Protein–RNA interactions for Protein: O43365

HOXA3, Homeobox protein Hox-A3, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 443 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HOXA3O43365 PTPRC-206ENST00000413409 1338 ntTSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
HOXA3O43365 ARFGAP1-220ENST00000547204 1327 ntTSL 2 BASIC13.36□□□□□ -0.27
HOXA3O43365 TRIM17-201ENST00000295033 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
HOXA3O43365 ALDH4A1-201ENST00000290597 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
HOXA3O43365 TTLL8-201ENST00000266182 2505 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.36□□□□□ -0.27
HOXA3O43365 ADO-201ENST00000373783 3627 ntAPPRIS P1 BASIC13.36□□□□□ -0.27
HOXA3O43365 ETNK2-203ENST00000367202 2434 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
HOXA3O43365 ICAM3-205ENST00000589261 2024 ntTSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
HOXA3O43365 CDKN1A-201ENST00000244741 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
HOXA3O43365 CLDN14-204ENST00000399137 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
HOXA3O43365 TM2D3-207ENST00000559107 1353 ntTSL 3 BASIC13.35□□□□□ -0.27
HOXA3O43365 SLC30A4-201ENST00000261867 7157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
HOXA3O43365 RGS6-210ENST00000553530 5685 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
HOXA3O43365 ZMIZ1-201ENST00000334512 7546 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.35□□□□□ -0.27
HOXA3O43365 STAT5A-201ENST00000345506 4301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
HOXA3O43365 GAL3ST4-201ENST00000360039 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
HOXA3O43365 ANKRD29-208ENST00000592179 3361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
HOXA3O43365 SUPT20H-202ENST00000356185 2681 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
HOXA3O43365 SWAP70-202ENST00000447399 3538 ntTSL 2 BASIC13.35□□□□□ -0.27
HOXA3O43365 TMEM41A-201ENST00000296254 1060 ntTSL 2 BASIC13.35□□□□□ -0.27
HOXA3O43365 ERAS-201ENST00000338270 1266 ntAPPRIS P1 BASIC13.35□□□□□ -0.27
HOXA3O43365 POP5-202ENST00000357500 801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
HOXA3O43365 CTRC-202ENST00000375949 898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
HOXA3O43365 CD81-202ENST00000381036 880 ntTSL 3 BASIC13.35□□□□□ -0.27
HOXA3O43365 LINC00398-201ENST00000414407 906 ntTSL 2 BASIC13.35□□□□□ -0.27
HOXA3O43365 AL158071.2-201ENST00000423380 815 ntTSL 3 BASIC13.35□□□□□ -0.27
HOXA3O43365 U52111.1-201ENST00000434284 914 ntTSL 3 BASIC13.35□□□□□ -0.27
HOXA3O43365 TSPY16P-201ENST00000449843 468 ntBASIC13.35□□□□□ -0.27
HOXA3O43365 PPP6R2P1-201ENST00000450880 1275 ntBASIC13.35□□□□□ -0.27
HOXA3O43365 FXYD1-202ENST00000455515 594 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.35□□□□□ -0.27
HOXA3O43365 LINC01812-201ENST00000457448 725 ntTSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
HOXA3O43365 SLC50A1-209ENST00000484157 886 ntTSL 3 BASIC13.35□□□□□ -0.27
HOXA3O43365 KRT18P34-201ENST00000488218 1270 ntBASIC13.35□□□□□ -0.27
HOXA3O43365 AC016168.1-201ENST00000591422 722 ntTSL 3 BASIC13.35□□□□□ -0.27
HOXA3O43365 SNHG8-201ENST00000602414 672 ntTSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
HOXA3O43365 SNHG8-205ENST00000602819 470 ntTSL 2 BASIC13.35□□□□□ -0.27
HOXA3O43365 AL158211.3-201ENST00000607385 239 ntBASIC13.35□□□□□ -0.27
HOXA3O43365 TSC22D3-203ENST00000372383 2266 ntTSL 2 BASIC13.35□□□□□ -0.27
HOXA3O43365 RGN-203ENST00000397180 2257 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.35□□□□□ -0.27
HOXA3O43365 SNX17-210ENST00000537606 2400 ntTSL 2 BASIC13.35□□□□□ -0.27
HOXA3O43365 TMCO1-207ENST00000580248 1735 ntTSL 2 BASIC13.35□□□□□ -0.27
HOXA3O43365 MEPCE-201ENST00000310512 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
HOXA3O43365 CHRD-202ENST00000348986 3155 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.35□□□□□ -0.27
HOXA3O43365 PODXL-201ENST00000322985 2011 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
HOXA3O43365 GSDMD-206ENST00000526406 2496 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC13.35□□□□□ -0.27
HOXA3O43365 RTKN-203ENST00000305557 2646 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.35□□□□□ -0.27
HOXA3O43365 SYNE3-202ENST00000553340 2615 ntTSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
HOXA3O43365 PAM-206ENST00000438793 5432 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
HOXA3O43365 C8orf76-201ENST00000276704 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
HOXA3O43365 ULBP2-201ENST00000367351 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
HOXA3O43365 CLN3-229ENST00000567963 1452 ntTSL 5 BASIC13.35□□□□□ -0.27
HOXA3O43365 BSG-202ENST00000346916 1605 ntTSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
HOXA3O43365 BSG-203ENST00000353555 1616 ntTSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
HOXA3O43365 ADK-202ENST00000372734 2083 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
HOXA3O43365 PHGDH-208ENST00000641023 2096 ntAPPRIS P1 BASIC13.35□□□□□ -0.27
HOXA3O43365 LHX3-203ENST00000619587 2698 ntTSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
HOXA3O43365 ZNF134-201ENST00000396161 4914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
HOXA3O43365 PML-215ENST00000565898 5393 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
HOXA3O43365 RIC8A-208ENST00000527696 2565 ntTSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
HOXA3O43365 POLR3H-202ENST00000355209 4416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
HOXA3O43365 BCL2L12-203ENST00000441864 1371 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
HOXA3O43365 MARVELD3-204ENST00000565261 1351 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
HOXA3O43365 HRAT92-201ENST00000452622 3506 ntTSL 2 BASIC13.34□□□□□ -0.27
HOXA3O43365 SMARCA4-201ENST00000344626 5392 ntTSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
HOXA3O43365 CEP78-204ENST00000415759 2623 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.34□□□□□ -0.27
HOXA3O43365 HNRNPM-217ENST00000620401 2458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
HOXA3O43365 DNM3-203ENST00000367733 2322 ntTSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
HOXA3O43365 MMP17-206ENST00000535291 2301 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
HOXA3O43365 TMEM132D-202ENST00000422113 5776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
HOXA3O43365 ZBTB46-201ENST00000245663 5185 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.34□□□□□ -0.27
HOXA3O43365 PIGT-257ENST00000640210 1715 ntTSL 5 BASIC13.34□□□□□ -0.27
HOXA3O43365 FBXL5-202ENST00000412094 2837 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
HOXA3O43365 IFFO1-201ENST00000336604 2686 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
HOXA3O43365 NRG1-216ENST00000523079 2359 ntTSL 2 BASIC13.34□□□□□ -0.27
HOXA3O43365 ITPR3-201ENST00000374316 9870 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.34□□□□□ -0.27
HOXA3O43365 NKG7-201ENST00000221978 843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
HOXA3O43365 MRGPRD-201ENST00000309106 966 ntAPPRIS P1 BASIC13.34□□□□□ -0.27
HOXA3O43365 GBGT1-201ENST00000372036 871 ntTSL 3 BASIC13.34□□□□□ -0.27
HOXA3O43365 TEX30-202ENST00000376021 1038 ntTSL 2 BASIC13.34□□□□□ -0.27
HOXA3O43365 CXCL12-206ENST00000395795 404 ntTSL 5 BASIC13.34□□□□□ -0.27
HOXA3O43365 AC236430.1-201ENST00000402231 743 ntBASIC13.34□□□□□ -0.27
HOXA3O43365 COLEC11-205ENST00000402922 1134 ntTSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
HOXA3O43365 TMEM37-202ENST00000409826 794 ntTSL 3 BASIC13.34□□□□□ -0.27
HOXA3O43365 ZDHHC20-IT1-201ENST00000417513 440 ntTSL 3 BASIC13.34□□□□□ -0.27
HOXA3O43365 C2orf88-205ENST00000443551 692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
HOXA3O43365 NAGK-205ENST00000443938 1221 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.34□□□□□ -0.27
HOXA3O43365 AP001471.1-201ENST00000454245 672 ntTSL 3 BASIC13.34□□□□□ -0.27
HOXA3O43365 SSNA1-204ENST00000464553 723 ntTSL 2 BASIC13.34□□□□□ -0.27
HOXA3O43365 AC092691.1-201ENST00000484092 554 ntTSL 4 BASIC13.34□□□□□ -0.27
HOXA3O43365 TERF1P3-201ENST00000505638 1227 ntBASIC13.34□□□□□ -0.27
HOXA3O43365 TPT1-AS1-219ENST00000523506 574 ntTSL 4 BASIC13.34□□□□□ -0.27
HOXA3O43365 ASXL1-206ENST00000542461 1068 ntTSL 5 BASIC13.34□□□□□ -0.27
HOXA3O43365 NDUFA4L2-202ENST00000554503 1177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
HOXA3O43365 MIR4453-201ENST00000584019 89 ntBASIC13.34□□□□□ -0.27
HOXA3O43365 TNNT1-211ENST00000588426 683 ntTSL 5 BASIC13.34□□□□□ -0.27
HOXA3O43365 TIMM13-202ENST00000591871 631 ntTSL 5 BASIC13.34□□□□□ -0.27
HOXA3O43365 NKG7-205ENST00000600427 520 ntTSL 3 BASIC13.34□□□□□ -0.27
HOXA3O43365 AC254562.3-201ENST00000626627 631 ntTSL 5 BASIC13.34□□□□□ -0.27
HOXA3O43365 ZBP1-202ENST00000395822 2073 ntTSL 2 BASIC13.34□□□□□ -0.27
HOXA3O43365 AL590627.1-201ENST00000626603 1910 ntTSL 2 BASIC13.34□□□□□ -0.27
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