Protein–RNA interactions for Protein: A0AVI4

TMEM129, E3 ubiquitin-protein ligase TM129, humanhuman

Predictions only

Length 362 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TMEM129A0AVI4 LIN28B-AS1-205ENST00000637414 879 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
TMEM129A0AVI4 NSMF-205ENST00000371474 3571 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
TMEM129A0AVI4 NSMF-208ENST00000437259 3577 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
TMEM129A0AVI4 PHACTR3-204ENST00000371015 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
TMEM129A0AVI4 KIFC1-211ENST00000428849 2706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
TMEM129A0AVI4 MBP-202ENST00000355994 2772 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
TMEM129A0AVI4 HSFX1-201ENST00000370416 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
TMEM129A0AVI4 ACP5-212ENST00000592828 1699 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
TMEM129A0AVI4 BUB3-201ENST00000368858 1361 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
TMEM129A0AVI4 AC002310.6-201ENST00000624451 1377 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
TMEM129A0AVI4 PML-215ENST00000565898 5393 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
TMEM129A0AVI4 SGO1-201ENST00000263753 2338 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
TMEM129A0AVI4 TSSC2-204ENST00000529482 2337 ntTSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
TMEM129A0AVI4 CRB3-203ENST00000598494 1443 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
TMEM129A0AVI4 RAP1GDS1-203ENST00000380158 2085 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
TMEM129A0AVI4 TAF1D-203ENST00000448108 2082 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0.01
TMEM129A0AVI4 SMAP1-201ENST00000316999 2403 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
TMEM129A0AVI4 PURB-201ENST00000395699 9069 ntAPPRIS P1 BASIC15.08■□□□□ 0.01
TMEM129A0AVI4 ST3GAL2-201ENST00000342907 4450 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0.01
TMEM129A0AVI4 KTN1-AS1-202ENST00000412224 2185 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0.01
TMEM129A0AVI4 LINC00271-201ENST00000421378 1580 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
TMEM129A0AVI4 TBL2-205ENST00000432538 1573 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
TMEM129A0AVI4 CHMP1A-202ENST00000535997 2295 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
TMEM129A0AVI4 CHAC1-204ENST00000617768 1560 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
TMEM129A0AVI4 PITHD1-201ENST00000246151 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
TMEM129A0AVI4 HBQ1-201ENST00000199708 536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
TMEM129A0AVI4 TMEM89-201ENST00000330862 662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
TMEM129A0AVI4 MRPS18A-201ENST00000372116 785 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
TMEM129A0AVI4 HIST2H3DP1-201ENST00000401004 416 ntBASIC15.08■□□□□ 0
TMEM129A0AVI4 COLEC11-207ENST00000404205 1062 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
TMEM129A0AVI4 AC018712.1-201ENST00000455767 687 ntBASIC15.08■□□□□ 0
TMEM129A0AVI4 SCARNA2-201ENST00000458748 420 ntBASIC15.08■□□□□ 0
TMEM129A0AVI4 MCCC2-205ENST00000509358 1214 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
TMEM129A0AVI4 RCHY1-208ENST00000512706 1011 ntTSL 3 BASIC15.08■□□□□ 0
TMEM129A0AVI4 MTHFSD-203ENST00000543303 1207 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
TMEM129A0AVI4 ADAM10-217ENST00000561288 583 ntTSL 3 BASIC15.08■□□□□ 0
TMEM129A0AVI4 AC021087.4-201ENST00000563761 564 ntBASIC15.08■□□□□ 0
TMEM129A0AVI4 PAM16-208ENST00000573553 722 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
TMEM129A0AVI4 TNFRSF13B-206ENST00000583789 859 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
TMEM129A0AVI4 LINC01956-202ENST00000584273 612 ntTSL 3 BASIC15.08■□□□□ 0
TMEM129A0AVI4 NKAPP1-205ENST00000585790 367 ntBASIC15.08■□□□□ 0
TMEM129A0AVI4 AL773604.1-201ENST00000617417 272 ntBASIC15.08■□□□□ 0
TMEM129A0AVI4 MTHFSD-220ENST00000634347 1207 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
TMEM129A0AVI4 AL161669.4-201ENST00000634353 732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
TMEM129A0AVI4 MXI1-202ENST00000332674 3470 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
TMEM129A0AVI4 BRD3-201ENST00000303407 5652 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
TMEM129A0AVI4 LRRC58-201ENST00000295628 7903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
TMEM129A0AVI4 PVR-204ENST00000406449 1344 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
TMEM129A0AVI4 TRIM33-201ENST00000358465 8339 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
TMEM129A0AVI4 ANXA11-203ENST00000422982 2534 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
TMEM129A0AVI4 SCARB1-202ENST00000339570 3329 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
TMEM129A0AVI4 C16orf70-208ENST00000569600 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
TMEM129A0AVI4 NOMO1-207ENST00000610363 3765 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
TMEM129A0AVI4 CTNNBIP1-203ENST00000377263 3000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
TMEM129A0AVI4 AC132938.5-201ENST00000624980 1813 ntBASIC15.08■□□□□ 0
TMEM129A0AVI4 ARHGEF40-201ENST00000298694 5919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
TMEM129A0AVI4 SLFNL1-203ENST00000372611 1865 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
TMEM129A0AVI4 AK4-207ENST00000545314 6887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
TMEM129A0AVI4 ZFAND6-207ENST00000558494 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
TMEM129A0AVI4 ULK4-203ENST00000420927 1904 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
TMEM129A0AVI4 ASNS-201ENST00000175506 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
TMEM129A0AVI4 GCLC-213ENST00000616923 3694 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
TMEM129A0AVI4 FAM222B-202ENST00000452648 2836 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
TMEM129A0AVI4 PCDH1-203ENST00000394536 3827 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
TMEM129A0AVI4 LONRF3-201ENST00000304778 2989 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
TMEM129A0AVI4 FADS3-207ENST00000527697 1640 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
TMEM129A0AVI4 MED25-202ENST00000538643 1623 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
TMEM129A0AVI4 AMT-233ENST00000636522 1620 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
TMEM129A0AVI4 SGCE-206ENST00000445866 1666 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
TMEM129A0AVI4 NUS1-201ENST00000368494 4676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
TMEM129A0AVI4 STAC-201ENST00000273183 3227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
TMEM129A0AVI4 NANS-201ENST00000210444 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
TMEM129A0AVI4 SMOX-204ENST00000346595 982 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
TMEM129A0AVI4 FGF8-203ENST00000346714 694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
TMEM129A0AVI4 CMTM2-202ENST00000379486 904 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
TMEM129A0AVI4 RBCK1-206ENST00000400247 790 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
TMEM129A0AVI4 KLF4P1-201ENST00000412782 1185 ntBASIC15.07■□□□□ 0
TMEM129A0AVI4 HNRNPDP1-201ENST00000439535 754 ntBASIC15.07■□□□□ 0
TMEM129A0AVI4 C1orf109-203ENST00000464085 919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
TMEM129A0AVI4 AF186996.4-201ENST00000467186 377 ntBASIC15.07■□□□□ 0
TMEM129A0AVI4 TRMT112-203ENST00000535750 823 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
TMEM129A0AVI4 AC021739.2-201ENST00000558375 964 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
TMEM129A0AVI4 MAP1LC3B-207ENST00000565788 625 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
TMEM129A0AVI4 AC008105.3-202ENST00000585471 1077 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
TMEM129A0AVI4 FUT6-212ENST00000592563 1095 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
TMEM129A0AVI4 AC013467.2-201ENST00000605472 835 ntBASIC15.07■□□□□ 0
TMEM129A0AVI4 ISG15-203ENST00000624697 788 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.07■□□□□ 0
TMEM129A0AVI4 DAP-201ENST00000230895 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
TMEM129A0AVI4 OTX1-201ENST00000282549 2861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
TMEM129A0AVI4 OTX1-202ENST00000366671 2861 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.07■□□□□ 0
TMEM129A0AVI4 FLT3LG-204ENST00000595510 1301 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
TMEM129A0AVI4 LINC00599-203ENST00000519461 2922 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
TMEM129A0AVI4 C16orf89-201ENST00000315997 1872 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
TMEM129A0AVI4 ARHGEF1-204ENST00000378152 2986 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
TMEM129A0AVI4 SYT15-201ENST00000374321 1369 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
TMEM129A0AVI4 ADAD1-203ENST00000388725 1918 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
TMEM129A0AVI4 POR-218ENST00000461988 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
TMEM129A0AVI4 SLC4A3-201ENST00000273063 4246 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
TMEM129A0AVI4 HS3ST3B1-201ENST00000360954 5367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
TMEM129A0AVI4 EXT2-210ENST00000533608 3136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 48 ms