Protein–RNA interactions for Protein: P18545

PDE6G, Retinal rod rhodopsin-sensitive cGMP 3',5'-cyclic phosphodiesterase subunit gamma, humanhuman

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Length 87 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PDE6GP18545 RAB37-208ENST00000402449 1560 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC10.3□□□□□ -0.76
PDE6GP18545 COLEC11-206ENST00000403096 1557 ntTSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
PDE6GP18545 C15orf59-204ENST00000569673 6573 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.3□□□□□ -0.76
PDE6GP18545 RER1-209ENST00000605895 3044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
PDE6GP18545 C6orf223-201ENST00000336600 3581 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
PDE6GP18545 CD58-203ENST00000457047 1328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
PDE6GP18545 HEY1-208ENST00000523976 1325 ntTSL 2 BASIC10.3□□□□□ -0.76
PDE6GP18545 SSR4P1-203ENST00000599569 2260 ntBASIC10.3□□□□□ -0.76
PDE6GP18545 FAM92B-201ENST00000539556 1898 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.3□□□□□ -0.76
PDE6GP18545 DUOXA1-216ENST00000613425 1867 ntTSL 5 BASIC10.3□□□□□ -0.76
PDE6GP18545 TUBB6-211ENST00000591208 1492 ntTSL 5 BASIC10.3□□□□□ -0.76
PDE6GP18545 FGFR1-202ENST00000335922 4157 ntTSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
PDE6GP18545 KIAA1191-201ENST00000298569 2991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
PDE6GP18545 CDCP2-201ENST00000371330 2723 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC10.29□□□□□ -0.76
PDE6GP18545 AC009242.1-201ENST00000634300 2706 ntTSL 5 BASIC10.29□□□□□ -0.76
PDE6GP18545 CDH23-202ENST00000299366 3954 ntTSL 5 BASIC10.29□□□□□ -0.76
PDE6GP18545 ZFYVE28-201ENST00000290974 4131 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
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PDE6GP18545 MPL-201ENST00000372470 1908 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
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PDE6GP18545 HIPK3-202ENST00000379016 7345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
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PDE6GP18545 CD9-203ENST00000382518 1556 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.28□□□□□ -0.76
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PDE6GP18545 CACNA2D2-204ENST00000424201 5206 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
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PDE6GP18545 CD209-210ENST00000601951 1439 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
PDE6GP18545 SAMD4A-213ENST00000631086 6677 ntTSL 5 BASIC10.28□□□□□ -0.76
PDE6GP18545 PARL-201ENST00000311101 1240 ntTSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
PDE6GP18545 KRT17P2-202ENST00000326333 1174 ntTSL 2 BASIC10.28□□□□□ -0.76
PDE6GP18545 C6orf48-205ENST00000375640 1053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
PDE6GP18545 CDKN1B-202ENST00000396340 897 ntTSL 3 BASIC10.28□□□□□ -0.76
PDE6GP18545 EMC6-202ENST00000397133 762 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.28□□□□□ -0.76
PDE6GP18545 AC096633.1-201ENST00000422446 749 ntBASIC10.28□□□□□ -0.76
PDE6GP18545 NELFE-206ENST00000444811 1202 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.28□□□□□ -0.76
PDE6GP18545 POU5F1P6-201ENST00000466990 990 ntBASIC10.28□□□□□ -0.76
PDE6GP18545 OAS3-207ENST00000551007 998 ntTSL 2 BASIC10.28□□□□□ -0.76
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