Protein–RNA interactions for Protein: P08100

RHO, Rhodopsin, humanhuman

Predictions only

Length 348 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RHOP08100 B3GNT8-201ENST00000321702 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
RHOP08100 PTDSS1-202ENST00000517309 5177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
RHOP08100 INPP5J-205ENST00000404390 2215 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.09■□□□□ 0.33
RHOP08100 BCAS3-204ENST00000585744 2203 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
RHOP08100 NSD3-201ENST00000316985 3995 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
RHOP08100 SLC39A7-202ENST00000374677 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
RHOP08100 KCNJ2-AS1-201ENST00000590966 2442 ntBASIC17.09■□□□□ 0.33
RHOP08100 ZNF22-201ENST00000298299 2551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
RHOP08100 MTA1-207ENST00000435036 2888 ntTSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
RHOP08100 EBI3-201ENST00000221847 1186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
RHOP08100 OR8S1-201ENST00000310194 1080 ntBASIC17.09■□□□□ 0.33
RHOP08100 C11orf88-202ENST00000375618 712 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
RHOP08100 RTN4RL2-202ENST00000395120 582 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
RHOP08100 Z98749.2-201ENST00000428294 700 ntTSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
RHOP08100 GNAQP1-201ENST00000444815 1067 ntBASIC17.09■□□□□ 0.33
RHOP08100 MAGI2-AS3-208ENST00000446159 670 ntTSL 3 BASIC17.09■□□□□ 0.33
RHOP08100 KRT17P7-201ENST00000451704 1104 ntBASIC17.09■□□□□ 0.33
RHOP08100 AC008378.1-201ENST00000521251 496 ntTSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
RHOP08100 AP003068.1-201ENST00000528887 544 ntTSL 4 BASIC17.09■□□□□ 0.33
RHOP08100 AL512361.1-201ENST00000554200 418 ntBASIC17.09■□□□□ 0.33
RHOP08100 AC104794.3-201ENST00000566840 1248 ntBASIC17.09■□□□□ 0.33
RHOP08100 CREB3L2-208ENST00000620715 1053 ntTSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
RHOP08100 BCRP3-202ENST00000621462 1021 ntTSL 3 BASIC17.09■□□□□ 0.33
RHOP08100 UBAP1L-201ENST00000502113 1381 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
RHOP08100 TOM1L2-209ENST00000540946 1420 ntTSL 2 BASIC17.09■□□□□ 0.33
RHOP08100 TVP23C-201ENST00000225576 1527 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
RHOP08100 RHCE-201ENST00000294413 1591 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
RHOP08100 HOXA10-202ENST00000396344 1570 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
RHOP08100 MED19-201ENST00000337672 1637 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
RHOP08100 ACOT7-204ENST00000377855 1614 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
RHOP08100 AD000671.3-202ENST00000591091 1712 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
RHOP08100 GJA3-201ENST00000241125 5211 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.09■□□□□ 0.33
RHOP08100 RDH13-223ENST00000610356 1931 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
RHOP08100 TTC24-202ENST00000368237 1969 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
RHOP08100 SHE-201ENST00000304760 6243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
RHOP08100 ZCWPW1-202ENST00000398027 2356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
RHOP08100 RIC8B-203ENST00000392839 2440 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
RHOP08100 NR2C2-206ENST00000425241 2494 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.09■□□□□ 0.33
RHOP08100 PGAP3-203ENST00000378011 2533 ntTSL 2 BASIC17.09■□□□□ 0.33
RHOP08100 NGLY1-207ENST00000428257 2534 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
RHOP08100 LRRC20-203ENST00000358141 2924 ntTSL 2 BASIC17.09■□□□□ 0.33
RHOP08100 C6orf223-203ENST00000442114 3109 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
RHOP08100 ARHGAP26-201ENST00000274498 6862 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
RHOP08100 IL6R-202ENST00000368485 5914 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
RHOP08100 FENDRR-206ENST00000599749 2843 ntTSL 3 BASIC17.08■□□□□ 0.33
RHOP08100 SEC14L2-215ENST00000617837 2632 ntTSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.33
RHOP08100 BAG3-201ENST00000369085 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
RHOP08100 CCT6A-202ENST00000335503 2529 ntTSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.33
RHOP08100 HNF1A-212ENST00000544413 2014 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
RHOP08100 CD8A-202ENST00000352580 1977 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.33
RHOP08100 RDH13-202ENST00000396247 1987 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
RHOP08100 PCGF1-201ENST00000233630 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
RHOP08100 FAM49B-224ENST00000522941 1700 ntTSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.32
RHOP08100 RNF157-201ENST00000269391 4955 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
RHOP08100 CD14-202ENST00000401743 1648 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.08■□□□□ 0.32
RHOP08100 AL023806.1-201ENST00000603994 1649 ntBASIC17.08■□□□□ 0.32
RHOP08100 AC005622.1-202ENST00000637093 1543 ntTSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.32
RHOP08100 CD1E-212ENST00000368167 1458 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
RHOP08100 WDR45-201ENST00000322995 1444 ntTSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.32
RHOP08100 SNRPN-201ENST00000346403 1304 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.32
RHOP08100 AKR7L-202ENST00000429712 1313 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
RHOP08100 NBL1-201ENST00000289749 731 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.32
RHOP08100 CCDC182-201ENST00000299415 832 ntAPPRIS P1 BASIC17.08■□□□□ 0.32
RHOP08100 VHLL-201ENST00000339922 676 ntAPPRIS P1 BASIC17.08■□□□□ 0.32
RHOP08100 IDH3B-202ENST00000380851 1230 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
RHOP08100 FAM166B-201ENST00000399742 958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
RHOP08100 PTPA-220ENST00000436883 532 ntTSL 4 BASIC17.08■□□□□ 0.32
RHOP08100 IL32-234ENST00000552936 713 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.08■□□□□ 0.32
RHOP08100 AC010336.2-201ENST00000564226 506 ntBASIC17.08■□□□□ 0.32
RHOP08100 AC140912.1-201ENST00000577171 1054 ntBASIC17.08■□□□□ 0.32
RHOP08100 AC027575.2-201ENST00000585258 1295 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
RHOP08100 C19orf70-206ENST00000590389 769 ntTSL 3 BASIC17.08■□□□□ 0.32
RHOP08100 ZNF655-225ENST00000626122 705 ntTSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.32
RHOP08100 LGI4-201ENST00000310123 2814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
RHOP08100 TMC6-202ENST00000322914 2786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
RHOP08100 KCTD2-201ENST00000322444 3635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
RHOP08100 HAS3-205ENST00000569188 2170 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.32
RHOP08100 NFATC1-210ENST00000587635 2195 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
RHOP08100 SLFNL1-205ENST00000439569 2117 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.32
RHOP08100 GPAA1P2-202ENST00000606848 1787 ntBASIC17.07■□□□□ 0.32
RHOP08100 CPVL-202ENST00000396276 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
RHOP08100 GAREM2-202ENST00000407684 5138 ntTSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
RHOP08100 MRGPRX3-201ENST00000396275 1639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
RHOP08100 CTD-2194D22.4-201ENST00000514569 1635 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
RHOP08100 PLBD2-201ENST00000280800 4800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
RHOP08100 CLDN5-202ENST00000406028 2548 ntTSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
RHOP08100 SLC12A5-210ENST00000616202 2445 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
RHOP08100 OTUB1-206ENST00000535715 1391 ntTSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
RHOP08100 PDZD3-202ENST00000355547 2252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
RHOP08100 RBCK1-203ENST00000382181 2208 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
RHOP08100 AARSD1-202ENST00000427569 1322 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
RHOP08100 TRAPPC3-210ENST00000617904 1305 ntTSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
RHOP08100 PDSS2-201ENST00000369031 1236 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
RHOP08100 LINC00229-201ENST00000443783 500 ntTSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
RHOP08100 NAA50-208ENST00000497255 789 ntTSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
RHOP08100 AC061975.2-201ENST00000581722 295 ntBASIC17.07■□□□□ 0.32
RHOP08100 AL157392.3-207ENST00000601758 744 ntTSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
RHOP08100 AL008721.1-201ENST00000609964 604 ntBASIC17.07■□□□□ 0.32
RHOP08100 ACOT12-201ENST00000307624 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
RHOP08100 COL5A3-201ENST00000264828 6174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 47.4 ms