Protein–RNA interactions for Protein: O14874

BCKDK, [3-methyl-2-oxobutanoate dehydrogenase [lipoamide]] kinase, mitochondrial, humanhuman

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Length 412 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BCKDKO14874 MTHFSD-220ENST00000634347 1207 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
BCKDKO14874 BX088651.4-201ENST00000435586 2579 ntTSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
BCKDKO14874 MFSD4B-201ENST00000368847 5958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
BCKDKO14874 RIMS1-213ENST00000517960 4428 ntTSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
BCKDKO14874 RIMS1-215ENST00000520567 4442 ntTSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
BCKDKO14874 SLC43A3-203ENST00000395124 2617 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
BCKDKO14874 INTS11-247ENST00000540437 2629 ntTSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
BCKDKO14874 BBS2-218ENST00000568104 2623 ntTSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
BCKDKO14874 PROK1-201ENST00000271331 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
BCKDKO14874 PMS2P7-201ENST00000506558 1336 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
BCKDKO14874 ISCU-205ENST00000535729 1330 ntTSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
BCKDKO14874 AC068418.2-201ENST00000577309 3703 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
BCKDKO14874 ZNF84-208ENST00000539354 3237 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
BCKDKO14874 TEAD4-201ENST00000358409 1637 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
BCKDKO14874 CCDC187-205ENST00000638797 10126 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
BCKDKO14874 IL12RB1-201ENST00000322153 1902 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
BCKDKO14874 CTNNBIP1-203ENST00000377263 3000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
BCKDKO14874 CHRNG-201ENST00000389492 1398 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
BCKDKO14874 SCARB1-202ENST00000339570 3329 ntTSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
BCKDKO14874 TLE2-203ENST00000443826 2238 ntTSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
BCKDKO14874 SLC17A7-204ENST00000600601 2237 ntTSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
BCKDKO14874 PTPN11-201ENST00000351677 6101 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
BCKDKO14874 SWSAP1-201ENST00000312423 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
BCKDKO14874 RREB1-204ENST00000379938 8778 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
BCKDKO14874 CHAT-203ENST00000351556 2286 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
BCKDKO14874 AC024909.3-201ENST00000611513 2257 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
BCKDKO14874 NABP2-201ENST00000267023 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
BCKDKO14874 SIGLEC16-201ENST00000599858 1437 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
BCKDKO14874 SRPX-202ENST00000432886 1725 ntTSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
BCKDKO14874 ANKRD24-206ENST00000600132 4026 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
BCKDKO14874 MAP2K5-201ENST00000178640 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
BCKDKO14874 TPD52L2-204ENST00000351424 2302 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
BCKDKO14874 PLAGL1-211ENST00000625622 3216 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
BCKDKO14874 CHEK2-202ENST00000348295 1771 ntTSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
BCKDKO14874 HNRNPLL-212ENST00000608859 3035 ntTSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
BCKDKO14874 SREK1-216ENST00000612404 2128 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
BCKDKO14874 ASB10-201ENST00000275838 1820 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
BCKDKO14874 HOXC5-201ENST00000312492 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
BCKDKO14874 ZP3-204ENST00000416245 1846 ntTSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
BCKDKO14874 MCF2L2-201ENST00000328913 4980 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
BCKDKO14874 HLA-A-202ENST00000376806 1854 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
BCKDKO14874 ASH1L-207ENST00000548830 1862 ntTSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
BCKDKO14874 HSD3B7-201ENST00000262520 2200 ntTSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
BCKDKO14874 CSF3-203ENST00000394148 622 ntTSL 3 BASIC15.85■□□□□ 0.13
BCKDKO14874 KRT18P13-201ENST00000400056 1290 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
BCKDKO14874 COLEC11-207ENST00000404205 1062 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
BCKDKO14874 RPP21-221ENST00000428040 594 ntTSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
BCKDKO14874 AC098831.1-202ENST00000438821 336 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
BCKDKO14874 RPP21-224ENST00000442966 525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
BCKDKO14874 PRYP5-201ENST00000451909 266 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
BCKDKO14874 LTBR-201ENST00000228918 2260 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
BCKDKO14874 SEPT8-204ENST00000378699 2289 ntTSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
BCKDKO14874 TTC24-202ENST00000368237 1969 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
BCKDKO14874 PRMT1-202ENST00000454376 1327 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
BCKDKO14874 MGEA5-203ENST00000370094 3314 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
BCKDKO14874 DMRTC2-204ENST00000596827 1675 ntTSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
BCKDKO14874 IQCF5-AS1-201ENST00000440723 2000 ntTSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
BCKDKO14874 ZNF764-201ENST00000252797 2738 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
BCKDKO14874 GDA-201ENST00000238018 2074 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
BCKDKO14874 F7-201ENST00000346342 2409 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
BCKDKO14874 MEG3-206ENST00000423456 1771 ntTSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
BCKDKO14874 SRCIN1-215ENST00000621492 4644 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
BCKDKO14874 RUSC1-201ENST00000292254 2163 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
BCKDKO14874 SIK3-201ENST00000375300 6213 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
BCKDKO14874 TMEM97-201ENST00000226230 2568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
BCKDKO14874 OTUD5-204ENST00000428668 1493 ntTSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
BCKDKO14874 STX3-203ENST00000529177 1571 ntTSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
BCKDKO14874 FAM131B-206ENST00000443739 4382 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
BCKDKO14874 CEP72-201ENST00000264935 2434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
BCKDKO14874 ADM-208ENST00000534464 1640 ntTSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
BCKDKO14874 ARFRP1-212ENST00000618838 1623 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
BCKDKO14874 ITGA7-202ENST00000347027 4084 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
BCKDKO14874 AL365203.3-201ENST00000609742 2057 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
BCKDKO14874 SAP130-203ENST00000357702 4173 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
BCKDKO14874 NODAL-201ENST00000287139 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
BCKDKO14874 SIGLEC8-202ENST00000340550 1293 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
BCKDKO14874 UBE2J2-204ENST00000400929 1057 ntTSL 3 BASIC15.84■□□□□ 0.13
BCKDKO14874 VPS13A-AS1-201ENST00000415172 519 ntTSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
BCKDKO14874 NKTR-203ENST00000442970 646 ntTSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
BCKDKO14874 BX005266.1-201ENST00000473402 457 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
BCKDKO14874 AC116021.1-201ENST00000530049 653 ntTSL 3 BASIC15.84■□□□□ 0.13
BCKDKO14874 MIR22HG-204ENST00000571595 767 ntTSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
BCKDKO14874 AC006557.2-201ENST00000592985 1240 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
BCKDKO14874 NUTM2B-AS1-211ENST00000601369 1233 ntTSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
BCKDKO14874 AC027601.4-201ENST00000611259 610 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
BCKDKO14874 MIR1199-201ENST00000621445 119 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
BCKDKO14874 AC073592.5-201ENST00000624854 528 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
BCKDKO14874 UIMC1-201ENST00000377227 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
BCKDKO14874 RBFOX1-212ENST00000550418 4775 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
BCKDKO14874 FIP1L1-207ENST00000507922 1335 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
BCKDKO14874 TMTC2-203ENST00000548305 2682 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
BCKDKO14874 NDRG4-202ENST00000356752 1375 ntTSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
BCKDKO14874 C19orf54-201ENST00000378313 2753 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
BCKDKO14874 VASP-201ENST00000245932 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
BCKDKO14874 SLCO4A1-AS1-202ENST00000433126 1420 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
BCKDKO14874 AC010478.1-202ENST00000559112 2367 ntTSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
BCKDKO14874 CLEC10A-204ENST00000571664 1442 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
BCKDKO14874 AC104109.2-201ENST00000602919 1418 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
BCKDKO14874 PCSK5-205ENST00000545128 9538 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
BCKDKO14874 NR4A3-204ENST00000618101 5706 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
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