Protein–RNA interactions for Protein: O43426

SYNJ1, Synaptojanin-1, humanhuman

Predictions only

Length 1,573 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SYNJ1O43426 TAGLN3-202ENST00000393917 1488 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.36■■□□□ 1.97
SYNJ1O43426 NEK2-202ENST00000366999 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
SYNJ1O43426 TAF1C-222ENST00000570117 2349 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.36■■□□□ 1.97
SYNJ1O43426 PHF23-202ENST00000454255 1662 ntTSL 2 BASIC27.36■■□□□ 1.97
SYNJ1O43426 PSEN2-211ENST00000626989 1972 ntTSL 5 BASIC27.36■■□□□ 1.97
SYNJ1O43426 NDUFS2-202ENST00000392179 2064 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
SYNJ1O43426 SLC41A3-203ENST00000360370 2169 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
SYNJ1O43426 KLK10-202ENST00000358789 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
SYNJ1O43426 DCAF4-201ENST00000353777 1940 ntTSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
SYNJ1O43426 KCNE3-201ENST00000310128 3143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
SYNJ1O43426 DIRC3-201ENST00000423123 552 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC27.35■■□□□ 1.97
SYNJ1O43426 C11orf98-201ENST00000524958 654 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.35■■□□□ 1.97
SYNJ1O43426 QRFP-202ENST00000623824 1658 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.35■■□□□ 1.97
SYNJ1O43426 LYPLAL1-202ENST00000366928 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
SYNJ1O43426 SLC18B1-201ENST00000275227 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
SYNJ1O43426 RNF157-202ENST00000319945 2937 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.35■■□□□ 1.97
SYNJ1O43426 LARGE2-201ENST00000325468 2522 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
SYNJ1O43426 PIGT-207ENST00000543458 2037 ntTSL 2 BASIC27.35■■□□□ 1.97
SYNJ1O43426 PARP15-202ENST00000464300 2156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
SYNJ1O43426 ACSM2B-211ENST00000567001 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
SYNJ1O43426 NTNG1-202ENST00000370065 1485 ntTSL 5 BASIC27.35■■□□□ 1.97
SYNJ1O43426 ERLEC1-201ENST00000185150 2433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
SYNJ1O43426 H1FOO-201ENST00000324382 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
SYNJ1O43426 EFNA4-201ENST00000359751 1096 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
SYNJ1O43426 AZGP1P1-201ENST00000411909 902 ntBASIC27.35■■□□□ 1.97
SYNJ1O43426 BMP7-AS1-201ENST00000445956 436 ntTSL 2 BASIC27.35■■□□□ 1.97
SYNJ1O43426 HOXB3-204ENST00000465120 943 ntTSL 3 BASIC27.35■■□□□ 1.97
SYNJ1O43426 MIR4538-201ENST00000581377 78 ntBASIC27.35■■□□□ 1.97
SYNJ1O43426 TCIRG1-201ENST00000265686 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
SYNJ1O43426 GTPBP3-201ENST00000324894 2579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
SYNJ1O43426 ZSCAN10-202ENST00000538082 2350 ntTSL 4 BASIC27.34■■□□□ 1.97
SYNJ1O43426 BRINP1-202ENST00000373964 1641 ntTSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
SYNJ1O43426 TM6SF2-201ENST00000389363 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
SYNJ1O43426 FCHO1-201ENST00000252771 3118 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.34■■□□□ 1.97
SYNJ1O43426 ZNF302-201ENST00000423823 2590 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
SYNJ1O43426 AC118344.1-201ENST00000378432 1462 ntTSL 2 BASIC27.34■■□□□ 1.97
SYNJ1O43426 TUBB6-211ENST00000591208 1492 ntTSL 5 BASIC27.34■■□□□ 1.97
SYNJ1O43426 PTPRO-209ENST00000543886 2070 ntTSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
SYNJ1O43426 LCE5A-201ENST00000334269 819 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.34■■□□□ 1.97
SYNJ1O43426 LINC01975-201ENST00000571890 549 ntTSL 4 BASIC27.34■■□□□ 1.97
SYNJ1O43426 C1QTNF1-208ENST00000580474 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
SYNJ1O43426 AIFM3-201ENST00000399163 2309 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
SYNJ1O43426 PPP1R27-202ENST00000570394 1443 ntTSL 2 BASIC27.34■■□□□ 1.97
SYNJ1O43426 EIF3C-211ENST00000566866 2986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
SYNJ1O43426 BEX4-202ENST00000372695 1328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
SYNJ1O43426 URAHP-202ENST00000409873 1349 ntTSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
SYNJ1O43426 CBS-201ENST00000352178 2583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
SYNJ1O43426 MOGS-205ENST00000452063 2568 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
SYNJ1O43426 RAB4B-EGLN2-201ENST00000594136 2554 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.33■■□□□ 1.97
SYNJ1O43426 DCST1-202ENST00000368419 2207 ntTSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
SYNJ1O43426 EPN2-203ENST00000395618 2216 ntTSL 2 BASIC27.33■■□□□ 1.97
SYNJ1O43426 GTPBP3-222ENST00000600625 2493 ntTSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
SYNJ1O43426 B9D1-209ENST00000477478 1353 ntTSL 3 BASIC27.33■■□□□ 1.97
SYNJ1O43426 GLMP-213ENST00000612353 1365 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.33■■□□□ 1.97
SYNJ1O43426 NOL4L-210ENST00000616976 1376 ntTSL 5 BASIC27.33■■□□□ 1.97
SYNJ1O43426 GLMP-215ENST00000622703 1364 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.33■■□□□ 1.97
SYNJ1O43426 U82695.1-201ENST00000635752 1889 ntBASIC27.33■■□□□ 1.97
SYNJ1O43426 LRCOL1-201ENST00000376608 778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
SYNJ1O43426 HLA-DPB2-205ENST00000435074 1188 ntBASIC27.33■■□□□ 1.97
SYNJ1O43426 AHSA1-201ENST00000216479 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
SYNJ1O43426 NFKB2-201ENST00000189444 3011 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
SYNJ1O43426 PDCD1-201ENST00000334409 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
SYNJ1O43426 CD300LG-206ENST00000588884 1459 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.33■■□□□ 1.96
SYNJ1O43426 TAB1-202ENST00000331454 1660 ntTSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
SYNJ1O43426 BCAR1-201ENST00000162330 3221 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
SYNJ1O43426 TMEM140-201ENST00000275767 1997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
SYNJ1O43426 BUD31-201ENST00000222969 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
SYNJ1O43426 AC017116.1-201ENST00000445938 708 ntTSL 3 BASIC27.32■■□□□ 1.96
SYNJ1O43426 BRF2-202ENST00000520601 1192 ntTSL 3 BASIC27.32■■□□□ 1.96
SYNJ1O43426 MIR6775-201ENST00000617557 69 ntBASIC27.32■■□□□ 1.96
SYNJ1O43426 MIR6069-201ENST00000620069 79 ntBASIC27.32■■□□□ 1.96
SYNJ1O43426 RBM47-212ENST00000514014 2419 ntTSL 2 BASIC27.32■■□□□ 1.96
SYNJ1O43426 SLC26A5-202ENST00000339444 2474 ntTSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
SYNJ1O43426 Z97205.2-201ENST00000564697 1639 ntBASIC27.32■■□□□ 1.96
SYNJ1O43426 MAGEA8-201ENST00000286482 1778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
SYNJ1O43426 MSMO1-202ENST00000393766 1789 ntTSL 2 BASIC27.32■■□□□ 1.96
SYNJ1O43426 FFAR2-201ENST00000246549 2051 ntAPPRIS P1 BASIC27.32■■□□□ 1.96
SYNJ1O43426 LMBR1L-204ENST00000547382 2235 ntTSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
SYNJ1O43426 DMRTA2-201ENST00000404795 3137 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.32■■□□□ 1.96
SYNJ1O43426 HECA-201ENST00000367658 5614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
SYNJ1O43426 ESR2-209ENST00000555278 1883 ntTSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
SYNJ1O43426 AC091729.1-201ENST00000449721 869 ntTSL 3 BASIC27.31■■□□□ 1.96
SYNJ1O43426 USB1-203ENST00000539737 1212 ntTSL 2 BASIC27.31■■□□□ 1.96
SYNJ1O43426 LINC01759-203ENST00000635271 888 ntTSL 5 BASIC27.31■■□□□ 1.96
SYNJ1O43426 HTR3E-201ENST00000335304 1912 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
SYNJ1O43426 MAGI2-215ENST00000628980 6212 ntTSL 5 BASIC27.31■■□□□ 1.96
SYNJ1O43426 KLK8-211ENST00000600767 1324 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.31■■□□□ 1.96
SYNJ1O43426 MGME1-203ENST00000377710 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
SYNJ1O43426 AL034417.2-201ENST00000445300 2044 ntTSL 2 BASIC27.31■■□□□ 1.96
SYNJ1O43426 RBFOX3-212ENST00000584778 1547 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.31■■□□□ 1.96
SYNJ1O43426 PLEKHB1-203ENST00000398492 2275 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
SYNJ1O43426 SERPINA4-202ENST00000555095 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
SYNJ1O43426 ABHD11-AS1-201ENST00000427153 662 ntTSL 5 BASIC27.31■■□□□ 1.96
SYNJ1O43426 AC147067.1-201ENST00000466692 579 ntTSL 2 BASIC27.31■■□□□ 1.96
SYNJ1O43426 AP000943.3-201ENST00000536540 954 ntTSL 3 BASIC27.31■■□□□ 1.96
SYNJ1O43426 IGHV3OR16-16-201ENST00000563644 343 ntBASIC27.31■■□□□ 1.96
SYNJ1O43426 TMEM170A-203ENST00000566980 547 ntTSL 5 BASIC27.31■■□□□ 1.96
SYNJ1O43426 AC120498.3-201ENST00000568884 542 ntTSL 4 BASIC27.31■■□□□ 1.96
SYNJ1O43426 AC010336.6-201ENST00000595107 528 ntTSL 4 BASIC27.31■■□□□ 1.96
SYNJ1O43426 GPS1-226ENST00000623691 1839 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.31■■□□□ 1.96
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 36.5 ms