Protein–RNA interactions for Protein: E9PCH4

Uncharacterized protein, humanhuman

Predictions only

Length 1,651 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
E9PCH4 LINC02356-202ENST00000552663 314 ntTSL 3 BASIC23.67■■□□□ 1.38
E9PCH4 LINC01115-203ENST00000606068 577 ntBASIC23.67■■□□□ 1.38
E9PCH4 FAM129C-202ENST00000335393 2508 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
E9PCH4 GPS1-226ENST00000623691 1839 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.66■■□□□ 1.38
E9PCH4 FAM193A-211ENST00000637812 4885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.66■■□□□ 1.38
E9PCH4 KLK10-202ENST00000358789 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
E9PCH4 C6orf47-202ENST00000375911 2475 ntAPPRIS P1 BASIC23.66■■□□□ 1.38
E9PCH4 LSR-212ENST00000602122 2480 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.66■■□□□ 1.38
E9PCH4 RBM47-212ENST00000514014 2419 ntTSL 2 BASIC23.66■■□□□ 1.38
E9PCH4 ACTL9-201ENST00000324436 1426 ntAPPRIS P1 BASIC23.66■■□□□ 1.38
E9PCH4 NPBWR2-201ENST00000369768 1352 ntAPPRIS P1 BASIC23.66■■□□□ 1.38
E9PCH4 ASNA1-204ENST00000591090 1368 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.66■■□□□ 1.38
E9PCH4 BEX4-202ENST00000372695 1328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
E9PCH4 H2BFWT-201ENST00000217926 894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
E9PCH4 AC123567.1-201ENST00000548294 1261 ntBASIC23.66■■□□□ 1.38
E9PCH4 APOC4-201ENST00000591600 348 ntTSL 3 BASIC23.66■■□□□ 1.38
E9PCH4 AC008735.3-201ENST00000596646 500 ntBASIC23.66■■□□□ 1.38
E9PCH4 AC254629.1-202ENST00000618276 2112 ntTSL 2 BASIC23.66■■□□□ 1.38
E9PCH4 CPSF4-201ENST00000292476 1691 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
E9PCH4 SDCBP-202ENST00000413219 2086 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.66■■□□□ 1.38
E9PCH4 AC080080.1-201ENST00000625121 2420 ntBASIC23.66■■□□□ 1.38
E9PCH4 VGLL4-202ENST00000413604 1554 ntTSL 2 BASIC23.66■■□□□ 1.38
E9PCH4 PFDN4-201ENST00000371419 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
E9PCH4 TAGLN3-202ENST00000393917 1488 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.65■■□□□ 1.38
E9PCH4 LINC00336-201ENST00000477984 2107 ntTSL 2 BASIC23.65■■□□□ 1.38
E9PCH4 EGR2-203ENST00000439032 2844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
E9PCH4 AC010478.1-202ENST00000559112 2367 ntTSL 2 BASIC23.65■■□□□ 1.38
E9PCH4 TMEFF2-201ENST00000272771 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
E9PCH4 MZT1-201ENST00000377818 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
E9PCH4 SAR1B-208ENST00000507419 2287 ntTSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
E9PCH4 EHBP1L1-201ENST00000309295 5185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
E9PCH4 RBCK1-215ENST00000640614 2599 ntTSL 5 BASIC23.65■■□□□ 1.38
E9PCH4 LCE5A-201ENST00000334269 819 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.65■■□□□ 1.38
E9PCH4 AC112492.5-201ENST00000421897 457 ntBASIC23.65■■□□□ 1.38
E9PCH4 AC073130.2-202ENST00000444244 842 ntTSL 3 BASIC23.65■■□□□ 1.38
E9PCH4 GLI4-203ENST00000517468 963 ntTSL 5 BASIC23.65■■□□□ 1.38
E9PCH4 AL359881.2-201ENST00000602973 570 ntBASIC23.65■■□□□ 1.38
E9PCH4 TRIM11-202ENST00000366699 2511 ntTSL 2 BASIC23.65■■□□□ 1.38
E9PCH4 MBD1-207ENST00000398488 1512 ntTSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
E9PCH4 SARDH-205ENST00000422262 2367 ntTSL 5 BASIC23.65■■□□□ 1.38
E9PCH4 PAX3-207ENST00000409551 1782 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
E9PCH4 NDUFV1-223ENST00000532303 1493 ntTSL 2 BASIC23.65■■□□□ 1.38
E9PCH4 PHF20L1-203ENST00000337920 2311 ntTSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
E9PCH4 AL034417.2-201ENST00000445300 2044 ntTSL 2 BASIC23.65■■□□□ 1.38
E9PCH4 SPATS1-201ENST00000288390 1354 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
E9PCH4 EIF2B3-210ENST00000620860 1923 ntTSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
E9PCH4 LRP3-201ENST00000253193 3807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
E9PCH4 PAAF1-207ENST00000536003 1639 ntTSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
E9PCH4 PRPS2-203ENST00000398491 1348 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
E9PCH4 PBX1-215ENST00000559240 2866 ntTSL 5 BASIC23.64■■□□□ 1.38
E9PCH4 LYPLA2-201ENST00000374501 1117 ntTSL 2 BASIC23.64■■□□□ 1.38
E9PCH4 GALT-202ENST00000450095 1280 ntTSL 2 BASIC23.64■■□□□ 1.38
E9PCH4 USP32P1-208ENST00000506594 1164 ntBASIC23.64■■□□□ 1.38
E9PCH4 AC009902.2-201ENST00000518880 620 ntTSL 4 BASIC23.64■■□□□ 1.38
E9PCH4 TMEM218-210ENST00000529609 734 ntTSL 3 BASIC23.64■■□□□ 1.38
E9PCH4 DRAP1-208ENST00000532933 751 ntTSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
E9PCH4 RRP7BP-205ENST00000566851 833 ntBASIC23.64■■□□□ 1.38
E9PCH4 AC129507.3-201ENST00000571512 913 ntTSL 2 BASIC23.64■■□□□ 1.38
E9PCH4 PDX1-201ENST00000381033 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
E9PCH4 MAP6-201ENST00000304771 3334 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
E9PCH4 MAPKAPK3-208ENST00000621469 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
E9PCH4 RNF38-204ENST00000357058 5254 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.64■■□□□ 1.37
E9PCH4 RABEPK-206ENST00000628863 1537 ntTSL 5 BASIC23.64■■□□□ 1.37
E9PCH4 APH1A-202ENST00000360244 2353 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
E9PCH4 MAGEA4-206ENST00000393921 1727 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.64■■□□□ 1.37
E9PCH4 HTR3E-201ENST00000335304 1912 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
E9PCH4 PDCD1-201ENST00000334409 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
E9PCH4 MXI1-205ENST00000393134 889 ntTSL 2 BASIC23.64■■□□□ 1.37
E9PCH4 KDM4A-AS1-204ENST00000439057 686 ntTSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
E9PCH4 DCUN1D5-209ENST00000531543 1030 ntTSL 5 BASIC23.64■■□□□ 1.37
E9PCH4 AC017083.2-201ENST00000608069 979 ntBASIC23.64■■□□□ 1.37
E9PCH4 WFDC1-204ENST00000613603 549 ntBASIC23.64■■□□□ 1.37
E9PCH4 RNF157-202ENST00000319945 2937 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.63■■□□□ 1.37
E9PCH4 ESR2-209ENST00000555278 1883 ntTSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
E9PCH4 U82695.1-201ENST00000635752 1889 ntBASIC23.63■■□□□ 1.37
E9PCH4 KCNE3-201ENST00000310128 3143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
E9PCH4 NR5A1-202ENST00000373588 3104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
E9PCH4 FBXL17-205ENST00000542267 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
E9PCH4 SLC26A5-202ENST00000339444 2474 ntTSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
E9PCH4 GLMP-213ENST00000612353 1365 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.63■■□□□ 1.37
E9PCH4 GLMP-215ENST00000622703 1364 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.63■■□□□ 1.37
E9PCH4 MAP3K15-201ENST00000338883 4012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.63■■□□□ 1.37
E9PCH4 C8orf33-201ENST00000331434 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
E9PCH4 ANKRD23-202ENST00000331001 2455 ntTSL 2 BASIC23.63■■□□□ 1.37
E9PCH4 HACD3-206ENST00000565299 1465 ntTSL 5 BASIC23.63■■□□□ 1.37
E9PCH4 EML3-212ENST00000494176 2901 ntTSL 2 BASIC23.63■■□□□ 1.37
E9PCH4 EML3-216ENST00000529309 2909 ntTSL 2 BASIC23.63■■□□□ 1.37
E9PCH4 ATP6V0B-201ENST00000236067 944 ntTSL 2 BASIC23.63■■□□□ 1.37
E9PCH4 TPM1-207ENST00000403994 1049 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
E9PCH4 AC087499.6-201ENST00000411576 835 ntBASIC23.63■■□□□ 1.37
E9PCH4 AL034550.1-201ENST00000442179 986 ntTSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
E9PCH4 AC140481.1-201ENST00000448777 706 ntTSL 3 BASIC23.63■■□□□ 1.37
E9PCH4 C9orf41-AS1-201ENST00000455609 719 ntTSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
E9PCH4 LCN10-203ENST00000474369 564 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
E9PCH4 ATP6V0B-211ENST00000498664 825 ntTSL 2 BASIC23.63■■□□□ 1.37
E9PCH4 AL158212.4-201ENST00000624062 1286 ntBASIC23.63■■□□□ 1.37
E9PCH4 SLC39A1-211ENST00000621013 2322 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.63■■□□□ 1.37
E9PCH4 NDUFS2-202ENST00000392179 2064 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
E9PCH4 FBXO15-201ENST00000419743 1708 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.62■■□□□ 1.37
E9PCH4 AC105020.1-201ENST00000435356 2205 ntBASIC23.62■■□□□ 1.37
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.7 ms