Protein–RNA interactions for Protein: A6NCF5

KLHL33, Kelch-like protein 33, humanhuman

Predictions only

Length 533 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KLHL33A6NCF5 HMGN1-203ENST00000380748 829 ntTSL 3 BASIC16.69■□□□□ 0.26
KLHL33A6NCF5 MIR574-201ENST00000385209 96 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
KLHL33A6NCF5 IGHV3-15-201ENST00000390603 437 ntAPPRIS P1 BASIC16.69■□□□□ 0.26
KLHL33A6NCF5 THAP7-202ENST00000399133 1144 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
KLHL33A6NCF5 MED15P5-201ENST00000423150 992 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
KLHL33A6NCF5 AFG3L1P-210ENST00000431757 569 ntTSL 4 BASIC16.69■□□□□ 0.26
KLHL33A6NCF5 ARPC4-203ENST00000433034 926 ntTSL 3 BASIC16.69■□□□□ 0.26
KLHL33A6NCF5 DYNC1LI2-202ENST00000440564 1145 ntTSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
KLHL33A6NCF5 HS6ST1P1-201ENST00000481504 1234 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
KLHL33A6NCF5 CDKN2A-209ENST00000498628 926 ntTSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
KLHL33A6NCF5 UCHL1-204ENST00000503431 917 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.69■□□□□ 0.26
KLHL33A6NCF5 EEF1E1-205ENST00000507463 654 ntTSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
KLHL33A6NCF5 AP002490.2-201ENST00000524791 560 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
KLHL33A6NCF5 AC135050.2-203ENST00000529564 725 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC16.69■□□□□ 0.26
KLHL33A6NCF5 AP000442.1-201ENST00000533552 769 ntTSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
KLHL33A6NCF5 LDLRAD2-203ENST00000543870 1180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
KLHL33A6NCF5 AC096734.2-201ENST00000562054 433 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
KLHL33A6NCF5 AC091167.2-201ENST00000579581 588 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
KLHL33A6NCF5 OAZ1-202ENST00000582888 969 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
KLHL33A6NCF5 CR381653.1-203ENST00000625153 577 ntTSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
KLHL33A6NCF5 MAPKAP1-206ENST00000373511 3252 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
KLHL33A6NCF5 AL009178.2-201ENST00000597278 2719 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
KLHL33A6NCF5 LMNA-202ENST00000361308 1713 ntTSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
KLHL33A6NCF5 HAS3-205ENST00000569188 2170 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
KLHL33A6NCF5 SLC2A6-202ENST00000371899 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
KLHL33A6NCF5 OTX1-201ENST00000282549 2861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
KLHL33A6NCF5 OTX1-202ENST00000366671 2861 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.69■□□□□ 0.26
KLHL33A6NCF5 LRRC71-201ENST00000337428 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
KLHL33A6NCF5 GABRB2-202ENST00000353437 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
KLHL33A6NCF5 DHX33-201ENST00000225296 5618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
KLHL33A6NCF5 ZNF48-206ENST00000622647 2695 ntTSL 4 BASIC16.69■□□□□ 0.26
KLHL33A6NCF5 CCDC94-201ENST00000262962 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
KLHL33A6NCF5 TBRG4-203ENST00000395655 2225 ntTSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
KLHL33A6NCF5 EHHADH-203ENST00000456310 2577 ntTSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
KLHL33A6NCF5 OVOL1-203ENST00000532448 1774 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
KLHL33A6NCF5 CLDN15-202ENST00000401528 2131 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
KLHL33A6NCF5 SCAMP2-201ENST00000268099 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
KLHL33A6NCF5 PODXL-201ENST00000322985 2011 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
KLHL33A6NCF5 WDR20-211ENST00000556807 2382 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
KLHL33A6NCF5 UBE3D-203ENST00000369747 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
KLHL33A6NCF5 AC012313.3-202ENST00000599109 3322 ntTSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
KLHL33A6NCF5 RUBCNL-204ENST00000378797 3206 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
KLHL33A6NCF5 SREBF1-201ENST00000261646 4178 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
KLHL33A6NCF5 PUF60-201ENST00000313352 1804 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
KLHL33A6NCF5 FOS-208ENST00000555686 1496 ntTSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
KLHL33A6NCF5 TDRKH-202ENST00000368823 2751 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
KLHL33A6NCF5 KCNJ2-AS1-201ENST00000590966 2442 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
KLHL33A6NCF5 AFMID-201ENST00000327898 1700 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
KLHL33A6NCF5 PCDHGC3-205ENST00000617641 2346 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
KLHL33A6NCF5 HDHD2-201ENST00000300605 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
KLHL33A6NCF5 DPEP1-203ENST00000421184 1647 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
KLHL33A6NCF5 AGBL3-202ENST00000435976 2495 ntTSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
KLHL33A6NCF5 KRTCAP2-201ENST00000295682 552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
KLHL33A6NCF5 BX276092.7-202ENST00000422194 696 ntTSL 3 BASIC16.68■□□□□ 0.26
KLHL33A6NCF5 AL121672.1-201ENST00000439423 1181 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
KLHL33A6NCF5 FAM185BP-201ENST00000443595 716 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
KLHL33A6NCF5 HYAL1-206ENST00000447605 666 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
KLHL33A6NCF5 AC012363.1-201ENST00000455707 575 ntTSL 4 BASIC16.68■□□□□ 0.26
KLHL33A6NCF5 AL807752.7-201ENST00000471521 989 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
KLHL33A6NCF5 SLC25A6P2-201ENST00000497974 877 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
KLHL33A6NCF5 CXCL1P1-201ENST00000502804 216 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
KLHL33A6NCF5 AC139887.2-202ENST00000507446 534 ntTSL 4 BASIC16.68■□□□□ 0.26
KLHL33A6NCF5 MOK-203ENST00000517966 1230 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
KLHL33A6NCF5 JPH4-203ENST00000544177 1124 ntTSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
KLHL33A6NCF5 AC104758.1-202ENST00000568184 602 ntTSL 3 BASIC16.68■□□□□ 0.26
KLHL33A6NCF5 NUBP2-214ENST00000568706 913 ntTSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
KLHL33A6NCF5 NUTF2-206ENST00000569436 1119 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
KLHL33A6NCF5 AC092115.3-201ENST00000575838 592 ntTSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
KLHL33A6NCF5 CDC42EP4-206ENST00000581014 737 ntTSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
KLHL33A6NCF5 AC064836.3-201ENST00000607928 673 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
KLHL33A6NCF5 ZNF805-201ENST00000354309 2396 ntTSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
KLHL33A6NCF5 GHR-201ENST00000230882 4560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
KLHL33A6NCF5 HLA-F-218ENST00000376861 1544 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
KLHL33A6NCF5 ITGB7-201ENST00000267082 2867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
KLHL33A6NCF5 CISH-201ENST00000348721 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
KLHL33A6NCF5 TBCE-202ENST00000406207 2012 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
KLHL33A6NCF5 HYAL1-201ENST00000266031 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
KLHL33A6NCF5 RNF7-201ENST00000273480 2763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
KLHL33A6NCF5 RHOT1-203ENST00000358365 3297 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
KLHL33A6NCF5 SHOX-204ENST00000554971 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
KLHL33A6NCF5 SLC39A7-202ENST00000374677 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
KLHL33A6NCF5 GRM7-203ENST00000389336 2901 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
KLHL33A6NCF5 GNAO1-201ENST00000262493 3337 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
KLHL33A6NCF5 WRAP53-203ENST00000431639 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
KLHL33A6NCF5 WRAP53-204ENST00000457584 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
KLHL33A6NCF5 RBPMS-203ENST00000339877 1341 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
KLHL33A6NCF5 UBFD1-201ENST00000395878 5110 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
KLHL33A6NCF5 SEMA3B-212ENST00000616701 2958 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
KLHL33A6NCF5 OSBP2-202ENST00000401475 2468 ntTSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
KLHL33A6NCF5 MYO1B-202ENST00000339514 5026 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
KLHL33A6NCF5 AC062028.1-203ENST00000447433 1472 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
KLHL33A6NCF5 PODXL-202ENST00000378555 2105 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
KLHL33A6NCF5 PBX3-207ENST00000447726 2789 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
KLHL33A6NCF5 VARS-215ENST00000375663 4312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
KLHL33A6NCF5 PDE9A-205ENST00000349112 1616 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
KLHL33A6NCF5 F12-201ENST00000253496 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
KLHL33A6NCF5 CMTM3-203ENST00000460097 1797 ntTSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
KLHL33A6NCF5 NLE1-202ENST00000442241 2588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
KLHL33A6NCF5 RASA2-202ENST00000452898 2562 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
KLHL33A6NCF5 RASL11A-201ENST00000241463 1543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 62 ms