Protein–RNA interactions for Protein: P12018

VPREB1, Immunoglobulin iota chain, humanhuman

Predictions only

Length 145 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VPREB1P12018 PRELID3A-203ENST00000587735 1694 ntTSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
VPREB1P12018 C6orf15-201ENST00000259870 1140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
VPREB1P12018 IGLL1-202ENST00000330377 901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
VPREB1P12018 BET1L-202ENST00000332865 533 ntTSL 5 BASIC10.74□□□□□ -0.69
VPREB1P12018 MRPL20-201ENST00000344843 721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
VPREB1P12018 BEX3-204ENST00000372645 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
VPREB1P12018 ATP5J-203ENST00000400090 647 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.74□□□□□ -0.69
VPREB1P12018 SMIM19-202ENST00000416469 691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
VPREB1P12018 DLEU2-203ENST00000425586 1267 ntTSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
VPREB1P12018 AL109741.1-201ENST00000432195 403 ntTSL 2 BASIC10.74□□□□□ -0.69
VPREB1P12018 ENO1-AS1-201ENST00000442636 456 ntTSL 2 BASIC10.74□□□□□ -0.69
VPREB1P12018 PRYP5-201ENST00000451909 266 ntBASIC10.74□□□□□ -0.69
VPREB1P12018 BET1L-206ENST00000486280 665 ntTSL 3 BASIC10.74□□□□□ -0.69
VPREB1P12018 ERCC5-207ENST00000535557 1125 ntTSL 5 BASIC10.74□□□□□ -0.69
VPREB1P12018 IFT20-215ENST00000585313 852 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC10.74□□□□□ -0.69
VPREB1P12018 EEF2KMT-206ENST00000587133 873 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC10.74□□□□□ -0.69
VPREB1P12018 TMIGD2-202ENST00000595645 1212 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
VPREB1P12018 TMEM114-203ENST00000620492 945 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.74□□□□□ -0.69
VPREB1P12018 ISPD-201ENST00000399310 1709 ntTSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
VPREB1P12018 AL512652.2-201ENST00000625156 1716 ntBASIC10.74□□□□□ -0.69
VPREB1P12018 GRB7-205ENST00000445327 2197 ntTSL 2 BASIC10.74□□□□□ -0.69
VPREB1P12018 PDXDC1-204ENST00000455313 2183 ntTSL 2 BASIC10.74□□□□□ -0.69
VPREB1P12018 MCF2L2-201ENST00000328913 4980 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.74□□□□□ -0.69
VPREB1P12018 TYSND1-201ENST00000287078 3644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
VPREB1P12018 DENND1A-202ENST00000373620 3612 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
VPREB1P12018 MAP2K5-201ENST00000178640 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
VPREB1P12018 SCP2-201ENST00000371509 1889 ntTSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
VPREB1P12018 SLFNL1-203ENST00000372611 1865 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.74□□□□□ -0.69
VPREB1P12018 ARMC6-203ENST00000392336 1866 ntTSL 2 BASIC10.74□□□□□ -0.69
VPREB1P12018 KIAA0319L-201ENST00000325722 4789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
VPREB1P12018 SHISA5-209ENST00000443308 1933 ntTSL 2 BASIC10.74□□□□□ -0.69
VPREB1P12018 IER2-203ENST00000588173 2934 ntAPPRIS P1 BASIC10.74□□□□□ -0.69
VPREB1P12018 WDR81-206ENST00000446363 2968 ntTSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
VPREB1P12018 BBS5-201ENST00000295240 3475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
VPREB1P12018 COL4A1-204ENST00000543140 2547 ntTSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
VPREB1P12018 PICALM-204ENST00000526033 3613 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
VPREB1P12018 AC005920.1-201ENST00000501718 2054 ntTSL 2 BASIC10.73□□□□□ -0.69
VPREB1P12018 AL031731.1-201ENST00000642131 2094 ntBASIC10.73□□□□□ -0.69
VPREB1P12018 NCOA1-205ENST00000406961 7289 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC10.73□□□□□ -0.69
VPREB1P12018 RUFY2-205ENST00000454950 2613 ntTSL 2 BASIC10.73□□□□□ -0.69
VPREB1P12018 AP000487.1-202ENST00000500185 2602 ntTSL 2 BASIC10.73□□□□□ -0.69
VPREB1P12018 PITHD1-201ENST00000246151 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
VPREB1P12018 ZMIZ1-205ENST00000611351 2196 ntTSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
VPREB1P12018 SLC29A1-205ENST00000371740 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
VPREB1P12018 LDB3-208ENST00000623007 1664 ntTSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
VPREB1P12018 PIK3R6-203ENST00000614407 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
VPREB1P12018 TTC29-202ENST00000398886 1729 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.73□□□□□ -0.69
VPREB1P12018 CLPTM1L-209ENST00000507807 1740 ntTSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
VPREB1P12018 RANBP3-201ENST00000034275 1762 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
VPREB1P12018 SCRN2-202ENST00000407215 1779 ntTSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
VPREB1P12018 INTS11-203ENST00000419704 1798 ntTSL 2 BASIC10.73□□□□□ -0.69
VPREB1P12018 ADAM9-206ENST00000481513 2387 ntTSL 2 BASIC10.73□□□□□ -0.69
VPREB1P12018 CES1-202ENST00000361503 1835 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
VPREB1P12018 SP100-205ENST00000409824 1802 ntTSL 5 BASIC10.73□□□□□ -0.69
VPREB1P12018 ABLIM2-202ENST00000361581 2472 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
VPREB1P12018 SLCO5A1-203ENST00000524945 3725 ntTSL 2 BASIC10.73□□□□□ -0.69
VPREB1P12018 C16orf89-201ENST00000315997 1872 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
VPREB1P12018 SLC22A12-201ENST00000336464 1854 ntTSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
VPREB1P12018 MRPL43-203ENST00000318364 1010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
VPREB1P12018 MRPL43-204ENST00000342071 894 ntTSL 5 BASIC10.73□□□□□ -0.69
VPREB1P12018 CAPN10-203ENST00000352879 862 ntTSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
VPREB1P12018 ASGR1-202ENST00000380920 944 ntTSL 3 BASIC10.73□□□□□ -0.69
VPREB1P12018 KRTAP5-6-201ENST00000382160 561 ntAPPRIS P1 BASIC10.73□□□□□ -0.69
VPREB1P12018 YDJC-202ENST00000398873 1066 ntTSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
VPREB1P12018 BX890604.1-205ENST00000425492 856 ntTSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
VPREB1P12018 MTG1-205ENST00000477902 1283 ntTSL 3 BASIC10.73□□□□□ -0.69
VPREB1P12018 TUBB3-205ENST00000554336 903 ntTSL 3 BASIC10.73□□□□□ -0.69
VPREB1P12018 MPI-205ENST00000562606 1052 ntTSL 3 BASIC10.73□□□□□ -0.69
VPREB1P12018 AC087289.1-201ENST00000586808 890 ntTSL 5 BASIC10.73□□□□□ -0.69
VPREB1P12018 ZNF549-203ENST00000594943 556 ntTSL 4 BASIC10.73□□□□□ -0.69
VPREB1P12018 AC243773.1-201ENST00000614759 544 ntTSL 5 BASIC10.73□□□□□ -0.69
VPREB1P12018 CCNC-219ENST00000627680 896 ntTSL 5 BASIC10.73□□□□□ -0.69
VPREB1P12018 OPN5-206ENST00000638973 1090 ntTSL 5 BASIC10.73□□□□□ -0.69
VPREB1P12018 GK2-201ENST00000358842 1942 ntAPPRIS P1 BASIC10.73□□□□□ -0.69
VPREB1P12018 AP000787.1-201ENST00000501356 1926 ntTSL 2 BASIC10.73□□□□□ -0.69
VPREB1P12018 SLC17A9-201ENST00000370349 2594 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
VPREB1P12018 CSPG4P12-202ENST00000559989 7790 ntTSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
VPREB1P12018 PCBP3-204ENST00000400309 1986 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.73□□□□□ -0.69
VPREB1P12018 PDCL3-201ENST00000264254 1337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
VPREB1P12018 SARDH-202ENST00000371867 1326 ntTSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
VPREB1P12018 PRKRA-203ENST00000432031 1344 ntTSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
VPREB1P12018 KIF1A-201ENST00000320389 8832 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.73□□□□□ -0.69
VPREB1P12018 IFNAR2-204ENST00000382264 1389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
VPREB1P12018 KRT8P39-201ENST00000396270 1433 ntBASIC10.73□□□□□ -0.69
VPREB1P12018 ELOF1-203ENST00000586683 2154 ntTSL 2 BASIC10.73□□□□□ -0.69
VPREB1P12018 ZNF574-202ENST00000359044 2940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
VPREB1P12018 KCNC2-209ENST00000550433 2931 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
VPREB1P12018 SNAP91-205ENST00000439399 4452 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.73□□□□□ -0.69
VPREB1P12018 ZKSCAN2-201ENST00000328086 7523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
VPREB1P12018 RGN-203ENST00000397180 2257 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.73□□□□□ -0.69
VPREB1P12018 RAB37-208ENST00000402449 1560 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC10.73□□□□□ -0.69
VPREB1P12018 IRS1-201ENST00000305123 9705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
VPREB1P12018 VARS2-212ENST00000542001 4064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
VPREB1P12018 ZFP90-203ENST00000563169 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
VPREB1P12018 AC097376.2-201ENST00000608661 2510 ntTSL 5 BASIC10.73□□□□□ -0.69
VPREB1P12018 MAPK8IP2-202ENST00000329492 3381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
VPREB1P12018 PNMA6E-202ENST00000633844 2596 ntTSL 3 BASIC10.72□□□□□ -0.69
VPREB1P12018 LMNA-202ENST00000361308 1713 ntTSL 5 BASIC10.72□□□□□ -0.69
VPREB1P12018 RIMS1-213ENST00000517960 4428 ntTSL 5 BASIC10.72□□□□□ -0.69
VPREB1P12018 RIMS1-215ENST00000520567 4442 ntTSL 5 BASIC10.72□□□□□ -0.69
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 41.7 ms