Protein–RNA interactions for Protein: B4E171

Tetraspanin, humanhuman

Predictions only

Length 279 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
B4E171 AC135586.1-201ENST00000539323 574 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
B4E171 AC012173.1-201ENST00000567942 430 ntTSL 3 BASIC15.53■□□□□ 0.08
B4E171 AC005544.2-201ENST00000579138 229 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
B4E171 AC061975.2-201ENST00000581722 295 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
B4E171 AL132655.2-201ENST00000596276 594 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
B4E171 Metazoa_SRP.112-201ENST00000613101 279 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
B4E171 AC004840.1-201ENST00000636359 365 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
B4E171 GPAA1P2-202ENST00000606848 1787 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
B4E171 ZSCAN18-201ENST00000240727 2779 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
B4E171 PRKCD-201ENST00000330452 2680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
B4E171 DVL2-209ENST00000575458 2659 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
B4E171 USP27X-AS1-201ENST00000437322 2175 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
B4E171 COQ6-201ENST00000334571 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
B4E171 CRKL-201ENST00000354336 5325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
B4E171 ZNF274-212ENST00000617501 2538 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
B4E171 AL139099.2-201ENST00000555043 2469 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
B4E171 GOLGA2P2Y-202ENST00000423852 1506 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
B4E171 GTF2IP1-210ENST00000622829 3605 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
B4E171 CD1E-212ENST00000368167 1458 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
B4E171 AC007541.1-201ENST00000570282 1469 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
B4E171 TUBGCP3-202ENST00000375669 2723 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
B4E171 HERPUD2-202ENST00000396081 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
B4E171 LRRC38-201ENST00000376085 2209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
B4E171 STRN4-204ENST00000539396 2608 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
B4E171 AP001273.2-201ENST00000638767 2993 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
B4E171 PCGF1-201ENST00000233630 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
B4E171 JAG1-201ENST00000254958 6048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
B4E171 CLDN5-202ENST00000406028 2548 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
B4E171 SLFNL1-205ENST00000439569 2117 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
B4E171 CPVL-202ENST00000396276 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
B4E171 TBX4-201ENST00000240335 2470 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
B4E171 AKR7L-202ENST00000429712 1313 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
B4E171 LETM2-201ENST00000297720 1693 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
B4E171 NFE2-201ENST00000312156 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
B4E171 CORO6-202ENST00000388767 2397 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
B4E171 EBI3-201ENST00000221847 1186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
B4E171 THOC7-201ENST00000295899 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
B4E171 WDR45-208ENST00000396681 1146 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
B4E171 SPDYE17-201ENST00000412399 783 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
B4E171 STMN1-204ENST00000426559 948 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
B4E171 DFFBP1-201ENST00000433250 979 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
B4E171 NDRG4-247ENST00000568640 1281 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
B4E171 AC140912.1-201ENST00000577171 1054 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
B4E171 AC015688.8-201ENST00000577746 656 ntTSL 4 BASIC15.52■□□□□ 0.08
B4E171 AC138474.1-201ENST00000586630 523 ntTSL 3 BASIC15.52■□□□□ 0.08
B4E171 SRP9-204ENST00000619790 377 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
B4E171 FGFR4-203ENST00000393648 2733 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
B4E171 ATP2A3-201ENST00000309890 4826 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.07
B4E171 MAP4K4-205ENST00000350878 7640 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
B4E171 SNED1-202ENST00000342631 1930 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
B4E171 AC068880.1-201ENST00000507289 2297 ntBASIC15.52■□□□□ 0.07
B4E171 RDH13-223ENST00000610356 1931 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
B4E171 TRAPPC2L-201ENST00000301021 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
B4E171 TRPM2-202ENST00000300482 5989 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
B4E171 SCP2-201ENST00000371509 1889 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
B4E171 BNIP2-212ENST00000607373 1851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
B4E171 TMEM131-201ENST00000186436 6640 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.07
B4E171 TEKT2-201ENST00000207457 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
B4E171 CCT6A-202ENST00000335503 2529 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.07
B4E171 DYRK1B-205ENST00000597639 1806 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.07
B4E171 OSBP2-202ENST00000401475 2468 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.07
B4E171 NDUFV1-223ENST00000532303 1493 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.07
B4E171 RNF121-203ENST00000393713 2132 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
B4E171 TRA2A-211ENST00000538367 2142 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.07
B4E171 CHGA-201ENST00000216492 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
B4E171 MFNG-201ENST00000356998 2088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
B4E171 PPP2R2B-203ENST00000394411 2071 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.07
B4E171 FZD10-202ENST00000539839 3282 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
B4E171 STK32C-204ENST00000368622 2010 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
B4E171 AL391825.1-201ENST00000457671 1364 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
B4E171 KRT8P12-202ENST00000472924 1397 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
B4E171 PACS1-209ENST00000529757 1688 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
B4E171 TTLL5-219ENST00000556977 1961 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
B4E171 DEF6-201ENST00000316637 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
B4E171 ITGB5-201ENST00000296181 4372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
B4E171 MAPT-215ENST00000574436 1326 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
B4E171 ASPRV1-201ENST00000320256 2177 ntAPPRIS P1 BASIC15.51■□□□□ 0.07
B4E171 PABPC1L-201ENST00000217073 1851 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
B4E171 SEPT11-201ENST00000264893 5593 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
B4E171 NBL1-201ENST00000289749 731 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
B4E171 C9orf24-204ENST00000379127 596 ntTSL 3 BASIC15.51■□□□□ 0.07
B4E171 RTN4RL2-202ENST00000395120 582 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
B4E171 AC087499.6-201ENST00000411576 835 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
B4E171 DIRC3-201ENST00000423123 552 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.51■□□□□ 0.07
B4E171 C3orf67-212ENST00000491845 832 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
B4E171 AP003068.1-201ENST00000528887 544 ntTSL 4 BASIC15.51■□□□□ 0.07
B4E171 TAGLN-206ENST00000530649 1227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
B4E171 API5-211ENST00000534695 560 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
B4E171 AC010336.2-201ENST00000564226 506 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
B4E171 ARMC7-205ENST00000584947 445 ntTSL 3 BASIC15.51■□□□□ 0.07
B4E171 FAM66A-202ENST00000602658 546 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
B4E171 IFI27-210ENST00000616764 716 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
B4E171 IFI27-213ENST00000620066 719 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
B4E171 ZNF133-212ENST00000622607 2660 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC15.51■□□□□ 0.07
B4E171 MYC-202ENST00000377970 2351 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
B4E171 ADORA1-202ENST00000337894 2919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
B4E171 B3GALT5-206ENST00000615480 2617 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
B4E171 PRDM5-203ENST00000428209 2338 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
B4E171 ILF3-203ENST00000449870 6119 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
B4E171 MRPS21-201ENST00000581066 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 100.8 ms