Protein–RNA interactions for Protein: B4DU55

ZNF879, Zinc finger protein 879, humanhuman

Predictions only

Length 563 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZNF879B4DU55 ANAPC11-204ENST00000571024 668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
ZNF879B4DU55 ANAPC11-218ENST00000582222 523 ntTSL 2 BASIC14.87□□□□□ -0.03
ZNF879B4DU55 AC008687.7-201ENST00000593309 920 ntTSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
ZNF879B4DU55 REXO2-220ENST00000611665 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
ZNF879B4DU55 AL513523.2-201ENST00000633218 660 ntTSL 3 BASIC14.87□□□□□ -0.03
ZNF879B4DU55 MYOC-201ENST00000037502 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
ZNF879B4DU55 PSME3-202ENST00000441946 2944 ntTSL 2 BASIC14.87□□□□□ -0.03
ZNF879B4DU55 PDE1B-201ENST00000243052 3444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
ZNF879B4DU55 USHBP1-203ENST00000431146 2136 ntTSL 2 BASIC14.87□□□□□ -0.03
ZNF879B4DU55 FADS2-202ENST00000278840 3630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
ZNF879B4DU55 MASTL-203ENST00000375946 3623 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
ZNF879B4DU55 DGAT2-202ENST00000376262 2324 ntTSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
ZNF879B4DU55 CDH15-201ENST00000289746 2847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
ZNF879B4DU55 PTPN9-206ENST00000618819 7813 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
ZNF879B4DU55 TGIF1-205ENST00000401449 1670 ntTSL 2 BASIC14.87□□□□□ -0.03
ZNF879B4DU55 IGFBP5-201ENST00000233813 6215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
ZNF879B4DU55 RGL3-201ENST00000380456 2542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
ZNF879B4DU55 CALU-205ENST00000535011 3210 ntTSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
ZNF879B4DU55 PYCR1-201ENST00000329875 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
ZNF879B4DU55 CELF4-202ENST00000361795 1853 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC14.86□□□□□ -0.03
ZNF879B4DU55 MAGI3-204ENST00000369617 3911 ntTSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
ZNF879B4DU55 FGF11-201ENST00000293829 3063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
ZNF879B4DU55 NR4A3-201ENST00000330847 4982 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC14.86□□□□□ -0.03
ZNF879B4DU55 YDJC-201ENST00000292778 1351 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.86□□□□□ -0.03
ZNF879B4DU55 AC233702.3-201ENST00000578656 1387 ntBASIC14.86□□□□□ -0.03
ZNF879B4DU55 TMEM57-202ENST00000399766 3294 ntTSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
ZNF879B4DU55 AL136309.2-201ENST00000427049 2277 ntTSL 2 BASIC14.86□□□□□ -0.03
ZNF879B4DU55 KIAA1468-202ENST00000398130 6178 ntTSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
ZNF879B4DU55 LGALS3BP-218ENST00000591778 1961 ntTSL 2 BASIC14.86□□□□□ -0.03
ZNF879B4DU55 SYAP1-201ENST00000380155 6129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
ZNF879B4DU55 AMZ2P1-202ENST00000430983 3425 ntTSL 2 BASIC14.86□□□□□ -0.03
ZNF879B4DU55 INS-201ENST00000250971 503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
ZNF879B4DU55 SPIN2B-202ENST00000333933 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
ZNF879B4DU55 CD9-202ENST00000382515 1229 ntTSL 5 BASIC14.86□□□□□ -0.03
ZNF879B4DU55 RPUSD3-201ENST00000383820 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
ZNF879B4DU55 SMIM11A-202ENST00000399295 1074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.86□□□□□ -0.03
ZNF879B4DU55 GGT1-204ENST00000401885 968 ntTSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
ZNF879B4DU55 AC246785.2-201ENST00000432512 513 ntBASIC14.86□□□□□ -0.03
ZNF879B4DU55 AC136604.3-201ENST00000508188 429 ntTSL 3 BASIC14.86□□□□□ -0.03
ZNF879B4DU55 PNN-202ENST00000553331 656 ntTSL 3 BASIC14.86□□□□□ -0.03
ZNF879B4DU55 SCAMP4-213ENST00000621748 1172 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.86□□□□□ -0.03
ZNF879B4DU55 NFIB-212ENST00000622520 1274 ntTSL 5 BASIC14.86□□□□□ -0.03
ZNF879B4DU55 AC012313.10-201ENST00000623509 926 ntBASIC14.86□□□□□ -0.03
ZNF879B4DU55 SMIM11B-207ENST00000624758 1074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.86□□□□□ -0.03
ZNF879B4DU55 PCBP4-202ENST00000355852 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
ZNF879B4DU55 RUNDC3B-202ENST00000338056 4099 ntTSL 2 BASIC14.86□□□□□ -0.03
ZNF879B4DU55 CANX-201ENST00000247461 4260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
ZNF879B4DU55 WDTC1-202ENST00000361771 4275 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
ZNF879B4DU55 CDC25B-204ENST00000379598 2990 ntTSL 2 BASIC14.86□□□□□ -0.03
ZNF879B4DU55 CEACAM21-203ENST00000407170 1691 ntTSL 2 BASIC14.86□□□□□ -0.03
ZNF879B4DU55 KMT2E-201ENST00000257745 6714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
ZNF879B4DU55 ASAH1-201ENST00000262097 2618 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
ZNF879B4DU55 MAPK8IP2-202ENST00000329492 3381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
ZNF879B4DU55 BTN3A1-204ENST00000425234 1882 ntTSL 2 BASIC14.86□□□□□ -0.03
ZNF879B4DU55 ELMO1-209ENST00000448602 2621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
ZNF879B4DU55 AC004233.2-201ENST00000573315 2062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.86□□□□□ -0.03
ZNF879B4DU55 AIFM1-201ENST00000287295 2260 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
ZNF879B4DU55 RASL11A-201ENST00000241463 1543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
ZNF879B4DU55 PPAN-P2RY11-202ENST00000428358 2661 ntTSL 2 BASIC14.86□□□□□ -0.03
ZNF879B4DU55 APH1A-204ENST00000414276 1718 ntTSL 2 BASIC14.86□□□□□ -0.03
ZNF879B4DU55 WDR74-205ENST00000525752 1724 ntTSL 5 BASIC14.86□□□□□ -0.03
ZNF879B4DU55 C14orf93-205ENST00000397379 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
ZNF879B4DU55 MPP6-201ENST00000222644 8452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
ZNF879B4DU55 AL445931.1-201ENST00000412181 2112 ntTSL 2 BASIC14.86□□□□□ -0.03
ZNF879B4DU55 AC026412.1-203ENST00000507841 2338 ntTSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
ZNF879B4DU55 PTK6-202ENST00000542869 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
ZNF879B4DU55 TMEM145-201ENST00000301204 1768 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC14.85□□□□□ -0.03
ZNF879B4DU55 PLIN1-201ENST00000300055 2953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
ZNF879B4DU55 RFWD2-204ENST00000367669 3033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
ZNF879B4DU55 VWA2-203ENST00000603594 2600 ntTSL 2 BASIC14.85□□□□□ -0.03
ZNF879B4DU55 CHN1-205ENST00000409900 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
ZNF879B4DU55 ASB10-201ENST00000275838 1820 ntTSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
ZNF879B4DU55 CLCF1-201ENST00000312438 1844 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
ZNF879B4DU55 CD1E-213ENST00000444681 1820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
ZNF879B4DU55 GPS1-228ENST00000624957 1825 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.85□□□□□ -0.03
ZNF879B4DU55 MED25-202ENST00000538643 1623 ntTSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
ZNF879B4DU55 LINC00895-201ENST00000629028 1637 ntBASIC14.85□□□□□ -0.03
ZNF879B4DU55 C6orf136-203ENST00000376473 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
ZNF879B4DU55 CRB3-203ENST00000598494 1443 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.85□□□□□ -0.03
ZNF879B4DU55 FBLN1-202ENST00000327858 2896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
ZNF879B4DU55 SAP130-201ENST00000259234 4140 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.85□□□□□ -0.03
ZNF879B4DU55 AC024909.3-201ENST00000611513 2257 ntBASIC14.85□□□□□ -0.03
ZNF879B4DU55 LILRB5-202ENST00000345866 1864 ntTSL 2 BASIC14.85□□□□□ -0.03
ZNF879B4DU55 ARHGEF28-211ENST00000512883 2936 ntTSL 2 BASIC14.85□□□□□ -0.03
ZNF879B4DU55 LRRC61-201ENST00000323078 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
ZNF879B4DU55 SLC6A8-201ENST00000253122 3763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
ZNF879B4DU55 PDLIM2-206ENST00000409141 1463 ntTSL 2 BASIC14.85□□□□□ -0.03
ZNF879B4DU55 SNRPA1-201ENST00000254193 1055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
ZNF879B4DU55 NT5E-202ENST00000369646 974 ntTSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
ZNF879B4DU55 C1QC-201ENST00000374637 1089 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.85□□□□□ -0.03
ZNF879B4DU55 KRTAP5-6-201ENST00000382160 561 ntAPPRIS P1 BASIC14.85□□□□□ -0.03
ZNF879B4DU55 CLDN7-202ENST00000397317 1228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
ZNF879B4DU55 ITM2C-204ENST00000409704 1106 ntTSL 5 BASIC14.85□□□□□ -0.03
ZNF879B4DU55 LINC00421-201ENST00000413833 1054 ntTSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
ZNF879B4DU55 AL845331.1-201ENST00000424978 1190 ntBASIC14.85□□□□□ -0.03
ZNF879B4DU55 NKTR-203ENST00000442970 646 ntTSL 2 BASIC14.85□□□□□ -0.03
ZNF879B4DU55 PHGR1-201ENST00000448599 436 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.85□□□□□ -0.03
ZNF879B4DU55 PP7080-204ENST00000510714 601 ntTSL 3 BASIC14.85□□□□□ -0.03
ZNF879B4DU55 ENDOV-205ENST00000518644 625 ntTSL 4 BASIC14.85□□□□□ -0.03
ZNF879B4DU55 SDHD-206ENST00000528182 754 ntTSL 3 BASIC14.85□□□□□ -0.03
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 80.3 ms