Protein–RNA interactions for Protein: O00716

E2F3, Transcription factor E2F3, humanhuman

Predictions only

Length 465 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
E2F3O00716 TSKU-205ENST00000612930 2666 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC16.24■□□□□ 0.19
E2F3O00716 ELAVL2-208ENST00000544538 3789 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
E2F3O00716 LCORL-203ENST00000382226 5009 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
E2F3O00716 MPP1-205ENST00000413259 2195 ntTSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
E2F3O00716 DAP-201ENST00000230895 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
E2F3O00716 AP000487.1-202ENST00000500185 2602 ntTSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
E2F3O00716 ARFGAP1-201ENST00000353546 2776 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
E2F3O00716 SIN3B-206ENST00000595541 2767 ntTSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
E2F3O00716 SATB1-201ENST00000338745 7810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
E2F3O00716 GOLGA2P2Y-202ENST00000423852 1506 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
E2F3O00716 PRR15-201ENST00000319694 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
E2F3O00716 EWSR1-201ENST00000331029 2267 ntTSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
E2F3O00716 ZNF628-201ENST00000391718 3177 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
E2F3O00716 LZTS3-202ENST00000337576 4238 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
E2F3O00716 ZNF281-201ENST00000294740 4891 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
E2F3O00716 AL512625.3-203ENST00000445604 1602 ntTSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
E2F3O00716 CYP51A1P2-201ENST00000419457 1499 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
E2F3O00716 INTS11-247ENST00000540437 2629 ntTSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
E2F3O00716 SLC37A4-217ENST00000545985 2606 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
E2F3O00716 SYNGAP1-202ENST00000418600 5828 ntTSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
E2F3O00716 REPS1-201ENST00000258062 3161 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
E2F3O00716 TMPRSS2-206ENST00000458356 1701 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
E2F3O00716 ARHGAP6-202ENST00000337414 5117 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
E2F3O00716 HSPB1-201ENST00000248553 909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
E2F3O00716 MED15P5-201ENST00000423150 992 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
E2F3O00716 AP000355.1-201ENST00000432032 480 ntTSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
E2F3O00716 SNHG17-206ENST00000436764 973 ntTSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
E2F3O00716 AC098831.1-202ENST00000438821 336 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
E2F3O00716 EEF1D-238ENST00000531621 840 ntTSL 3 BASIC16.23■□□□□ 0.19
E2F3O00716 MRPL52-208ENST00000553711 586 ntTSL 3 BASIC16.23■□□□□ 0.19
E2F3O00716 AC105339.3-201ENST00000560043 636 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
E2F3O00716 AC034105.1-201ENST00000563488 319 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
E2F3O00716 MKNK2-212ENST00000591588 631 ntTSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
E2F3O00716 FAM197Y3-203ENST00000618346 717 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
E2F3O00716 MIR1199-201ENST00000621445 119 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
E2F3O00716 ADAM6-201ENST00000606026 1843 ntTSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
E2F3O00716 GCFC2-202ENST00000409857 2516 ntTSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
E2F3O00716 ADGRG2-202ENST00000354791 4494 ntTSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
E2F3O00716 FAM135A-205ENST00000418814 6415 ntTSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
E2F3O00716 SEPT4-201ENST00000317256 1530 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
E2F3O00716 RECQL4-210ENST00000621189 3896 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
E2F3O00716 MAPK8IP1-202ENST00000395629 3180 ntTSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
E2F3O00716 GPAA1P2-202ENST00000606848 1787 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
E2F3O00716 KLC1-206ENST00000389744 3250 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
E2F3O00716 AC100830.1-201ENST00000560387 1609 ntTSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
E2F3O00716 AP002414.3-201ENST00000589352 1468 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
E2F3O00716 F3-202ENST00000370207 1879 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
E2F3O00716 C7orf31-201ENST00000283905 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
E2F3O00716 PTP4A1-201ENST00000370651 5088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
E2F3O00716 CLPTM1L-209ENST00000507807 1740 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
E2F3O00716 ARHGEF25-202ENST00000333972 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
E2F3O00716 INPP5B-201ENST00000373021 3934 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
E2F3O00716 AC008741.2-201ENST00000612792 3115 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
E2F3O00716 STK17A-201ENST00000319357 3368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
E2F3O00716 ANAPC13-206ENST00000514612 1420 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
E2F3O00716 FRMD4A-203ENST00000357447 6821 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
E2F3O00716 FAM53A-201ENST00000308132 2802 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
E2F3O00716 AP000787.1-201ENST00000501356 1926 ntTSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
E2F3O00716 TM2D1-201ENST00000294613 1250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
E2F3O00716 TMEM44-201ENST00000330115 1278 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
E2F3O00716 TM2D1-204ENST00000371180 1248 ntTSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
E2F3O00716 LBH-204ENST00000406087 559 ntTSL 4 BASIC16.22■□□□□ 0.19
E2F3O00716 CHMP3-203ENST00000409225 1099 ntTSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
E2F3O00716 HCG4-201ENST00000418983 998 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
E2F3O00716 C1orf226-202ENST00000426197 1049 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
E2F3O00716 WDR53-204ENST00000433160 887 ntTSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
E2F3O00716 NDUFB2-208ENST00000471136 499 ntTSL 3 BASIC16.22■□□□□ 0.19
E2F3O00716 FAM172A-207ENST00000509739 1031 ntTSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
E2F3O00716 SPCS2-202ENST00000526361 772 ntTSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
E2F3O00716 RPS29-206ENST00000557111 488 ntTSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
E2F3O00716 HAGH-208ENST00000566709 1291 ntTSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
E2F3O00716 NUTM2B-AS1-211ENST00000601369 1233 ntTSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
E2F3O00716 TM2D1-212ENST00000606498 969 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
E2F3O00716 ACYP2-209ENST00000607452 831 ntTSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
E2F3O00716 AL691403.2-201ENST00000618460 490 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
E2F3O00716 C1QL3-202ENST00000619991 783 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
E2F3O00716 AGK-211ENST00000629555 2765 ntTSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
E2F3O00716 PPP1R21-206ENST00000449090 3049 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
E2F3O00716 SLC22A12-201ENST00000336464 1854 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
E2F3O00716 CMKLR1-204ENST00000550402 1893 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
E2F3O00716 RCAN3-210ENST00000618490 2386 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
E2F3O00716 FDX1-201ENST00000260270 3206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
E2F3O00716 ZDHHC20-202ENST00000382466 5338 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
E2F3O00716 MXD4-201ENST00000337190 4056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
E2F3O00716 SLFNL1-201ENST00000302946 1951 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
E2F3O00716 RALGDS-205ENST00000393160 3801 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
E2F3O00716 PCGF3-201ENST00000362003 5685 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
E2F3O00716 TRIM9-202ENST00000338969 3312 ntTSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
E2F3O00716 SH2B1-206ENST00000545570 1488 ntTSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
E2F3O00716 SDR16C5-201ENST00000303749 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
E2F3O00716 RGS12-203ENST00000344733 5469 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
E2F3O00716 FBXL12-206ENST00000588922 1843 ntTSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
E2F3O00716 GALNT14-201ENST00000324589 2169 ntTSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
E2F3O00716 ARHGAP22-201ENST00000249601 2751 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
E2F3O00716 CHAT-205ENST00000395562 2528 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
E2F3O00716 CBSL-201ENST00000398168 2514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
E2F3O00716 TRIM9-201ENST00000298355 5284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
E2F3O00716 MAP3K3-202ENST00000361733 3529 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
E2F3O00716 SMIM10-201ENST00000330288 1536 ntAPPRIS P1 BASIC16.21■□□□□ 0.19
E2F3O00716 COQ6-220ENST00000629426 1538 ntTSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.3 ms