Protein–RNA interactions for Protein: A2RUR9

CCDC144A, Coiled-coil domain-containing protein 144A, humanhuman

Predictions only

Length 1,427 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC144AA2RUR9 PRR29-204ENST00000577953 565 ntTSL 4 BASIC23.64■■□□□ 1.37
CCDC144AA2RUR9 CRMP1-202ENST00000397890 2911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
CCDC144AA2RUR9 FBLIM1-206ENST00000441801 1543 ntTSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
CCDC144AA2RUR9 LRRC14-205ENST00000529022 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
CCDC144AA2RUR9 PSEN2-211ENST00000626989 1972 ntTSL 5 BASIC23.64■■□□□ 1.37
CCDC144AA2RUR9 SRGAP2C-201ENST00000304465 1477 ntTSL 5 BASIC23.64■■□□□ 1.37
CCDC144AA2RUR9 SRGAP2-201ENST00000419187 1477 ntTSL 5 BASIC23.64■■□□□ 1.37
CCDC144AA2RUR9 SRGAP2B-205ENST00000619678 1477 ntTSL 5 BASIC23.64■■□□□ 1.37
CCDC144AA2RUR9 RABEP2-202ENST00000358201 2821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
CCDC144AA2RUR9 SH3YL1-206ENST00000405430 2064 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.64■■□□□ 1.37
CCDC144AA2RUR9 SHISA5-219ENST00000612611 1677 ntTSL 5 BASIC23.63■■□□□ 1.37
CCDC144AA2RUR9 TNXB-204ENST00000479795 2742 ntTSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
CCDC144AA2RUR9 LTBP3-202ENST00000322147 4046 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
CCDC144AA2RUR9 MSMO1-202ENST00000393766 1789 ntTSL 2 BASIC23.63■■□□□ 1.37
CCDC144AA2RUR9 MTFR2-203ENST00000420702 1793 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.63■■□□□ 1.37
CCDC144AA2RUR9 DNAJB8-AS1-201ENST00000471626 1798 ntTSL 2 BASIC23.63■■□□□ 1.37
CCDC144AA2RUR9 CDH23-212ENST00000616684 4814 ntTSL 5 BASIC23.63■■□□□ 1.37
CCDC144AA2RUR9 KIF16B-206ENST00000636835 5109 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
CCDC144AA2RUR9 LST1-202ENST00000303757 604 ntTSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
CCDC144AA2RUR9 LRRC28-202ENST00000331450 752 ntTSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
CCDC144AA2RUR9 RN7SL618P-201ENST00000477850 296 ntBASIC23.63■■□□□ 1.37
CCDC144AA2RUR9 RBAKDN-201ENST00000498308 514 ntTSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
CCDC144AA2RUR9 AC026979.3-201ENST00000607315 403 ntBASIC23.63■■□□□ 1.37
CCDC144AA2RUR9 AC004790.1-201ENST00000612686 536 ntBASIC23.63■■□□□ 1.37
CCDC144AA2RUR9 TONSL-203ENST00000613741 1713 ntTSL 5 BASIC23.63■■□□□ 1.37
CCDC144AA2RUR9 LINC01144-201ENST00000626198 1710 ntBASIC23.63■■□□□ 1.37
CCDC144AA2RUR9 CAMK2G-205ENST00000372765 1822 ntTSL 5 BASIC23.63■■□□□ 1.37
CCDC144AA2RUR9 HYAL3-201ENST00000336307 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
CCDC144AA2RUR9 SERAC1-201ENST00000367101 1907 ntTSL 5 BASIC23.63■■□□□ 1.37
CCDC144AA2RUR9 DIAPH1-203ENST00000389057 5762 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.63■■□□□ 1.37
CCDC144AA2RUR9 LSM12-204ENST00000591247 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
CCDC144AA2RUR9 SLC25A45-208ENST00000527174 2138 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.63■■□□□ 1.37
CCDC144AA2RUR9 TIGAR-201ENST00000179259 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
CCDC144AA2RUR9 MEG3-206ENST00000423456 1771 ntTSL 2 BASIC23.63■■□□□ 1.37
CCDC144AA2RUR9 SPC24-206ENST00000592540 2315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
CCDC144AA2RUR9 MPL-202ENST00000413998 1887 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
CCDC144AA2RUR9 GPS1-208ENST00000578552 1874 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
CCDC144AA2RUR9 GALNT9-201ENST00000328957 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
CCDC144AA2RUR9 RASGRP1-201ENST00000310803 5023 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
CCDC144AA2RUR9 RASGRP1-204ENST00000539159 5021 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.62■■□□□ 1.37
CCDC144AA2RUR9 IMPDH1P4-201ENST00000445028 1534 ntBASIC23.62■■□□□ 1.37
CCDC144AA2RUR9 CLCNKB-204ENST00000619181 1544 ntTSL 5 BASIC23.62■■□□□ 1.37
CCDC144AA2RUR9 VEPH1-218ENST00000494677 1714 ntTSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
CCDC144AA2RUR9 ITGB7-202ENST00000422257 2791 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.62■■□□□ 1.37
CCDC144AA2RUR9 ZSCAN2-203ENST00000334141 993 ntTSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
CCDC144AA2RUR9 KRTAP6-3-201ENST00000391624 636 ntAPPRIS P1 BASIC23.62■■□□□ 1.37
CCDC144AA2RUR9 FKBP11-208ENST00000550765 1030 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
CCDC144AA2RUR9 SSH2-210ENST00000582084 560 ntTSL 3 BASIC23.62■■□□□ 1.37
CCDC144AA2RUR9 DUSP26-203ENST00000523956 1373 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.62■■□□□ 1.37
CCDC144AA2RUR9 AC004890.2-201ENST00000426347 2419 ntTSL 5 BASIC23.62■■□□□ 1.37
CCDC144AA2RUR9 TRPV4-205ENST00000537083 2436 ntTSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
CCDC144AA2RUR9 PRRT3-202ENST00000411976 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
CCDC144AA2RUR9 PKM-216ENST00000565184 2503 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
CCDC144AA2RUR9 TBC1D2B-202ENST00000409931 6086 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
CCDC144AA2RUR9 RNF157-202ENST00000319945 2937 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.62■■□□□ 1.37
CCDC144AA2RUR9 IGSF9B-206ENST00000533871 5050 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.62■■□□□ 1.37
CCDC144AA2RUR9 CERCAM-201ENST00000372838 2685 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
CCDC144AA2RUR9 POU3F2-201ENST00000328345 4879 ntAPPRIS P1 BASIC23.62■■□□□ 1.37
CCDC144AA2RUR9 FADS3-207ENST00000527697 1640 ntTSL 5 BASIC23.62■■□□□ 1.37
CCDC144AA2RUR9 MEIS3-206ENST00000559524 1828 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.62■■□□□ 1.37
CCDC144AA2RUR9 SGPP2-201ENST00000321276 3336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
CCDC144AA2RUR9 NOM1-201ENST00000275820 6077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
CCDC144AA2RUR9 EBI3-201ENST00000221847 1186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
CCDC144AA2RUR9 MORN4-202ENST00000370635 419 ntTSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
CCDC144AA2RUR9 LRP5L-201ENST00000402785 1193 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
CCDC144AA2RUR9 SPDYE17-201ENST00000412399 783 ntBASIC23.61■■□□□ 1.37
CCDC144AA2RUR9 GSAP-205ENST00000430584 600 ntTSL 5 BASIC23.61■■□□□ 1.37
CCDC144AA2RUR9 FYCO1-203ENST00000438446 1072 ntTSL 5 BASIC23.61■■□□□ 1.37
CCDC144AA2RUR9 GAPDHP21-201ENST00000450301 1010 ntBASIC23.61■■□□□ 1.37
CCDC144AA2RUR9 MSC-AS1-206ENST00000519751 596 ntTSL 4 BASIC23.61■■□□□ 1.37
CCDC144AA2RUR9 AC138466.1-201ENST00000535242 391 ntTSL 3 BASIC23.61■■□□□ 1.37
CCDC144AA2RUR9 SECTM1-202ENST00000580437 1030 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.61■■□□□ 1.37
CCDC144AA2RUR9 AURKB-214ENST00000585124 1227 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
CCDC144AA2RUR9 PRDM1-202ENST00000369091 2612 ntTSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
CCDC144AA2RUR9 GNAS-212ENST00000371098 1719 ntTSL 5 BASIC23.61■■□□□ 1.37
CCDC144AA2RUR9 PALM-201ENST00000264560 2755 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC23.61■■□□□ 1.37
CCDC144AA2RUR9 HM13-202ENST00000340852 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
CCDC144AA2RUR9 PCDH1-201ENST00000287008 4793 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.61■■□□□ 1.37
CCDC144AA2RUR9 RUSC2-202ENST00000455600 5636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
CCDC144AA2RUR9 BEND4-203ENST00000611697 1348 ntTSL 2 BASIC23.61■■□□□ 1.37
CCDC144AA2RUR9 C1orf56-201ENST00000368926 2096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
CCDC144AA2RUR9 SHISA7-201ENST00000376325 6033 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.61■■□□□ 1.37
CCDC144AA2RUR9 EML6-201ENST00000356458 8320 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.61■■□□□ 1.37
CCDC144AA2RUR9 NEK2-202ENST00000366999 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
CCDC144AA2RUR9 LGMN-202ENST00000393218 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
CCDC144AA2RUR9 PEA15-202ENST00000368076 2694 ntTSL 2 BASIC23.6■■□□□ 1.37
CCDC144AA2RUR9 TNRC18-202ENST00000399434 1459 ntTSL 2 BASIC23.6■■□□□ 1.37
CCDC144AA2RUR9 KRT8P12-202ENST00000472924 1397 ntBASIC23.6■■□□□ 1.37
CCDC144AA2RUR9 NOL4L-210ENST00000616976 1376 ntTSL 5 BASIC23.6■■□□□ 1.37
CCDC144AA2RUR9 SARDH-205ENST00000422262 2367 ntTSL 5 BASIC23.6■■□□□ 1.37
CCDC144AA2RUR9 NME3-201ENST00000219302 1069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
CCDC144AA2RUR9 PIN1P1-201ENST00000412108 996 ntBASIC23.6■■□□□ 1.37
CCDC144AA2RUR9 AC007388.1-210ENST00000415640 458 ntTSL 3 BASIC23.6■■□□□ 1.37
CCDC144AA2RUR9 SPSB2-204ENST00000523102 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
CCDC144AA2RUR9 SPSB2-205ENST00000524270 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
CCDC144AA2RUR9 TUBB3-203ENST00000553967 736 ntTSL 2 BASIC23.6■■□□□ 1.37
CCDC144AA2RUR9 AC106820.2-201ENST00000563775 3264 ntBASIC23.6■■□□□ 1.37
CCDC144AA2RUR9 ZNF232-201ENST00000250076 2179 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.6■■□□□ 1.37
CCDC144AA2RUR9 SRPX-201ENST00000378533 1874 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
CCDC144AA2RUR9 RASEF-202ENST00000376447 5576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 53 ms