Protein–RNA interactions for Protein: P16410

CTLA4, Cytotoxic T-lymphocyte protein 4, humanhuman

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Length 223 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CTLA4P16410 FBXL12-206ENST00000588922 1843 ntTSL 2 BASIC14.77□□□□□ -0.05
CTLA4P16410 NRSN1-203ENST00000378478 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
CTLA4P16410 LRRN2-203ENST00000367177 3463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
CTLA4P16410 CLPTM1L-209ENST00000507807 1740 ntTSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
CTLA4P16410 GMPR2-217ENST00000559104 1719 ntTSL 5 BASIC14.77□□□□□ -0.05
CTLA4P16410 IL11-201ENST00000264563 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
CTLA4P16410 LETM2-201ENST00000297720 1693 ntTSL 2 BASIC14.77□□□□□ -0.05
CTLA4P16410 C1orf43-201ENST00000350592 1610 ntTSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
CTLA4P16410 FANCA-203ENST00000389302 1641 ntTSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
CTLA4P16410 SLC37A4-217ENST00000545985 2606 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.77□□□□□ -0.05
CTLA4P16410 SDCBP2-202ENST00000360779 1519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
CTLA4P16410 AL139130.1-201ENST00000451362 5586 ntTSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
CTLA4P16410 AFF2-204ENST00000370458 1488 ntTSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
CTLA4P16410 AP2A2-222ENST00000534328 1491 ntTSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
CTLA4P16410 LHCGR-203ENST00000403273 1921 ntTSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
CTLA4P16410 TPD52L2-201ENST00000217121 2362 ntTSL 2 BASIC14.76□□□□□ -0.05
CTLA4P16410 DGAT2-202ENST00000376262 2324 ntTSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
CTLA4P16410 CABP1-201ENST00000288616 1369 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
CTLA4P16410 DNAJB8-AS1-201ENST00000471626 1798 ntTSL 2 BASIC14.76□□□□□ -0.05
CTLA4P16410 IGLL5-203ENST00000532223 1335 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
CTLA4P16410 SATB1-201ENST00000338745 7810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
CTLA4P16410 NDUFB9-201ENST00000276689 711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
CTLA4P16410 C21orf2-201ENST00000325223 1283 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
CTLA4P16410 MEAF6-202ENST00000373073 603 ntTSL 3 BASIC14.76□□□□□ -0.05
CTLA4P16410 HUS1B-201ENST00000380907 1025 ntAPPRIS P1 BASIC14.76□□□□□ -0.05
CTLA4P16410 STARD13-205ENST00000439831 945 ntTSL 2 BASIC14.76□□□□□ -0.05
CTLA4P16410 FAM185BP-201ENST00000443595 716 ntBASIC14.76□□□□□ -0.05
CTLA4P16410 AC108751.1-201ENST00000490852 363 ntBASIC14.76□□□□□ -0.05
CTLA4P16410 PLA2G12A-202ENST00000502283 1189 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
CTLA4P16410 KBTBD4-203ENST00000525720 980 ntTSL 3 BASIC14.76□□□□□ -0.05
CTLA4P16410 AL160237.2-201ENST00000556165 472 ntBASIC14.76□□□□□ -0.05
CTLA4P16410 BRICD5-202ENST00000562360 783 ntTSL 2 BASIC14.76□□□□□ -0.05
CTLA4P16410 CARHSP1-205ENST00000562843 843 ntTSL 2 BASIC14.76□□□□□ -0.05
CTLA4P16410 AC008738.3-201ENST00000589932 659 ntTSL 2 BASIC14.76□□□□□ -0.05
CTLA4P16410 SLC9A3-AS1-204ENST00000606288 791 ntTSL 2 BASIC14.76□□□□□ -0.05
CTLA4P16410 PRKN-208ENST00000610470 531 ntTSL 2 BASIC14.76□□□□□ -0.05
CTLA4P16410 PRKN-209ENST00000612485 225 ntTSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
CTLA4P16410 TSPY4-205ENST00000640033 663 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
CTLA4P16410 AC099508.1-201ENST00000499110 1666 ntTSL 4 BASIC14.76□□□□□ -0.05
CTLA4P16410 GPR176-205ENST00000561100 2816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
CTLA4P16410 PPM1D-201ENST00000305921 4778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
CTLA4P16410 PPP6R1-201ENST00000412770 3961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
CTLA4P16410 ATP6V1C2-204ENST00000635370 1578 ntTSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
CTLA4P16410 FBXL16-202ENST00000397621 3547 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
CTLA4P16410 MICALL2-201ENST00000297508 3121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
CTLA4P16410 ZMYM3-202ENST00000373978 1511 ntTSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
CTLA4P16410 AC012569.1-201ENST00000591191 1524 ntBASIC14.76□□□□□ -0.05
CTLA4P16410 TXNDC2-201ENST00000306084 1873 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
CTLA4P16410 ZNF446-201ENST00000335841 1889 ntTSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
CTLA4P16410 MAGEA2-201ENST00000595583 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
CTLA4P16410 LINC00963-208ENST00000454968 1403 ntTSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
CTLA4P16410 GFOD2-201ENST00000268797 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
CTLA4P16410 SLC8A3-203ENST00000357887 5259 ntTSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
CTLA4P16410 SLC8A3-204ENST00000381269 5268 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
CTLA4P16410 SMAP1-201ENST00000316999 2403 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
CTLA4P16410 ARCN1-203ENST00000392859 1709 ntTSL 2 BASIC14.75□□□□□ -0.05
CTLA4P16410 GALNT9-202ENST00000397325 1727 ntTSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
CTLA4P16410 ACP5-203ENST00000433365 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
CTLA4P16410 NAA50-209ENST00000497525 1385 ntTSL 2 BASIC14.75□□□□□ -0.05
CTLA4P16410 PDCD2-208ENST00000541970 3378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
CTLA4P16410 TSKU-205ENST00000612930 2666 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC14.75□□□□□ -0.05
CTLA4P16410 SLFNL1-201ENST00000302946 1951 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
CTLA4P16410 HAPLN3-201ENST00000359595 1980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
CTLA4P16410 AL596087.1-201ENST00000400979 1969 ntBASIC14.75□□□□□ -0.05
CTLA4P16410 JADE3-204ENST00000614628 4934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
CTLA4P16410 FAM83G-201ENST00000345041 2929 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
CTLA4P16410 CCDC116-203ENST00000607942 1913 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.75□□□□□ -0.05
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CTLA4P16410 GUK1-203ENST00000366718 1275 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC14.75□□□□□ -0.05
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CTLA4P16410 AP1S3-203ENST00000396654 830 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC14.75□□□□□ -0.05
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CTLA4P16410 HYAL1-206ENST00000447605 666 ntTSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
CTLA4P16410 ACP6-203ENST00000487562 1258 ntTSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
CTLA4P16410 BATF2-204ENST00000527716 1230 ntTSL 2 BASIC14.75□□□□□ -0.05
CTLA4P16410 GSTO1-207ENST00000539281 1052 ntTSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
CTLA4P16410 ORAOV1-210ENST00000539414 817 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC14.75□□□□□ -0.05
CTLA4P16410 KRT126P-201ENST00000549467 1181 ntBASIC14.75□□□□□ -0.05
CTLA4P16410 AL162171.1-201ENST00000556328 718 ntTSL 3 BASIC14.75□□□□□ -0.05
CTLA4P16410 UBE2Q2P1-205ENST00000559871 534 ntTSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
CTLA4P16410 YPEL3-209ENST00000566595 796 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.75□□□□□ -0.05
CTLA4P16410 PRSS8-206ENST00000568261 1214 ntTSL 2 BASIC14.75□□□□□ -0.05
CTLA4P16410 MIR4751-201ENST00000578027 74 ntBASIC14.75□□□□□ -0.05
CTLA4P16410 ARHGEF25-202ENST00000333972 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
CTLA4P16410 SUFU-202ENST00000369902 5001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
CTLA4P16410 CMKLR1-204ENST00000550402 1893 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
CTLA4P16410 TM9SF1-201ENST00000261789 2452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
CTLA4P16410 TMEM101-201ENST00000206380 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
CTLA4P16410 LCK-202ENST00000336890 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
CTLA4P16410 DNAAF2-201ENST00000298292 2963 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
CTLA4P16410 TULP2-201ENST00000221399 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
CTLA4P16410 COMMD6-203ENST00000377615 1793 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
CTLA4P16410 EIPR1-202ENST00000398659 1795 ntTSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
CTLA4P16410 SEMA4B-202ENST00000411539 3807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
CTLA4P16410 TRPC3-202ENST00000379645 3548 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
CTLA4P16410 SNAI2-201ENST00000020945 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
CTLA4P16410 THOC5-202ENST00000397871 2560 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
CTLA4P16410 KRT76-201ENST00000332411 2529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
CTLA4P16410 MAST3-201ENST00000262811 5896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
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