Protein–RNA interactions for Protein: P12955

PEPD, Xaa-Pro dipeptidase, humanhuman

Predictions only

Length 493 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PEPDP12955 TMEM119-201ENST00000392806 2707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
PEPDP12955 EED-202ENST00000327320 2033 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
PEPDP12955 CTSB-228ENST00000533455 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
PEPDP12955 ULBP2-201ENST00000367351 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
PEPDP12955 SEMA3B-213ENST00000618865 2925 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
PEPDP12955 ZNF561-AS1-204ENST00000587536 1799 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
PEPDP12955 PKN3-201ENST00000291906 3375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
PEPDP12955 UAP1L1-202ENST00000409858 3365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
PEPDP12955 N4BP1-201ENST00000262384 7106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
PEPDP12955 PTPRN2-205ENST00000409483 4711 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
PEPDP12955 TCF3-212ENST00000588136 2658 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
PEPDP12955 AC092171.3-201ENST00000610122 2651 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
PEPDP12955 ADAMTSL1-202ENST00000327883 1864 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
PEPDP12955 LIMS2-208ENST00000410011 2335 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
PEPDP12955 LITAF-202ENST00000381810 1527 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
PEPDP12955 KLHDC8B-201ENST00000332780 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
PEPDP12955 TNKS-211ENST00000520408 1964 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
PEPDP12955 PDE9A-205ENST00000349112 1616 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
PEPDP12955 DDX19B-204ENST00000451014 1608 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
PEPDP12955 AC069281.2-201ENST00000485071 4401 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
PEPDP12955 MADCAM1-204ENST00000587541 1723 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
PEPDP12955 TLE2-201ENST00000262953 2705 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
PEPDP12955 HUS1B-201ENST00000380907 1025 ntAPPRIS P1 BASIC15.44■□□□□ 0.06
PEPDP12955 CD99-204ENST00000381187 892 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
PEPDP12955 AGTRAP-205ENST00000400895 786 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
PEPDP12955 MIR940-201ENST00000401276 94 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
PEPDP12955 AC064807.1-202ENST00000423716 936 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
PEPDP12955 KRT18P3-201ENST00000451602 1288 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
PEPDP12955 HS6ST1P1-201ENST00000481504 1234 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
PEPDP12955 RNA5SP416-201ENST00000516838 111 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
PEPDP12955 MRPL49-203ENST00000526171 501 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
PEPDP12955 RIN3-211ENST00000557762 517 ntTSL 3 BASIC15.44■□□□□ 0.06
PEPDP12955 ICAM2-205ENST00000578379 1064 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
PEPDP12955 ICAM2-206ENST00000578892 1056 ntTSL 3 BASIC15.44■□□□□ 0.06
PEPDP12955 ZEB1-AS1-209ENST00000607455 559 ntTSL 4 BASIC15.44■□□□□ 0.06
PEPDP12955 AC010654.1-201ENST00000615722 808 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
PEPDP12955 TMEM178A-206ENST00000618232 1286 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
PEPDP12955 AC004790.2-201ENST00000623588 572 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
PEPDP12955 CFAP77-201ENST00000343036 1818 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
PEPDP12955 DNAAF1-201ENST00000378553 2379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
PEPDP12955 BBS5-201ENST00000295240 3475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
PEPDP12955 CAMTA1-201ENST00000303635 8444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
PEPDP12955 TMEM177-201ENST00000272521 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
PEPDP12955 SRSF2-205ENST00000508921 1390 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
PEPDP12955 LCA10-201ENST00000618311 1392 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
PEPDP12955 WDR45B-201ENST00000392325 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
PEPDP12955 ZNF425-201ENST00000378061 3220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
PEPDP12955 JRK-209ENST00000612905 9124 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
PEPDP12955 GCAT-201ENST00000248924 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
PEPDP12955 VIPR1-217ENST00000543411 2681 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
PEPDP12955 INPP5J-204ENST00000402238 1564 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
PEPDP12955 C4A-243ENST00000428956 5460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
PEPDP12955 C4B-202ENST00000435363 5460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
PEPDP12955 IQCE-212ENST00000476665 2400 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
PEPDP12955 NPR3-203ENST00000415167 1753 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
PEPDP12955 OSBPL1A-203ENST00000399441 1887 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
PEPDP12955 PUS1-208ENST00000542167 2151 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
PEPDP12955 PMS2P7-201ENST00000506558 1336 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
PEPDP12955 CALU-205ENST00000535011 3210 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
PEPDP12955 CLDN7-201ENST00000360325 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
PEPDP12955 TDRKH-202ENST00000368823 2751 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
PEPDP12955 STIM2-203ENST00000467011 3925 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
PEPDP12955 PPM1E-201ENST00000308249 6542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
PEPDP12955 FGFR3-208ENST00000481110 4217 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
PEPDP12955 TMUB2-212ENST00000589785 1918 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
PEPDP12955 CCDC120-202ENST00000496529 2415 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
PEPDP12955 PCDH19-202ENST00000373034 9756 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
PEPDP12955 TNNT3-203ENST00000381557 1019 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
PEPDP12955 OTOS-202ENST00000391989 645 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
PEPDP12955 VN2R19P-201ENST00000442399 1052 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
PEPDP12955 ITGB1BP1-205ENST00000456913 1043 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
PEPDP12955 ITGB1BP1-216ENST00000488451 874 ntTSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
PEPDP12955 PLA2G12A-202ENST00000502283 1189 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
PEPDP12955 AP000442.1-201ENST00000533552 769 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
PEPDP12955 LDLRAD2-203ENST00000543870 1180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
PEPDP12955 CALM1-205ENST00000553542 877 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
PEPDP12955 AC092384.3-201ENST00000561980 531 ntTSL 4 BASIC15.43■□□□□ 0.06
PEPDP12955 AL671883.3-201ENST00000603274 991 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
PEPDP12955 CHEK1-202ENST00000427383 1670 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
PEPDP12955 PAPLN-202ENST00000340738 5834 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
PEPDP12955 DOLPP1-202ENST00000372546 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
PEPDP12955 SLC35E2B-204ENST00000614300 2156 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
PEPDP12955 SENP1-204ENST00000549518 2260 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
PEPDP12955 CYP2S1-201ENST00000310054 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
PEPDP12955 CORO2B-201ENST00000261861 3569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
PEPDP12955 CORO2B-204ENST00000566799 3566 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
PEPDP12955 PCNX2-201ENST00000258229 7518 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
PEPDP12955 PIGQ-201ENST00000026218 2846 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
PEPDP12955 ATP6V0E2-201ENST00000421974 2605 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
PEPDP12955 LCK-202ENST00000336890 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
PEPDP12955 TMEM138-201ENST00000278826 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
PEPDP12955 WDR74-204ENST00000525239 1736 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
PEPDP12955 BSG-203ENST00000353555 1616 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
PEPDP12955 SEPT6-209ENST00000489216 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
PEPDP12955 CDIPT-209ENST00000569956 1532 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
PEPDP12955 TUBB8P12-201ENST00000308911 1335 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
PEPDP12955 TUBB7P-202ENST00000428444 1305 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
PEPDP12955 TUBB8P7-204ENST00000567960 1332 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
PEPDP12955 CDC25B-204ENST00000379598 2990 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
PEPDP12955 HAGH-202ENST00000397356 2984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 46.6 ms