Protein–RNA interactions for Protein: O94953

KDM4B, Lysine-specific demethylase 4B, humanhuman

Predictions only

Length 1,096 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KDM4BO94953 CFC1B-203ENST00000620207 1444 ntTSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
KDM4BO94953 CFC1-203ENST00000621673 1444 ntTSL 2 BASIC14.69□□□□□ -0.06
KDM4BO94953 AASDHPPT-201ENST00000278618 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
KDM4BO94953 ITSN1-205ENST00000381291 5437 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
KDM4BO94953 C1R-202ENST00000536053 2347 ntTSL 2 BASIC14.69□□□□□ -0.06
KDM4BO94953 AL135999.2-201ENST00000622438 1686 ntBASIC14.69□□□□□ -0.06
KDM4BO94953 MAP3K1-201ENST00000399503 7011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
KDM4BO94953 GCK-202ENST00000345378 2421 ntTSL 2 BASIC14.69□□□□□ -0.06
KDM4BO94953 PTGDS-202ENST00000371625 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
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KDM4BO94953 EEF1D-202ENST00000395119 1249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
KDM4BO94953 ING5-202ENST00000406941 946 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
KDM4BO94953 ISCU-203ENST00000431221 799 ntTSL 2 BASIC14.69□□□□□ -0.06
KDM4BO94953 AC113382.1-201ENST00000500267 1253 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
KDM4BO94953 AC079848.1-202ENST00000507924 444 ntTSL 3 BASIC14.69□□□□□ -0.06
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KDM4BO94953 AC010632.1-201ENST00000590376 572 ntTSL 4 BASIC14.69□□□□□ -0.06
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KDM4BO94953 OSBPL10-201ENST00000396556 6600 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
KDM4BO94953 P2RY6-204ENST00000393592 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
KDM4BO94953 NSUN5P2-201ENST00000388955 1789 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
KDM4BO94953 COBL-203ENST00000395542 5339 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
KDM4BO94953 USP3-AS1-201ENST00000558831 1784 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
KDM4BO94953 RANBP3-220ENST00000591092 1783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
KDM4BO94953 MPP1-202ENST00000369534 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
KDM4BO94953 ADAMTS2-201ENST00000251582 6754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
KDM4BO94953 SEPT6-209ENST00000489216 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
KDM4BO94953 USP36-201ENST00000312010 5234 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
KDM4BO94953 DCAF11-217ENST00000559115 2711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
KDM4BO94953 RALGPS1-203ENST00000373434 2466 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
KDM4BO94953 LCOR-202ENST00000356016 4834 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC14.69□□□□□ -0.06
KDM4BO94953 CHGA-202ENST00000334654 1474 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
KDM4BO94953 APOA4-201ENST00000357780 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
KDM4BO94953 NFIX-209ENST00000587760 1487 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
KDM4BO94953 LENG8-209ENST00000616932 2825 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
KDM4BO94953 PPAN-P2RY11-202ENST00000428358 2661 ntTSL 2 BASIC14.69□□□□□ -0.06
KDM4BO94953 PRAMEF20-201ENST00000316412 1597 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
KDM4BO94953 FAM49B-223ENST00000522746 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
KDM4BO94953 FAM104A-201ENST00000403627 2798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
KDM4BO94953 SMG1P3-206ENST00000522841 2774 ntTSL 2 BASIC14.68□□□□□ -0.06
KDM4BO94953 B4GALNT2-201ENST00000300404 1906 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
KDM4BO94953 CD19-201ENST00000324662 1932 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
KDM4BO94953 GPER1-206ENST00000617001 1900 ntTSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
KDM4BO94953 LTBR-201ENST00000228918 2260 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
KDM4BO94953 SMARCA4-207ENST00000541122 5139 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
KDM4BO94953 LINC02370-201ENST00000428272 2009 ntTSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
KDM4BO94953 PIGT-207ENST00000543458 2037 ntTSL 2 BASIC14.68□□□□□ -0.06
KDM4BO94953 GLI2-210ENST00000452319 6799 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
KDM4BO94953 NABP2-201ENST00000267023 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
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KDM4BO94953 CSAD-208ENST00000444623 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
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KDM4BO94953 RASA4-201ENST00000262940 5605 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
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KDM4BO94953 TMEM33-208ENST00000513702 1092 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
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KDM4BO94953 LHCGR-204ENST00000405626 2073 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
KDM4BO94953 IER3-202ENST00000376377 1350 ntBASIC14.68□□□□□ -0.06
KDM4BO94953 FGFBP1-201ENST00000382333 1359 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.68□□□□□ -0.06
KDM4BO94953 VWA2-203ENST00000603594 2600 ntTSL 2 BASIC14.68□□□□□ -0.06
KDM4BO94953 LINC01270-201ENST00000371639 2281 ntTSL 2 BASIC14.68□□□□□ -0.06
KDM4BO94953 PDE4A-203ENST00000380702 4781 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
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KDM4BO94953 KIF26B-202ENST00000407071 7287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
KDM4BO94953 TAB1-202ENST00000331454 1660 ntTSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
KDM4BO94953 KRT35-202ENST00000393989 1670 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
KDM4BO94953 UNC13B-201ENST00000378495 6303 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
KDM4BO94953 NFE2-202ENST00000435572 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
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KDM4BO94953 KRT2-201ENST00000309680 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
KDM4BO94953 AC097376.2-201ENST00000608661 2510 ntTSL 5 BASIC14.67□□□□□ -0.06
KDM4BO94953 TVP23B-201ENST00000307767 2064 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
KDM4BO94953 CNOT8-204ENST00000517876 2708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.67□□□□□ -0.06
KDM4BO94953 KCNJ12-201ENST00000331718 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
KDM4BO94953 HLF-201ENST00000226067 5547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
KDM4BO94953 MAGI1-216ENST00000497477 3555 ntTSL 5 BASIC14.67□□□□□ -0.06
KDM4BO94953 MRI1-202ENST00000319545 3027 ntTSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
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