Protein–RNA interactions for Protein: P21695

GPD1, Glycerol-3-phosphate dehydrogenase [NAD(+)], cytoplasmic, humanhuman

Predictions only

Length 349 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GPD1P21695 LEPROTL1-203ENST00000518001 589 ntTSL 4 BASIC17.37■□□□□ 0.37
GPD1P21695 AC135050.2-203ENST00000529564 725 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC17.37■□□□□ 0.37
GPD1P21695 CDC42EP4-206ENST00000581014 737 ntTSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
GPD1P21695 AC074135.2-201ENST00000600896 510 ntTSL 3 BASIC17.37■□□□□ 0.37
GPD1P21695 AL009183.1-201ENST00000603760 355 ntBASIC17.37■□□□□ 0.37
GPD1P21695 CHMP4A-211ENST00000609024 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
GPD1P21695 FAM197Y3-203ENST00000618346 717 ntBASIC17.37■□□□□ 0.37
GPD1P21695 PI16-201ENST00000373674 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
GPD1P21695 SCRIB-202ENST00000356994 5218 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
GPD1P21695 CLN3-216ENST00000565316 1318 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
GPD1P21695 ITGA3-202ENST00000320031 4888 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
GPD1P21695 COMMD6-203ENST00000377615 1793 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
GPD1P21695 DNAJB8-AS1-201ENST00000471626 1798 ntTSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
GPD1P21695 EIF2B4-212ENST00000622434 1771 ntTSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
GPD1P21695 CDS1-201ENST00000295887 4461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
GPD1P21695 NID1-202ENST00000366595 5412 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
GPD1P21695 SNX9-201ENST00000392185 4198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
GPD1P21695 MYCL-203ENST00000397332 3256 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
GPD1P21695 NSMCE3-201ENST00000332303 4838 ntAPPRIS P1 BASIC17.37■□□□□ 0.37
GPD1P21695 AP3D1-201ENST00000345016 4870 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
GPD1P21695 BTBD11-205ENST00000490090 4614 ntTSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
GPD1P21695 CTSL-203ENST00000343150 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
GPD1P21695 C16orf71-201ENST00000299320 2722 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
GPD1P21695 CELF6-201ENST00000287202 3345 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
GPD1P21695 DNAJA3-201ENST00000262375 2763 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
GPD1P21695 IRF5-215ENST00000619830 1652 ntTSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
GPD1P21695 KDM6A-211ENST00000536777 5633 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
GPD1P21695 ARCN1-203ENST00000392859 1709 ntTSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
GPD1P21695 C20orf166-AS1-201ENST00000412495 2302 ntTSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
GPD1P21695 SAP130-202ENST00000259235 4065 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
GPD1P21695 TSC22D4-201ENST00000300181 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
GPD1P21695 ITM2C-201ENST00000326407 1888 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
GPD1P21695 CYP2T1P-202ENST00000641596 2535 ntBASIC17.36■□□□□ 0.37
GPD1P21695 MRGPRD-201ENST00000309106 966 ntAPPRIS P1 BASIC17.36■□□□□ 0.37
GPD1P21695 CD99L2-202ENST00000355149 1278 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
GPD1P21695 KCNIP2-208ENST00000370046 923 ntTSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
GPD1P21695 TCEAL2-202ENST00000372780 1100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
GPD1P21695 TM4SF19-204ENST00000454715 1061 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
GPD1P21695 NTMT1-205ENST00000459968 1123 ntTSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
GPD1P21695 CMPK1-205ENST00000471289 816 ntTSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
GPD1P21695 AC139887.2-202ENST00000507446 534 ntTSL 4 BASIC17.36■□□□□ 0.37
GPD1P21695 SMN2-210ENST00000511812 867 ntTSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
GPD1P21695 DDIAS-202ENST00000524921 607 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC17.36■□□□□ 0.37
GPD1P21695 BLOC1S1-201ENST00000547076 837 ntTSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
GPD1P21695 ACE-204ENST00000428043 5120 ntTSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
GPD1P21695 TUBA4B-203ENST00000490341 1380 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
GPD1P21695 NBL1-211ENST00000618761 2051 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
GPD1P21695 GPAT2-201ENST00000359548 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
GPD1P21695 PCDH8P1-201ENST00000428983 2773 ntBASIC17.36■□□□□ 0.37
GPD1P21695 GFOD2-201ENST00000268797 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
GPD1P21695 FOXN1-203ENST00000579795 2145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
GPD1P21695 ATP6V1E1-201ENST00000253413 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
GPD1P21695 SCAF8-201ENST00000367178 5057 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
GPD1P21695 RALGDS-205ENST00000393160 3801 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
GPD1P21695 CCDC90B-202ENST00000455220 1550 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
GPD1P21695 TRIM39-205ENST00000396551 3249 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
GPD1P21695 CRYM-AS1-201ENST00000338573 1661 ntTSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
GPD1P21695 CCNA1-203ENST00000625767 1699 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
GPD1P21695 MAST3-201ENST00000262811 5896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
GPD1P21695 FGFR3-208ENST00000481110 4217 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
GPD1P21695 CPVL-202ENST00000396276 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
GPD1P21695 SLC27A1-201ENST00000252595 3594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
GPD1P21695 AL139130.1-201ENST00000451362 5586 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
GPD1P21695 NPM2-203ENST00000397940 1874 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
GPD1P21695 ST3GAL6-214ENST00000483910 1886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
GPD1P21695 RTEL1-TNFRSF6B-202ENST00000482936 4931 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
GPD1P21695 HAGH-202ENST00000397356 2984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
GPD1P21695 SPRYD7-201ENST00000361840 3053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
GPD1P21695 VCAN-204ENST00000502527 2087 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
GPD1P21695 DMTN-223ENST00000523782 2235 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
GPD1P21695 VPS54-201ENST00000272322 3463 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
GPD1P21695 RPN1-201ENST00000296255 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
GPD1P21695 HSPB1-201ENST00000248553 909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
GPD1P21695 IFNL1-201ENST00000333625 857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
GPD1P21695 LCE1B-201ENST00000360090 1139 ntAPPRIS P1 BASIC17.35■□□□□ 0.37
GPD1P21695 ANP32E-201ENST00000369114 1048 ntTSL 3 BASIC17.35■□□□□ 0.37
GPD1P21695 CST3-201ENST00000376925 873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
GPD1P21695 AC140658.5-201ENST00000438532 169 ntBASIC17.35■□□□□ 0.37
GPD1P21695 CDKN2A-209ENST00000498628 926 ntTSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
GPD1P21695 AC109635.5-201ENST00000533593 962 ntBASIC17.35■□□□□ 0.37
GPD1P21695 SPATA33-208ENST00000568929 1264 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
GPD1P21695 CD7-202ENST00000578509 925 ntTSL 3 BASIC17.35■□□□□ 0.37
GPD1P21695 AL513190.1-201ENST00000621254 727 ntBASIC17.35■□□□□ 0.37
GPD1P21695 HSP90B1-210ENST00000614327 1338 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
GPD1P21695 AMOTL2-211ENST00000513145 2653 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
GPD1P21695 DIP2A-205ENST00000466639 2711 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
GPD1P21695 CHMP5-201ENST00000223500 1477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
GPD1P21695 NEO1-206ENST00000558964 4441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
GPD1P21695 PDE12-202ENST00000487257 3040 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
GPD1P21695 ELAVL2-208ENST00000544538 3789 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
GPD1P21695 HTR3E-201ENST00000335304 1912 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
GPD1P21695 HAPLN3-201ENST00000359595 1980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
GPD1P21695 MAGI3-203ENST00000369615 6508 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
GPD1P21695 F3-201ENST00000334047 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
GPD1P21695 ZNF18-204ENST00000580306 2330 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
GPD1P21695 RCAN3-210ENST00000618490 2386 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
GPD1P21695 GPR158-AS1-201ENST00000449643 2433 ntTSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
GPD1P21695 PLPPR4-202ENST00000370185 5369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
GPD1P21695 AP1AR-201ENST00000274000 2902 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
GPD1P21695 B3GNT8-201ENST00000321702 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.2 ms