P25789 TNFRSF14-AS1-202ENST00000432521 3608 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
PSMA4P25789 CTNND2-214ENST00000511377 4336 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
PSMA4P25789 UCKL1-203ENST00000369908 1954 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
PSMA4P25789 IPPK-202ENST00000375522 882 ntTSL 3 BASIC16.01■□□□□ 0.15
PSMA4P25789 EIF5A2-203ENST00000474096 570 ntTSL 4 BASIC16.01■□□□□ 0.15
PSMA4P25789 MRPL2-208ENST00000489623 570 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
PSMA4P25789 AC122714.2-201ENST00000502787 707 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
PSMA4P25789 PRELID1P1-202ENST00000567272 903 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
PSMA4P25789 AC087289.1-201ENST00000586808 890 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
PSMA4P25789 AC138894.3-201ENST00000603787 634 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
PSMA4P25789 IGHV3OR16-7-201ENST00000604106 360 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
PSMA4P25789 CEACAM3-208ENST00000630848 1110 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
PSMA4P25789 C1orf43-210ENST00000640799 1287 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
PSMA4P25789 MROH1-201ENST00000326134 5183 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
PSMA4P25789 VEPH1-218ENST00000494677 1714 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
PSMA4P25789 SURF4-207ENST00000545297 2863 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
PSMA4P25789 INPPL1-207ENST00000538751 4656 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
PSMA4P25789 PAFAH1B1-202ENST00000397195 5497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
PSMA4P25789 SIN3B-201ENST00000248054 5037 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
PSMA4P25789 COPS3-212ENST00000539941 1699 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
PSMA4P25789 AC006063.2-201ENST00000640161 1696 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
PSMA4P25789 PYCR1-201ENST00000329875 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
PSMA4P25789 AC023824.1-201ENST00000562945 2975 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
PSMA4P25789 PCDH17-201ENST00000377918 8232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
PSMA4P25789 C6orf136-203ENST00000376473 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
PSMA4P25789 PITPNM1-202ENST00000436757 4216 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
PSMA4P25789 AP004609.1-201ENST00000498872 1646 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
PSMA4P25789 ALKBH5-203ENST00000541285 1605 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
PSMA4P25789 MYCBPAP-203ENST00000436259 3102 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
PSMA4P25789 AC011840.1-202ENST00000436477 1351 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
PSMA4P25789 GUCD1-204ENST00000407471 3482 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
PSMA4P25789 LYAR-201ENST00000343470 1569 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
PSMA4P25789 RUNDC3B-202ENST00000338056 4099 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
PSMA4P25789 LGALS3BP-218ENST00000591778 1961 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
PSMA4P25789 CDC25B-204ENST00000379598 2990 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
PSMA4P25789 P2RY6-204ENST00000393592 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
PSMA4P25789 TSSC2-204ENST00000529482 2337 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
PSMA4P25789 NTRK3-202ENST00000355254 2938 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
PSMA4P25789 DAAM2-211ENST00000633794 3871 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
PSMA4P25789 IL11-201ENST00000264563 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
PSMA4P25789 RGS7-203ENST00000366564 2295 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
PSMA4P25789 SHISA5-208ENST00000442747 2250 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
PSMA4P25789 CHEK1-202ENST00000427383 1670 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
PSMA4P25789 NKIRAS2-207ENST00000449471 1461 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
PSMA4P25789 CCDC134-201ENST00000255784 1270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
PSMA4P25789 RPA2-202ENST00000373909 1162 ntTSL 3 BASIC16■□□□□ 0.15
PSMA4P25789 C6orf48-204ENST00000375639 712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
PSMA4P25789 FAM220CP-201ENST00000395253 831 ntBASIC16■□□□□ 0.15
PSMA4P25789 GGT1-207ENST00000404532 853 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
PSMA4P25789 LINC00421-201ENST00000413833 1054 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
PSMA4P25789 KRT16P4-201ENST00000453883 522 ntBASIC16■□□□□ 0.15
PSMA4P25789 COX18-204ENST00000507544 1086 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
PSMA4P25789 AC004801.5-202ENST00000546804 530 ntTSL 4 BASIC16■□□□□ 0.15
PSMA4P25789 MIR5100-201ENST00000579544 119 ntBASIC16■□□□□ 0.15
PSMA4P25789 STK25P1-201ENST00000585406 838 ntBASIC16■□□□□ 0.15
PSMA4P25789 AC010632.1-201ENST00000590376 572 ntTSL 4 BASIC16■□□□□ 0.15
PSMA4P25789 TNR-201ENST00000263525 5190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
PSMA4P25789 LMAN1-201ENST00000251047 5521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
PSMA4P25789 DACH1-203ENST00000619232 2986 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
PSMA4P25789 MYLK2-201ENST00000375985 2787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
PSMA4P25789 AC068944.1-201ENST00000514855 1604 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
PSMA4P25789 ITGB2-207ENST00000397854 2592 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
PSMA4P25789 CCDC120-203ENST00000536628 2381 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
PSMA4P25789 PCM1-206ENST00000518537 2171 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
PSMA4P25789 ZCCHC18-203ENST00000537356 2907 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
PSMA4P25789 TBC1D25-201ENST00000376771 4042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
PSMA4P25789 POR-218ENST00000461988 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
PSMA4P25789 GSK3B-201ENST00000264235 7711 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
PSMA4P25789 TAP2-205ENST00000620123 5676 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
PSMA4P25789 CMTM3-202ENST00000424011 2330 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
PSMA4P25789 GFRA2-208ENST00000524240 4921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
PSMA4P25789 ADAM15-208ENST00000447332 2146 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
PSMA4P25789 YDJC-201ENST00000292778 1351 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
PSMA4P25789 CDK1-204ENST00000448257 1948 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
PSMA4P25789 CDKN1A-203ENST00000405375 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
PSMA4P25789 EPB41L4A-AS1-201ENST00000413221 2969 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
PSMA4P25789 ZNF574-202ENST00000359044 2940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
PSMA4P25789 CLDN14-203ENST00000399136 1330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
PSMA4P25789 KCTD14-201ENST00000353172 1691 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
PSMA4P25789 SH2D2A-202ENST00000368199 1658 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
PSMA4P25789 SLC6A9-204ENST00000372307 2162 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
PSMA4P25789 ZMIZ2-202ENST00000309315 5144 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
PSMA4P25789 IDH3G-201ENST00000217901 1485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
PSMA4P25789 FCER2-202ENST00000360067 1482 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.4 ms