Protein–RNA interactions for Protein: P20719

HOXA5, Homeobox protein Hox-A5, humanhuman

Predictions only

Length 270 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HOXA5P20719 CT47A3-201ENST00000441330 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
HOXA5P20719 MAP3K13-213ENST00000454237 526 ntTSL 3 BASIC13.05□□□□□ -0.32
HOXA5P20719 CT47A8-201ENST00000457977 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
HOXA5P20719 CT47A2-201ENST00000458218 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
HOXA5P20719 SEC1P-202ENST00000473944 940 ntBASIC13.05□□□□□ -0.32
HOXA5P20719 YBX1P2-201ENST00000489612 999 ntBASIC13.05□□□□□ -0.32
HOXA5P20719 LINC01385-201ENST00000512310 780 ntTSL 4 BASIC13.05□□□□□ -0.32
HOXA5P20719 TMEM64-204ENST00000519519 873 ntTSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
HOXA5P20719 ABHD14B-208ENST00000525795 980 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.05□□□□□ -0.32
HOXA5P20719 CENPS-CORT-205ENST00000602787 571 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.05□□□□□ -0.32
HOXA5P20719 AC140113.3-201ENST00000605663 199 ntBASIC13.05□□□□□ -0.32
HOXA5P20719 AC011558.1-201ENST00000623459 338 ntBASIC13.05□□□□□ -0.32
HOXA5P20719 ISOC2-201ENST00000085068 1122 ntTSL 2 BASIC13.05□□□□□ -0.32
HOXA5P20719 ADAMTS14-202ENST00000373208 5269 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC13.05□□□□□ -0.32
HOXA5P20719 ATXN7L1-207ENST00000477775 2426 ntTSL 2 BASIC13.05□□□□□ -0.32
HOXA5P20719 UROS-202ENST00000368778 1556 ntTSL 2 BASIC13.05□□□□□ -0.32
HOXA5P20719 PARD6G-201ENST00000353265 3868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
HOXA5P20719 NELFA-202ENST00000382882 3343 ntTSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
HOXA5P20719 GRB7-205ENST00000445327 2197 ntTSL 2 BASIC13.05□□□□□ -0.32
HOXA5P20719 ALOX12P2-203ENST00000570921 1945 ntBASIC13.05□□□□□ -0.32
HOXA5P20719 UGDH-202ENST00000501493 2826 ntTSL 2 BASIC13.05□□□□□ -0.32
HOXA5P20719 DGKZ-205ENST00000456247 3482 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
HOXA5P20719 CAMKK2-209ENST00000446440 2587 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
HOXA5P20719 CD1D-201ENST00000368171 2253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
HOXA5P20719 NKIRAS2-201ENST00000307641 2948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
HOXA5P20719 SRD5A3-201ENST00000264228 4190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
HOXA5P20719 CAPN2-201ENST00000295006 3573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
HOXA5P20719 RALGDS-202ENST00000372050 3634 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
HOXA5P20719 RNF34-201ENST00000361234 2066 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
HOXA5P20719 DOLK-201ENST00000372586 2090 ntAPPRIS P1 BASIC13.04□□□□□ -0.32
HOXA5P20719 CLDN4-201ENST00000340958 1831 ntAPPRIS P1 BASIC13.04□□□□□ -0.32
HOXA5P20719 GCK-203ENST00000395796 2539 ntTSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
HOXA5P20719 L3HYPDH-201ENST00000247194 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
HOXA5P20719 CDX4-201ENST00000373514 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
HOXA5P20719 ERCC2-205ENST00000485403 1538 ntTSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
HOXA5P20719 DPF3-204ENST00000546183 1514 ntTSL 2 BASIC13.04□□□□□ -0.32
HOXA5P20719 ACKR3-201ENST00000272928 2203 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.04□□□□□ -0.32
HOXA5P20719 AP4E1-201ENST00000261842 6758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
HOXA5P20719 SSX2IP-210ENST00000605755 1933 ntTSL 2 BASIC13.04□□□□□ -0.32
HOXA5P20719 SATB2-205ENST00000443023 6194 ntTSL 5 BASIC13.04□□□□□ -0.32
HOXA5P20719 RCC2-202ENST00000375436 4087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
HOXA5P20719 HSDL2-202ENST00000398805 3350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
HOXA5P20719 GOPC-203ENST00000535237 4460 ntTSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
HOXA5P20719 JPT1-203ENST00000409753 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
HOXA5P20719 MRPL52-201ENST00000311892 1042 ntTSL 3 BASIC13.04□□□□□ -0.32
HOXA5P20719 LCE3C-201ENST00000333881 425 ntAPPRIS P1 BASIC13.04□□□□□ -0.32
HOXA5P20719 TSPAN14-202ENST00000341863 1037 ntTSL 5 BASIC13.04□□□□□ -0.32
HOXA5P20719 MLLT10-205ENST00000377100 1136 ntTSL 2 BASIC13.04□□□□□ -0.32
HOXA5P20719 ST8SIA1-202ENST00000381424 1036 ntTSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
HOXA5P20719 AL161452.1-201ENST00000415062 1117 ntTSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
HOXA5P20719 AC103564.1-201ENST00000437330 562 ntTSL 5 BASIC13.04□□□□□ -0.32
HOXA5P20719 C7orf49-209ENST00000483029 596 ntTSL 2 BASIC13.04□□□□□ -0.32
HOXA5P20719 AC008825.1-201ENST00000504398 452 ntTSL 3 BASIC13.04□□□□□ -0.32
HOXA5P20719 AC009185.1-201ENST00000517634 911 ntTSL 3 BASIC13.04□□□□□ -0.32
HOXA5P20719 DRAP1-205ENST00000527119 581 ntTSL 5 BASIC13.04□□□□□ -0.32
HOXA5P20719 AC104390.1-201ENST00000555663 520 ntBASIC13.04□□□□□ -0.32
HOXA5P20719 MRPL46-202ENST00000558531 1002 ntTSL 2 BASIC13.04□□□□□ -0.32
HOXA5P20719 AL441883.1-201ENST00000566170 1045 ntBASIC13.04□□□□□ -0.32
HOXA5P20719 CENPX-206ENST00000580435 710 ntTSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
HOXA5P20719 CD177-202ENST00000607855 536 ntTSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
HOXA5P20719 DNAJB6-218ENST00000634080 1005 ntTSL 2 BASIC13.04□□□□□ -0.32
HOXA5P20719 BLMH-201ENST00000261714 2365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
HOXA5P20719 MYH14-204ENST00000440075 4247 ntTSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
HOXA5P20719 MSH5-203ENST00000375750 2775 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
HOXA5P20719 ELFN2-207ENST00000613079 8360 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC13.04□□□□□ -0.32
HOXA5P20719 RAI14-202ENST00000428746 5064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
HOXA5P20719 LIN9-201ENST00000328205 3567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
HOXA5P20719 FSIP1-201ENST00000350221 2805 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
HOXA5P20719 GPR17-201ENST00000272644 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
HOXA5P20719 REXO1L2P-201ENST00000425429 2069 ntBASIC13.04□□□□□ -0.32
HOXA5P20719 UCKL1-AS1-201ENST00000623569 3602 ntBASIC13.04□□□□□ -0.32
HOXA5P20719 AGO3-202ENST00000324350 1726 ntTSL 2 BASIC13.04□□□□□ -0.32
HOXA5P20719 WDR74-204ENST00000525239 1736 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.04□□□□□ -0.32
HOXA5P20719 NOS1AP-205ENST00000493151 5559 ntTSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
HOXA5P20719 PRAL-201ENST00000624952 3286 ntBASIC13.04□□□□□ -0.32
HOXA5P20719 LRRFIP2-205ENST00000421276 2522 ntTSL 2 BASIC13.04□□□□□ -0.32
HOXA5P20719 MZF1-201ENST00000215057 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
HOXA5P20719 IFNAR2-204ENST00000382264 1389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
HOXA5P20719 NELFA-203ENST00000411638 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
HOXA5P20719 HACE1-201ENST00000262903 4576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
HOXA5P20719 GLS2-201ENST00000311966 2623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
HOXA5P20719 KLHDC4-227ENST00000622456 1422 ntTSL 5 BASIC13.04□□□□□ -0.32
HOXA5P20719 AC008969.1-203ENST00000313957 1897 ntTSL 2 BASIC13.04□□□□□ -0.32
HOXA5P20719 TRIM46-202ENST00000368382 3127 ntTSL 2 BASIC13.04□□□□□ -0.32
HOXA5P20719 DCTN1-203ENST00000409240 4365 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
HOXA5P20719 AC008393.1-201ENST00000499601 1454 ntTSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
HOXA5P20719 ENDOV-225ENST00000522751 1475 ntTSL 5 BASIC13.04□□□□□ -0.32
HOXA5P20719 ZFAND6-207ENST00000558494 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
HOXA5P20719 CYB5D2-201ENST00000301391 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
HOXA5P20719 OSGIN1-203ENST00000393306 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
HOXA5P20719 REEP2-211ENST00000613650 1944 ntTSL 5 BASIC13.03□□□□□ -0.32
HOXA5P20719 TUSC3-201ENST00000382020 3683 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
HOXA5P20719 SLC26A11-203ENST00000546047 2807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
HOXA5P20719 SRSF1-201ENST00000258962 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
HOXA5P20719 SLC22A1-201ENST00000324965 1521 ntTSL 5 BASIC13.03□□□□□ -0.32
HOXA5P20719 TMEM216-203ENST00000515837 1958 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC13.03□□□□□ -0.32
HOXA5P20719 SYNRG-225ENST00000619541 3787 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
HOXA5P20719 PITPNM1-201ENST00000356404 4225 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
HOXA5P20719 UBXN11-206ENST00000374222 2043 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC13.03□□□□□ -0.32
HOXA5P20719 RTL8B-201ENST00000391440 2026 ntAPPRIS P1 BASIC13.03□□□□□ -0.32
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.9 ms