Protein–RNA interactions for Protein: P16422

EPCAM, Epithelial cell adhesion molecule, humanhuman

Predictions only

Length 314 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EPCAMP16422 AL645941.1-201ENST00000415875 338 ntTSL 3 BASIC17.22■□□□□ 0.35
EPCAMP16422 AC112492.5-201ENST00000421897 457 ntBASIC17.22■□□□□ 0.35
EPCAMP16422 DIRC3-201ENST00000423123 552 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC17.22■□□□□ 0.35
EPCAMP16422 TRIM73-204ENST00000447409 1286 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
EPCAMP16422 ACA64.2-201ENST00000459014 129 ntBASIC17.22■□□□□ 0.35
EPCAMP16422 SERBP1P3-201ENST00000459980 809 ntBASIC17.22■□□□□ 0.35
EPCAMP16422 ATP6V0B-211ENST00000498664 825 ntTSL 2 BASIC17.22■□□□□ 0.35
EPCAMP16422 AC124067.4-202ENST00000522471 397 ntTSL 3 BASIC17.22■□□□□ 0.35
EPCAMP16422 SCN4B-204ENST00000529878 566 ntTSL 4 BASIC17.22■□□□□ 0.35
EPCAMP16422 GABARAPL2-202ENST00000563744 791 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
EPCAMP16422 NDRG4-247ENST00000568640 1281 ntTSL 2 BASIC17.22■□□□□ 0.35
EPCAMP16422 AC061975.2-201ENST00000581722 295 ntBASIC17.22■□□□□ 0.35
EPCAMP16422 AC079336.1-201ENST00000583156 420 ntTSL 3 BASIC17.22■□□□□ 0.35
EPCAMP16422 SRD5A3P1-201ENST00000603021 949 ntBASIC17.22■□□□□ 0.35
EPCAMP16422 AC105277.1-203ENST00000635492 1293 ntTSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
EPCAMP16422 AL033527.5-202ENST00000641632 1098 ntBASIC17.22■□□□□ 0.35
EPCAMP16422 DNAJB2-201ENST00000336576 3176 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
EPCAMP16422 ZNF789-201ENST00000331410 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
EPCAMP16422 AJUBA-202ENST00000361265 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
EPCAMP16422 MAFK-201ENST00000343242 3368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
EPCAMP16422 UBL3-201ENST00000380680 4384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
EPCAMP16422 CLCNKB-204ENST00000619181 1544 ntTSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
EPCAMP16422 AC012414.7-201ENST00000621235 1507 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
EPCAMP16422 AL589702.1-201ENST00000641229 1509 ntBASIC17.21■□□□□ 0.35
EPCAMP16422 FAM49B-224ENST00000522941 1700 ntTSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
EPCAMP16422 SDR16C5-201ENST00000303749 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
EPCAMP16422 GPS1-228ENST00000624957 1825 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
EPCAMP16422 SFRP2-201ENST00000274063 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
EPCAMP16422 HNF1A-212ENST00000544413 2014 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
EPCAMP16422 C14orf28-201ENST00000325192 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
EPCAMP16422 CRKL-201ENST00000354336 5325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
EPCAMP16422 TNFAIP2-201ENST00000333007 4175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
EPCAMP16422 AC011474.1-201ENST00000582581 2582 ntTSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.35
EPCAMP16422 TACSTD2-201ENST00000371225 2351 ntAPPRIS P1 BASIC17.21■□□□□ 0.35
EPCAMP16422 LTBR-207ENST00000539925 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.35
EPCAMP16422 HDHD3-202ENST00000374180 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
EPCAMP16422 KRT8P12-202ENST00000472924 1397 ntBASIC17.21■□□□□ 0.35
EPCAMP16422 CD300LG-204ENST00000539718 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
EPCAMP16422 KCNQ2-213ENST00000626839 9213 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
EPCAMP16422 GPR148-201ENST00000309926 1267 ntAPPRIS P1 BASIC17.21■□□□□ 0.35
EPCAMP16422 AGTRAP-202ENST00000376627 1055 ntTSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
EPCAMP16422 AQP7-204ENST00000379506 1062 ntTSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.35
EPCAMP16422 MIR1909-201ENST00000411312 80 ntBASIC17.21■□□□□ 0.35
EPCAMP16422 SERF1B-208ENST00000515588 792 ntTSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.35
EPCAMP16422 AC079296.1-201ENST00000531592 560 ntTSL 3 BASIC17.21■□□□□ 0.35
EPCAMP16422 AC024267.1-201ENST00000582320 895 ntBASIC17.21■□□□□ 0.35
EPCAMP16422 AC004461.2-201ENST00000629517 803 ntBASIC17.21■□□□□ 0.35
EPCAMP16422 AC067852.2-201ENST00000590513 2313 ntBASIC17.21■□□□□ 0.35
EPCAMP16422 STK32C-204ENST00000368622 2010 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
EPCAMP16422 MPP1-202ENST00000369534 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
EPCAMP16422 BIN3-201ENST00000276416 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
EPCAMP16422 EVX2-201ENST00000308618 4203 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
EPCAMP16422 CDK2-204ENST00000553376 1725 ntTSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
EPCAMP16422 AL512652.2-201ENST00000625156 1716 ntBASIC17.21■□□□□ 0.35
EPCAMP16422 MED19-201ENST00000337672 1637 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
EPCAMP16422 CD14-202ENST00000401743 1648 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.21■□□□□ 0.35
EPCAMP16422 EEPD1-201ENST00000242108 4765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
EPCAMP16422 TIMM50-202ENST00000544017 2572 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
EPCAMP16422 RALGPS1-208ENST00000424082 2362 ntTSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.34
EPCAMP16422 RASL10B-201ENST00000603017 3205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.34
EPCAMP16422 AARSD1-202ENST00000427569 1322 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.34
EPCAMP16422 KLK8-211ENST00000600767 1324 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.34
EPCAMP16422 CLDN9-201ENST00000445369 2050 ntAPPRIS P1 BASIC17.2■□□□□ 0.34
EPCAMP16422 NECAB2-203ENST00000565691 2064 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
EPCAMP16422 CACNA1B-205ENST00000371363 9758 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
EPCAMP16422 ABCF3-203ENST00000429586 2624 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
EPCAMP16422 ZBTB33-201ENST00000326624 5211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
EPCAMP16422 FGFR4-202ENST00000393637 2418 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
EPCAMP16422 PDE1C-206ENST00000396193 5109 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
EPCAMP16422 MRPS30-202ENST00000507110 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
EPCAMP16422 RAD1-208ENST00000628399 1678 ntTSL 3 BASIC17.2■□□□□ 0.34
EPCAMP16422 ESPN-216ENST00000636330 4731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
EPCAMP16422 PIF1-201ENST00000268043 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
EPCAMP16422 PIMREG-201ENST00000250056 1473 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
EPCAMP16422 LINC00221-202ENST00000619530 1499 ntTSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
EPCAMP16422 PDE3B-201ENST00000282096 6076 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
EPCAMP16422 ZDHHC9-202ENST00000371064 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
EPCAMP16422 LYPLA2-201ENST00000374501 1117 ntTSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
EPCAMP16422 H2AFV-207ENST00000446531 1041 ntTSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
EPCAMP16422 AL589987.1-201ENST00000453380 819 ntBASIC17.2■□□□□ 0.34
EPCAMP16422 AC009902.2-201ENST00000518880 620 ntTSL 4 BASIC17.2■□□□□ 0.34
EPCAMP16422 FAU-205ENST00000527548 538 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
EPCAMP16422 AC055876.2-201ENST00000531834 546 ntBASIC17.2■□□□□ 0.34
EPCAMP16422 KRT17P8-201ENST00000540749 863 ntBASIC17.2■□□□□ 0.34
EPCAMP16422 AC008969.1-205ENST00000553254 876 ntTSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
EPCAMP16422 CHRNA5-203ENST00000559554 1051 ntTSL 3 BASIC17.2■□□□□ 0.34
EPCAMP16422 HOTAIRM1_1.1-201ENST00000622675 125 ntBASIC17.2■□□□□ 0.34
EPCAMP16422 TAMM41-212ENST00000630288 607 ntTSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
EPCAMP16422 AC090164.4-201ENST00000632451 313 ntTSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
EPCAMP16422 UBL7-209ENST00000567435 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
EPCAMP16422 EXOC5-201ENST00000340918 2632 ntTSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
EPCAMP16422 RPS9-207ENST00000441429 1600 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
EPCAMP16422 EML3-217ENST00000531557 2509 ntTSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
EPCAMP16422 EXTL3-201ENST00000220562 6483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
EPCAMP16422 POC1A-201ENST00000296484 1898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
EPCAMP16422 KRT86-202ENST00000423955 2217 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
EPCAMP16422 SORCS3-202ENST00000369701 5757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
EPCAMP16422 PRMT1-202ENST00000454376 1327 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
EPCAMP16422 ATP5S-201ENST00000245448 1671 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
EPCAMP16422 NR2E3-204ENST00000621736 2032 ntTSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35.1 ms