Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y4P9

SPEF1, Sperm flagellar protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 236 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SPEF1Q9Y4P9 GRIN3A-201ENST00000361820 7770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
SPEF1Q9Y4P9 MRPL28-201ENST00000199706 1098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
SPEF1Q9Y4P9 TCEAL2-201ENST00000329035 1080 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
SPEF1Q9Y4P9 RWDD3-202ENST00000370202 1235 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.09■□□□□ 0.01
SPEF1Q9Y4P9 DRAP1-202ENST00000376991 819 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
SPEF1Q9Y4P9 TXNRD2-212ENST00000485358 850 ntTSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
SPEF1Q9Y4P9 RCHY1-208ENST00000512706 1011 ntTSL 3 BASIC15.09■□□□□ 0.01
SPEF1Q9Y4P9 TRMT112-203ENST00000535750 823 ntTSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
SPEF1Q9Y4P9 AL157871.1-202ENST00000556458 478 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
SPEF1Q9Y4P9 NKAPP1-205ENST00000585790 367 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
SPEF1Q9Y4P9 AC012615.5-201ENST00000592720 581 ntTSL 4 BASIC15.09■□□□□ 0.01
SPEF1Q9Y4P9 AC104692.2-201ENST00000603054 253 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
SPEF1Q9Y4P9 AL773604.1-201ENST00000617417 272 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
SPEF1Q9Y4P9 NXNL2-205ENST00000618633 739 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
SPEF1Q9Y4P9 AC073592.4-201ENST00000623827 446 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
SPEF1Q9Y4P9 PCDHA4-203ENST00000530339 5251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
SPEF1Q9Y4P9 PITPNM2-202ENST00000320201 6736 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
SPEF1Q9Y4P9 GNAO1-201ENST00000262493 3337 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
SPEF1Q9Y4P9 PATZ1-203ENST00000351933 3638 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
SPEF1Q9Y4P9 MAP3K4-202ENST00000366919 5397 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
SPEF1Q9Y4P9 DDB1-201ENST00000301764 4506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
SPEF1Q9Y4P9 SLC17A7-204ENST00000600601 2237 ntTSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
SPEF1Q9Y4P9 ZNF212-201ENST00000335870 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
SPEF1Q9Y4P9 ASIC1-202ENST00000447966 3778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
SPEF1Q9Y4P9 CRELD1-201ENST00000326434 1994 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
SPEF1Q9Y4P9 HCK-210ENST00000629881 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
SPEF1Q9Y4P9 ANAPC11-211ENST00000575195 1361 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
SPEF1Q9Y4P9 SNAP91-205ENST00000439399 4452 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
SPEF1Q9Y4P9 FGFR4-207ENST00000502906 2638 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
SPEF1Q9Y4P9 TMPRSS5-207ENST00000540540 2001 ntTSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
SPEF1Q9Y4P9 PDE9A-203ENST00000335440 1728 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
SPEF1Q9Y4P9 TMEM106C-203ENST00000449758 1414 ntTSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
SPEF1Q9Y4P9 CTSA-204ENST00000372484 2149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
SPEF1Q9Y4P9 SDHA-213ENST00000510361 2148 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0.01
SPEF1Q9Y4P9 AC105411.1-202ENST00000565050 1476 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0.01
SPEF1Q9Y4P9 NDOR1-202ENST00000371521 2497 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
SPEF1Q9Y4P9 SLC4A7-210ENST00000440156 4120 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
SPEF1Q9Y4P9 AC132938.5-201ENST00000624980 1813 ntBASIC15.08■□□□□ 0.01
SPEF1Q9Y4P9 PDE3A-201ENST00000359062 7576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
SPEF1Q9Y4P9 AC073324.2-201ENST00000626532 2941 ntTSL 4 BASIC15.08■□□□□ 0
SPEF1Q9Y4P9 RBBP8-201ENST00000327155 3288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
SPEF1Q9Y4P9 SNCAIP-202ENST00000261368 3745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
SPEF1Q9Y4P9 CAPN1-201ENST00000279247 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
SPEF1Q9Y4P9 ZNF48-206ENST00000622647 2695 ntTSL 4 BASIC15.08■□□□□ 0
SPEF1Q9Y4P9 STRADA-254ENST00000640999 2336 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
SPEF1Q9Y4P9 RIC8A-201ENST00000325207 2702 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
SPEF1Q9Y4P9 PCIF1-201ENST00000372409 2747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
SPEF1Q9Y4P9 GML-201ENST00000220940 723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
SPEF1Q9Y4P9 GCLC-201ENST00000229416 3813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
SPEF1Q9Y4P9 VAMP5-201ENST00000306384 689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
SPEF1Q9Y4P9 ZHX1-C8orf76-201ENST00000357082 1257 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
SPEF1Q9Y4P9 PFDN6-201ENST00000374606 740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
SPEF1Q9Y4P9 CMTM2-202ENST00000379486 904 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
SPEF1Q9Y4P9 MCFD2-208ENST00000409973 821 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
SPEF1Q9Y4P9 AL391650.1-205ENST00000433939 579 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.08■□□□□ 0
SPEF1Q9Y4P9 MOGAT1-201ENST00000446656 1048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
SPEF1Q9Y4P9 S100A2-206ENST00000497140 697 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
SPEF1Q9Y4P9 NDUFA6-202ENST00000498737 1256 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
SPEF1Q9Y4P9 MOK-208ENST00000519058 917 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
SPEF1Q9Y4P9 TRPC2-202ENST00000526541 1189 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
SPEF1Q9Y4P9 RPS15A-205ENST00000565420 802 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
SPEF1Q9Y4P9 MTDHP4-201ENST00000600287 670 ntBASIC15.08■□□□□ 0
SPEF1Q9Y4P9 COPE-211ENST00000600932 1144 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
SPEF1Q9Y4P9 NDUFA6-203ENST00000602404 1080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
SPEF1Q9Y4P9 FAM25C-201ENST00000617224 319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
SPEF1Q9Y4P9 MCRIP2-211ENST00000629534 341 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
SPEF1Q9Y4P9 ZNF140-207ENST00000440550 1663 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
SPEF1Q9Y4P9 SOCS2-AS1-202ENST00000500986 1655 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
SPEF1Q9Y4P9 ADAM22-204ENST00000398204 9334 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
SPEF1Q9Y4P9 HSPH1-201ENST00000320027 5191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
SPEF1Q9Y4P9 PACSIN2-204ENST00000403744 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
SPEF1Q9Y4P9 KIAA1211-206ENST00000541073 4117 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
SPEF1Q9Y4P9 HARS-201ENST00000307633 1780 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
SPEF1Q9Y4P9 TCP11L2-203ENST00000547153 1788 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
SPEF1Q9Y4P9 MBD1-202ENST00000269471 2980 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
SPEF1Q9Y4P9 NOMO2-203ENST00000543392 3765 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
SPEF1Q9Y4P9 NID2-208ENST00000617139 3827 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
SPEF1Q9Y4P9 TLE3-223ENST00000560939 3021 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
SPEF1Q9Y4P9 ADORA1-203ENST00000367235 2219 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
SPEF1Q9Y4P9 TMEM237-213ENST00000621467 1824 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
SPEF1Q9Y4P9 STAP2-201ENST00000594605 1426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
SPEF1Q9Y4P9 WDR81-202ENST00000409644 6733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
SPEF1Q9Y4P9 TMEM40-202ENST00000314124 2308 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
SPEF1Q9Y4P9 LINC01250-201ENST00000457478 2344 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
SPEF1Q9Y4P9 SCP2-202ENST00000371513 2003 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
SPEF1Q9Y4P9 PKLR-202ENST00000392414 2479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
SPEF1Q9Y4P9 AC009336.1-201ENST00000608941 1553 ntBASIC15.07■□□□□ 0
SPEF1Q9Y4P9 SOD2-215ENST00000546087 2558 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
SPEF1Q9Y4P9 RUNX1-202ENST00000344691 7274 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
SPEF1Q9Y4P9 ERG28-201ENST00000256319 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
SPEF1Q9Y4P9 KRT28-201ENST00000306658 1685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
SPEF1Q9Y4P9 AC133963.1-201ENST00000504166 1679 ntBASIC15.07■□□□□ 0
SPEF1Q9Y4P9 ITGAV-201ENST00000261023 7030 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
SPEF1Q9Y4P9 CREB3L1-206ENST00000621158 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
SPEF1Q9Y4P9 SERPINH1-201ENST00000358171 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
SPEF1Q9Y4P9 CICP13-201ENST00000422015 2789 ntBASIC15.07■□□□□ 0
SPEF1Q9Y4P9 PGRMC1-202ENST00000535419 1762 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
SPEF1Q9Y4P9 DNAH14-205ENST00000366850 1103 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
SPEF1Q9Y4P9 AL049795.1-201ENST00000373604 642 ntTSL 3 BASIC15.07■□□□□ 0
SPEF1Q9Y4P9 INIP-202ENST00000374236 874 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.2 ms