Protein–RNA interactions for Protein: B2RD01

CENPBD1, CENPB DNA-binding domain-containing protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 187 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CENPBD1B2RD01 SMIM11B-207ENST00000624758 1074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
CENPBD1B2RD01 ATP5F1-202ENST00000369722 3156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
CENPBD1B2RD01 VPS16-203ENST00000380469 2318 ntTSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
CENPBD1B2RD01 CD81-AS1-201ENST00000413483 1460 ntTSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
CENPBD1B2RD01 STUM-201ENST00000366788 7705 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
CENPBD1B2RD01 GAPDH-201ENST00000229239 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
CENPBD1B2RD01 KIAA1211-201ENST00000264229 4109 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
CENPBD1B2RD01 MGEA5-201ENST00000357797 3263 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
CENPBD1B2RD01 POM121C-206ENST00000607367 3690 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
CENPBD1B2RD01 TBRG4-203ENST00000395655 2225 ntTSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
CENPBD1B2RD01 ERG28-201ENST00000256319 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
CENPBD1B2RD01 NLRX1-202ENST00000409109 4092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
CENPBD1B2RD01 ELFN1-201ENST00000424383 3845 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
CENPBD1B2RD01 SKP2-201ENST00000274254 1537 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
CENPBD1B2RD01 DEGS2-201ENST00000305631 4352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
CENPBD1B2RD01 AL136309.2-201ENST00000427049 2277 ntTSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
CENPBD1B2RD01 POM121-203ENST00000434423 3750 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
CENPBD1B2RD01 CSNK1A1L-201ENST00000379800 2406 ntAPPRIS P1 BASIC15.23■□□□□ 0.03
CENPBD1B2RD01 TMEM37-201ENST00000306406 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
CENPBD1B2RD01 CHEK1-202ENST00000427383 1670 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
CENPBD1B2RD01 ADGRA1-202ENST00000392607 4283 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
CENPBD1B2RD01 UBE3A-227ENST00000638011 8742 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
CENPBD1B2RD01 AC063926.3-201ENST00000624734 5658 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
CENPBD1B2RD01 BAG1-202ENST00000379704 1128 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
CENPBD1B2RD01 AC093459.1-201ENST00000444567 481 ntTSL 3 BASIC15.23■□□□□ 0.03
CENPBD1B2RD01 NCBP2-AS1-201ENST00000447775 562 ntTSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
CENPBD1B2RD01 RAB42-202ENST00000465518 857 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
CENPBD1B2RD01 MCCC2-205ENST00000509358 1214 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
CENPBD1B2RD01 MSRA-206ENST00000521209 814 ntTSL 3 BASIC15.23■□□□□ 0.03
CENPBD1B2RD01 MRPL21-208ENST00000567045 932 ntTSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
CENPBD1B2RD01 METRN-205ENST00000568415 612 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.23■□□□□ 0.03
CENPBD1B2RD01 NOL12-207ENST00000611699 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
CENPBD1B2RD01 AL009178.2-201ENST00000597278 2719 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
CENPBD1B2RD01 DNASE2-201ENST00000222219 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
CENPBD1B2RD01 ERVK13-1-203ENST00000564340 1449 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
CENPBD1B2RD01 STAP2-201ENST00000594605 1426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
CENPBD1B2RD01 R3HDM2P2-201ENST00000401880 2116 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
CENPBD1B2RD01 HOXA10-202ENST00000396344 1570 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
CENPBD1B2RD01 DMTN-202ENST00000358242 2772 ntTSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
CENPBD1B2RD01 PIGT-257ENST00000640210 1715 ntTSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
CENPBD1B2RD01 ARID4B-202ENST00000349213 5811 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
CENPBD1B2RD01 OSGEP-201ENST00000206542 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
CENPBD1B2RD01 AC092068.3-201ENST00000587894 2016 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
CENPBD1B2RD01 PLCB1-201ENST00000338037 7092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
CENPBD1B2RD01 TTBK2-208ENST00000622375 6891 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
CENPBD1B2RD01 COTL1-203ENST00000564057 1677 ntTSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
CENPBD1B2RD01 ZNRF3-201ENST00000402174 2667 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
CENPBD1B2RD01 DTNB-228ENST00000496972 2328 ntTSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
CENPBD1B2RD01 PDCL3-201ENST00000264254 1337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
CENPBD1B2RD01 TRPV4-207ENST00000541794 2475 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
CENPBD1B2RD01 NFIA-205ENST00000371189 1989 ntTSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
CENPBD1B2RD01 CR392000.2-201ENST00000640235 1994 ntTSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
CENPBD1B2RD01 SLC6A11-201ENST00000254488 4296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
CENPBD1B2RD01 VIPR2-202ENST00000377633 1491 ntTSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
CENPBD1B2RD01 TTC13-201ENST00000366661 3253 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
CENPBD1B2RD01 KIFC3-205ENST00000540079 2781 ntTSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
CENPBD1B2RD01 BRD3-201ENST00000303407 5652 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
CENPBD1B2RD01 SNCAIP-202ENST00000261368 3745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
CENPBD1B2RD01 EIF4G1-204ENST00000352767 5484 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
CENPBD1B2RD01 UGT3A2-204ENST00000513300 1924 ntTSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
CENPBD1B2RD01 PELP1-208ENST00000572293 5272 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
CENPBD1B2RD01 TMEM14A-201ENST00000211314 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
CENPBD1B2RD01 VKORC1-201ENST00000300851 876 ntTSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
CENPBD1B2RD01 DBI-201ENST00000311521 714 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
CENPBD1B2RD01 COLEC11-202ENST00000349077 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
CENPBD1B2RD01 AP002414.1-201ENST00000391405 1147 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
CENPBD1B2RD01 COLEC11-207ENST00000404205 1062 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
CENPBD1B2RD01 TSTD3-201ENST00000452647 962 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
CENPBD1B2RD01 REXO2-206ENST00000539275 710 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
CENPBD1B2RD01 H2AFJ-203ENST00000544848 644 ntAPPRIS P1 BASIC15.22■□□□□ 0.03
CENPBD1B2RD01 AC139887.3-201ENST00000568585 713 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
CENPBD1B2RD01 TNFRSF13B-206ENST00000583789 859 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
CENPBD1B2RD01 CLEC4GP1-201ENST00000596555 870 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
CENPBD1B2RD01 IL6ST-209ENST00000502326 3007 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
CENPBD1B2RD01 MBL1P-201ENST00000480805 1424 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
CENPBD1B2RD01 SGK1-205ENST00000413996 2686 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
CENPBD1B2RD01 PCMTD1-206ENST00000521344 1712 ntTSL 3 BASIC15.22■□□□□ 0.03
CENPBD1B2RD01 RNF168-201ENST00000318037 5347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
CENPBD1B2RD01 ADAMTSL1-202ENST00000327883 1864 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
CENPBD1B2RD01 PTPN5-201ENST00000358540 3135 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
CENPBD1B2RD01 PPP1R26-206ENST00000605660 4502 ntAPPRIS P1 BASIC15.22■□□□□ 0.03
CENPBD1B2RD01 RHOT1-203ENST00000358365 3297 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
CENPBD1B2RD01 HOXD3-201ENST00000249440 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
CENPBD1B2RD01 TPD52L2-205ENST00000352482 2339 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
CENPBD1B2RD01 DNMT3A-205ENST00000402667 2300 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
CENPBD1B2RD01 TPD52L2-210ENST00000615907 2310 ntTSL 4 BASIC15.22■□□□□ 0.03
CENPBD1B2RD01 ABLIM2-202ENST00000361581 2472 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
CENPBD1B2RD01 HTD2-201ENST00000461393 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
CENPBD1B2RD01 TP53INP1-201ENST00000342697 5638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
CENPBD1B2RD01 TGIF1-201ENST00000330513 1980 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
CENPBD1B2RD01 MTA2-204ENST00000527204 2265 ntTSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
CENPBD1B2RD01 AIFM2-202ENST00000373248 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
CENPBD1B2RD01 SCARB1-202ENST00000339570 3329 ntTSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
CENPBD1B2RD01 MMP2-201ENST00000219070 3741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
CENPBD1B2RD01 TXNDC11-201ENST00000283033 3140 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
CENPBD1B2RD01 PTPRN2-201ENST00000389413 4723 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
CENPBD1B2RD01 SPEG-201ENST00000312358 10782 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
CENPBD1B2RD01 CSNK2A1-203ENST00000400217 1451 ntTSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
CENPBD1B2RD01 LZTS1-202ENST00000381569 5706 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
CENPBD1B2RD01 SCAMP2-201ENST00000268099 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.2 ms