Protein–RNA interactions for Protein: P15529

CD46, Membrane cofactor protein, humanhuman

Predictions only

Length 392 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CD46P15529 AC087645.4-201ENST00000638890 792 ntTSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
CD46P15529 SEC14L2-215ENST00000617837 2632 ntTSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
CD46P15529 ARHGAP26-202ENST00000378004 9200 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
CD46P15529 KRT8P39-201ENST00000396270 1433 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
CD46P15529 TIA1-206ENST00000445587 1440 ntTSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
CD46P15529 TMEM50B-210ENST00000542230 2375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
CD46P15529 GCFC2-202ENST00000409857 2516 ntTSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
CD46P15529 C19orf25-207ENST00000588871 2128 ntTSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
CD46P15529 LRCH3-201ENST00000334859 2258 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
CD46P15529 CD1D-201ENST00000368171 2253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
CD46P15529 TACR2-202ENST00000373307 1740 ntTSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
CD46P15529 KDM5C-204ENST00000375401 6031 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
CD46P15529 KCNE3-201ENST00000310128 3143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
CD46P15529 GABBR1-205ENST00000377034 4527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
CD46P15529 PRMT1-202ENST00000454376 1327 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
CD46P15529 TRAPPC3-210ENST00000617904 1305 ntTSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
CD46P15529 C14orf180-202ENST00000410013 2009 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
CD46P15529 AC092068.3-201ENST00000587894 2016 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
CD46P15529 CCDC91-220ENST00000545336 2738 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
CD46P15529 CCDC157-201ENST00000338306 3001 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
CD46P15529 EXOC5-201ENST00000340918 2632 ntTSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
CD46P15529 MAPRE1-201ENST00000375571 2623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
CD46P15529 FAM181B-201ENST00000329203 3924 ntAPPRIS P1 BASIC15.13■□□□□ 0.01
CD46P15529 ALDH1A3-201ENST00000329841 3924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
CD46P15529 ADK-202ENST00000372734 2083 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
CD46P15529 CACNA1G-201ENST00000352832 7848 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
CD46P15529 ZCWPW1-202ENST00000398027 2356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
CD46P15529 DIXDC1-208ENST00000615255 4825 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
CD46P15529 MBNL1-201ENST00000282486 6422 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
CD46P15529 XKR8-201ENST00000373884 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
CD46P15529 FO538757.1-201ENST00000623083 1397 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
CD46P15529 SATB2-202ENST00000417098 5730 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
CD46P15529 HOXC5-201ENST00000312492 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
CD46P15529 COQ6-201ENST00000334571 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
CD46P15529 DCLK2-204ENST00000506325 2298 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
CD46P15529 KCNJ5-201ENST00000338350 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
CD46P15529 SLC38A6-202ENST00000354886 1730 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
CD46P15529 DPM2-202ENST00000373110 738 ntTSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
CD46P15529 VCX3A-201ENST00000381089 995 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
CD46P15529 ARL13B-203ENST00000394222 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
CD46P15529 TREML5P-201ENST00000421694 576 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
CD46P15529 AC142381.1-201ENST00000426099 345 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
CD46P15529 U52111.1-201ENST00000434284 914 ntTSL 3 BASIC15.13■□□□□ 0.01
CD46P15529 CCDC90B-202ENST00000455220 1550 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
CD46P15529 USP9YP2-201ENST00000504503 1000 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
CD46P15529 USP9YP1-201ENST00000513521 1002 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
CD46P15529 TPT1-AS1-219ENST00000523506 574 ntTSL 4 BASIC15.13■□□□□ 0.01
CD46P15529 LINC01089-211ENST00000543334 1282 ntTSL 4 BASIC15.13■□□□□ 0.01
CD46P15529 RNF24-204ENST00000545616 1128 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
CD46P15529 AC027088.1-201ENST00000557966 1117 ntTSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
CD46P15529 RARRES2P9-201ENST00000565168 469 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
CD46P15529 AC004771.3-201ENST00000574260 551 ntTSL 4 BASIC15.13■□□□□ 0.01
CD46P15529 MIR4745-201ENST00000577608 62 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
CD46P15529 AC011491.2-201ENST00000599584 447 ntTSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
CD46P15529 AL390955.2-201ENST00000603032 514 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
CD46P15529 AL158211.3-201ENST00000607385 239 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
CD46P15529 AC018529.1-201ENST00000613063 361 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
CD46P15529 AC009118.3-201ENST00000622896 873 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
CD46P15529 RAPH1-211ENST00000457812 2673 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
CD46P15529 GDA-201ENST00000238018 2074 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
CD46P15529 TRA2A-212ENST00000621813 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
CD46P15529 NAPA-AS1-201ENST00000593284 1753 ntTSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
CD46P15529 CHMP5-201ENST00000223500 1477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
CD46P15529 FAM131A-203ENST00000383847 1483 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
CD46P15529 PTP4A3-202ENST00000349124 2710 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
CD46P15529 PDZD3-202ENST00000355547 2252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
CD46P15529 SLC25A43-201ENST00000217909 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
CD46P15529 CCNA1-203ENST00000625767 1699 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
CD46P15529 LMBR1-202ENST00000359422 4727 ntTSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
CD46P15529 TRIM8-201ENST00000302424 2831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
CD46P15529 EIF5A-206ENST00000571955 1366 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
CD46P15529 SEMA5B-202ENST00000357599 4792 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
CD46P15529 TSC2-222ENST00000568454 5434 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
CD46P15529 PDX1-201ENST00000381033 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
CD46P15529 SNX9-201ENST00000392185 4198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
CD46P15529 DOLK-201ENST00000372586 2090 ntAPPRIS P1 BASIC15.12■□□□□ 0.01
CD46P15529 IRF1-202ENST00000405885 2061 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
CD46P15529 SLC12A5-201ENST00000243964 6061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
CD46P15529 SLC37A2-203ENST00000403796 2910 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
CD46P15529 PSMC3IP-202ENST00000393795 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
CD46P15529 ATP6V0E1-203ENST00000519374 1433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
CD46P15529 NFAM1-201ENST00000329021 5602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
CD46P15529 PAX7-201ENST00000375375 2260 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
CD46P15529 C21orf58-203ENST00000397680 2624 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
CD46P15529 SMARCC2-202ENST00000347471 3839 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
CD46P15529 CD81-202ENST00000381036 880 ntTSL 3 BASIC15.12■□□□□ 0.01
CD46P15529 HLA-H-201ENST00000383620 1096 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
CD46P15529 AP1S3-202ENST00000396653 589 ntTSL 4 BASIC15.12■□□□□ 0.01
CD46P15529 CBX7-202ENST00000401405 784 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
CD46P15529 FAM221A-202ENST00000409192 888 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
CD46P15529 AC124057.1-201ENST00000433035 404 ntTSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
CD46P15529 PRICKLE2-AS1-203ENST00000476308 623 ntTSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
CD46P15529 AHSA2-208ENST00000489653 1197 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
CD46P15529 AC107884.1-203ENST00000530846 628 ntTSL 3 BASIC15.12■□□□□ 0.01
CD46P15529 UBE2Q2-208ENST00000569423 2969 ntTSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
CD46P15529 MIR4453-201ENST00000584019 89 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
CD46P15529 TIMM13-202ENST00000591871 631 ntTSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
CD46P15529 AC003101.2-201ENST00000612557 442 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
CD46P15529 ASAH1-231ENST00000636577 2129 ntTSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
CD46P15529 ZDHHC9-202ENST00000371064 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31 ms